FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1592, 404 aa 1>>>pF1KE1592 404 - 404 aa - 404 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3619+/-0.000928; mu= 17.0587+/- 0.056 mean_var=69.9412+/-13.960, 0's: 0 Z-trim(104.8): 49 B-trim: 166 in 1/50 Lambda= 0.153358 statistics sampled from 8017 (8066) to 8017 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16 Scan time: 2.670 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 404) 2686 603.5 1.1e-172 CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 383) 1992 450.0 1.8e-126 CCDS53704.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 311) 1972 445.5 3.2e-125 CCDS8331.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 263) 1177 269.6 2.5e-72 CCDS8327.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 ( 377) 1134 260.1 2.4e-69 CCDS41704.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 ( 321) 1132 259.7 2.9e-69 CCDS44719.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 376) 1089 250.2 2.4e-66 CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 434) 1089 250.2 2.7e-66 CCDS44720.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 447) 1089 250.2 2.8e-66 CCDS44718.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 292) 1078 247.7 1.1e-65 CCDS41705.1 CARD16 gene_id:114769|Hs108|chr11 ( 97) 563 133.5 8.5e-32 CCDS31661.1 CARD16 gene_id:114769|Hs108|chr11 ( 197) 552 131.2 8.2e-31 CCDS31662.1 CARD17 gene_id:440068|Hs108|chr11 ( 110) 543 129.1 2e-30 CCDS8332.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 88) 495 118.4 2.6e-27 CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 ( 452) 368 90.7 2.9e-18 CCDS53705.1 CARD18 gene_id:59082|Hs108|chr11 ( 90) 315 78.6 2.6e-15 CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 478) 283 71.9 1.4e-12 CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 479) 283 71.9 1.4e-12 CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 521) 283 71.9 1.5e-12 CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 522) 283 71.9 1.5e-12 CCDS12323.1 CASP14 gene_id:23581|Hs108|chr19 ( 242) 266 68.0 1.1e-11 >>CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 (404 aa) initn: 2686 init1: 2686 opt: 2686 Z-score: 3213.7 bits: 603.5 E(32554): 1.1e-172 Smith-Waterman score: 2686; 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CCDS83 M----------------QEKQRMAGQMLL---QT---FFNIDQ----IS--PNKKAHPNM 70 80 90 130 140 150 160 170 pF1KE1 PAMPTSSG-SEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSAEIYPIMDKSSRTRLALIICNEEFDSIPRR : : :: : .::: :: :. :... ::::: ....:::::::::: ::: .: : CCDS83 EAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPR 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 TGAEVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLVFMSHGI .::. ::::: ::..: :::::..:::: :: . :.::: :::::.:::::::.::::: CCDS83 NGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGI 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 REGICGKKHSEQVPDILQLNAIFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRGDSPGVVWFKDSV ::::: :.:. ::.: ..::...:..:: ::::::::::.::::: . : .: .:: CCDS83 LEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSP 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 GVSGNLSLPTTEEFEDDAIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQE . : ..:..:.::. :.:.:::::::::::: ::::: ::::.:: .:: .:. CCDS83 ASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQK 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KE1 YACSCDVEEIFRKVRFSFEQPDGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH :. : .::.::::. ::: : ..::::: ::...:: ::::::. CCDS83 YSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN 340 350 360 370 >>CCDS41704.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 (321 aa) initn: 1109 init1: 1109 opt: 1132 Z-score: 1357.0 bits: 259.7 E(32554): 2.9e-69 Smith-Waterman score: 1132; 57.8% identity (77.9% similar) in 294 aa overlap (112-404:28-321) 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 YLAGTLGLSADQTSGNYLNMQDSQGVLSSFPAPQAVQDNPAMPTSSG-SEGNVKLCSLEE : .: . : : :: : .::: :: CCDS41 MADSMQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNKKAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEE 10 20 30 40 50 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 AQRIWKQKSAEIYPIMDKSSRTRLALIICNEEFDSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSV :. :... ::::: ....:::::::::: ::: .: :.::. ::::: ::..: ::: CCDS41 FLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSV 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 DVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLVFMSHGIREGICGKKHSEQVPDILQLNA ::..:::: :: . :.::: :::::.:::::::.::::: ::::: :.:. ::.: .. CCDS41 DVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDT 120 130 140 150 160 170 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 IFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRGDSPGVVWFKDSVGVSGNLSLPTTEEFEDDAIKK ::...:..:: ::::::::::.::::: . : .: .:: . : ..:..:.::. : CCDS41 IFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYK 180 190 200 210 220 230 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 AHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQP .:.:::::::::::: ::::: ::::.:: .:: .:.:. : .::.::::. ::: : CCDS41 THVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETP 240 250 260 270 280 290 390 400 pF1KE1 DGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH ..::::: ::...:: ::::::. CCDS41 RAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN 300 310 320 >>CCDS44719.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (376 aa) initn: 1133 init1: 1064 opt: 1089 Z-score: 1304.6 bits: 250.2 E(32554): 2.4e-66 Smith-Waterman score: 1130; 48.0% identity (69.8% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MADKVLKEKRKLFIRSMGEGTINGLLDELLQTRVLNKEEMEKVKRENATVMDKTRALIDS ::. :.: ... .:. ...:... : . ::. .: :: : .. . ::. :.:: CCDS44 MAEDNHKKKTVKMLEYLGKDVLHGVFNYLAKHDVLTLKEEEKKKYYDTKIEDKALILVDS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 VIPKGAQACQICITYICEEDSYLAGTLGLSADQTSGNYLNMQDSQGVLSSFPAPQAVQDN . :. : :. .. :: :::. : . : : : .. . CCDS44 -LRKNRVAHQM-----------FTQTL-----------LNMD--QKITSVKPLLQ-IEAG 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 PAMPTSSGSEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSAEIYPIMDKSSRTRLALIICNEEFDSIPRRT : : :. : . .::: :: :. :.. ::::: . .: :::::::: .:: .: :. CCDS44 P--PESAESTNILKLCPREEFLRLCKKNHDEIYPIKKREDRRRLALIICNTKFDHLPARN 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 GAEVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLVFMSHGIR ::. ::.:: :::.:::.: .::::: :: . :.::: :::::.:::::::.::::: CCDS44 GAHYDIVGMKRLLQGLGYTVVDEKNLTARDMESVLRAFAARPEHKSSDSTFLVLMSHGIL 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 EGICGKKHSEQVPDILQLNAIFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRGDSPGVVWFKDSVG ::::: :... ::.: ..::...:..:: ::::::::::.:::::.. : .: .:: . CCDS44 EGICGTAHKKKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGEKHGELWVRDSPA 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 VSGNLSLPTTEEFEDDAIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQEY . .: ..:..: :.. : : :::::::::::: ::::: : ::.:: .:: .:.: CCDS44 SLALISSQSSENLEADSVCKIHEEKDFIAFCSSTPHNVSWRDRTRGSIFITELITCFQKY 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 pF1KE1 ACSCDVEEIFRKVRFSFEQPDGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH .: : . ::::::. ::: :...::::: ::.:::: ::::::. CCDS44 SCCCHLMEIFRKVQKSFEVPQAKAQMPTIERATLTRDFYLFPGN 340 350 360 370 >>CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (434 aa) initn: 1170 init1: 1064 opt: 1089 Z-score: 1303.7 bits: 250.2 E(32554): 2.7e-66 Smith-Waterman score: 1123; 48.2% identity (70.1% similar) in 398 aa overlap (7-404:65-434) 10 20 30 pF1KE1 MADKVLKEKRKLFIRSMGEGTINGLLDELLQTRVLN :.: ... .:. ...:... : . ::. CCDS83 LKNNVAGQTSIQTLVPNTDQKSTSVKKDNHKKKTVKMLEYLGKDVLHGVFNYLAKHDVLT 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 KEEMEKVKRENATVMDKTRALIDSVIPKGAQACQICITYICEEDSYLAGTLGLSADQTSG .: :: : .. . ::. :.:: . :. : :. .. :: CCDS83 LKEEEKKKYYDTKIEDKALILVDS-LRKNRVAHQM-----------FTQTL--------- 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 NYLNMQDSQGVLSSFPAPQAVQDNPAMPTSSGSEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSAEIYPIM :::. : . : : : .. .: : :. : . .::: :: :. :.. ::::: CCDS83 --LNMD--QKITSVKPLLQ-IEAGP--PESAESTNILKLCPREEFLRLCKKNHDEIYPIK 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 DKSSRTRLALIICNEEFDSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTTELE . .: :::::::: .:: .: :.::. ::.:: :::.:::.: .::::: :: . :. 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CCDS83 DFYLFPGN 430 >>CCDS44720.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (447 aa) initn: 1133 init1: 1064 opt: 1089 Z-score: 1303.5 bits: 250.2 E(32554): 2.8e-66 Smith-Waterman score: 1123; 48.2% identity (70.1% similar) in 398 aa overlap (7-404:78-447) 10 20 30 pF1KE1 MADKVLKEKRKLFIRSMGEGTINGLLDELLQTRVLN :.: ... .:. ...:... : . ::. CCDS44 LKNNVAGQTSIQTLVPNTDQKSTSVKKDNHKKKTVKMLEYLGKDVLHGVFNYLAKHDVLT 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 KEEMEKVKRENATVMDKTRALIDSVIPKGAQACQICITYICEEDSYLAGTLGLSADQTSG .: :: : .. . ::. :.:: . :. : :. .. :: CCDS44 LKEEEKKKYYDTKIEDKALILVDS-LRKNRVAHQM-----------FTQTL--------- 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 NYLNMQDSQGVLSSFPAPQAVQDNPAMPTSSGSEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSAEIYPIM :::. : . : : : .. .: : :. : . .::: :: :. :.. ::::: CCDS44 --LNMD--QKITSVKPLLQ-IEAGP--PESAESTNILKLCPREEFLRLCKKNHDEIYPIK 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 DKSSRTRLALIICNEEFDSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTTELE . .: :::::::: .:: .: :.::. ::.:: :::.:::.: .::::: :: . :. 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CCDS44 DFYLFPGN 440 >>CCDS44718.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (292 aa) initn: 1087 init1: 1064 opt: 1078 Z-score: 1293.1 bits: 247.7 E(32554): 1.1e-65 Smith-Waterman score: 1078; 58.0% identity (78.3% similar) in 281 aa overlap (124-404:12-292) 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 TSGNYLNMQDSQGVLSSFPAPQAVQDNPAMPTSSGSEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSAEIY : :. : . .::: :: :. :.. ::: CCDS44 MAALLQIEAGPPESAESTNILKLCPREEFLRLCKKNHDEIY 10 20 30 40 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 PIMDKSSRTRLALIICNEEFDSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTT :: . .: :::::::: .:: .: :.::. ::.:: :::.:::.: .::::: :: . 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CCDS44 LTRDFYLFPGN 290 404 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 15:00:42 2016 done: Sun Nov 6 15:00:42 2016 Total Scan time: 2.670 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]