FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5629, 471 aa 1>>>pF1KE5629 471 - 471 aa - 471 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4933+/-0.000362; mu= 17.1256+/- 0.023 mean_var=78.7401+/-15.527, 0's: 0 Z-trim(114.6): 88 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.144536 statistics sampled from 24472 (24568) to 24472 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16 Scan time: 6.550 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002418 (OMIM: 250400,600108,602111) collagenase ( 471) 3299 697.7 1.8e-200 NP_002415 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase is ( 467) 1625 348.6 2.1e-95 NP_001291370 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444) 1614 346.3 1e-94 NP_001291371 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444) 1614 346.3 1e-94 XP_011541137 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 444) 1614 346.3 1e-94 XP_016873260 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 444) 1614 346.3 1e-94 XP_011541136 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 476) 1614 346.3 1.1e-94 NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitia ( 469) 1556 334.2 4.6e-91 NP_001139410 (OMIM: 120353,226600,606963) intersti ( 403) 1493 321.0 3.7e-87 NP_002417 (OMIM: 601046) macrophage metalloelastas ( 470) 1459 314.0 5.7e-85 NP_004762 (OMIM: 604629,612529) matrix metalloprot ( 483) 1323 285.6 2e-76 XP_011541138 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 377) 1244 269.1 1.5e-71 NP_002413 (OMIM: 185250,614466) stromelysin-1 prep ( 477) 1023 223.1 1.3e-57 NP_002416 (OMIM: 185260) stromelysin-2 preproprote ( 476) 1009 220.2 1e-56 NP_002414 (OMIM: 178990) matrilysin preproprotein ( 267) 821 180.8 4e-45 NP_004521 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV col ( 660) 705 156.9 1.6e-37 NP_001121363 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 610) 682 152.1 4.1e-36 NP_001289437 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 669 149.3 2.6e-35 NP_001289439 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 669 149.3 2.6e-35 NP_001289438 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 669 149.3 2.6e-35 NP_002420 (OMIM: 601807,611543) matrix metalloprot ( 508) 654 146.2 2e-34 NP_068573 (OMIM: 605470) matrix metalloproteinase- ( 261) 632 141.4 2.9e-33 XP_011518521 (OMIM: 605470) PREDICTED: matrix meta ( 191) 616 137.9 2.3e-32 NP_004985 (OMIM: 120361,613073) matrix metalloprot ( 707) 606 136.3 2.7e-31 NP_002419 (OMIM: 602261) matrix metalloproteinase- ( 669) 598 134.6 8.3e-31 XP_016874796 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 434) 591 133.0 1.6e-30 NP_057239 (OMIM: 602285) matrix metalloproteinase- ( 603) 591 133.1 2.1e-30 XP_011536659 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 578 130.3 1.2e-29 XP_011536658 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 578 130.3 1.2e-29 XP_011536657 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 578 130.3 1.2e-29 NP_005931 (OMIM: 185261) stromelysin-3 preproprote ( 488) 569 128.4 4.3e-29 XP_016880550 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 409) 557 125.9 2.1e-28 XP_011523534 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 494) 557 125.9 2.5e-28 XP_016874798 (OMIM: 601807,611543) PREDICTED: matr ( 366) 531 120.4 8.3e-27 XP_016874797 (OMIM: 601807,611543) PREDICTED: matr ( 387) 531 120.4 8.7e-27 XP_011526802 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 556) 503 114.7 6.6e-25 NP_004986 (OMIM: 277950,600754) matrix metalloprot ( 582) 496 113.3 1.9e-24 XP_016883086 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 591) 486 111.2 8.1e-24 NP_005932 (OMIM: 602262) matrix metalloproteinase- ( 607) 482 110.3 1.5e-23 XP_016883087 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 614) 479 109.7 2.3e-23 NP_006681 (OMIM: 604871) matrix metalloproteinase- ( 645) 479 109.7 2.4e-23 XP_016880552 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 446 102.7 1.8e-21 XP_016880553 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 446 102.7 1.8e-21 XP_016880551 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 446 102.7 1.8e-21 XP_011523533 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 390) 446 102.7 1.9e-21 NP_116568 (OMIM: 608417) matrix metalloproteinase- ( 393) 446 102.7 1.9e-21 XP_011523532 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 418) 446 102.7 2e-21 XP_011523529 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 446 102.7 2.1e-21 XP_011523530 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 446 102.7 2.1e-21 XP_011523528 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 446 102.7 2.1e-21 >>NP_002418 (OMIM: 250400,600108,602111) collagenase 3 p (471 aa) initn: 3299 init1: 3299 opt: 3299 Z-score: 3720.1 bits: 697.7 E(85289): 1.8e-200 Smith-Waterman score: 3299; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKENA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKENA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 ASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 RIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 PSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 PSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 FPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGET 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 MIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 MIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGY 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 DILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 DILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLI 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 EEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 EEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC 430 440 450 460 470 >>NP_002415 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase isofor (467 aa) initn: 1562 init1: 1354 opt: 1625 Z-score: 1833.6 bits: 348.6 E(85289): 2.1e-95 Smith-Waterman score: 1625; 49.9% identity (77.3% similar) in 467 aa overlap (6-471:7-464) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKE : .:.: .:.:. : .:.. . .. ::...:. :.: .. NP_002 MFSLKTLPFLLLLHVQISKAFPVSS-------KEKNTKTVQDYLEKFYQLPSNQYQSTRK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 NAASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNL :... ..:.:.::: ::::.:::: ...:::.:::::::::: : . . : . :: . :: NP_002 NGTNVIVEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 TYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPF :::: ::::.....:::.:.: ::..:: ..:: :::. .: ::: :.: ..::: :: NP_002 TYRIRNYTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DGPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGA :::.:.::::: :: . ::::::: .::::..: .::::::::::::::::: ::.:::: NP_002 DGPNGILAHAFQPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRG ::.: :.. :.. ::.::..:::..:: ... .: :.:: :::::..::::.::: NP_002 LMYPNYAFRETSNYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 ETMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALN : ..::::.::: ::: .:. . . ::: ::. :.:::: ..::::.:.: ..:::. NP_002 EILFFKDRYFWRRHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 GYDILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPR :::::.:::: ::. :.:. :. :.::: ... :: .: ..: ::::. ..:. ::. NP_002 GYDILQGYPKDISNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LIEEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC : :::: .:::::.... ... :.:: . ... ..:..:: .:. : : NP_002 SISGAFPGIESKVDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 420 430 440 450 460 >>NP_001291370 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase iso (444 aa) initn: 1562 init1: 1354 opt: 1614 Z-score: 1821.6 bits: 346.3 E(85289): 1e-94 Smith-Waterman score: 1614; 52.4% identity (79.6% similar) in 431 aa overlap (42-471:13-441) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 LSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKENAASSMTERLRE ::...:. :.: ..:... ..:.:.: NP_001 MQQIPQEKSINDYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVIVEKLKE 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 MQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVNYTPDMT :: ::::.:::: ...:::.:::::::::: : . . : . :: . :::::: ::::... NP_001 MQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRIRNYTPQLS 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 HSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGLLAHAFP ..:::.:.: ::..:: ..:: :::. .: ::: :.: ..::: :::::.:.::::: NP_001 EAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQ 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 PGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYTGKS :: . ::::::: .::::..: .::::::::::::::::: ::.::::::.: :.. : NP_001 PGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNYAFRETS 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 HFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGETMIFKDRFFWR .. ::.::..:::..:: ... .: :.:: :::::..::::.:::: ..::::.::: NP_001 NYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILFFKDRYFWR 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 LHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI ::: .:. . . ::: ::. :.:::: ..::::.:.: ..:::.:::::.:::: : NP_001 RHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDILQGYPKDI 290 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDK :. :.:. :. :.::: ... :: .: ..: ::::. ..:. ::. : :::: .: NP_001 SNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGAFPGIESK 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 pF1KE5 VDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC ::::.... ... :.:: . ... ..:..:: .:. : : NP_001 VDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 410 420 430 440 >>NP_001291371 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase iso (444 aa) initn: 1562 init1: 1354 opt: 1614 Z-score: 1821.6 bits: 346.3 E(85289): 1e-94 Smith-Waterman score: 1614; 52.4% identity (79.6% similar) in 431 aa overlap (42-471:13-441) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 LSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKENAASSMTERLRE ::...:. :.: ..:... ..:.:.: NP_001 MQQIPQEKSINDYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVIVEKLKE 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 MQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVNYTPDMT :: ::::.:::: ...:::.:::::::::: : . . : . :: . :::::: ::::... NP_001 MQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRIRNYTPQLS 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 HSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGLLAHAFP ..:::.:.: ::..:: ..:: :::. .: ::: :.: ..::: :::::.:.::::: NP_001 EAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQ 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 PGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYTGKS :: . ::::::: .::::..: .::::::::::::::::: ::.::::::.: :.. : NP_001 PGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNYAFRETS 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 HFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGETMIFKDRFFWR .. ::.::..:::..:: ... .: :.:: :::::..::::.:::: ..::::.::: NP_001 NYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILFFKDRYFWR 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 LHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI ::: .:. . . ::: ::. :.:::: ..::::.:.: ..:::.:::::.:::: : NP_001 RHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDILQGYPKDI 290 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDK :. :.:. :. :.::: ... :: .: ..: ::::. ..:. ::. : :::: .: NP_001 SNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGAFPGIESK 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 pF1KE5 VDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC ::::.... ... :.:: . ... ..:..:: .:. : : NP_001 VDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 410 420 430 440 >>XP_011541137 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil coll (444 aa) initn: 1562 init1: 1354 opt: 1614 Z-score: 1821.6 bits: 346.3 E(85289): 1e-94 Smith-Waterman score: 1614; 52.4% identity (79.6% similar) in 431 aa overlap (42-471:13-441) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 LSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKENAASSMTERLRE ::...:. :.: ..:... ..:.:.: XP_011 MQQIPQEKSINDYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVIVEKLKE 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 MQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVNYTPDMT :: ::::.:::: ...:::.:::::::::: : . . : . :: . :::::: ::::... XP_011 MQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRIRNYTPQLS 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 HSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGLLAHAFP ..:::.:.: ::..:: ..:: :::. .: ::: :.: ..::: :::::.:.::::: XP_011 EAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQ 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 PGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYTGKS :: . ::::::: .::::..: .::::::::::::::::: ::.::::::.: :.. : XP_011 PGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNYAFRETS 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 HFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGETMIFKDRFFWR .. ::.::..:::..:: ... .: :.:: :::::..::::.:::: ..::::.::: XP_011 NYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILFFKDRYFWR 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 LHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI ::: .:. . . ::: ::. :.:::: ..::::.:.: ..:::.:::::.:::: : XP_011 RHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDILQGYPKDI 290 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDK :. :.:. :. :.::: ... :: .: ..: ::::. ..:. ::. : :::: .: XP_011 SNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGAFPGIESK 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 pF1KE5 VDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC ::::.... ... :.:: . ... ..:..:: .:. : : XP_011 VDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 410 420 430 440 >>XP_016873260 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil coll (444 aa) initn: 1562 init1: 1354 opt: 1614 Z-score: 1821.6 bits: 346.3 E(85289): 1e-94 Smith-Waterman score: 1614; 52.4% identity (79.6% similar) in 431 aa overlap (42-471:13-441) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 LSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKENAASSMTERLRE ::...:. :.: ..:... ..:.:.: XP_016 MQQIPQEKSINDYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVIVEKLKE 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 MQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVNYTPDMT :: ::::.:::: ...:::.:::::::::: : . . : . :: . :::::: ::::... XP_016 MQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRIRNYTPQLS 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 HSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGLLAHAFP ..:::.:.: ::..:: ..:: :::. .: ::: :.: ..::: :::::.:.::::: XP_016 EAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQ 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 PGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYTGKS :: . ::::::: .::::..: .::::::::::::::::: ::.::::::.: :.. : XP_016 PGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNYAFRETS 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 HFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGETMIFKDRFFWR .. ::.::..:::..:: ... .: :.:: :::::..::::.:::: ..::::.::: XP_016 NYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILFFKDRYFWR 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 LHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI ::: .:. . . ::: ::. :.:::: ..::::.:.: ..:::.:::::.:::: : XP_016 RHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDILQGYPKDI 290 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDK :. :.:. :. :.::: ... :: .: ..: ::::. ..:. ::. : :::: .: XP_016 SNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGAFPGIESK 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 pF1KE5 VDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC ::::.... ... :.:: . ... ..:..:: .:. : : XP_016 VDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 410 420 430 440 >>XP_011541136 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil coll (476 aa) initn: 1562 init1: 1354 opt: 1614 Z-score: 1821.1 bits: 346.3 E(85289): 1.1e-94 Smith-Waterman score: 1614; 52.4% identity (79.6% similar) in 431 aa overlap (42-471:45-473) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 LSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKENAASSMTERLRE ::...:. :.: ..:... ..:.:.: XP_011 KIQKLFSTRPSQKPTRCSHLILDFPASRIDYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVIVEKLKE 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 MQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVNYTPDMT :: ::::.:::: ...:::.:::::::::: : . . : . :: . :::::: ::::... XP_011 MQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRIRNYTPQLS 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 HSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGLLAHAFP ..:::.:.: ::..:: ..:: :::. .: ::: :.: ..::: :::::.:.::::: XP_011 EAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQ 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 PGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYTGKS :: . ::::::: .::::..: .::::::::::::::::: ::.::::::.: :.. : XP_011 PGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNYAFRETS 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 HFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGETMIFKDRFFWR .. ::.::..:::..:: ... .: :.:: :::::..::::.:::: ..::::.::: XP_011 NYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILFFKDRYFWR 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 LHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI ::: .:. . . ::: ::. :.:::: ..::::.:.: ..:::.:::::.:::: : XP_011 RHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDILQGYPKDI 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDK :. :.:. :. :.::: ... :: .: ..: ::::. ..:. ::. : :::: .: XP_011 SNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGAFPGIESK 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 VDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC ::::.... ... :.:: . ... ..:..:: .:. : : XP_011 VDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 440 450 460 470 >>NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitial co (469 aa) initn: 1493 init1: 763 opt: 1556 Z-score: 1755.9 bits: 334.2 E(85289): 4.6e-91 Smith-Waterman score: 1556; 49.8% identity (78.8% similar) in 444 aa overlap (30-471:25-466) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLA-GILKEN . .:.:......::..::. : . . :. NP_002 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 AASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLT .. ..:.:..:: ::::.:::: : .:: :::.::::::::... . . .: . .:: NP_002 NSGPVVEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFD ::: :::::. ...:..:..:::..::.::::.::.. .: ::::::: .: : ::: NP_002 YRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 GPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGAL ::.: ::::: :::. :::::::.:: ::.. . ::: :::::.::::::.:: : ::: NP_002 GPGGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 MFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGE :.: ::..: .: .::..:::..:: ... .: :.:: :: .:..::::..::: NP_002 MYPSYTFSG--DVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITTIRGE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 TMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNG .:.:::::. : .: ..:: . . :::.::: ..:::: ..: . .:.: :.::..: NP_002 VMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 YDILEGYPKKI-SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPR ..:.:::: : : .:.:. ::.:.::. :.:::: .: .:. ::::. .. :: ::. NP_002 QNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LIEEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC .: .:::::: :::::. :.:..:::.: :.... ..::. .. ::: . : NP_002 MIAHDFPGIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN 420 430 440 450 460 >>NP_001139410 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitial (403 aa) initn: 1493 init1: 763 opt: 1493 Z-score: 1685.8 bits: 321.0 E(85289): 3.7e-87 Smith-Waterman score: 1493; 52.5% identity (79.1% similar) in 402 aa overlap (71-471:1-400) 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 RYLRSYYHPTNLAGILKENAASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPD :: ::::.:::: : .:: :::.::::::: NP_001 MQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPD 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 VGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGI :... . . .: . .::::: :::::. ...:..:..:::..::.::::.::.. .: NP_001 VAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQ 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 ADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVA ::::::: .: : :::::.: ::::: :::. :::::::.:: ::.. . ::: :: NP_001 ADIMISFVRGDHRDNSPFDGPGGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVA 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 AHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKT :::.::::::.:: : ::::.: ::..: . : .::..:::..:: ... .: :.: NP_001 AHELGHSLGLSHSTDIGALMYPSYTFSGDVQ--LAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQT 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 PDKCDPSLSLDAITSLRGETMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEH : :: .:..::::..:::.:.:::::. : .: ..:: . . :::.::: ..:::: NP_001 PKACDSKLTFDAITTIRGEVMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEF 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 pF1KE5 PSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI-SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSG ..: . .:.: :.::..: ..:.:::: : : .:.:. ::.:.::. :.:::: .: . NP_001 ADRDEVRFFKGNKYWAVQGQNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVA 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 NQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRI :. ::::. .. :: ::..: .:::::: :::::. :.:..:::.: :.... ..:: NP_001 NKYWRYDEYKRSMDPGYPKMIAHDFPGIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRI 330 340 350 360 370 380 460 470 pF1KE5 VRVMPANSILWC . .. ::: . : NP_001 LTLQKANSWFNCRKN 390 400 >>NP_002417 (OMIM: 601046) macrophage metalloelastase pr (470 aa) initn: 1448 init1: 850 opt: 1459 Z-score: 1646.5 bits: 314.0 E(85289): 5.7e-85 Smith-Waterman score: 1459; 47.2% identity (72.4% similar) in 468 aa overlap (10-471:7-470) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKEN :.:. : :::: :. .: .... :.::::...: : . : . NP_002 MKFLLILLLQATASGALPLNSS---TSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 AASS-MTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNL ... : :...::: :.::.:::.:: .::..:. :::::::: .. .: : : . NP_002 YSGNLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 TYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPF :::: ::::::.. .:. :..:::.:::.::::.:.... :.:::.. :. ::::. : NP_002 TYRINNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DGPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGA :: .:.::::: :: . :::::::.:: ::. : : ::::.:.::.:::::: ::.:: : NP_002 DGKGGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDED---PNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITS .::: : :. . : : ::..::::::: :. ::: . . : :::.::.::.:. NP_002 VMFPTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSE-PALCDPNLSFDAVTT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LRGETMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFW . .. ..::::::: .. . . : .:.:: ::. :.:::: ... .:.:. :.: NP_002 VGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 ALNGYDILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKD ... .:::.: .:.:. ::::.::: .: .: :: ::::. ..:: NP_002 LISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 YPRLIEEDFPGIGDKVDAV-YEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC ::.:: ..: ::: :.::: : :: : :::.: ::::.. .::.... .:: . : NP_002 YPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC 420 430 440 450 460 470 471 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:20:05 2016 done: Tue Nov 8 05:20:06 2016 Total Scan time: 6.550 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]