Result of FASTA (ccds) for pFN21AB3260
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3260, 1615 aa
  1>>>pF1KB3260 1615 - 1615 aa - 1615 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1962+/-0.00114; mu= 10.6894+/- 0.069
 mean_var=189.6339+/-38.103, 0's: 0 Z-trim(109.9): 71  B-trim: 7 in 1/50
 Lambda= 0.093136
 statistics sampled from 11151 (11217) to 11151 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.345), width:  16
 Scan time:  4.570

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs108|chr11           (1615) 11265 1527.8       0
CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs108|chr12           (1613) 7863 1070.6       0
CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11          (1905) 2995 416.6 3.9e-115
CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2          (4599) 1416 204.7 5.7e-51
CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs108|chr22        ( 252) 1298 187.9 3.7e-47
CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12           (4544)  974 145.3 4.2e-33
CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2            (4655)  876 132.2   4e-29
CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9           ( 873)  854 128.7 8.6e-29
CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4            (1165)  856 129.0 8.9e-29
CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4            (1166)  856 129.0 8.9e-29
CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4             (1207)  856 129.0 9.1e-29
CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9          ( 845)  847 127.7 1.6e-28
CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11          (2214)  822 124.7 3.4e-27
CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 700)  775 118.0 1.1e-25
CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 692)  713 109.6 3.6e-23
CCDS580.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 793)  714 109.8 3.7e-23
CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1           ( 904)  714 109.9 4.1e-23
CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 819)  713 109.7 4.1e-23
CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 963)  714 109.9 4.3e-23
CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 858)  713 109.7 4.3e-23
CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 860)  713 109.7 4.3e-23
CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 682)  656 102.0 7.3e-21
CCDS1608.1 NID1 gene_id:4811|Hs108|chr1            (1247)  640 100.0 5.1e-20
CCDS9706.1 NID2 gene_id:22795|Hs108|chr14          (1375)  596 94.1 3.3e-18
CCDS31462.1 LDLRAD3 gene_id:143458|Hs108|chr11     ( 345)  406 68.1 5.6e-11


>>CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs108|chr11                (1615 aa)
 initn: 11265 init1: 11265 opt: 11265  Z-score: 8187.0  bits: 1527.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11265; 100.0% identity (100.0% similar) in 1615 aa overlap (1-1615:1-1615)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MEAAPPGPPWPLLLLLLLLLALCGCPAPAAASPLLLFANRRDVRLVDAGGVKLESTIVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MEAAPPGPPWPLLLLLLLLLALCGCPAPAAASPLLLFANRRDVRLVDAGGVKLESTIVVS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 GLEDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEAIKQTYLNQTGAAVQNVVISGLVSPDGLACDWVGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLEDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEAIKQTYLNQTGAAVQNVVISGLVSPDGLACDWVGK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 KLYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMYWTDWGETPRIERAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KLYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMYWTDWGETPRIERAG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 MDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHRANLDGSFRQKVVEGSLTHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHRANLDGSFRQKVVEGSLTHP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 FALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSPMDIQVLSQERQPFFHTRCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSPMDIQVLSQERQPFFHTRCE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 EDNGGCSHLCLLSPSEPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKAGAEEVLLLARRTDLRRISLDTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EDNGGCSHLCLLSPSEPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKAGAEEVLLLARRTDLRRISLDTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 DFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 IAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 NPKIECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NPKIECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 LEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 ETNNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVVEFGLDYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ETNNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVVEFGLDYP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 EGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQVLVWRDLDNPRSLALDPTKGYIYWTEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQVLVWRDLDNPRSLALDPTKGYIYWTEW
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 GGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDKVGRANDLTIDYADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQERVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDKVGRANDLTIDYADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQERVV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 IADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLHSIERADKTSGRNRTLIQGHLDFVMDILVFHSSRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLHSIERADKTSGRNRTLIQGHLDFVMDILVFHSSRQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 DGLNDCMHNNGQCGQLCLAIPGGHRCGCASHYTLDPSSRNCSPPTTFLLFSQKSAISRMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DGLNDCMHNNGQCGQLCLAIPGGHRCGCASHYTLDPSSRNCSPPTTFLLFSQKSAISRMI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 PDDQHSPDLILPLHGLRNVKAIDYDPLDKFIYWVDGRQNIKRAKDDGTQPFVLTSLSQGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PDDQHSPDLILPLHGLRNVKAIDYDPLDKFIYWVDGRQNIKRAKDDGTQPFVLTSLSQGQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 NPDRQPHDLSIDIYSRTLFWTCEATNTINVHRLSGEAMGVVLRGDRDKPRAIVVNAERGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NPDRQPHDLSIDIYSRTLFWTCEATNTINVHRLSGEAMGVVLRGDRDKPRAIVVNAERGY
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 LYFTNMQDRAAKIERAALDGTEREVLFTTGLIRPVALVVDNTLGKLFWVDADLKRIESCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LYFTNMQDRAAKIERAALDGTEREVLFTTGLIRPVALVVDNTLGKLFWVDADLKRIESCD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB3 LSGANRLTLEDANIVQPLGLTILGKHLYWIDRQQQMIERVEKTTGDKRTRIQGRVAHLTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSGANRLTLEDANIVQPLGLTILGKHLYWIDRQQQMIERVEKTTGDKRTRIQGRVAHLTG
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB3 IHAVEEVSLEEFSAHPCARDNGGCSHICIAKGDGTPRCSCPVHLVLLQNLLTCGEPPTCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IHAVEEVSLEEFSAHPCARDNGGCSHICIAKGDGTPRCSCPVHLVLLQNLLTCGEPPTCS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB3 PDQFACATGEIDCIPGAWRCDGFPECDDQSDEEGCPVCSAAQFPCARGQCVDLRLRCDGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PDQFACATGEIDCIPGAWRCDGFPECDDQSDEEGCPVCSAAQFPCARGQCVDLRLRCDGE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB3 ADCQDRSDEADCDAICLPNQFRCASGQCVLIKQQCDSFPDCIDGSDELMCEITKPPSDDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ADCQDRSDEADCDAICLPNQFRCASGQCVLIKQQCDSFPDCIDGSDELMCEITKPPSDDS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB3 PAHSSAIGPVIGIILSLFVMGGVYFVCQRVVCQRYAGANGPFPHEYVSGTPHVPLNFIAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PAHSSAIGPVIGIILSLFVMGGVYFVCQRVVCQRYAGANGPFPHEYVSGTPHVPLNFIAP
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB3 GGSQHGPFTGIACGKSMMSSVSLMGGRGGVPLYDRNHVTGASSSSSSSTKATLYPPILNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GGSQHGPFTGIACGKSMMSSVSLMGGRGGVPLYDRNHVTGASSSSSSSTKATLYPPILNP
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB3 PPSPATDPSLYNMDMFYSSNIPATARPYRPYIIRGMAPPTTPCSTDVCDSDYSASRWKAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PPSPATDPSLYNMDMFYSSNIPATARPYRPYIIRGMAPPTTPCSTDVCDSDYSASRWKAS
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610     
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS86            MGAVLRSLLA-CSFCVLLRAAPLLLYANRRDLRLVDATNGKENATIVVG
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       ::::::::::::::.::.:. :::::::.:::::::::::. :.::::::::.:.:::::
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       ::::.: ::..:.::::::::.: ::::::::::::.:::..::::. :: ::.::: ::
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        ::::::::::.:: .::: :::::::.: .::.::: :: :.:::::::::::::::::
CCDS86 IDNGGCSHLCLMSPVKPFYQCACPTGVKLLENGKTCKDGATELLLLARRTDLRRISLDTP
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CCDS86 DFTDIVLQLEDIRHAIAIDYDPVEGYIYWTDDEVRAIRRSFIDGSGSQFVVTAQIAHPDG
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pF1KB3 IAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGE
       :::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::.:::::.: :..: ::::::::
CCDS86 IAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTMRKILISEDLEEPRAIVLDPMVGYMYWTDWGE
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        :::: : :::..: ::::.::::::::::: .:::.::::::::::::.:.::: ::.:
CCDS86 IPKIERAALDGSDRVVLVNTSLGWPNGLALDYDEGKIYWGDAKTDKIEVMNTDGTGRRVL
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pF1KB3 LEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVV
       .:::.:::::::::::..::::::::::::::: .: :.::::::::::::::.:: .:.
CCDS86 VEDKIPHIFGFTLLGDYVYWTDWQRRSIERVHKRSAEREVIIDQLPDLMGLKATNVHRVI
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pF1KB3 GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISL
       :.::::..::::::::.. :.. ::.::::.::.:::::::::::::.:. :: :.::::
CCDS86 GSNPCAEENGGCSHLCLYRPQGLRCACPIGFELISDMKTCIVPEAFLLFSRRADIRRISL
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       :::::.::::::::::::::::::..:.:::::.:::::::::::::..:::::::::::
CCDS86 ETNNNNVAIPLTGVKEASALDFDVTDNRIYWTDISLKTISRAFMNGSALEHVVEFGLDYP
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pF1KB3 EGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQVLVWRDLDNPRSLALDPTKGYIYWTEW
       :::::::.::::::::::::::::..:::: ::::::.:::.::.:::::..:..:::::
CCDS86 EGMAVDWLGKNLYWADTGTNRIEVSKLDGQHRQVLVWKDLDSPRALALDPAEGFMYWTEW
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       ::::.: :: :::..  ::: .::::: :::::: .::::::::::.:::::::: .: :
CCDS86 GGKPKIDRAAMDGSERTTLVPNVGRANGLTIDYAKRRLYWTDLDTNLIESSNMLGLNREV
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       ::::::::::::::.::::::::. .:::::.::::.:::.::::::.::::::::::::
CCDS86 IADDLPHPFGLTQYQDYIYWTDWSRRSIERANKTSGQNRTIIQGHLDYVMDILVFHSSRQ
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pF1KB3 DGLNDCMHNNGQCGQLCLAIP-GGHRCGCASHYTLDPSSRNCSPPTTFLLFSQKSAISRM
       .: :.:  .::.:..::::.: ::  ::: .::.:. ..:.:: :::::::::::::.::
CCDS86 SGWNECASSNGHCSHLCLAVPVGGFVCGCPAHYSLNADNRTCSAPTTFLLFSQKSAINRM
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pF1KB3 IPDDQHSPDLILPLHGLRNVKAIDYDPLDKFIYWVDGRQN-IKRAKDDGTQPF-VLTSLS
       . :.:.:::.:::.:.::::.::::::::: .::.:.::: :..:..::.: : :..:  
CCDS86 VIDEQQSPDIILPIHSLRNVRAIDYDPLDKQLYWIDSRQNMIRKAQEDGSQGFTVVVSSV
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pF1KB3 QGQNPDRQPHDLSIDIYSRTLFWTCEATNTINVHRLSGEAMGVVLRGDRDKPRAIVVNAE
        .:: . ::.::::::::: ..:::::::.::: ::.:...::::.:..:.:::.::: :
CCDS86 PSQNLEIQPYDLSIDIYSRYIYWTCEATNVINVTRLDGRSVGVVLKGEQDRPRAVVVNPE
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pF1KB3 RGYLYFTNMQDRAAKIERAALDGTEREVLFTTGLIRPVALVVDNTLGKLFWVDADLKRIE
       .::.::::.:.:. :::::::::::::::: .:: .:.::..:. ::::::.:.::.:::
CCDS86 KGYMYFTNLQERSPKIERAALDGTEREVLFFSGLSKPIALALDSRLGKLFWADSDLRRIE
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pF1KB3 SCDLSGANRLTLEDANIVQPLGLTILGKHLYWIDRQQQMIERVEKTTGDKRTRIQGRVAH
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CCDS86 SSDLSGANRIVLEDSNILQPVGLTVFENWLYWIDKQQQMIEKIDMTGREGRTKVQARIAQ
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pF1KB3 LTGIHAVEEVSLEEFSAHPCARDNGGCSHICIAKGDGTPRCSCPVHLVLLQNLLTCGEPP
       :. ::::.:..:.:.  ::::.:::::::::..::::: :::::.::::::. :.:::::
CCDS86 LSDIHAVKELNLQEYRQHPCAQDNGGCSHICLVKGDGTTRCSCPMHLVLLQDELSCGEPP
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pF1KB3 TCSPDQFACATGEIDCIPGAWRCDGFPECDDQSDEEGCPVCSAAQFPCARGQCVDLRLRC
       ::::.::.: :::::::: ::::::: ::.:.::: .::::: .:: :: :::.:  :::
CCDS86 TCSPQQFTCFTGEIDCIPVAWRCDGFTECEDHSDELNCPVCSESQFQCASGQCIDGALRC
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pF1KB3 DGEADCQDRSDEADCDAICLPNQFRCASGQCVLIKQQCDSFPDCIDGSDELMCEITKPPS
       .:.:.:::.::: .:...:: .:::::.:::.  ...::   :: : :::: :  :. :.
CCDS86 NGDANCQDKSDEKNCEVLCLIDQFRCANGQCIGKHKKCDHNVDCSDKSDELDCYPTEEPA
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pF1KB3 DDSPAHSSAIGPVIGIILSLFVMGGVYFVCQRVVCQRYAGANGPFPHEYV-SGTPHVPLN
          :  ....: :::.:...:: : :::.:::..: :. : .  . ..::  :   :::.
CCDS86 ---PQATNTVGSVIGVIVTIFVSGTVYFICQRMLCPRMKGDGETMTNDYVVHGPASVPLG
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pF1KB3 FIAPGGSQHGPFTGIACGKSMMSSVSLMGGRGGVPLYDRNHVTGASSSSSSSTKATLYPP
       ..   .:  : . :.. ::::.::.:.::: .: : ::: ::::::::::::::.: .: 
CCDS86 YVPHPSSLSGSLPGMSRGKSMISSLSIMGGSSGPP-YDRAHVTGASSSSSSSTKGTYFPA
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pF1KB3 ILNPPPSPATDPSLYNMDMFYSSNIPATARPY--RPYIIRGMAPPTTPCSTDVCDSDYSA
       ::::::::::. : :.:.. :::: :.: : :  :::  : .::::::::::::::::. 
CCDS86 ILNPPPSPATERSHYTMEFGYSSNSPSTHRSYSYRPYSYRHFAPPTTPCSTDVCDSDYAP
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pF1KB3 SRW-----KASKYYLDLNSDSDPYPPPPTPHSQYLSAED---SCPPSPATERSY-FHLFP
       ::       :. :  ::: ::.: ::::::.:::::::.   :::::: :::::  ::.:
CCDS86 SRRMTSVATAKGYTSDLNYDSEPVPPPPTPRSQYLSAEENYESCPPSPYTERSYSHHLYP
          1550      1560      1570      1580      1590      1600   

        1610     
pF1KB3 PPPSPCTDSS
       ::::::::::
CCDS86 PPPSPCTDSS
          1610   

>>CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11               (1905 aa)
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pF1KB3         MEAAPPGPPWPLLLLLLLLLALCGCP-------APAAASPL---LLFANRRD
                                     :.::       . : :. :   :::: : :
CCDS31 PQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQNYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMD
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pF1KB3 VRLVDAGGVKLESTIV-VSGLEDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEAIKQTYLNQTGAAVQN
       .: ..     : . .. .. ...:.:.:..     ::::::: ..:...  . ::  :  
CCDS31 IRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEV--
             760       770       780       790       800           

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pF1KB3 VVISGLVSPDGLACDWVGKKLYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPA
       :: ..: :: ::: ::: .::::::. :.:::::: .:. : ::.:..::.:: :...: 
CCDS31 VVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPM
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pF1KB3 HGYMYWTDWGETPRIERAGMDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHR
        ::::::::: .:.:::::::.: :..:..:.. :::::.::   :.:::::: .. :. 
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pF1KB3 ANLDGSFRQKVVEGSLTHPFALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSP
       :.:::: :. .. ..: :::.::: :. .:::::::.::.. .. ::  :. .   : . 
CCDS31 AGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENL
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       :::.:. ..: :   : :  .::::::::: ::.   ..:.::::..: ..:.::. : .
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         :..::: :.: .::: : :.:.:. ..  ....:::  :: :: :::.:. .. : ::
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pF1KB3 RNRTLIQGHLDFVMDILVFHSSRQDGLNDCMHNNGQCGQLCLAIPGGHRCGCASHYTLDP
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CCDS31 QGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPA
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CCDS31 GKNRCGDNNGGCTHLCL--PSGQNYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRI
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>>CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2               (4599 aa)
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CCDS21 MCLINHNRS-AACACPHLMKLSSDKKTCYE-MKKFLLYARRSEIRGVDIDNPYFNFITAF
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pF1KB3 QVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDGIAVDWVA
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CCDS21 TVPDIDDVTVIDFDASEERLYWTDIKTQTIKRAFINGTGLETVISRDIQSIRGLAVDWVS
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pF1KB3 RNLYWTDTGTD--RIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGENPKIE
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CCDS21 RNLYWISSEFDETQINVARLDG-SLKTSIIHGIDKPQCLAAHPVRGKLYWTD-GNT--IN
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pF1KB3 CANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTL--LED
        ::.::.. ..: . .   : ::..:  :.:::: .. .  :.  :.:: . ...  ...
CCDS21 MANMDGSNSKILFQNQ-KEPVGLSIDYVENKLYWISSGNGTINRCNLDGGNLEVIESMKE
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CCDS21 ELTKATALTIMDKKLWWADQNLAQLGTCSKRDGRNPTILRNKTSGVVHMKVYDKEAQQGS
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pF1KB3 NPCADRNGGCSHLCFFTPHATR-CGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISLE
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CCDS21 NSCQLNNGGCSQLCLPTSETTRTCMCTVGYYLQKNRMSCQGIESFLMYSVHEGIRGIPLE
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pF1KB3 TNNN-DVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVVEFGLDYP
        ... :. .:..:.. : ..:: . :. :::::.... ::::  . .  : ..  ::   
CCDS21 PSDKMDALMPISGTSFAVGIDFHAENDTIYWTDMGFNKISRAKRDQTWKEDIITNGLGRV
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CCDS21 EGIAVDWIAGNIYWTDHGFNLIEVARLNGSFRYVIISQGLDQPRSIAVHPEKGLLFWTEW
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pF1KB3 GGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDK-VGRANDLTIDYADQRLYWTDLDTNMIESSNML--GQE
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CCDS21 GQMPCIGKARLDGSEKVVLVSMGIAWPNGISIDYEENKLYWCDARTDKIERIDLETGGNR
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pF1KB3 RVVIADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLH---SIERADKTSGRNRTLIQGHLDFVM-DIL
       ..:.. .    :... .. ::::.:   :   :..:. :... .   ..  :   . .. 
CCDS21 EMVLSGSNVDMFSVAVFGAYIYWSD-RAHANGSVRRGHKNDATETITMRTGLGVNLKEVK
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pF1KB3 VFHSSRQDGLNDCMHNNGQCGQLCLAIPGGHR-CGCASHYTLDPSSRNCSPPTTFLLFSQ
       .:.  :. : : : ..:: : ::::   ...: :.::  : :  .. .:     .::.: 
CCDS21 IFNRVREKGTNVCARDNGGCKQLCLYRGNSRRTCACAHGY-LAEDGVTCLRHEGYLLYSG
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pF1KB3 KSAISRM-IPDDQHSPDLILPLHGLRNVK-----AIDYDPLDK---FIYWVDGR-QNIKR
       .. .. . . :. .  . : : .. :  :     :.::.   :    :.. :..  ::. 
CCDS21 RTILKSIHLSDETNLNSPIRPYENPRYFKNVIALAFDYNQRRKGTNRIFYSDAHFGNIQL
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        ::.  .  :..  . :.      :  . :    ::.::  .:..:. : ..    :   
CCDS21 IKDNWEDRQVIVE-NVGSVEGLAYHR-AWD----TLYWTSSTTSSITRHTVDQTRPGAFD
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CCDS21 REAVITMSEDDHPHVLALDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRSTLTGKNAQVVVSTDILTPNG
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       :..:    ::.. :..: .:: :. .:..: ..  ..    :.:..  ....: :  .. 
CCDS21 LTIDYRAEKLYFSDGSLGKIERCEYDGSQRHVIVKSGPGTFLSLAVYDNYIFWSDWGRRA
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pF1KB3 IERVEKTTGDKRTRIQGRVAHLT-GIHAV-EEVSLEEFSAHPCARDNGGCSHICIAKGDG
       : : .: ::     ... . :   :: :: ....  :.:  :::  ::::  .:.   .:
CCDS21 ILRSNKYTGGDTKILRSDIPHQPMGIIAVANDTNSCELS--PCALLNGGCHDLCLLTPNG
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pF1KB3 TPRCSCPVHLVLLQNLLTCGEPPTCSP-DQFACATGEIDCIPGAWRCDGFPECDDQSDEE
          :::    .::..     .  .:.  ..: :..::  ::     :::.:.: :.:::.
CCDS21 RVNCSCRGDRILLEDNRCVTKNSSCNAYSEFECGNGE--CIDYQLTCDGIPHCKDKSDEK
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pF1KB3 --GCP--VCSAAQFPCARGQCVDLRLRCDGEADCQDRSDEADCD-AICLPNQFRCASGQC
          :    :  .  ::   .:.     :::: :: : ::: ::  . :   .::::.: :
CCDS21 LLYCENRSCRRGFKPCYNRRCIPHGKLCDGENDCGDNSDELDCKVSTCATVEFRCADGTC
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       .  . .:..  :: :.:::  :. :                                   
CCDS21 IPRSARCNQNIDCADASDEKNCNNTDCTHFYKLGVKTTGFIRCNSTSLCVLPTWICDGSN
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CCDS21 SYKCKCWPGFQLKDDGKTCVDIDECSSGFPCSQQCINTYGTYKCLCTDGYEIQPDNPNGC
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pF1KB3 KTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISLETNNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLK
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CCDS21 KSLSDEEPFLILADHHEIRKIS--TDGSNYTLLKQGLNNVIAIDFDYREEFIYWIDSSRP
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pF1KB3 T---ISRAFMNGSSVEHVVEFGLDYPEGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQV
       .   :.:  .:::...  :  .   :...::::.::::::.::    :::..:.: .  .
CCDS21 NGSRINRMCLNGSDIK--VVHNTAVPNALAVDWIGKNLYWSDTEKRIIEVSKLNGLYPTI
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CCDS21 LVSKRLKFPRDLSLDPQAGYLYWIDCCEYPHIGRVGMDGTNQSVVIETKISRPMALTIDY
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pF1KB3 ADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQERVVIAD-DLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLHSIERAD
       ...::::.:   : :: ::: :..:  . . :.:  ..:: . ::::::: . .:. :: 
CCDS21 VNRRLYWAD--ENHIEFSNMDGSHRHKVPNQDIPGVIALTLFEDYIYWTDGKTKSLSRAH
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       :::: .:  .      . :: :.:: ::  ..   :: ::: :..:::  ::  : :.: 
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CCDS21 TNFYLAADNRTCLSNCTASQFRCKT--DKCIP-------FWWKCDTVDDCGDGSDEPDDC
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pF1KB3 FIYWVDGRQNIKRAKDDGTQPFVLTS-LSQGQNPDRQPHD-LSIDIYSRTLFWTCEATNT
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CCDS21 PEF----RCQPGRFQC-GTGLCALPAFICDGENDCGDNSDELNCDTH------VC-----
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pF1KB3 INVHRLSGEAMGVVLRGDRDKPRAIVVNAERGYLYFTNMQDRAA--KIERAALDGTEREV
            :::.     ..  ... . : :: .       : ::  .  . ::   ...    
CCDS21 -----LSGQ-----FKCTKNQ-KCIPVNLR------CNGQDDCGDEEDERDCPENSCSPD
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pF1KB3 LFTTGLIRPVALVVDNTLGKLFWVDADLKRIESCDLSGANRLTLEDANIVQPLGLTILGK
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CCDS21 YFQCKTTK-------HCISKLWVCDEDPDCADASDEANCDKKTC-GPHEFQCKNNNCIPD
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pF1KB3 HLYW-IDRQQQMIERVEKTTGDKRTRIQGRVAHLTGIHAVEEVSLEEFSAHPCARDNGGC
       :  :  : :..  .  .. .   .:                  .:..:    ::  :: :
CCDS21 H--WRCDSQNDCSDNSDEENCKPQT-----------------CTLKDFL---CA--NGDC
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         :.. :    ::   :.        ..  .:    .:: ::: :..:.  :::. :.::
CCDS21 VSSRFWC----DGDFDCADG------SDERNC--ETSCSKDQFRCSNGQ--CIPAKWKCD
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pF1KB3 GFPECDDQSDEEGC----PVCSAAQFPCARGQCVDLRLRCDGEADCQDRSDEADCDAICL
       :  .:    ::..:    :.::. .. ::   :..  :.:.:: :: : ::: :: . : 
CCDS21 GHEDCKYGEDEKSCEPASPTCSSREYICASDGCISASLKCNGEYDCADGSDEMDCVTECK
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pF1KB3 PNQFRCAS-GQCVLIKQQCDSFPDCIDGSDELMCEITKPPSDDSPAHSSAIGPVIGIILS
        .:::: . ..:. :.  ::.. ::.:::::  ::                         
CCDS21 EDQFRCKNKAHCIPIRWLCDGIHDCVDGSDEENCERGGNICRADEFLCNNSLCKLHFWVC
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pF1KB3 LFVMGGVYFVCQRVVCQRYAGANGPFPHEYVSGTPHVPLNFIAPGGSQHGPFTGIACGKS
                                                                   
CCDS21 DGEDDCGDNSDEAPDMCVKFLCPSTRPHRCRNNRICLQSEQMCNGIDECGDNSDEDHCGG
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CCDS21 GTCSQTCRNTHGSYTCSCVEGYLMQPDNRSCKAKIEPTDRPPILLIANFETIEVFYLNGS
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pF1KB3 KLESTIVVSGLEDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEA--IKQTYLNQTGAAVQNVVISGLVS
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CCDS21 KMATLSSVNG-NEIHTLDFIYNEDMICWIESRESSNQLKCIQITKAGGLTDEWTINILQS
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pF1KB3 PDG---LACDWVGKKLYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMY
         .   .: ::. ..::..:   .:: : : ::.   .:.  .: .:.:::.::  : ..
CCDS21 FHNVQQMAIDWLTRNLYFVDHVGDRIFVCNSNGSVCVTLIDLELHNPKAIAVDPIAGKLF
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pF1KB3 WTDWGETPRIERAGMDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHRANLDG
       .::.:.. ..::  ::: .:  :.::    : .:..:: .. .::.:  :...  .. .:
CCDS21 FTDYGNVAKVERCDMDGMNRTRIIDSKTEQPAALALDLVNKLVYWVDLYLDYVGVVDYQG
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pF1KB3 SFRQKVVEG-SLTHPFALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSPMDIQ
       . :. :..: .. : ...:.  : :: :. .. .:   : : .:   . :  . .   :.
CCDS21 KNRHTVIQGRQVRHLYGITVFEDYLYATNSDNYNIVRIN-RFNGTDIHSLIKIENAWGIR
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pF1KB3 VLSQERQPFFHTR-CEEDN----GGCSHLCLLSPSEPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKAGA
       . ... ::  ... :: :     :::::.:::: :    :: : :: .: ..::.::   
CCDS21 IYQKRTQPTVRSHACEVDPYGMPGGCSHICLLSSSYKTRTCRCRTGFNLGSDGRSCKRPK
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pF1KB3 EEVLLL---ARRTDLRRISLDTPDFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAI
       .:..:.   .:   .: ..:.:    . .. .... .  :.:.    .:.:..:     :
CCDS21 NELFLFYGKGRPGIVRGMDLNTKIADEYMIPIENLVNPRALDFHAETNYIYFADTTSFLI
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pF1KB3 RRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDGIAVDWVARNLYWTDTGTDR-IEVTRLN--GTSRKILV
        :  .::.  .:... .... .::::::.. :::::. :  . :.:.::.  . ::: :.
CCDS21 GRQKIDGTERETILKDDLDNVEGIAVDWIGNNLYWTNDGHRKTINVARLEKASQSRKTLL
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pF1KB3 SEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGENP------KIECANLDGQERRVLVNASLGWPNGL
         ....::.:.. :: : :::::: :.       .:: : .:: .:...:.... :::::
CCDS21 EGEMSHPRGIVVDPVNGWMYWTDWEEDEIDDSVGRIEKAWMDGFNRQIFVTSKMLWPNGL
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pF1KB3 ALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTLLEDK-LPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRS
       .::.. . ::: ::  :.:: . ..::.:. .   . : : ::..  :....:::..  :
CCDS21 TLDFHTNTLYWCDAYYDHIEKVFLNGTHRKIVYSGRELNHPFGLSHHGNYVFWTDYMNGS
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pF1KB3 IERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVVGTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGC
       : ..  . .   ..  . : :.::.  .  :  : : :   ::::: ::.  : .  :.:
CCDS21 IFQLDLITSEVTLLRHERPPLFGLQIYDPRKQQGDNMCRVNNGGCSTLCLAIPGGRVCAC
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pF1KB3 PIGLELLSDMKTCIV-PEAFLVFTSRAAIHR------ISLETNNNDVAIPLTGVKEASAL
         .  :  .  ::   :   :    .:.  :      :. . . .     : :  : :. 
CCDS21 ADNQLLDENGTTCTFNPGEALPHICKAGEFRCKNRHCIQARWKCDGDDDCLDGSDEDSVN
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pF1KB3 DFDVS---------NNHIY---WT-----------DVSLKT------------------I
        :. :         ::.     :            : : .:                  :
CCDS21 CFNHSCPDDQFKCQNNRCIPKRWLCDGANDCGSNEDESNQTCTARTCQVDQFSCGNGRCI
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pF1KB3 SRAFMN------GSSVEHVV--EFGLDYPEGMAVDWMGKNLY--WA-----DTGTNRIEV
        ::..       :.......  ::    :  . :   :. .   :      : : .  ::
CCDS21 PRAWLCDREDDCGDQTDEMASCEFPTCEPLTQFVCKSGRCISSKWHCDSDDDCGDGSDEV
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pF1KB3 ----ARLDGQFR----QVLV--WR-DLDNPRSLALDPTK---------------GYIYWT
           . .:.:::    . .   :  : ::  .   : ..               :  .  
CCDS21 GCVHSCFDNQFRCSSGRCIPGHWACDGDNDCGDFSDEAQINCTKEEIHSPAGCNGNEFQC
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pF1KB3 EWGGK--PRIVRAFMDGT-NCMTLVDKVGRANDLTI-DYADQRLYWT-----------DL
       .  :.  : . :   ::  .:    :. :  . . . :.  .   :.           : 
CCDS21 HPDGNCVPDLWRC--DGEKDCEDGSDEKGCNGTIRLCDHKTKFSCWSTGRCINKAWVCDG
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pF1KB3 DTNMIESSN-------MLGQERVVIADDLP---HPFGLTQ-YSDYIYWTDWNLHSIERAD
       : .  ..:.       . :  .   :.:     .:  : .  .:    .: .    : . 
CCDS21 DIDCEDQSDEDDCDSFLCGPPKHPCANDTSVCLQPEKLCNGKKDCPDGSDEGYLCDECSL
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pF1KB3 KTSGRNR--TLIQGH---LDFVMDILVFHSSRQDGLNDCMHNNGQCGQLCLAIPGGHRCG
       ...: .   ... :.    .    . . ....   . :   :. .:.:.:       .:.
CCDS21 NNGGCSNHCSVVPGRGIVCSCPEGLQLNKDNKTCEIVDYCSNHLKCSQVCEQHKHTVKCS
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pF1KB3 CASHYTLDPSSRNCS---PPTTFLLFSQKSAISRMIPDDQHSPDLILPLHGLRNVKAIDY
       :   . :: ....:.   :  .:..:: .  : :.   : :. :  : . ::::. :.:.
CCDS21 CYEGWKLDVDGESCTSVDPFEAFIIFSIRHEIRRI---DLHKRDYSLLVPGLRNTIALDF
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pF1KB3 DPLDKFIYWVDGRQN-IKRAK--DDGTQPFVLTSLSQGQNPDRQPHDLSIDIYSRTLFWT
          ....::.:  .. : :.:  ..:    . . . .:      :. :..:  . ...: 
CCDS21 HFNQSLLYWTDVVEDRIYRGKLSESGGVSAIEVVVEHGLAT---PEGLTVDWIAGNIYWI
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pF1KB3 CEATNTINVHRLSGEAMGVVLRGDRDKPRAIVVNAERGYLYFTNMQDRAAKIERAALDGT
           . :.: .:.:    ... :  ..::::... . : :..:. .    .:: :...:.
CCDS21 DSNLDQIEVAKLDGSLRTTLIAGAMEHPRAIALDPRYGILFWTDWDANFPRIESASMSGA
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pF1KB3 EREVLFT---TGLIRPVALVVDNTLGKLFWVDADLKRIESCDLSGANRLTLEDAN--IVQ
        :....    ::   : .:.::.   .. :.::    : :   .:.: . .  ..  . .
CCDS21 GRKTIYKDMKTG-AWPNGLTVDHFEKRIVWTDARSDAIYSALYDGTNMIEIIRGHEYLSH
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pF1KB3 PLGLTILGKHLYWIDRQQQMIERVEKTTGDKRTRIQGRVAHLTGIHAVEEVSLEEFSAHP
       :..... :...:: : . . . ...: ::.. . ::   :.                   
CCDS21 PFAVSLYGSEVYWTDWRTNTLSKANKWTGQNVSVIQKTSAQPFDLQIYHPSRQPQAPNPC
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pF1KB3 CARDNGGCSHICIAKGDGTPRCSCPVHLVLLQNLLTCGEPPTCSPDQFACATGEIDCIPG
                                                                   
CCDS21 AANDGKGPCSHMCLINHNRSAACACPHLMKLSSDKKTCYEMKKFLLYARRSEIRGVDIDN
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>>CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs108|chr22             (252 aa)
 initn: 1298 init1: 1298 opt: 1298  Z-score: 960.2  bits: 187.9 E(32554): 3.7e-47
Smith-Waterman score: 1298; 84.3% identity (93.4% similar) in 229 aa overlap (383-611:1-229)

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pF1KB3 RRISLDTPDFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVN
                                     .::.:::::::: :::::::::::::::.:
CCDS33                               MEGHVYWTDDEVWAIRRAYLDGSGAQTLIN
                                             10        20        30

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pF1KB3 TEINDPDGIAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGL
       :.::::: :::.::::.:::: :::..:::: ::.::.:::::::.:::::::::: :::
CCDS33 TKINDPDDIAVNWVARSLYWTHTGTEHIEVTCLNSTSHKILVSEDMDEPRAIALHPEMGL
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pF1KB3 MYWTDWGENPKIECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINV
        :: ::::::.:. :::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:
CCDS33 TYWIDWGENPEIKRANLDRQELRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEAISV
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pF1KB3 DGTKRRTLLEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLK
       : :::.:::.::::::: ::::::::::: ::..::.:::::::.:::::::::::::::
CCDS33 DETKRQTLLKDKLPHIFRFTLLGDFIYWTAWQHHSIKRVHKVKANRDVIIDQLPDLMGLK
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pF1KB3 AVNVAKVVGTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSR
       :::: ::::::: ::::::                                         
CCDS33 AVNVDKVVGTNPHADRNGGAATCASSRPTQPGLAAPSRAWNC                  
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>>CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12                (4544 aa)
 initn: 1504 init1: 839 opt: 974  Z-score: 707.7  bits: 145.3 E(32554): 4.2e-33
Smith-Waterman score: 2298; 34.2% identity (64.2% similar) in 1225 aa overlap (281-1442:1522-2706)

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pF1KB3 YWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSPMDIQVLSQERQPFFHTRCEEDNGG---CS
                                     :.:.::    :::.  . ::  :::   ::
CCDS89 YWTDWRTNTLAKANKWTGHNVTVVQRTNTQPFDLQVYHPSRQPMAPNPCEA-NGGQGPCS
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pF1KB3 HLCLLSPSEPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKAGAEEVLLLARRTDLRRISLDTPDFTDIV-
       ::::.. ..   .::::  ..:. .. ::    .. :: ::. ..: ..::.: .. :. 
CCDS89 HLCLINYNRTV-SCACPHLMKLHKDNTTCYE-FKKFLLYARQMEIRGVDLDAPYYNYIIS
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pF1KB3 LQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDGIAVDWV
       . : :: .. ..:::  :  :::.: ...::.::...:.:..:.:.... .  :.:::::
CCDS89 FTVPDIDNVTVLDYDAREQRVYWSDVRTQAIKRAFINGTGVETVVSADLPNAHGLAVDWV
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pF1KB3 ARNLYWT--DTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGENPKI
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CCDS89 SRNLFWTSYDTNKKQINVARLDGSFKNAVV-QGLEQPHGLVVHPLRGKLYWTD-GDN--I
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pF1KB3 ECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTL--LE
         ::.::..: .: ... : : :::.:. :.:::: .. .  :.  :.::.  ...  ..
CCDS89 SMANMDGSNRTLLFSGQKG-PVGLAIDFPESKLYWISSGNHTINRCNLDGSGLEVIDAMR
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pF1KB3 DKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDL-MGLKAVNVAKVV-
       ..: .  .....:: ..:.:   ...    :. .: .:.. .   : : .:. . .  . 
CCDS89 SQLGKATALAIMGDKLWWADQVSEKMGTCSKADGSGSVVLRNSTTLVMHMKVYDESIQLD
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pF1KB3 --GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATR-CGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHR
         :::::.  :: ::.::. : ..:: : :  :  : : ...:    .::... . .:. 
CCDS89 HKGTNPCSVNNGDCSQLCLPTSETTRSCMCTAGYSLRSGQQACEGVGSFLLYSVHEGIRG
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pF1KB3 ISLETNN-NDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVVEFG
       : :. :. .:. .:..:.. : ..:: . :. :::.:..:.:::::  . .  : ::  :
CCDS89 IPLDPNDKSDALVPVSGTSLAVGIDFHAENDTIYWVDMGLSTISRAKRDQTWREDVVTNG
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       .   ::.::::.. :.::.: : . ::::::.:.:: :.. . ::.::.... : :::..
CCDS89 IGRVEGIAVDWIAGNIYWTDQGFDVIEVARLNGSFRYVVISQGLDKPRAITVHPEKGYLF
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CCDS89 WTEWGQYPRIERSRLDGTERVVLVNVSISWPNGISVDYQDGKLYWCDARTDKIERIDLET
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CCDS89 GENREVVLSSNNMDMFSVSVFEDFIYWSD-RTHANGSIKRGSKDNATDSVPLRTGIGVQL
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pF1KB3 -DILVFHSSRQDGLNDCMHNNGQCGQLCLAIPGGHR-CGCASHYTLDPSSRNCSPPTTFL
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CCDS89 KDIKVFNRDRQKGTNVCAVANGGCQQLCLYRGRGQRACACA-HGMLAEDGASCREYAGYL
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       :.:... .. . . :...    . :..    ..:: :. .:      :   . :.. : .
CCDS89 LYSERTILKSIHLSDERNLNAPVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPGTPNRIFFSDIH
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         ::.. .:::.. ....  . :.      :  . :    ::.::  .:.::. : ..  
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CCDS89 RPGAFERETVITMSGD-DHPRAFVLDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRAALSGANVLTLIEK
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pF1KB3 GLIRPVALVVDNTLGKLFWVDADLKRIESCDLSGANRLTLEDANIVQPLGLTILGKHLYW
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CCDS89 DIRTPNGLAIDHRAEKLYFSDATLDKIERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFW
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CCDS89 TDWVRRAVQRANKHVGSNMKLLRVDIPQQPMGIIAVANDTNSCELS--PCRINNGGCQDL
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CCDS89 CLLTHQGHVNCSCRGGRIL-QDDLTCRAVNSSCRAQDEFECANGE--CINFSLTCDGVPH
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CCDS89 CKDKSDEKPSYCNSRRCKKTFRQCSNGRCVSNMLWCNGADDCGDGSDEIPCNKTACGVGE
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CCDS89 FRCRDGTCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSAT-----DCSSY-----------FRLGVK
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CCDS89 GVLFQPCERTSLC--YAPSWVCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPRCPLNYFACPSGRCIPM
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>--
 initn: 1504 init1: 839 opt: 974  Z-score: 707.7  bits: 145.3 E(32554): 4.2e-33
Smith-Waterman score: 1223; 26.3% identity (51.2% similar) in 1431 aa overlap (25-1370:3021-4330)

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CCDS89 PCSQRCINTHGSYKCLCVEGYAPRGGDPHSCKAVTDEEPFLIFANRYYLRKLNLDGSNY-
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CCDS89 PDVPNHPCKVNNGGCSNLCLLSPGGG-HKCACPTNFYLGSDGRTCVSNCTASQFVCKNDK
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CCDS89 APNQFQCSITKRCIPRVWVCDRDNDC--VDGSDEPANCTQMTCGVDEFRCKD--SGRCIP
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pF1KB3 DVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVVGTNPCADRNGGCSH-LCFFTPHATRCGCPIGLELL--S
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CCDS89 DNDCGDNSD---------EESCTPRPCSESEFSCANGRCI----AGRWKCDGDHDCADGS
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pF1KB3 DMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISLETNNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVS
       : : :         : :  . ... ....    :::    .:.:  .: :...   : : 
CCDS89 DEKDC---------TPRCDMDQFQCKSGH---CIPLRWRCDADADCMDGSDEEACGTGVR
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pF1KB3 LKTISRAFMNGSSVEHVVEFGLDYPEGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARL----DGQF
          ...   :..         :  : .   :  :..    ..  :  : ::.    .  :
CCDS89 TCPLDEFQCNNT---------LCKPLAWKCD--GEDDCGDNSDENPEECARFVCPPNRPF
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pF1KB3 R----QVLVW--RDLDNPRSLALDPTKGYIYWTEWGGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDKVGR
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CCDS89 RCKNDRVCLWIGRQCDGTDNCG-DGTD------EEDCEPPTAHT----THCKDKKEFLCR
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pF1KB3 ANDLTIDYADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQERVVIADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNL
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CCDS89 ---------NQRCLSSSLRCNMFDDCGDGSDEEDCSID--PK---LTSCA-----TNASI
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pF1KB3 HSIE-RADKTSGRNRTLIQGHLDFVMDILVFHSSRQDGLNDCMHNNGQCGQLCLAIPGGH
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CCDS89 CGDEARCVRTEKAAYCACRSGFHTVPG----QPGCQD-INECLRF-GTCSQLCNNTKGGH
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pF1KB3 RCGCASHYTLDPSSRNCSPPTT---FLLFSQKSAISRMIPDDQHSPDLILPLHGLRNVK-
        :.:: ..    .  .:.   .    : ... . :  ..:   ::      ..: ..:. 
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CCDS89 GNDDCGDGSDEGELCDQCSLNNGGCSHNCSVAPGEGIVCSCPLGMELGPDNHTCQIQSYC
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CCDS89 AKHLKCSQKCDQNKFSVKCSCYEGWVLEPDGESCRSLDPFKPFIIFSNRHEIRRI---DL
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CCDS89 HKGDYSVLVPGLRNTIALDFHLSQSALYWTDVVEDKIYRGKLLDNGALTSFEVVIQYGLA
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CCDS89 T---PEGLAVDWIAGNIYWVESNLDQIEVAKLDGTLRTTLLAGDIEHPRAIALDPRDGIL
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CCDS89 FWTDWDASLPRIEAASMSGAGRRTVHRETGSGGWPNGLTVDYLEKRILWIDARSDAIYSA
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CCDS89 RYDGSGHMEVLRGHEFLSHPFAVTLYGGEVYWTDWRTNTLAKANKWTGHNVTVVQRTNTQ
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pF1KB3 LTGIHAVEEVSLEEFSAHPCARDNGGCSHICIAKGDGTPRCSCPVHLVLLQNLLTCGEPP
                                                                   
CCDS89 PFDLQVYHPSRQPMAPNPCEANGGQGPCSHLCLINYNRTVSCACPHLMKLHKDNTTCYEF
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>>CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2                 (4655 aa)
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                                     :   .   : :.:.::  .: .   :    
CCDS22 FVCSQKCENVIGSYICKCAPGYLREPDGKTCRQNSNIEPYLIFSNRYYLRNLTIDG--YF
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pF1KB3 STIVVSGLEDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEAIKQTYLNQTGAAVQNVVISGLVSPDGLA
        .... ::....:.::.  .  .:: :.....:.. .::.:.   ....   : . ..::
CCDS22 YSLILEGLDNVVALDFDRVEKRLYWIDTQRQVIERMFLNKTNK--ETIINHRLPAAESLA
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        :::..:::: :.. . . :..:::  :..:  .  :      .:.::..:: : .::.:
CCDS22 VDWVSRKLYWLDARLDGLFVSDLNGGHRRMLAQHCVDANNTFCFDNPRGLALHPQYGYLY
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pF1KB3 WTDWGETPRIERAGMDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHRANLDG
       :.:::.   : :.::::.....:... . ::::.:::  .. ::::::.:..:. ..:.:
CCDS22 WADWGHRAYIGRVGMDGTNKSVIISTKLEWPNGITIDYTNDLLYWADAHLGYIEYSDLEG
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pF1KB3 SFRQKVVEGSLTHPFALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSPMDIQV
         :. : .:.: ::::.:.  ::.:::::.::...  ::  :..:. .... . :.::.:
CCDS22 HHRHTVYDGALPHPFAITIFEDTIYWTDWNTRTVEKGNKYDGSNRQTLVNTTHRPFDIHV
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pF1KB3 LSQERQPFFHTRCEEDNGGCSHLCLLSPSEPFYTCACPTGVQ-LQDNGRT----------
           :::.  . :  .:::::::::..:.   .:: ::   . :: .: :          
CCDS22 YHPYRQPIVSNPCGTNNGGCSHLCLIKPGGKGFTCECPDDFRTLQLSGSTYCMPMCSSTQ
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pF1KB3 ---------------------CKAGAEEVLLLARR---------TD--------LRRISL
                            :. :..:. :  .:         .:        :     
CCDS22 FLCANNEKCIPIWWKCDGQKDCSDGSDELALCPQRFCRLGQFQCSDGNCTSPQTLCNAHQ
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pF1KB3 DTPD-----------------------------------FTDIVLQVD-DIRHAIA----
       . ::                                   :.:   . : :  :  .    
CCDS22 NCPDGSDEDRLLCENHHCDSNEWQCANKRCIPESWQCDTFNDCEDNSDEDSSHCASRTCR
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pF1KB3 -------------------IDYD-------PLE---GYVYWTDD--------EVRAIRR-
                          .: :       :.:   . ..  :.        . : : . 
CCDS22 PGQFRCANGRCIPQAWKCDVDNDCGDHSDEPIEECMSSAHLCDNFTEFSCKTNYRCIPKW
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pF1KB3 AYLDG----------SGAQTLVNTEIND---------P-----DG---------------
       :  .:          .: .  .   ..:         :     ::               
CCDS22 AVCNGVDDCRDNSDEQGCEERTCHPVGDFRCKNHHCIPLRWQCDGQNDCGDNSDEENCAP
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pF1KB3 ---------------IAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVT----------------------
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CCDS22 RECTESEFRCVNQQCIPSRWICD--HYNDCGDNSDERDCEMRTCHPEYFQCTSGHCVHSE
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pF1KB3 -RLNGTSRKILVSEDLDEP-RAIALHPVMGLMYWTD--------WGENPKIECANLDGQE
        . .:..  . .:.. : : :       .. :.           :  .   .:.. . .:
CCDS22 LKCDGSADCLDASDEADCPTRFPDGAYCQATMFECKNHVCIPPYWKCDGDDDCGDGSDEE
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pF1KB3 RRVLVNASLGWPNGLALD---------LQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTLLEDK
        .. ...  . :: .  :         . .:    ::.  .  :       :  :  : :
CCDS22 LHLCLDVPCNSPNRFRCDNNRCIYSHEVCNGVDDCGDGTDETEEHCRKPTPKPCTEYEYK
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pF1KB3 ------LPHIFGFTLLGDFIYWTDWQ--RRSIERV--HKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAV
             .::        :   :.:     .. ::.  ...  .  . ...   . .  : 
CCDS22 CGNGHCIPHDNVCDDADDCGDWSDELGCNKGKERTCAENICEQNCTQLNEGGFICSCTAG
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pF1KB3 NVAKVVGTNPCADRN-----GGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDM--KTCIVPEA--
         ..:   . : : :     : : . :  :  . .: :  :.  .::   : : .  .  
CCDS22 FETNVFDRTSCLDINECEQFGTCPQHCRNTKGSYECVCADGFTSMSDRPGKRCAAEGSSP
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pF1KB3 FLVFTSRAAIHRISLETNNNDVAIPLTGVKEASALDFD-----VSNNHIYWT----DVSL
       .:.. . . :.. .:  ...  .  :   .  .:.:.:     .. . .:.:       .
CCDS22 LLLLPDNVRIRKYNL--SSERFSEYLQDEEYIQAVDYDWDPKDIGLSVVYYTVRGEGSRF
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pF1KB3 KTISRAFM----NG-SSVEHVVEFGLDY---PEGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLD
        .:.::..    .: ... . :.. : :   :.:.::::.:...::.:. ..:::::.::
CCDS22 GAIKRAYIPNFESGRNNLVQEVDLKLKYVMQPDGIAVDWVGRHIYWSDVKNKRIEVAKLD
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pF1KB3 GQFRQVLVWRDLDNPRSLALDPTKGYIYWTEWGGKPRIVRAFMDGTNCMTLV-DKVGRAN
       :..:. :.  :::.: ..:..:  : ..::.:: .:.:  :.:.: .   :: . .:  .
CCDS22 GRYRKWLISTDLDQPAAIAVNPKLGLMFWTDWGKEPKIESAWMNGEDRNILVFEDLGWPT
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pF1KB3 DLTIDY-ADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQERVVIADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLH
        :.:::  ..:.::.:.  ..::. .. : .: ::: .  .:..:  . : .:: . .  
CCDS22 GLSIDYLNNDRIYWSDFKEDVIETIKYDGTDRRVIAKEAMNPYSLDIFEDQLYWISKEKG
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pF1KB3 SIERADK--TSGRNRTLIQGHLDFVMDILVFHSSRQDGL--NDCMHNNGQCGQLCLAIPG
        . . .:   . ...::. .   .. .. .::. : .    : : .    :..:::  ::
CCDS22 EVWKQNKFGQGKKEKTLVVN--PWLTQVRIFHQLRYNKSVPNLCKQI---CSHLCLLRPG
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pF1KB3 GHRCGCASHYT-LDPSSRNCSPPTTFLLFSQKSAISRMIPDDQHSPDLILPLHGLRNVKA
       :. :.: .  . .. :. .:                                        
CCDS22 GYSCACPQGSSFIEGSTTECDAAIELPINLPPPCRCMHGGNCYFDETDLPKCKCPSGYTG
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>>CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9                (873 aa)
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pF1KB3            MEAAPPGPPWPLLLLLLLLLALCGCPAPAAASPLLLFANRRDVRLVDAG
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CCDS64 ECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKA-VGKEPSLIFTNRRDIRKI--G
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pF1KB3 GVKLESTIVVSGLEDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEAIKQTYLN-QTGAAVQNVVISGLV
         . :   .:  :....:.: ...   ..:.:.:..:: .. .. ..:  :.  .:... 
CCDS64 LERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVK--MIDNVY
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pF1KB3 SPDGLACDWVGKKLYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMYWT
       .: ..: ::: : .::::. .. : ::.:.::.:: :: .:: .: .::.::  :..::.
CCDS64 NPAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWS
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pF1KB3 DWGETPRIERAGMDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHRANLDGSF
       ::::  .::.:::.:  :. .: .:: ::::.:.:: ...::: :.:: ..  ..:.:. 
CCDS64 DWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQD
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pF1KB3 RQKVVEGS--LTHPFALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSPMDIQV
       :. :...   :.::.:::.  : .:: : ....... :: ::..   ... : . .:: :
CCDS64 RRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIV
           640       650       660       670       680       690   

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pF1KB3 LSQERQPFFHTRCEED--NGGCSHLCLLSPS----EPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKAGA
         .  ::  .. ::::  :::: .::: .:.     : :::.::.: ....::: :.. :
CCDS64 YHELVQPSGKNWCEEDMENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQSTA
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pF1KB3 EEVLLLARR-TDLRRISLDT---PDFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRA
         :     . :.  .::  .   :   ...  :...                        
CCDS64 TTVTYSETKDTNTTEISATSGLVPGGINVTTAVSEVSVPPKGTSAAWAILPLLLLVMAAV
           760       770       780       790       800       810   

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pF1KB3 IRRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDGIAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSE
                                                                   
CCDS64 GGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
           820       830       840       850       860       870   

>>CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4                 (1165 aa)
 initn: 820 init1: 584 opt: 856  Z-score: 630.1  bits: 129.0 E(32554): 8.9e-29
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                                     :. .: .:.  .. .::....  .::.:. 
CCDS54 GNSTCVGPAPFLIFSHGNSIFRIDTEGTNYEQLVVDAGV--SVIMDFHYNEKRIYWVDLE
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pF1KB3 EEAIKQTYLNQTGAAVQNVVISGLVSPDGLACDWVGKKLYWTDSETNRIEVANLNGTSRK
       .. .....::   .. :. : .   . .:.: .:..... :.... . : :....:.. .
CCDS54 RQLLQRVFLN---GSRQERVCNIEKNVSGMAINWINEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNNSH
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       .:. . :  :  .:.::.. ...:..   .  . :: .::   : .....    .....:
CCDS54 ILL-SALKYPANVAVDPVERFIFWSSE-VAGSLYRADLDGVGVKALLETS-EKITAVSLD
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       . ...:.:     ... :.:   . ::.  .   . .  . ::..: :: .... :. ..
CCDS54 VLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHISKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKMKT
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       :   ::.::    .: : . . :. ...:.    ::                        
CCDS54 IWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHPLAQPKAEDDTWEPDVNECAFWNHGCTLG
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              .. :            ::..                                 
CCDS54 CKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPLCFCPEGSVLE
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pF1KB3 ------------DNGGCSHLCL-LSPSEPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKA-GAEEVLLLA
                   ::::::.::. :::    . : :  : .:: . ..: : : .  ::.:
CCDS54 RDGKTCSGCSSPDNGGCSQLCVPLSPVS--WECDCFPGYDLQLDEKSCAASGPQPFLLFA
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pF1KB3 RRTDLRRISLDTPDFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGA
          :.:.. .:  :.  .. :  ..  . :.:.::.:. .:..   .. :.:: .:::  
CCDS54 NSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQ--QMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERANMDGSQR
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pF1KB3 QTLVNTEINDPDGIAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALH
       . :..  .. :.:.::::..: .:::: : . :  . :::   ::...:....::.::.:
CCDS54 ERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQPRGIAVH
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pF1KB3 PVMGLMYWTDWGENPKIECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKI
       :.   ..::: : ::.:: ..:.:  : :.....: ::.:...:.   :::: ::: . :
CCDS54 PMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCDAKQSVI
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pF1KB3 EVINVDGTKRRTLLEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPD
       :. :.::.::: : .. . : :. ... :.....::   :. ::.: ....: .  :   
CCDS54 EMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVMRVNK-RTGKDRVRLQGSM
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pF1KB3 LMGLKAVNVAKVV--GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEA
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CCDS54 LKPSSLVVVHPLAKPGADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTCLALDG
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pF1KB3 FLVFTSRAAIHRISLETNNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMN
                                                                   
CCDS54 HQLLAGGEVDLKNQVTPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGCSMYAR
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>>CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4                 (1166 aa)
 initn: 812 init1: 584 opt: 856  Z-score: 630.1  bits: 129.0 E(32554): 8.9e-29
Smith-Waterman score: 860; 26.7% identity (54.2% similar) in 670 aa overlap (112-641:120-781)

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pF1KB3 VSEEAIKQTYLNQTGAAVQNVVISGLVSPDGLACDWVGKKLYWTDSETNRIEVANLNGTS
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CCDS54 WVDLERQLLQRVFLNGSRQERVCNIEKNVSGMAINWINEEVIWSNQQEGIITVTDMKGNN
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pF1KB3 RKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMYWTDWGETPRIERAGMDGSTRKIIVDSDIYWPNGLT
        ..:. . :  :  .:.::.. ...:..   .  . :: .::   : .....    ....
CCDS54 SHILL-SALKYPANVAVDPVERFIFWSSE-VAGSLYRADLDGVGVKALLETS-EKITAVS
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pF1KB3 IDLEEQKLYWA----DAKLSFIHRANLDGSFRQKVVEGSLTHPFALTLSGDTLYWTDWQT
       .:. ...:.:     ... :.:   . ::.  .   . .  . ::..: :: .... :. 
CCDS54 LDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVHISKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTWKM
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pF1KB3 RSIHACNKRTG---------------GK--------------------------RKEILS
       ..:   ::.::               :.                          ::   :
CCDS54 KTIWIANKHTGKDMVRINLHSSFVPLGELKVVHPLAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCS
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pF1KB3 ALYSPMDIQ----------VLSQERQ----------------------P--FFHT-----
       .    .:.:          .::..:.                      :  .. :     
CCDS54 STVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYCEDVNECAFWNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGF
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pF1KB3 -------RCEE---------------------------------------------DNGG
              ::..                                             ::::
CCDS54 VLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPLCFCPEGSVLERDGKTCSGCSSPDNGG
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       ::.::. :::    . : :  : .:: . ..: : : .  ::.:   :.:.. .:  :. 
CCDS54 CSQLCVPLSPVS--WECDCFPGYDLQLDEKSCAASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYG
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pF1KB3 DIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDGIAV
        .. :  ..  . :.:.::.:. .:..   .. :.:: .:::  . :..  .. :.:.::
CCDS54 TLLSQ--QMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERANMDGSQRERLIEEGVDVPEGLAV
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pF1KB3 DWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGENPK
       ::..: .:::: : . :  . :::   ::...:....::.::.::.   ..::: : ::.
CCDS54 DWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQPRGIAVHPMAKRLFWTDTGINPR
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pF1KB3 IECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTLLED
       :: ..:.:  : :.....: ::.:...:.   :::: ::: . ::. :.::.::: : ..
CCDS54 IESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCDAKQSVIEMANLDGSKRRRLTQN
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CCDS54 DVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVMRVNK-RTGKDRVRLQGSMLKPSSLVVVHPLAKPG
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pF1KB3 TNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISLE
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CCDS54 ADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTCLALDGHQLLAGGEVDLKNQVT
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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