FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1970, 537 aa 1>>>pF1KE1970 537 - 537 aa - 537 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3888+/-0.000383; mu= 18.4929+/- 0.024 mean_var=74.2112+/-15.422, 0's: 0 Z-trim(113.3): 50 B-trim: 1206 in 1/49 Lambda= 0.148881 statistics sampled from 22514 (22564) to 22514 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16 Scan time: 9.810 The best scores are: opt bits E(85289) NP_036325 (OMIM: 133780,604579) frizzled-4 precurs ( 537) 3691 802.4 0 NP_003499 (OMIM: 601766) frizzled-9 precursor [Hom ( 591) 1238 275.6 3e-73 NP_009128 (OMIM: 606147) frizzled-10 precursor [Ho ( 581) 1227 273.2 1.5e-72 XP_016869333 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 470) 1084 242.4 2.3e-63 XP_016869332 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 491) 1084 242.4 2.3e-63 XP_016869331 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 502) 1084 242.5 2.4e-63 NP_059108 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Hom ( 666) 1084 242.5 3e-63 NP_665873 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Hom ( 666) 1084 242.5 3e-63 NP_001457 (OMIM: 600667) frizzled-2 precursor [Hom ( 565) 1073 240.1 1.3e-62 NP_003496 (OMIM: 603408) frizzled-1 [Homo sapiens] ( 647) 1055 236.3 2.2e-61 NP_003498 (OMIM: 603410) frizzled-7 precursor [Hom ( 574) 1054 236.0 2.3e-61 NP_001158087 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 706) 1039 232.9 2.5e-60 NP_003497 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isoform ( 706) 1039 232.9 2.5e-60 NP_003459 (OMIM: 601723) frizzled-5 precursor [Hom ( 585) 1027 230.3 1.3e-59 NP_001158088 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 674) 996 223.6 1.5e-57 XP_016869330 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 599) 942 212.0 4.2e-54 NP_114072 (OMIM: 606146) frizzled-8 precursor [Hom ( 694) 744 169.5 3e-41 XP_011514824 (OMIM: 601500,601707,605462) PREDICTE ( 657) 463 109.1 4.2e-23 NP_005622 (OMIM: 601500,601707,605462) smoothened ( 787) 463 109.2 4.8e-23 NP_001304725 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 401) 372 89.5 2.2e-17 NP_003004 (OMIM: 604157) secreted frizzled-related ( 295) 370 88.9 2.3e-17 NP_003003 (OMIM: 604156) secreted frizzled-related ( 314) 368 88.5 3.2e-17 NP_003005 (OMIM: 265900,606570) secreted frizzled- ( 346) 366 88.1 4.7e-17 NP_001454 (OMIM: 165720,605083) secreted frizzled- ( 325) 364 87.7 6e-17 NP_001265515 (OMIM: 605236,614595) atrial natriure ( 734) 364 87.9 1.2e-16 NP_001265514 (OMIM: 605236,614595) atrial natriure ( 938) 364 88.0 1.4e-16 NP_006578 (OMIM: 605236,614595) atrial natriuretic (1042) 364 88.0 1.5e-16 NP_003006 (OMIM: 604158) secreted frizzled-related ( 317) 348 84.2 6.4e-16 NP_113621 (OMIM: 606227,609549,611040) membrane fr ( 579) 245 62.3 4.7e-09 NP_003643 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z isofor ( 641) 215 55.9 4.5e-07 NP_001014447 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z iso ( 652) 197 52.0 6.6e-06 NP_569711 (OMIM: 120328,267750) collagen alpha-1(X (1751) 165 45.4 0.0017 >>NP_036325 (OMIM: 133780,604579) frizzled-4 precursor [ (537 aa) initn: 3691 init1: 3691 opt: 3691 Z-score: 4284.2 bits: 802.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3691; 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NP_003 MAVAPLRGALLLWQLLAAGGAALEIGRF-------DPERGRGAAP---CQAVEIPMCRGI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GYNVTKMPNLVGHELQTDAELQLTTFTPLIQYGCSSQLQFFLCSVYVPMCTEKINIPIGP :::.:.::::.:: : .: .:. :.::.:::: :.:.:::::.:.::::.... :: NP_003 GYNLTRMPNLLGHTSQGEAAAELAEFAPLVQYGCHSHLRFFLCSLYAPMCTDQVSTPIPA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 CGGMCLSVKRRCEPVLKEFGFAWPESLNCSKFPPQNDHNHMCMEGPGDEEV-PL-PHK-- : :: ... :: :....:.:.::.::.:...: .:: . .:::.: . . : ::: NP_003 CRPMCEQARLRCAPIMEQFNFGWPDSLDCARLPTRNDPHALCMEAPENATAGPAEPHKGL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 --TPIQP---------GEECHSVGT--NSDQYIWVKRSLNCVLKCGYDAGLY-SRSAKEF :. : : . :: : ... .:..: .:. .:: . .. :: :.: NP_003 GMLPVAPRPARPPGDLGPGAGGSGTCENPEKFQYVEKSRSCAPRCGPGVEVFWSRRDKDF 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 TDIWMAVWASLCFISTAFTVLTFLIDSSRFSYPERPIIFLSMCYNIYSIAYIVRLTVGRE . .:::::..:::.::::::::::.. ::.::::::::::::::.::.:...: ..: . NP_003 ALVWMAVWSALCFFSTAFTVLTFLLEPHRFQYPERPIIFLSMCYNVYSLAFLIRAVAGAQ 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 RISCDFEEAAEPVLIQEGLKNTGCAIIFLLMYFFGMASSIWWVILTLTWFLAAGLKWGHE ..:: .::. .:::::.::::...:::.:.::::::.:::.:::::::::: ::::: NP_003 SVACD-QEAGALYVIQEGLENTGCTLVFLLLYYFGMASSLWWVVLTLTWFLAAGKKWGHE 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 AIEMHSSYFHIAAWAIPAVKTIVILIMRLVDADELTGLCYVGNQNLDALTGFVVAPLFTY ::: :.::::.:::..::.:::::: .: : .:::::::::.. . ::::::..:: : NP_003 AIEAHGSYFHMAAWGLPALKTIVILTLRKVAGDELTGLCYVASTDAAALTGFVLVPLSGY 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 LVIGTLFIAAGLVALFKIRSNLQKDGTKTDKLERLMVKIGVFSVLYTVPATCVIACYFYE ::.:. :. .:.::::.::. .. ::.:.:::.:::::::::.::::::::::.:: :: NP_003 LVLGSSFLLTGFVALFHIRKIMKTGGTNTEKLEKLMVKIGVFSILYTVPATCVIVCYVYE 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE1 ISNWALFRYSADDS----------------------NMAVEMLKIFMSLLVGITSGMWIW : ..: : .. ..:: ::::::::.::::::.:.: NP_003 RLNMDFWRLRATEQPCAAAAGPGGRRDCSLPGGSVPTVAVFMLKIFMSLVVGITSGVWVW 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 pF1KE1 SAKTLHTWQKCSNRLVNSGKVK-REKRGNGWVKPGKGSETVV :.::..:::. : . .:... . :. : . :.:. NP_003 SSKTFQTWQSLCYRKIAAGRARAKACRAPG--SYGRGTHCHYKAPTVVLHMTKTDPSLEN 530 540 550 560 570 580 NP_003 PTHL 590 >>NP_009128 (OMIM: 606147) frizzled-10 precursor [Homo s (581 aa) initn: 1522 init1: 850 opt: 1227 Z-score: 1423.4 bits: 273.2 E(85289): 1.5e-72 Smith-Waterman score: 1873; 51.9% identity (76.2% similar) in 543 aa overlap (18-518:5-546) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAWRGAGPSVPGAPGGVGLSLGLLLQLLLLLGPARGFGDEE--ERRCDPIRISMCQNLGY : : :.::.. . .. :. . .:.::.: ::...:: NP_009 MQRPGPRLWLVLQVMGSCAAISSMDMERPGDGKCQPIEIPMCKDIGY 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 NVTKMPNLVGHELQTDAELQLTTFTPLIQYGCSSQLQFFLCSVYVPMCTEKINIPIGPCG :.:.::::.::: : .: .:: :.::..::: ..:.:::::.:.:::::... :: : NP_009 NMTRMPNLMGHENQREAAIQLHEFAPLVEYGCHGHLRFFLCSLYAPMCTEQVSTPIPACR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KE1 GMCLSVKRRCEPVLKEFGFAWPESLNCSKFPPQNDHNHMCMEGP--GDEEV--------P :: ... .: :....:.: ::.::.: :.: .:: :..:::.: :..: : NP_009 VMCEQARLKCSPIMEQFNFKWPDSLDCRKLPNKNDPNYLCMEAPNNGSDEPTRGSGLFPP 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 L-----PHKT---PIQPGEECHSVGTNSDQYIWVKRSLNCVLKCGYDAGLY-SRSAKEFT : ::.. :.. : .. : .. :..: .:. : . .: :: :.:. NP_009 LFRPQRPHSAQEHPLKDGGPGRGGCDNPGKFHHVEKSASCAPLCTPGVDVYWSREDKRFA 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 DIWMAVWASLCFISTAFTVLTFLIDSSRFSYPERPIIFLSMCYNIYSIAYIVRLTVGRER .:.:.:: :::.:.:::::::::: .:: ::::::::::::: .::..:..:: .: : NP_009 VVWLAIWAVLCFFSSAFTVLTFLIDPARFRYPERPIIFLSMCYCVYSVGYLIRLFAGAES 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 ISCDFEEAAEPVLIQEGLKNTGCAIIFLLMYFFGMASSIWWVILTLTWFLAAGLKWGHEA :.:: ..... .:::::..:::...::..:.::::::.:::.:::::::::: :::::: NP_009 IACD-RDSGQLYVIQEGLESTGCTLVFLVLYYFGMASSLWWVVLTLTWFLAAGKKWGHEA 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 IEMHSSYFHIAAWAIPAVKTIVILIMRLVDADELTGLCYVGNQNLDALTGFVVAPLFTYL :: .:::::.:::::::::::.::.:: : .:::::.::::.....::::::. :: :: NP_009 IEANSSYFHLAAWAIPAVKTILILVMRRVAGDELTGVCYVGSMDVNALTGFVLIPLACYL 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 VIGTLFIAAGLVALFKIRSNLQKDGTKTDKLERLMVKIGVFSVLYTVPATCVIACYFYEI :::: :: .:.::::.:: .. : .:::::.:::.::.::::::::::::::::::: NP_009 VIGTSFILSGFVALFHIRRVMKTGGENTDKLEKLMVRIGLFSVLYTVPATCVIACYFYER 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 pF1KE1 SN---WALF--RYSADDSNM-------------AVE--MLKIFMSLLVGITSGMWIWSAK : : .. ... .:. ::: :.:::: :.::::::::::..: NP_009 LNMDYWKILAAQHKCKMNNQTKTLDCLMAASIPAVEIFMVKIFMLLVVGITSGMWIWTSK 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 pF1KE1 TLHTWQK-CSNRLVNSGKVKREKRGNGWVKPGKGSETVV ::..::. :: :: .... : NP_009 TLQSWQQVCSRRLKKKSRRKPASVITSGGIYKKAQHPQKTHHGKYEIPAQSPTCV 530 540 550 560 570 580 >>XP_016869333 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 isof (470 aa) initn: 821 init1: 594 opt: 1084 Z-score: 1258.7 bits: 242.4 E(85289): 2.3e-63 Smith-Waterman score: 1084; 37.7% identity (65.9% similar) in 422 aa overlap (45-458:28-442) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GGVGLSLGLLLQLLLLLGPARGFGDEEERRCDPIRISMCQNLGYNVTKMPNLVGHELQTD :.:: . :::.: ::.: ::::..: : XP_016 MAMTWIVFSLWPLTVFMGHIGGHSLFSCEPITLRMCQDLPYNTTFMPNLLNHYDQQT 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 AELQLTTFTPLIQYGCSSQLQFFLCSVYVPMCTEKINIPIGPCGGMCLSVKRRCEPVLKE : : . : :... :: ... :::..:.:.: : . . :: .: . .: ... 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XP_016 KIEGDNISGVCFVGLYDVDALRYFVLAPLCLYVVVGVSLLLAGIISLNRVRIEIPLEKEN 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 TDKLERLMVKIGVFSVLYTVPATCVIACYFYEISNWALFRYSADDSNMAVEMLKIFMSLL ::: ..:..:::::.:: :: ::.::::: XP_016 QDKLVKFMIRIGVFSILYLVPLLVVIGCYFYEQAYRGIWETTWIQERCREYHIPCPYQPS 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 pF1KE1 VGITSGMWIWSAKTLHTWQKCSNRLVNSGKVKREKRGNGWVKPGKGSETVV >>XP_016869332 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 isof (491 aa) initn: 821 init1: 594 opt: 1084 Z-score: 1258.5 bits: 242.4 E(85289): 2.3e-63 Smith-Waterman score: 1084; 37.7% identity (65.9% similar) in 422 aa overlap (45-458:28-442) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GGVGLSLGLLLQLLLLLGPARGFGDEEERRCDPIRISMCQNLGYNVTKMPNLVGHELQTD :.:: . :::.: ::.: ::::..: : XP_016 MAMTWIVFSLWPLTVFMGHIGGHSLFSCEPITLRMCQDLPYNTTFMPNLLNHYDQQT 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE1 AELQLTTFTPLIQYGCSSQLQFFLCSVYVPMCTEKINIPIGPCGGMCLSVKRRCEPVLKE : : . : :... :: ... :::..:.:.: : . . :: .: . .: ... XP_016 AALAMEPFHPMVNLDCSRDFRPFLCALYAPICMEYGRVTL-PCRRLCQRAYSECSKLMEM 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 pF1KE1 FGFAWPESLNCSKFP----PQNDHNHMCMEGPGDEEVPLPHKTPIQPGEEC-HSVGTNSD :: :::...::.:: : . . : : .:. . : : . . . : XP_016 FGVPWPEDMECSRFPDCDEPYPRLVDLNLAGEPTEGAPVAVQRDY--GFWCPRELKIDPD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 QYIWVKRSLNCVLKCGYDAGLYSRSAK-EFTDIWMAVWASLCFISTAFTVLTFLIDSSRF . .: : ..: : . :. .... . .:. .: :: :::::: .:: XP_016 LGYSFLHVRDCSPPC---PNMYFRREELSFARYFIGLISIICLSATLFTFLTFLIDVTRF 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SYPERPIIFLSMCYNIYSIAYIVRLTVGRERISCDFEEAAE--PVLIQEGLKNTGCAIIF :::::::: ..:: . :. ... . . ..:..:. :. . .: .: .:...: XP_016 RYPERPIIFYAVCYMMVSLIFFIGFLL-EDRVACNASIPAQYKASTVTQGSHNKACTMLF 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 LLMYFFGMASSIWWVILTLTWFLAAGLKWGHEAIEMHSSYFHIAAWAIPAVKTIVILIMR ...::: ::.:.::::::.:::::: ::: :::: .. :: .::.::.. ::..: : XP_016 MILYFFTMAGSVWWVILTITWFLAAVPKWGSEAIEKKALLFHASAWGIPGTLTIILLAMN 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 LVDADELTGLCYVGNQNLDALTGFVVAPLFTYLVIGTLFIAAGLVALFKIRSNLQKDGTK ...:...:.:.:: ..::: ::.::: :.:.:. .. ::...: ..: .. . . 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XP_016 AALAMEPFHPMVNLDCSRDFRPFLCALYAPICMEYGRVTL-PCRRLCQRAYSECSKLMEM 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 pF1KE1 FGFAWPESLNCSKFP----PQNDHNHMCMEGPGDEEVPLPHKTPIQPGEEC-HSVGTNSD :: :::...::.:: : . . : : .:. . : : . . . : XP_016 FGVPWPEDMECSRFPDCDEPYPRLVDLNLAGEPTEGAPVAVQRDY--GFWCPRELKIDPD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 QYIWVKRSLNCVLKCGYDAGLYSRSAK-EFTDIWMAVWASLCFISTAFTVLTFLIDSSRF . .: : ..: : . :. .... . .:. .: :: :::::: .:: XP_016 LGYSFLHVRDCSPPC---PNMYFRREELSFARYFIGLISIICLSATLFTFLTFLIDVTRF 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SYPERPIIFLSMCYNIYSIAYIVRLTVGRERISCDFEEAAE--PVLIQEGLKNTGCAIIF :::::::: ..:: . :. ... . . ..:..:. :. . .: .: .:...: XP_016 RYPERPIIFYAVCYMMVSLIFFIGFLL-EDRVACNASIPAQYKASTVTQGSHNKACTMLF 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 LLMYFFGMASSIWWVILTLTWFLAAGLKWGHEAIEMHSSYFHIAAWAIPAVKTIVILIMR ...::: ::.:.::::::.:::::: ::: :::: .. :: .::.::.. ::..: : XP_016 MILYFFTMAGSVWWVILTITWFLAAVPKWGSEAIEKKALLFHASAWGIPGTLTIILLAMN 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 LVDADELTGLCYVGNQNLDALTGFVVAPLFTYLVIGTLFIAAGLVALFKIRSNLQKDGTK ...:...:.:.:: ..::: ::.::: :.:.:. .. ::...: ..: .. . . 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