FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6488, 559 aa 1>>>pF1KE6488 559 - 559 aa - 559 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5333+/-0.000996; mu= 17.1994+/- 0.060 mean_var=65.8383+/-13.466, 0's: 0 Z-trim(103.8): 24 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.158065 statistics sampled from 7575 (7593) to 7575 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16 Scan time: 2.020 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7958.1 SLC43A1 gene_id:8501|Hs108|chr11 ( 559) 3712 855.8 0 CCDS67108.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 ( 573) 1879 437.8 1.7e-122 CCDS11006.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 ( 569) 1867 435.0 1.1e-121 CCDS67107.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 ( 432) 1328 312.1 9e-85 CCDS7956.1 SLC43A3 gene_id:29015|Hs108|chr11 ( 491) 295 76.5 8.2e-14 CCDS60784.1 SLC43A3 gene_id:29015|Hs108|chr11 ( 504) 295 76.5 8.4e-14 >>CCDS7958.1 SLC43A1 gene_id:8501|Hs108|chr11 (559 aa) initn: 3712 init1: 3712 opt: 3712 Z-score: 4571.8 bits: 855.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3712; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPAESSTNTTQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPAESSTNTTQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 DEQRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRLVGSACFTASCTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 DEQRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRLVGSACFTASCTL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 MALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLMALMIGSYASSAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 MALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLMALMIGSYASSAI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 TFPGIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEVNYTKKIKLSGLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 TFPGIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEVNYTKKIKLSGLA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 LDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLSQKAPSLEDGSDAFMSPQDVRGTSENLPERSVPLRKSLC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 LDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLSQKAPSLEDGSDAFMSPQDVRGTSENLPERSVPLRKSLC 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 SPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQEHETNEQQQKVAETVGFYSSVFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 SPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQEHETNEQQQKVAETVGFYSSVFG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 AMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDARDGVATKSIRPRYCKIQKLTNAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 AMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDARDGVATKSIRPRYCKIQKLTNAI 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 SAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGFFHSACGSLYAAVFPSNHFGTLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 SAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGFFHSACGSLYAAVFPSNHFGTLT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 GLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLLFSLLGFLLPSYLFYYRARLQQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 GLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLLFSLLGFLLPSYLFYYRARLQQE 490 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 YAANGMGPLKVLSGSEVTA ::::::::::::::::::: CCDS79 YAANGMGPLKVLSGSEVTA 550 >>CCDS67108.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 (573 aa) initn: 1960 init1: 1067 opt: 1879 Z-score: 2312.6 bits: 437.8 E(32554): 1.7e-122 Smith-Waterman score: 2143; 59.4% identity (81.1% similar) in 562 aa overlap (1-540:1-549) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPA-ESSTNTT ::::: :.:::::::::::::::.:::::::::::::.::.::::: : :. :: : CCDS67 MAPTLATAHRRRWWMACTAVLENLLFSAVLLGWGSLLIMLKSEGFYSYLCTEPENVTNGT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE6 --------QDE---QRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRL ..: . : .:. :::::::.::.:::.::: ::::::.::..::: .:: CCDS67 VGGTAEPGHEEVSWMNGWLSCQAQDEMLNLAFTVGSFLLSAITLPLGIVMDKYGPRKLRL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 VGSACFTASCTLMALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLM .:::::..:: :.: .. .::: :::.::.::::::.:.::::::::::::.::::.. CCDS67 LGSACFAVSCLLIAYGASKPNALSVLIFIALALNGFGGMCMTFTSLTLPNMFGDLRSTFI 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 ALMIGSYASSAITFPGIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEV :::::::::::.:::::::::::::.:.:.. .:.: . :.:::: .:::.: ::.::.. CCDS67 ALMIGSYASSAVTFPGIKLIYDAGVSFIVVLVVWAGCSGLVFLNCFFNWPLEPFPGPEDM 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 NYTKKIKLSGLALDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLS--------QKAPSLEDGSDAFMSPQD .:. :::.: :..:::.:: :: .:::.:.::: .. .:..: .: : CCDS67 DYSVKIKFSWLGFDHKITGKQFYKQVTTVGRRLSVGSSMRSAKEQVALQEGHKLCLSTVD 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE6 VRGTSENLPERSV-P-LRKSLCSPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQE .. . :. .: : . .:. :: .: ::.:: .::::.::::.:.:..:..::.: CCDS67 LEVKCQ--PDAAVAPSFMHSVFSPILLLSLVTMCVTQLRLIFYMGAMNNILKFLVSG--- 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 HETNEQQQKVAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDAR .:. : :::.:.:.::..::::::: :.::::::::.:.: :: .. :: CCDS67 -----DQKTVMATVGLYTSIFGVLQLLCLLTAPVIGYIMDWRLKECEDA-SEEPEEKDAN 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 DGVATKSIRPRYCKIQKLTNAISAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGF .: :. : : .:::.:::. ::..:::::::::.:::: :: ::...:.:::::::: CCDS67 QGEKKKKKRDR--QIQKITNAMRAFAFTNLLLVGFGVTCLIPNLPLQILSFILHTIVRGF 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 FHSACGSLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLL .::: :.:::::.::..::.::::::::::.:::::::::.::.:::.:.:.:::.:::: CCDS67 IHSAVGGLYAAVYPSTQFGSLTGLQSLISALFALLQQPLFLAMMGPLQGDPLWVNVGLLL 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 pF1KE6 FSLLGFLLPSYLFYYRARLQQEYAANGMGPLKVLSGSEVTA .::::: :: ::. :: .:... CCDS67 LSLLGFCLPLYLICYRRQLERQLQQRQEDDKLFLKINGSSNQEAFV 530 540 550 560 570 >>CCDS11006.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 (569 aa) initn: 2026 init1: 938 opt: 1867 Z-score: 2297.8 bits: 435.0 E(32554): 1.1e-121 Smith-Waterman score: 2131; 59.3% identity (80.8% similar) in 562 aa overlap (1-540:1-545) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPA-ESSTNTT ::::: :.:::::::::::::::.:::::::::::::.::.::::: : :. :: : CCDS11 MAPTLATAHRRRWWMACTAVLENLLFSAVLLGWGSLLIMLKSEGFYSYLCTEPENVTNGT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE6 --------QDE---QRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRL ..: . : .:. :::::::.::.:::.::: ::::::.::..::: .:: CCDS11 VGGTAEPGHEEVSWMNGWLSCQAQDEMLNLAFTVGSFLLSAITLPLGIVMDKYGPRKLRL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 VGSACFTASCTLMALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLM .:::::..:: :.: .. .::: :::.::.::::::.:.::::::::::::.::::.. CCDS11 LGSACFAVSCLLIAYGASKPNALSVLIFIALALNGFGGMCMTFTSLTLPNMFGDLRSTFI 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 ALMIGSYASSAITFPGIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEV :::::::::::.:::::::::::::.:.:.. .:.: . :.:::: .:::.: ::.::.. CCDS11 ALMIGSYASSAVTFPGIKLIYDAGVSFIVVLVVWAGCSGLVFLNCFFNWPLEPFPGPEDM 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 NYTKKIKLSGLALDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLS--------QKAPSLEDGSDAFMSPQD .:. :::.: :..:::.:: :: .:::.:.::: .. .:..: .: : CCDS11 DYSVKIKFSWLGFDHKITGKQFYKQVTTVGRRLSVGSSMRSAKEQVALQEGHKLCLSTVD 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE6 VRGTSENLPERSV-P-LRKSLCSPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQE .. . :. .: : . .:. :: .: ::.:: .::::.::::.:.:..:..::.: :. CCDS11 LEVKCQ--PDAAVAPSFMHSVFSPILLLSLVTMCVTQLRLIFYMGAMNNILKFLVSGDQK 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 HETNEQQQKVAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDAR :::.:.:.::..::::::: :.::::::::.:.: :: .. :: CCDS11 ------------TVGLYTSIFGVLQLLCLLTAPVIGYIMDWRLKECEDA-SEEPEEKDAN 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 DGVATKSIRPRYCKIQKLTNAISAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGF .: :. : : .:::.:::. ::..:::::::::.:::: :: ::...:.:::::::: CCDS11 QGEKKKKKRDR--QIQKITNAMRAFAFTNLLLVGFGVTCLIPNLPLQILSFILHTIVRGF 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 FHSACGSLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLL .::: :.:::::.::..::.::::::::::.:::::::::.::.:::.:.:.:::.:::: CCDS11 IHSAVGGLYAAVYPSTQFGSLTGLQSLISALFALLQQPLFLAMMGPLQGDPLWVNVGLLL 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 pF1KE6 FSLLGFLLPSYLFYYRARLQQEYAANGMGPLKVLSGSEVTA .::::: :: ::. :: .:... CCDS11 LSLLGFCLPLYLICYRRQLERQLQQRQEDDKLFLKINGSSNQEAFV 530 540 550 560 >>CCDS67107.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 (432 aa) initn: 1324 init1: 626 opt: 1328 Z-score: 1635.4 bits: 312.1 E(32554): 9e-85 Smith-Waterman score: 1446; 57.2% identity (80.8% similar) in 395 aa overlap (156-540:31-408) 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 RDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLMALMIGSYASSAITFPGI ::::::.::::..:::::::::::.::::: CCDS67 MTYGSPQANASPSDAVALDHGEVSRRQQQELPNMFGDLRSTFIALMIGSYASSAVTFPGI 10 20 30 40 50 60 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 KLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEVNYTKKIKLSGLALDHKV ::::::::.:.:.. .:.: . :.:::: .:::.: ::.::...:. :::.: :..:::. CCDS67 KLIYDAGVSFIVVLVVWAGCSGLVFLNCFFNWPLEPFPGPEDMDYSVKIKFSWLGFDHKI 70 80 90 100 110 120 250 260 270 280 290 pF1KE6 TGDLFYTHVTTMGQRLS--------QKAPSLEDGSDAFMSPQDVRGTSENLPERSV-P-L :: :: .:::.:.::: .. .:..: .: :.. . :. .: : . CCDS67 TGKQFYKQVTTVGRRLSVGSSMRSAKEQVALQEGHKLCLSTVDLEVKCQ--PDAAVAPSF 130 140 150 160 170 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 RKSLCSPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQEHETNEQQQKVAETVGFY .:. :: .: ::.:: .::::.::::.:.:..:..::.: :. :::.: CCDS67 MHSVFSPILLLSLVTMCVTQLRLIFYMGAMNNILKFLVSGDQK------------TVGLY 180 190 200 210 220 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 SSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDARDGVATKSIRPRYCKIQK .:.::..::::::: :.::::::::.:.: :: .. :: .: :. : : .::: CCDS67 TSIFGVLQLLCLLTAPVIGYIMDWRLKECEDA-SEEPEEKDANQGEKKKKKRDR--QIQK 230 240 250 260 270 280 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 LTNAISAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGFFHSACGSLYAAVFPSNH .:::. ::..:::::::::.:::: :: ::...:.::::::::.::: :.:::::.::.. CCDS67 ITNAMRAFAFTNLLLVGFGVTCLIPNLPLQILSFILHTIVRGFIHSAVGGLYAAVYPSTQ 290 300 310 320 330 340 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 FGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLLFSLLGFLLPSYLFYYRA ::.::::::::::.:::::::::.::.:::.:.:.:::.::::.::::: :: ::. :: CCDS67 FGSLTGLQSLISALFALLQQPLFLAMMGPLQGDPLWVNVGLLLLSLLGFCLPLYLICYRR 350 360 370 380 390 400 540 550 pF1KE6 RLQQEYAANGMGPLKVLSGSEVTA .:... CCDS67 QLERQLQQRQEDDKLFLKINGSSNQEAFV 410 420 430 >>CCDS7956.1 SLC43A3 gene_id:29015|Hs108|chr11 (491 aa) initn: 513 init1: 271 opt: 295 Z-score: 361.5 bits: 76.5 E(32554): 8.2e-14 Smith-Waterman score: 660; 29.1% identity (58.5% similar) in 530 aa overlap (18-540:15-485) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPAESSTNTTQ :..:: : :..::.:: ::....::: .... : ... . CCDS79 MAGQGLPLHVATLLTGLLECLGFAGVLFGWPSLVFVFKNEDYFKDLCGPDAGPIGNA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 DEQRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRLVGSACFTASCTL : : ::: ..: ::.:::. . :.: : ..::: .::.. .:.. . CCDS79 TGQ---ADCKAQDERFSLIFTLGSFMNNFMTFPTGYIFDRFKTTVARLIAIFFYTTATLI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 MALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLMALMIGSYASSAI .:..: .: .:::. . .::: . .:.: . :.::. :::...:. :.. ::. CCDS79 IAFTSAGSAVL---LFLAMPMLTIGGILFLITNLQIGNLFGQHRSTIITLYNGAFDSSSA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE6 TFPGIKLIYDAGVA------FVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEVNYTKKI .: :::.:. :.. :. . :: .... : .: : ::. CCDS79 VFLIIKLLYEKGISLRASFIFISVCSTWHVARTFLLM------PRGHIPYPLPPNYSY-- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 KLSGLALDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLSQKAPSLEDGSDAFMSPQD-VRGTSENLPERSV :: :. :: .. . . . : : :.: .. . :.... :: CCDS79 ---GLC-----PGN-----GTTKEEKETAEHENRELQSKEFLSAKEETPGAGQKQELRS- 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 PLRKSLCSPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQEHETNEQQQKVAETVG . . : : : :. ... :: ......:..: .. : . . :. CCDS79 -FWSYAFSRRFAWHLVWLSVIQLWHYLFIGTLNSLLTNMAGGDMAR------------VS 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 FYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDARDGVATKSIRPRYCKI :...:. :. .: : : .:: :.:. . .. : :.. .:: CCDS79 TYTNAFAFTQF-GVLCAPWNGLLMD-RLKQKYQKEARKT--GSSTLAVA----------- 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 QKLTNAISAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGFFHSACGSLYAAVFPS : ... ...::.:: .::.. . : ::..::.:..: :.:.... ... . .::: CCDS79 --LCSTVPSLALTSLLCLGFALCASVPILPLQYLTFILQVISRSFLYGSNAAFLTLAFPS 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 NHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLLFSLLGFLLPSYLFYY .::: : :: .::: .::: :.: . : :...::.::. ..: :: :. : .: : CCDS79 EHFGKLFGLVMALSAVVSLLQFPIFTLIKGSLQNDPFYVNVMFMLAILLTFFHP-FLVYR 420 430 440 450 460 470 540 550 pF1KE6 RARLQQEYAANGMGPLKVLSGSEVTA . : .: CCDS79 ECRTWKESPSAIA 480 490 >>CCDS60784.1 SLC43A3 gene_id:29015|Hs108|chr11 (504 aa) initn: 524 init1: 271 opt: 295 Z-score: 361.3 bits: 76.5 E(32554): 8.4e-14 Smith-Waterman score: 660; 29.1% identity (58.1% similar) in 540 aa overlap (18-540:15-498) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPAESST--NT :..:: : :..::.:: ::....::: .... : ... :. 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