FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1174, 635 aa 1>>>pF1KE1174 635 - 635 aa - 635 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9629+/-0.000405; mu= 2.6600+/- 0.025 mean_var=292.0377+/-59.559, 0's: 0 Z-trim(121.2): 315 B-trim: 66 in 1/57 Lambda= 0.075051 statistics sampled from 36939 (37386) to 36939 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16 Scan time: 12.120 The best scores are: opt bits E(85289) XP_005274296 (OMIM: 612810) PREDICTED: leucine-ric ( 635) 4318 481.6 3.6e-135 NP_076941 (OMIM: 612810) leucine-rich repeat and f ( 635) 4318 481.6 3.6e-135 XP_016876537 (OMIM: 612811) PREDICTED: leucine-ric ( 719) 1961 226.5 2.6e-58 NP_689660 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and f ( 719) 1961 226.5 2.6e-58 NP_001333102 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 719) 1961 226.5 2.6e-58 XP_005259159 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-ric ( 771) 1897 219.6 3.3e-56 XP_016882522 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-ric ( 771) 1897 219.6 3.3e-56 NP_065913 (OMIM: 612807) leucine-rich repeat and f ( 771) 1897 219.6 3.3e-56 NP_001317035 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466) 1657 193.4 1.6e-48 NP_001333104 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466) 1657 193.4 1.6e-48 XP_016866600 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 467) 1641 191.6 5.2e-48 XP_011513064 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 1642 192.0 6.9e-48 XP_011513063 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 1642 192.0 6.9e-48 NP_065788 (OMIM: 612808) leucine-rich repeat and f ( 789) 1642 192.0 6.9e-48 XP_016866599 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 1642 192.0 6.9e-48 XP_016882791 (OMIM: 612809) PREDICTED: leucine-ric ( 628) 1500 176.5 2.5e-43 NP_078785 (OMIM: 612809) leucine-rich repeat and f ( 628) 1500 176.5 2.5e-43 XP_005271426 (OMIM: 608869,615112) PREDICTED: leuc ( 958) 406 58.2 1.5e-07 XP_011515761 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin ( 757) 396 57.1 2.7e-07 NP_653252 (OMIM: 615904) peroxidasin-like protein (1463) 396 57.4 4.3e-07 XP_016877935 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 468) 370 54.0 1.4e-06 XP_011520142 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 370 54.2 1.9e-06 NP_065902 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfamil ( 745) 370 54.2 1.9e-06 NP_001123610 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 370 54.2 1.9e-06 NP_001123608 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 370 54.2 1.9e-06 NP_001123609 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 370 54.2 1.9e-06 XP_011520143 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 370 54.2 1.9e-06 XP_011515759 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 366 54.1 4e-06 NP_612449 (OMIM: 608843) vasorin precursor [Homo s ( 673) 351 52.1 7.4e-06 XP_016869792 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06 XP_016869795 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06 NP_001245211 (OMIM: 609793) leucine-rich repeat an ( 606) 348 51.8 8.7e-06 XP_016869794 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06 XP_011516021 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06 XP_011516026 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06 XP_011516030 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06 NP_689783 (OMIM: 609793) leucine-rich repeat and i ( 606) 348 51.8 8.7e-06 XP_016869793 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06 XP_016869796 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06 XP_011515758 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 352 52.6 1.1e-05 NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 326 49.6 6.2e-05 XP_016864013 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 361) 307 47.1 0.00013 XP_016864006 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 759) 313 48.1 0.00014 XP_011530477 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 760) 313 48.1 0.00014 NP_001004432 (OMIM: 609794) leucine-rich repeat an ( 593) 308 47.4 0.00017 NP_004961 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growt ( 605) 308 47.4 0.00017 NP_001139478 (OMIM: 601489,615961) insulin-like gr ( 643) 308 47.4 0.00018 XP_011515760 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1328) 313 48.3 0.0002 XP_016868530 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1328) 313 48.3 0.0002 XP_011530478 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 733) 307 47.4 0.00021 >>XP_005274296 (OMIM: 612810) PREDICTED: leucine-rich re (635 aa) initn: 4318 init1: 4318 opt: 4318 Z-score: 2547.8 bits: 481.6 E(85289): 3.6e-135 Smith-Waterman score: 4318; 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51.7% identity (78.8% similar) in 571 aa overlap (5-562:8-575) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLAD :.:. .: : :: :::: :: .:.::::..::::::::.::::::::::: XP_016 MEKILFYLFLIGIAVKAQICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLAD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 NFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLR ::. . :: :::.:::::::::.:. : .::.::..::.:::..:::... . . XP_016 NFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 GPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLD : ::.::::..::: :. :::: . .::.::::::::. .:: .. : .::::.:: XP_016 GLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDDVF-ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 HNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGR----DAEASPAPLVLSFSG ::.:: .: :.:..: ...:::.:::.: : :::::.:.. .. ::. ..:::.: XP_016 HNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 NPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVL :::::::::::::::.: :::::::::: :.:::::..:: :: ::::::.:::... :: XP_016 NPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 EGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIA :::::::::.: ::: :..::..:. .:..:..:. .. ::::.: .: . :.:..:::: XP_016 EGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 TNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASART-----AAEGEGTLESE .::::::: :.:... ::: ::. . .: : :::..:... ...:. : :. XP_016 SNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKL-SQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVP . :.:.:....:.... : . :::::::.. :.::.::..: .:. ::...:. XP_016 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNNLAA 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE1 GADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVL :. ::::.::. : ..:::::..:: .:.: :: .:.. ::::. . .::.. XP_016 GTMYDLCVLAIYDD-GITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGGII 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE1 VAALLVFTVALLVRGR-GAGNGRLPL-KLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSC ::..::: . :..: . .::. . :.:.: ::::: XP_016 VASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTKVSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAVGHE 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 pF1KE1 SLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV XP_016 ENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTEPQN 600 610 620 630 640 650 >>NP_689660 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fibro (719 aa) initn: 1926 init1: 764 opt: 1961 Z-score: 1167.9 bits: 226.5 E(85289): 2.6e-58 Smith-Waterman score: 1961; 51.7% identity (78.8% similar) in 571 aa overlap (5-562:8-575) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLAD :.:. .: : :: :::: :: .:.::::..::::::::.::::::::::: NP_689 MEKILFYLFLIGIAVKAQICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLAD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 NFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLR ::. . :: :::.:::::::::.:. : .::.::..::.:::..:::... . . NP_689 NFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 GPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLD : ::.::::..::: :. :::: . .::.::::::::. .:: .. : .::::.:: NP_689 GLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDDVF-ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 HNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGR----DAEASPAPLVLSFSG ::.:: .: :.:..: ...:::.:::.: : :::::.:.. .. ::. ..:::.: NP_689 HNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 NPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVL :::::::::::::::.: :::::::::: :.:::::..:: :: ::::::.:::... :: NP_689 NPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 EGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIA :::::::::.: ::: :..::..:. .:..:..:. .. ::::.: .: . :.:..:::: NP_689 EGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 TNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASART-----AAEGEGTLESE .::::::: :.:... ::: ::. . .: : :::..:... ...:. : :. NP_689 SNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKL-SQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVP . :.:.:....:.... : . :::::::.. :.::.::..: .:. ::...:. NP_689 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNNLAA 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE1 GADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVL :. ::::.::. : ..:::::..:: .:.: :: .:.. ::::. . .::.. NP_689 GTMYDLCVLAIYDD-GITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGGII 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE1 VAALLVFTVALLVRGR-GAGNGRLPL-KLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSC ::..::: . :..: . .::. . :.:.: ::::: NP_689 VASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTKVSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAVGHE 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 pF1KE1 SLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV NP_689 ENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTEPQN 600 610 620 630 640 650 >>NP_001333102 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fi (719 aa) initn: 1926 init1: 764 opt: 1961 Z-score: 1167.9 bits: 226.5 E(85289): 2.6e-58 Smith-Waterman score: 1961; 51.7% identity (78.8% similar) in 571 aa overlap (5-562:8-575) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLAD :.:. .: : :: :::: :: .:.::::..::::::::.::::::::::: NP_001 MEKILFYLFLIGIAVKAQICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLAD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 NFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLR ::. . :: :::.:::::::::.:. : .::.::..::.:::..:::... . . NP_001 NFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 GPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLD : ::.::::..::: :. :::: . .::.::::::::. .:: .. : .::::.:: NP_001 GLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDDVF-ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 HNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGR----DAEASPAPLVLSFSG ::.:: .: :.:..: ...:::.:::.: : :::::.:.. .. ::. ..:::.: NP_001 HNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 NPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVL :::::::::::::::.: :::::::::: :.:::::..:: :: ::::::.:::... :: NP_001 NPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 EGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIA :::::::::.: ::: :..::..:. .:..:..:. .. ::::.: .: . :.:..:::: NP_001 EGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 TNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASART-----AAEGEGTLESE .::::::: :.:... ::: ::. . .: : :::..:... ...:. : :. NP_001 SNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKL-SQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVP . :.:.:....:.... : . :::::::.. :.::.::..: .:. ::...:. NP_001 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNNLAA 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE1 GADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVL :. ::::.::. : ..:::::..:: .:.: :: .:.. ::::. . .::.. NP_001 GTMYDLCVLAIYDD-GITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGGII 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE1 VAALLVFTVALLVRGR-GAGNGRLPL-KLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSC ::..::: . :..: . .::. . :.:.: ::::: NP_001 VASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTKVSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAVGHE 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 pF1KE1 SLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV NP_001 ENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTEPQN 600 610 620 630 640 650 >>XP_005259159 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-rich re (771 aa) initn: 1349 init1: 798 opt: 1897 Z-score: 1130.1 bits: 219.6 E(85289): 3.3e-56 Smith-Waterman score: 1933; 52.1% identity (74.6% similar) in 591 aa overlap (2-576:17-600) 10 20 30 40 pF1KE1 MAPPLLLLLLA--SGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVP : :.:::: : : . :: :.:::.. .:. :::. :::::: XP_005 MAPGPFSSALLSPPPAALPFLLLLWAGASRGQPCPGRCICQNVAPTLTMLCAKTGLLFVP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 PNVDRRTVELRLADNFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHL : .:::.:::::.:::: :. :: :::.:: ::::::.: ...: ::.::..::.::: XP_005 PAIDRRVVELRLTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTIGQVAAGAFADLRALRALHL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DGNRLVELGTGSLRGPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWA :.:::.:. .::: ::.::::..::. :. .::: :: ..::::::::::. .:: XP_005 DSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDAFLSTVEDLDLSYNNLEALPWE 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 GIGAMPALHTLNLDHNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDA-EA ..: : :.::.::::::: . :.:.:: .: :::.::::: : :: :: :.. . 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XP_016 AVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNRLHKLPPDGLFLRSQGTGPK 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 SPAPLVLSFSGNPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPL :.::..::.::::::::::::::::.: :::::::.: :. ::::..:: :: ::::: XP_016 PPTPLTVSFGGNPLHCNCELLWLRRLTREDDLETCATPEHLTDRYFWSIPEEEFLCEPPL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 IARHTQ-RLWVLEGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVT :.:.. : :.::: ..:::::.::: :..:::.:: ::.:::::.:. .:::.. .: XP_016 ITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVGDPEPVVHWVAPDGRLLGNSSRTRVRGDGTLDVTIT 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 pF1KE1 GAGDAGGYTCIATNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGG---RPGPSDIAASARTAAE :.: .::::.: :::::: ::. :. :: . : .:: ::::. .: .:. XP_016 TLRDSGTFTCIASNAAGEATAPVEVCVVPLPLMAPPPAAPPPLTEPGSSDIATPGRPGAN 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 GEGTLESEPAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHH . .: . ..:.:..: :. : ::. . :.:.::::: :..:.::..:..:. 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XP_016 FLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDD-GATALPATRVVGCVQFTTAGDPAPCRPLRAHFLGGTM 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 pF1KE1 TVAVGGVLVAALLVFTVALLVRGR--GAGNGR-------LPLKLSHVQSQTNGGPSPTPK .:.:::.::..::: : :..: . : :..: :: ..::: ::::: . : XP_016 IIAIGGVIVASVLVFIVLLMIRYKVYGDGDSRRVKGSRSLP-RVSHVCSQTNG--AGTGA 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 AHPPRSPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAER :. : : XP_016 AQAPALPAQDHYEALREVESQAAPAVAVEAKAMEAETASAEPEVVLGRSLGGSATSLCLL 600 610 620 630 640 650 >>NP_065913 (OMIM: 612807) leucine-rich repeat and fibro (771 aa) initn: 1349 init1: 798 opt: 1897 Z-score: 1130.1 bits: 219.6 E(85289): 3.3e-56 Smith-Waterman score: 1933; 52.1% identity (74.6% similar) in 591 aa overlap (2-576:17-600) 10 20 30 40 pF1KE1 MAPPLLLLLLA--SGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVP : :.:::: : : . :: :.:::.. .:. :::. :::::: NP_065 MAPGPFSSALLSPPPAALPFLLLLWAGASRGQPCPGRCICQNVAPTLTMLCAKTGLLFVP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 PNVDRRTVELRLADNFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHL : .:::.:::::.:::: :. :: :::.:: ::::::.: ...: ::.::..::.::: NP_065 PAIDRRVVELRLTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTIGQVAAGAFADLRALRALHL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DGNRLVELGTGSLRGPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWA :.:::.:. .::: ::.::::..::. :. .::: :: ..::::::::::. .:: NP_065 DSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDAFLSTVEDLDLSYNNLEALPWE 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 GIGAMPALHTLNLDHNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDA-EA ..: : :.::.::::::: . :.:.:: .: :::.::::: : :: :: :.. . 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