Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1837
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1837, 354 aa
  1>>>pF1KE1837 354 - 354 aa - 354 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7560+/-0.000761; mu= 16.3763+/- 0.046
 mean_var=95.8460+/-19.037, 0's: 0 Z-trim(111.2): 27  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.131005
 statistics sampled from 12204 (12230) to 12204 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.376), width:  16
 Scan time:  2.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11          ( 354) 2492 480.7 8.1e-136
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1            ( 351) 1093 216.3 3.2e-56
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12         ( 359)  964 191.9 7.1e-49
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3          ( 365)  950 189.3 4.5e-48
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3          ( 380)  950 189.3 4.6e-48
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17          ( 355)  948 188.9 5.7e-48
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1          ( 352)  935 186.4 3.1e-47
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1            ( 372)  925 184.5 1.2e-46
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1            ( 391)  925 184.6 1.2e-46
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22         ( 349)  910 181.7 8.2e-46
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7            ( 360)  889 177.7 1.3e-44
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3           ( 349)  882 176.4 3.2e-44
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12           ( 370)  880 176.0 4.3e-44
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1          ( 299)  863 172.7 3.4e-43
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7          ( 355)  845 169.4 4.1e-42
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7          ( 365)  845 169.4 4.2e-42
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17         ( 357)  747 150.9 1.6e-36
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1          ( 365)  699 141.8 8.5e-34
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12         ( 389)  643 131.3 1.4e-30
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2            ( 365)  636 129.9 3.3e-30
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5          ( 351)  607 124.4 1.4e-28
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5          ( 369)  607 124.4 1.5e-28
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10          ( 351)  602 123.5 2.7e-28
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17         ( 329)  540 111.7 8.8e-25
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2         ( 417)  393 84.0 2.4e-16


>>CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11               (354 aa)
 initn: 2492 init1: 2492 opt: 2492  Z-score: 2551.8  bits: 480.7 E(32554): 8.1e-136
Smith-Waterman score: 2492; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKWLALSKTPSALALNQTQHCKQLEGLVSAQVQLCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKWLALSKTPSALALNQTQHCKQLEGLVSAQVQLCR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 SNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELAPNYLLDLERGTRESAFVYALSAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELAPNYLLDLERGTRESAFVYALSAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 AISHAIARACTSGDLPGCSCGPVPGEPPGPGNRWGGCADNLSYGLLMGAKFSDAPMKVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AISHAIARACTSGDLPGCSCGPVPGEPPGPGNRWGGCADNLSYGLLMGAKFSDAPMKVKK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 TGSQANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKCKCHGVSGSCSIRTCWKGLQELQDVAADLKTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TGSQANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKCKCHGVSGSCSIRTCWKGLQELQDVAADLKTR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 YLSATKVVHRPMGTRKHLVPKDLDIRPVKDSELVYLQSSPDFCMKNEKVGSHGTQDRQCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YLSATKVVHRPMGTRKHLVPKDLDIRPVKDSELVYLQSSPDFCMKNEKVGSHGTQDRQCN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350    
pF1KE1 KTSNGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRVVERCHCKYHWCCYVTCRRCERTVERYVCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KTSNGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRVVERCHCKYHWCCYVTCRRCERTVERYVCK
              310       320       330       340       350    

>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1                 (351 aa)
 initn: 1101 init1: 651 opt: 1093  Z-score: 1122.9  bits: 216.3 E(32554): 3.2e-56
Smith-Waterman score: 1093; 41.0% identity (73.8% similar) in 351 aa overlap (5-354:3-351)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKWLALSKTPSALALNQTQHCKQLEGLVSAQVQLCR
           :. :   :  :.. .    . .:: :.:  :. .... . :..:.::.. :::.:.
CCDS22   MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCK
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 SNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELAPNYLLDLERGTRESAFVYALSAA
        :::.: .: ..:. ... :.  : . :::::...  : .   . .::::.:::::.:.:
CCDS22 RNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSA
       60        70        80        90       100       110        

              130       140        150       160       170         
pF1KE1 AISHAIARACTSGDLPGCSCG-PVPGEPPGPGNRWGGCADNLSYGLLMGAKFSDAPMKVK
       ... :..:::.::.:  :.:   : :  :  : .:.::.::..::. .. .: :.  . .
CCDS22 GVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSP-QGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRER-S
      120       130       140        150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE1 KTGSQANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKCKCHGVSGSCSIRTCWKGLQELQDVAADLKT
       : .:..  :: :::.:.::.:. . ....:::::::::: ..:::...  ...:.  :: 
CCDS22 KGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKE
        180       190       200       210       220       230      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE1 RYLSATKVVHRPMGTRKHLVPKDLDIRPVKDSELVYLQSSPDFCMKNEKVGSHGTQDRQC
       .. .::.:  : .:. . :::.. ...:  : .::::. ::::: .. . :  ::. : :
CCDS22 KFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTC
        240       250       260       270       280       290      

     300       310       320       330       340       350    
pF1KE1 NKTSNGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRVVERCHCKYHWCCYVTCRRCERTVERYVCK
       ::::.. :.:.:.:::::..    ...::: ::.::::.: ::.:.: :: ..:.
CCDS22 NKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
        300       310       320       330       340       350 

>>CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12              (359 aa)
 initn: 893 init1: 442 opt: 964  Z-score: 991.0  bits: 191.9 E(32554): 7.1e-49
Smith-Waterman score: 964; 42.9% identity (68.5% similar) in 336 aa overlap (27-354:27-359)

               10        20         30          40        50       
pF1KE1 MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKW-LALS--KTPSALALNQTQHCKQLEGLVSAQVQ
                                 : :::.  . :  . ..    :.:: ::  .: .
CCDS85 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRK
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE1 LCRSNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELAPNYLLDLERGTRESAFVYAL
       ::.   : :  . ..:.  .: :.. : . :::::. . :  .   .. :.::.::..:.
CCDS85 LCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNASVFGRVMQIGSRETAFTHAV
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150        160       170      
pF1KE1 SAAAISHAIARACTSGDLPGCSCGPVPGEPPGPGNR-WGGCADNLSYGLLMGAKFSDAPM
       :::.. .::.:::  :.:  :.:. .      : .  ::::.::. ::  .. .: ::  
CCDS85 SAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDARE
              130       140       150       160       170       180

        180           190       200       210       220       230  
pF1KE1 KVKK--TGS--QANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKCKCHGVSGSCSIRTCWKGLQELQD
       . :.   ::  :.  :: :.:.:.::.:.    .. :::::::::::..:::  : :.. 
CCDS85 REKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRK
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE1 VAADLKTRYLSATKVVHRPMGTRKHLVPKDLDIRPVKDSELVYLQSSPDFCMKNEKVGSH
       :.  :: .: ::. .     : : .:: . .  .:. . .:::.. :::.:..::..:: 
CCDS85 VGDRLKEKYDSAAAMRVTRKG-RLELVNSRFT-QPTPE-DLVYVDPSPDYCLRNESTGSL
              250       260        270         280       290       

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE1 GTQDRQCNKTSNGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRVVERCHCKYHWCCYVTCRRCERTVERYV
       ::: : :::::.: :.:.::::::::: . .  :::::::.::::.: :..: . :..:.
CCDS85 GTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYI
       300       310       320       330       340       350       

         
pF1KE1 CK
       ::
CCDS85 CK
         

>>CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3               (365 aa)
 initn: 959 init1: 431 opt: 950  Z-score: 976.6  bits: 189.3 E(32554): 4.5e-48
Smith-Waterman score: 950; 39.7% identity (68.4% similar) in 358 aa overlap (7-354:13-365)

                     10        20        30             40         
pF1KE1       MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKWLALS-KTPSALA----LNQTQHCKQLE
                   :  :..:..: :. :  . .: .:. ..:  ..    ..    :.:: 
CCDS58 MAGSAMSSKFFLVALAIFFSFA-QV-VIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLA
               10        20          30        40        50        

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE1 GLVSAQVQLCRSNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELAPNYLLDLERGTR
       :: ..: .::.   . :. . ..:.  .: :.  :   :::::... .  .   .. :.:
CCDS58 GLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDNTSVFGRVMQIGSR
       60        70        80        90       100       110        

     110       120       130       140       150        160        
pF1KE1 ESAFVYALSAAAISHAIARACTSGDLPGCSCGPVPGEPPGPGNR-WGGCADNLSYGLLMG
       :.::.::.:::.. .:..:::  :.:  :.:. .      : .  ::::.::..::  ..
CCDS58 ETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWGGCGDNIDYGYRFA
      120       130       140       150       160       170        

      170         180         190       200       210       220    
pF1KE1 AKFSDAPMK--VKKTGS--QANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKCKCHGVSGSCSIRTCW
        .: ::  .  ..  ::  .:  :: :::.:.::...    .. :::::::::::..:::
CCDS58 KEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTCW
      180       190       200       210       220       230        

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE1 KGLQELQDVAADLKTRYLSATKVVHRPMGTRKHLVPKDLDIRPVKDSELVYLQSSPDFCM
         : ... :.  :: .: ::. .  : ...: .::  .  .     ..:::.. :::.:.
CCDS58 LQLADFRKVGDALKEKYDSAAAM--R-LNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCV
      240       250       260          270       280       290     

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE1 KNEKVGSHGTQDRQCNKTSNGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRVVERCHCKYHWCCYVTCRRC
       .::..:: ::: : :::::.: :.:.::::::::. .    .::::::.:::::: :..:
CCDS58 RNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKC
         300       310       320       330       340       350     

          350    
pF1KE1 ERTVERYVCK
        . :...:::
CCDS58 TEIVDQFVCK
         360     

>>CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3               (380 aa)
 initn: 959 init1: 431 opt: 950  Z-score: 976.3  bits: 189.3 E(32554): 4.6e-48
Smith-Waterman score: 950; 39.7% identity (68.4% similar) in 358 aa overlap (7-354:28-380)

                                    10        20        30         
pF1KE1                      MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKWLALS-KTPSALA
                                  :  :..:..: :. :  . .: .:. ..:  ..
CCDS46 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFA-QV-VIEANSWWSLGMNNPVQMS
               10        20        30          40        50        

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE1 ----LNQTQHCKQLEGLVSAQVQLCRSNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSI
           ..    :.:: :: ..: .::.   . :. . ..:.  .: :.  :   :::::..
CCDS46 EVYIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTV
       60        70        80        90       100       110        

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE1 ELAPNYLLDLERGTRESAFVYALSAAAISHAIARACTSGDLPGCSCGPVPGEPPGPGNR-
       . .  .   .. :.::.::.::.:::.. .:..:::  :.:  :.:. .      : .  
CCDS46 DNTSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWL
      120       130       140       150       160       170        

           160       170         180         190       200         
pF1KE1 WGGCADNLSYGLLMGAKFSDAPMK--VKKTGS--QANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKC
       ::::.::..::  .. .: ::  .  ..  ::  .:  :: :::.:.::...    .. :
CCDS46 WGGCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVAC
      180       190       200       210       220       230        

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE1 KCHGVSGSCSIRTCWKGLQELQDVAADLKTRYLSATKVVHRPMGTRKHLVPKDLDIRPVK
       ::::::::::..:::  : ... :.  :: .: ::. .  : ...: .::  .  .    
CCDS46 KCHGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAM--R-LNSRGKLVQVNSRFNSPT
      240       250       260       270          280       290     

     270       280       290       300       310       320         
pF1KE1 DSELVYLQSSPDFCMKNEKVGSHGTQDRQCNKTSNGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRVVERC
        ..:::.. :::.:..::..:: ::: : :::::.: :.:.::::::::. .    .:::
CCDS46 TQDLVYIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERC
         300       310       320       330       340       350     

     330       340       350    
pF1KE1 HCKYHWCCYVTCRRCERTVERYVCK
       :::.:::::: :..: . :...:::
CCDS46 HCKFHWCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
         360       370       380

>>CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17               (355 aa)
 initn: 662 init1: 541 opt: 948  Z-score: 974.7  bits: 188.9 E(32554): 5.7e-48
Smith-Waterman score: 948; 38.8% identity (69.8% similar) in 338 aa overlap (23-354:23-355)

               10        20         30        40        50         
pF1KE1 MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKW-LALSKTPSALALNQTQHCKQLEGLVSAQVQLC
                             : : : :::..  ..:. .:   : .. :::  :...:
CCDS11 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLG-SQPLLCGSIPGLVPKQLRFC
               10        20        30         40        50         

      60        70        80        90       100        110        
pF1KE1 RSNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELAPNYLLD-LERGTRESAFVYALS
       :. .:.: .:.....  .. :.. :   ::::..:. .   .   :...:::::::.:..
CCDS11 RNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIA
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE1 AAAISHAIARACTSGDLPGCSCGPVPGEPPGPGNRWGGCADNLSYGLLMGAKFSDAPMKV
       .:... :..:.:. :    :.:      ::: : .::::... ..:.:.. .:.::    
CCDS11 SAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADA----
     120       130       140       150       160       170         

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE1 KKTGSQANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKCKCHGVSGSCSIRTCWKGLQELQDVAADLK
       ...  .: . :  ::.:.:: ..   ...::::::.:::: ..::: .  ... ..  ::
CCDS11 RENRPDARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLK
         180       190       200       210       220       230     

      240          250        260       270       280       290    
pF1KE1 TRYLSATKVV---HRPM-GTRKHLVPKDLDIRPVKDSELVYLQSSPDFCMKNEKVGSHGT
        .: ::...:   ::   :  . :  :   ..:  . .::: ..::.::  : ..:: ::
CCDS11 DKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGT
         240       250       260       270       280       290     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE1 QDRQCNKTSNGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRVVERCHCKYHWCCYVTCRRCERTVERYVCK
       .:: :: ::.: :.:::.:::::.:  :..  :.::: .::::::.:..: :  . ..::
CCDS11 RDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
         300       310       320       330       340       350     

>>CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1               (352 aa)
 initn: 635 init1: 520 opt: 935  Z-score: 961.5  bits: 186.4 E(32554): 3.1e-47
Smith-Waterman score: 935; 37.4% identity (68.9% similar) in 350 aa overlap (11-354:9-352)

               10        20         30        40        50         
pF1KE1 MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKW-LALSKTPSALALNQTQHCKQLEGLVSAQVQLC
                 :: .:    :  : : : ::..   :.:. .:   : .. :::  :...:
CCDS15   MAPLGYFLLLCSLKQALG-SYPIWWSLAVGPQYSSLG-SQPILCASIPGLVPKQLRFC
                 10         20        30         40        50      

      60        70        80        90       100        110        
pF1KE1 RSNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELAPNYLLD-LERGTRESAFVYALS
       :. .:.: .:... .  .. :.. :   ::::.... .   .   :...:::::::.:..
CCDS15 RNYVEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRWNCTTVHDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIA
         60        70        80        90       100       110      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE1 AAAISHAIARACTSGDLPGCSCGPVPGEPPGPGNRWGGCADNLSYGLLMGAKFSDAPMKV
       .:... :..:.:. :    :.:.      :: : .::::.... .: ... .:.::    
CCDS15 SAGVAFAVTRSCAEGTAAICGCSSRHQGSPGKGWKWGGCSEDIEFGGMVSREFADA----
        120       130       140       150       160       170      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE1 KKTGSQANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKCKCHGVSGSCSIRTCWKGLQELQDVAADLK
       ...  .: . :  ::.:.::::. . ...::::::.:::: ..::: .  ... ..  ::
CCDS15 RENRPDARSAMNRHNNEAGRQAIASHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWSQPDFRAIGDFLK
            180       190       200       210       220       230  

      240          250        260       270       280       290    
pF1KE1 TRYLSATKVV---HRPM-GTRKHLVPKDLDIRPVKDSELVYLQSSPDFCMKNEKVGSHGT
        .: ::...:   ::   :  . : :.   ..   . .::: ..::.::  : ..:: ::
CCDS15 DKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRPRYTYFKVPTERDLVYYEASPNFCEPNPETGSFGT
            240       250       260       270       280       290  

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE1 QDRQCNKTSNGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRVVERCHCKYHWCCYVTCRRCERTVERYVCK
       .:: :: .:.: :.:::.:::::.:  ..:  :.:.: .::::::.:..: :. . ..::
CCDS15 RDRTCNVSSHGIDGCDLLCCGRGHNARAERRREKCRCVFHWCCYVSCQECTRVYDVHTCK
            300       310       320       330       340       350  

>>CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1                 (372 aa)
 initn: 879 init1: 360 opt: 925  Z-score: 950.9  bits: 184.5 E(32554): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 925; 42.1% identity (70.6% similar) in 323 aa overlap (38-354:46-361)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KE1 CEALLFALALQTGVCYGIKWLALSKTPSALALNQTQHCKQLEGLVSAQVQLCRSNLELMH
                                     ::.    : .. :::: : :::.   ..:.
CCDS84 QLKTEGSLRTAVPGIPTQSAFNKCLQRYIGALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMR
          20        30        40        50        60        70     

        70        80        90       100        110       120      
pF1KE1 TVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELAPNYLLD-LERGTRESAFVYALSAAAISHAI
       .: ..::: .. :.. :   ::::....   . .   . :..::.:::::.:.:.. :::
CCDS84 SVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAI
          80        90       100       110       120       130     

        130       140        150         160       170       180   
pF1KE1 ARACTSGDLPGCSCGPVP-GEPPGP-GN-RWGGCADNLSYGLLMGAKFSDAPMKVKKTGS
       .:::..:.:  ::: :   :.     :.  ::::.::. ::. ..  : ::  :  :   
CCDS84 TRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKRLK---
         140       150       160       170       180       190     

           190       200       210       220       230       240   
pF1KE1 QANKLMRLHNSEVGRQALRASLEMKCKCHGVSGSCSIRTCWKGLQELQDVAADLKTRYLS
       .:  :: :::.. :: :.:  :...::::::::::..::::..:.... ..  :. :: .
CCDS84 DARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDG
            200       210       220       230       240       250  

           250       260       270       280       290       300   
pF1KE1 ATKVVHRPMGTRKHLVPKDLDIRPVKDSELVYLQSSPDFCMKNEKVGSHGTQDRQCNKTS
       :..:.    :.  ...      : .  ..:::...:::.:. .. .:: ::  : :.:::
CCDS84 AVQVMATQDGA--NFTAARQGYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTS
            260         270       280       290       300       310

           310       320         330       340       350           
pF1KE1 NGSDSCDLMCCGRGYNPYTDRV--VERCHCKYHWCCYVTCRRCERTVERYVCK       
       .:.:.:..:::::::.  : ::  : .:.::.:::: : :..:. ::. ..::       
CCDS84 KGTDGCEIMCCGRGYD--TTRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEW
              320         330       340       350       360        

CCDS84 LDQT
      370  

>>CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1                 (391 aa)
 initn: 879 init1: 360 opt: 925  Z-score: 950.6  bits: 184.6 E(32554): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 928; 40.5% identity (68.3% similar) in 353 aa overlap (8-354:43-380)

                                      10        20        30       
pF1KE1                        MRARPQVCEALLFALALQTGVCYGIKWLALSKTPSAL
                                     :  ::. :.: . :    .:  ..      
CCDS84 LPLRRASAPVPVPSPAAPDGSRASARLGLACLLLLLLLTLPARV--DTSWWYIG------
             20        30        40        50          60          

        40        50        60        70        80        90       
pF1KE1 ALNQTQHCKQLEGLVSAQVQLCRSNLELMHTVVHAAREVMKACRRAFADMRWNCSSIELA
       ::.    : .. :::: : :::.   ..:..: ..::: .. :.. :   ::::....  
CCDS84 ALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMRSVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRD
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        . .   . :..::.:::::.:.:.. :::.:::..:.:  ::: :   :.     :.  
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       ::::.::. ::. ..  : ::  :  :   .:  :: :::.. :: :.:  :...:::::
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       :::::..::::..:.... ..  :. :: .:..:.    :.  ...      : .  ..:
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       ::...:::.:. .. .:: ::  : :.:::.:.:.:..:::::::.  : ::  : .:.:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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