Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5629
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5629, 471 aa
1>>>pF1KE5629 471 - 471 aa - 471 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6136+/-0.000879; mu= 16.3767+/- 0.053
mean_var=77.5955+/-15.139, 0's: 0 Z-trim(107.5): 43 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.145598
statistics sampled from 9562 (9605) to 9562 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 2.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 ( 471) 3299 702.6 2.2e-202
CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 ( 467) 1625 351.0 1.6e-96
CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 ( 469) 1556 336.5 3.6e-92
CCDS8319.1 MMP27 gene_id:64066|Hs108|chr11 ( 513) 1528 330.6 2.3e-90
CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 ( 470) 1459 316.1 5e-86
CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 ( 483) 1323 287.6 2e-77
CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 ( 477) 1023 224.5 1.9e-58
CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11 ( 476) 1009 221.6 1.4e-57
CCDS8317.1 MMP7 gene_id:4316|Hs108|chr11 ( 267) 821 182.0 6.9e-46
CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 660) 705 157.8 3.1e-38
CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 610) 682 153.0 8.3e-37
CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 584) 669 150.2 5.3e-36
CCDS8895.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 508) 654 147.1 4.2e-35
CCDS7752.1 MMP26 gene_id:56547|Hs108|chr11 ( 261) 632 142.3 6e-34
CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20 ( 707) 606 137.1 6e-32
CCDS10792.1 MMP15 gene_id:4324|Hs108|chr16 ( 669) 598 135.4 1.8e-31
CCDS31927.1 MMP17 gene_id:4326|Hs108|chr12 ( 603) 591 133.9 4.7e-31
CCDS13816.1 MMP11 gene_id:4320|Hs108|chr22 ( 488) 569 129.2 9.7e-30
CCDS9577.1 MMP14 gene_id:4323|Hs108|chr14 ( 582) 496 113.9 4.6e-25
CCDS6246.1 MMP16 gene_id:4325|Hs108|chr8 ( 607) 482 111.0 3.7e-24
CCDS46593.1 MMP24 gene_id:10893|Hs108|chr20 ( 645) 479 110.4 6e-24
CCDS76996.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 ( 393) 446 103.3 4.9e-22
CCDS74036.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 ( 520) 446 103.4 6.1e-22
CCDS7647.1 MMP21 gene_id:118856|Hs108|chr10 ( 569) 370 87.4 4.2e-17
CCDS61146.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 305) 267 65.6 8.2e-11
>>CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 (471 aa)
initn: 3299 init1: 3299 opt: 3299 Z-score: 3746.8 bits: 702.6 E(32554): 2.2e-202
Smith-Waterman score: 3299; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKENA
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CCDS83 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKENA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGET
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CCDS83 FPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGET
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 MIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 DILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLI
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CCDS83 DILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE5 EEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC
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CCDS83 EEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC
430 440 450 460 470
>>CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 (467 aa)
initn: 1562 init1: 1354 opt: 1625 Z-score: 1846.5 bits: 351.0 E(32554): 1.6e-96
Smith-Waterman score: 1625; 49.9% identity (77.3% similar) in 467 aa overlap (6-471:7-464)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKE
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CCDS83 MFSLKTLPFLLLLHVQISKAFPVSS-------KEKNTKTVQDYLEKFYQLPSNQYQSTRK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 NAASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNL
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CCDS83 NGTNVIVEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 TYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPF
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CCDS83 TYRIRNYTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DGPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGA
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CCDS83 DGPNGILAHAFQPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRG
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CCDS83 LMYPNYAFRETSNYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 ETMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALN
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CCDS83 EILFFKDRYFWRRHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 GYDILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPR
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CCDS83 GYDILQGYPKDISNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 LIEEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC
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CCDS83 SISGAFPGIESKVDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG
420 430 440 450 460
>>CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 (469 aa)
initn: 1493 init1: 763 opt: 1556 Z-score: 1768.1 bits: 336.5 E(32554): 3.6e-92
Smith-Waterman score: 1556; 49.8% identity (78.8% similar) in 444 aa overlap (30-471:25-466)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLA-GILKEN
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CCDS83 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLT
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CCDS83 NSGPVVEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFD
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CCDS83 YRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGAL
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CCDS83 GPGGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 MFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGE
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CCDS83 MYPSYTFSG--DVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITTIRGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 TMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNG
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CCDS83 VMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 YDILEGYPKKI-SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPR
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CCDS83 QNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 LIEEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC
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CCDS83 MIAHDFPGIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN
420 430 440 450 460
>>CCDS8319.1 MMP27 gene_id:64066|Hs108|chr11 (513 aa)
initn: 1285 init1: 732 opt: 1528 Z-score: 1735.8 bits: 330.6 E(32554): 2.3e-90
Smith-Waterman score: 1528; 48.4% identity (75.3% similar) in 473 aa overlap (5-471:4-465)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAG--ILKE
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CCDS83 MKRLLLLFLFFI-TFSSAFPLVRMTE----NEENMQLAQAYLNQFYS-LEIEGNHLVQS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 NAASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYN-VFPRTLKWSKMN
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CCDS83 KNRSLIDDKIREMQAFFGLTVTGKLDSNTLEIMKTPRCGVPDVGQYGYTLP---GWRKYN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LTYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYP
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CCDS83 LTYRIINYTPDMARAAVDEAIQEGLEVWSKVTPLKFTKISKGIADIMIAFRTRVHGRC-P
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 --FDGPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKD
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CCDS83 RYFDGPLGVLGHAFPPGPGLGGDTHFDEDENWTKDGAGFNLFLVAAHEFGHALGLSHSND
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 PGALMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDP-NPKHPKTPDKCDPSLSLDAIT
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CCDS83 QTALMFPNYVSLDPRKYPLSQDDINGIQSIYGGLPKEPAKPKEPTIPHACDPDLTFDAIT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SLRGETMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKF
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CCDS83 TFRREVMFFKGRHLWRIYYDITDVEFELIASFWPSLPADLQAAYENP-RDKILVFKDENF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 WALNGYDILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDK
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CCDS83 WMIRGYAVLPDYPKSIHTLGFPGRVKKIDAAVCDKTTRKTYFFVGIWCWRFDEMTQTMDK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 DYPRLIEEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC
.:. . . ::::. .:::... .:...: : ::::.: .. :.:.: .:. . :
CCDS83 GFPQRVVKHFPGISIRVDAAFQYKGFFFFSRGSKQFEYDIKTKNITRIMRTNTWFQCKEP
410 420 430 440 450 460
CCDS83 KNSSFGFDINKEKAHSGGIKILYHKSLSLFIFGIVHLLKNTSIYQ
470 480 490 500 510
>>CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 (470 aa)
initn: 1448 init1: 850 opt: 1459 Z-score: 1658.0 bits: 316.1 E(32554): 5e-86
Smith-Waterman score: 1459; 47.2% identity (72.4% similar) in 468 aa overlap (10-471:7-470)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILKEN
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CCDS73 MKFLLILLLQATASGALPLNSS---TSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AASS-MTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNL
... : :...::: :.::.:::.:: .::..:. :::::::: .. .: : : .
CCDS73 YSGNLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 TYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPF
:::: ::::::.. .:. :..:::.:::.::::.:.... :.:::.. :. ::::. :
CCDS73 TYRINNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DGPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGA
:: .:.::::: :: . :::::::.:: ::. : : ::::.:.::.:::::: ::.:: :
CCDS73 DGKGGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDED---PNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITS
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CCDS73 VMFPTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSE-PALCDPNLSFDAVTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LRGETMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFW
. .. ..::::::: .. . . : .:.:: ::. :.:::: ... .:.:. :.:
CCDS73 VGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYW
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ALNGYDILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKD
... .:::.: .:.:. ::::.::: .: .: :: ::::. ..::
CCDS73 LISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 YPRLIEEDFPGIGDKVDAV-YEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC
::.:: ..: ::: :.::: : :: : :::.: ::::.. .::.... .:: . :
CCDS73 YPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC
420 430 440 450 460 470
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10 20 30 40 50
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::.::... : : ... ... ..:. :: .:: . . :
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10 20 30 40 50
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. ...:: ....:.:.::::.::::::..:..:.::::::::::..: .:: ::.:
CCDS83 MVARGSNSMIRKIKELQAFFGLQVTGKLDQTTMNVIKKPRCGVPDVANYRLFPGEPKWKK
60 70 80 90 100 110
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CCDS83 NTLTYRISKYTPSMSSVEVDKAVEMALQAWSSAVPLSFVRINSGEADIMISFENGDHGDS
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CCDS83 YPFDGPRGTLAHAFAPGEGLGGDTHFDNAEKWTMGTNGFNLFTVAAHEFGHALGLAHSTD
180 190 200 210 220 230
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CCDS83 PSALMYPTYKYKNPYGFHLPKDDVKGIQALYGPRKVFLGKPTLPHAPHHKPSIPDLCDSS
240 250 260 270 280 290
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CCDS83 SSFDAVTMLGKELLLFKDRIFWRRQVHLRTGIRPSTITSSF-PQLMSNVDAAYEVAERGT
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CCDS83 AYFFKGPHYWITRGFQ-MQGPPRTIYDFGFPRHVQQIDAAVYLREPQKTLFFVGDEYYSY
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CCDS83 DERKRKMEKDYPKNTEEEFSGVNGQIDAAVELNGYIYFFSGPKTYKYDTEKEDVVSVVKS
420 430 440 450 460 470
470
pF1KE5 NSILWC
.: . :
CCDS83 SSWIGC
480
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10 20 30 40 50
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CCDS83 YRIVNYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVREHGDFYPFD
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180 190 200 210 220 230
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.::...:::: .::::: ::: .... :: : .:::: ::. .::::: :.::.:::
CCDS83 FDAVSTLRGEILIFKDRHFWRKSLRKLEPELHLISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKDLVFIF
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CCDS83 KGNQFWAIRGNEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKTYFFVEDKYWRFDEKR
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CCDS83 NSMEPGFPKQIAEDFPGIDSKIDAVFEEFGFFYFFTGSSQLEFDPNAKKVTHTLKSNSWL
420 430 440 450 460 470
470
pF1KE5 WC
:
CCDS83 NC
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKEN
:: :: ...: : : :: ... :.: :..:: :..::..::. . . ....
CCDS83 MMH---LAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEED-SNKDL--AQQYLEKYYNLEKDVKQFRRK
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.. ...... ::.:.::::::::: .::.::.::::::::::... :: :: : .::
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CCDS83 GPGHSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEAL
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CCDS83 MYPLYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALS
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.:::..:::: ..::::.::: . . :. : ..::: ::. .::::: :.: .:::
CCDS83 FDAISTLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIF
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CCDS83 KGNEFWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENS
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CCDS83 QSMEQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWL
420 430 440 450 460 470
470
pF1KE5 WC
:
CCDS83 HC
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::::: .:: .:: . . :. ::. .: . .
CCDS83 MRLTVLCAVCLLPGSLALPLPQEAGG----MSELQWEQAQDYLKRFYLYDS-----ET
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CCDS83 KNANSLEAKLKEMQKFFGLPITGMLNSRVIEIMQKPRCGVPDVAEYSLFPNSPKWTSKVV
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CCDS83 DGPGNTLAHAFAPGTGLGGDAHFDEDERWTDGSSLGINFLYAATHELGHSLGMGHSSDPN
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CCDS10 RKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFG
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:::: ::::: .::::::: :: . :::.:::::: ::
CCDS10 RWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCK
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:..
CCDS10 FPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFP
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.::.:::::::::::..::.::
CCDS10 FLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHS
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.:::::: :::::: ..: : .::..::: ::: . : : :.: : ::. : .
CCDS10 QDPGALMAPIYTYT--KNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQD
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. .:.:...::: ..:::::.::
CCDS10 IVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKA
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>--
initn: 459 init1: 343 opt: 370 Z-score: 419.6 bits: 87.5 E(32554): 4.7e-17
Smith-Waterman score: 370; 35.7% identity (70.6% similar) in 143 aa overlap (321-461:507-649)
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.:. .::::::..:::.:: :... .:
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:: .:.:: . . .: :..::: . .:. :::.: .. : . :.
CCDS10 KMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSD
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471 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Tue Nov 8 05:20:04 2016 done: Tue Nov 8 05:20:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]