FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7609, 300 aa 1>>>pF1KB7609 300 - 300 aa - 300 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5945+/-0.000819; mu= 13.9620+/- 0.049 mean_var=68.8210+/-13.578, 0's: 0 Z-trim(107.7): 72 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.154601 statistics sampled from 9689 (9761) to 9689 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16 Scan time: 2.210 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7894.1 EHF gene_id:26298|Hs108|chr11 ( 300) 2109 479.2 1.6e-135 CCDS55752.1 EHF gene_id:26298|Hs108|chr11 ( 322) 2109 479.2 1.7e-135 CCDS55753.1 EHF gene_id:26298|Hs108|chr11 ( 277) 1141 263.3 1.5e-70 CCDS1419.1 ELF3 gene_id:1999|Hs108|chr1 ( 371) 581 138.4 7.7e-33 CCDS58129.1 ELF5 gene_id:2001|Hs108|chr11 ( 160) 482 116.2 1.7e-26 CCDS73273.1 ELF5 gene_id:2001|Hs108|chr11 ( 187) 482 116.2 1.9e-26 CCDS7893.1 ELF5 gene_id:2001|Hs108|chr11 ( 255) 479 115.6 3.9e-26 CCDS7892.1 ELF5 gene_id:2001|Hs108|chr11 ( 265) 479 115.6 4.1e-26 CCDS58789.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 363) 346 86.0 4.6e-17 CCDS82674.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 455) 346 86.1 5.5e-17 CCDS13657.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 462) 346 86.1 5.6e-17 CCDS64063.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 504) 337 84.1 2.4e-16 CCDS64062.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 521) 326 81.6 1.4e-15 CCDS3745.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 533) 326 81.6 1.4e-15 CCDS3744.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 581) 326 81.6 1.5e-15 CCDS82954.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 593) 326 81.6 1.5e-15 CCDS14617.1 ELF4 gene_id:2000|Hs108|chrX ( 663) 321 80.5 3.7e-15 CCDS45043.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 ( 595) 309 77.9 2.1e-14 CCDS9374.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 ( 619) 309 77.9 2.2e-14 CCDS59013.1 SPDEF gene_id:25803|Hs108|chr6 ( 319) 274 69.9 2.8e-12 CCDS4794.1 SPDEF gene_id:25803|Hs108|chr6 ( 335) 274 69.9 2.9e-12 CCDS59165.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX ( 95) 265 67.7 3.9e-12 CCDS9060.1 ELK3 gene_id:2004|Hs108|chr12 ( 407) 270 69.1 6.4e-12 CCDS56422.1 ETV7 gene_id:51513|Hs108|chr6 ( 190) 263 67.4 9.7e-12 CCDS1457.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1 ( 405) 267 68.4 1e-11 CCDS1456.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1 ( 431) 267 68.4 1.1e-11 CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21 ( 469) 267 68.4 1.1e-11 CCDS75441.1 ETV7 gene_id:51513|Hs108|chr6 ( 260) 263 67.4 1.3e-11 CCDS56424.1 ETV7 gene_id:51513|Hs108|chr6 ( 264) 263 67.4 1.3e-11 CCDS75440.1 ETV7 gene_id:51513|Hs108|chr6 ( 282) 263 67.4 1.4e-11 CCDS56423.1 ETV7 gene_id:51513|Hs108|chr6 ( 286) 263 67.4 1.4e-11 CCDS14283.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX ( 428) 265 68.0 1.4e-11 CCDS4819.1 ETV7 gene_id:51513|Hs108|chr6 ( 341) 263 67.5 1.6e-11 CCDS74341.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19 ( 249) 260 66.8 2e-11 CCDS32995.2 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19 ( 342) 260 66.8 2.6e-11 CCDS8643.1 ETV6 gene_id:2120|Hs108|chr12 ( 452) 261 67.1 2.8e-11 CCDS78131.1 ETV7 gene_id:51513|Hs108|chr6 ( 262) 257 66.1 3.3e-11 CCDS56425.1 ETV7 gene_id:51513|Hs108|chr6 ( 317) 257 66.1 3.8e-11 CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 374) 255 65.7 6e-11 CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 419) 255 65.7 6.7e-11 CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3 ( 510) 256 66.0 6.8e-11 CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 437) 255 65.7 6.9e-11 CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 454) 255 65.8 7.1e-11 CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 459) 255 65.8 7.2e-11 CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 477) 255 65.8 7.4e-11 CCDS13575.1 GABPA gene_id:2551|Hs108|chr21 ( 454) 253 65.3 9.7e-11 >>CCDS7894.1 EHF gene_id:26298|Hs108|chr11 (300 aa) initn: 2109 init1: 2109 opt: 2109 Z-score: 2546.3 bits: 479.2 E(32554): 1.6e-135 Smith-Waterman score: 2109; 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CCDS14 DSTLASVPPAATFGADDLVLTLSNPQMSLEGTEKASWLGEQPQFWSKTQVLDWISYQVEK 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 NQLDANCIPFQEFDINGEHLCSMSLQEFTRAAGTAGQLLYSNLQHLKWNGQCSSDLFQST :. ::. : :.. :..: ::. .:.:. . : :. :...:. : . ::: .. CCDS14 NKYDASAIDFSRCDMDGATLCNCALEELRLVFGPLGDQLHAQLRDLT---SSSSDELSWI 90 100 110 120 130 130 140 150 160 pF1KB7 HNVIVKT-----EQTEPS-----------IMNTWKDENYLYDTNYGSTVDLLDSKTFCRA ... : : .:. ... .. . . . :. . :. : CCDS14 IELLEKDGMAFQEALDPGPFDQGSPFAQELLDDGQQASPYHPGSCGAGAPSPGSSDVSTA 140 150 160 170 180 190 170 180 190 pF1KB7 QISMTTTSHLPVAESPDMK-----------------KEQDP---------PAK------- . . .:: . . :. :. :: : : CCDS14 GTGASRSSHSSDSGGSDVDLDPTDGKLFPSDGFRDCKKGDPKHGKRKRGRPRKLSKEYWD 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 C---HTKKHNPRGTHLWEFIRDILLNPDKNPGLIKWEDRSEGVFRFLKSEAVAQLWGKKK : . .:: ::::::::::::::..:. : ::.:::.: ::::.::.:::::::::.:: CCDS14 CLEGKKSKHAPRGTHLWEFIRDILIHPELNEGLMKWENRHEGVFKFLRSEAVAQLWGQKK 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 pF1KB7 NNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGKNARGWRENEN .::.::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::.:.: CCDS14 KNSNMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGKNSSGWKEEEVLQSRN 320 330 340 350 360 370 >>CCDS58129.1 ELF5 gene_id:2001|Hs108|chr11 (160 aa) initn: 506 init1: 372 opt: 482 Z-score: 589.3 bits: 116.2 E(32554): 1.7e-26 Smith-Waterman score: 484; 46.9% identity (71.0% similar) in 162 aa overlap (149-299:1-159) 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SDLFQSTHNVIVKTEQTEPSIMNTWKDENYLYDTNYGSTVDLLDSKTFCRAQISMTTT-- . :. :: .: . .:: .: : CCDS58 MLDSVTHST--FLPNASFCDPLMSWTDLFS 10 20 180 190 200 210 220 pF1KB7 --------SHLPVAESPDMKKEQDPPAKCHTKKHNP-RGTHLWEFIRDILLNPDKNPGLI : :.: .: ::..... ...:::::.::.::.:..: :.. CCDS58 NEEYYPAFEHQTDADSNCLKTSGIKSQDCHSHSRTSLQSSHLWEFVRDLLLSPEENCGIL 30 40 50 60 70 80 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 KWEDRSEGVFRFLKSEAVAQLWGKKKNNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYK .:::: .:.:: .::::.:..::..:.:. :::::::::.::::: :::::: :::::: CCDS58 EWEDREQGIFRVVKSEALAKMWGQRKKNDRMTYEKLSRALRYYYKTGILERVD-RRLVYK 90 100 110 120 130 140 290 300 pF1KB7 FGKNARGWRENEN :::::.::.:.. CCDS58 FGKNAHGWQEDKL 150 160 >>CCDS73273.1 ELF5 gene_id:2001|Hs108|chr11 (187 aa) initn: 507 init1: 372 opt: 482 Z-score: 588.3 bits: 116.2 E(32554): 1.9e-26 Smith-Waterman score: 482; 43.8% identity (71.0% similar) in 176 aa overlap (125-299:16-186) 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 RAAGTAGQLLYSNLQHLKWNGQCSSDLFQSTHNVIVKTEQTEPSIMNTWKDENYLYDTNY ::.... . . .: .: : . . : CCDS73 MPSLPHSHRVMLDSVTHSTFLPNASFCDPLM-SWTDL-FSNEEYY 10 20 30 40 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 GSTVDLLDSKTFCRAQISMTTTSHLPVAESPDMKKEQDPPAKCHTKKHNP-RGTHLWEFI . . : :. : .: . :.: .: ::..... ...:::::. CCDS73 PAFEHQTGYSFFNDAEESKATIKD--YADSNCLKTSGIKSQDCHSHSRTSLQSSHLWEFV 50 60 70 80 90 100 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 RDILLNPDKNPGLIKWEDRSEGVFRFLKSEAVAQLWGKKKNNSSMTYEKLSRAMRYYYKR ::.::.:..: :...:::: .:.:: .::::.:..::..:.:. :::::::::.::::: CCDS73 RDLLLSPEENCGILEWEDREQGIFRVVKSEALAKMWGQRKKNDRMTYEKLSRALRYYYKT 110 120 130 140 150 160 280 290 300 pF1KB7 EILERVDGRRLVYKFGKNARGWRENEN :::::: :::::::::::.::.:.. CCDS73 GILERVD-RRLVYKFGKNAHGWQEDKL 170 180 >>CCDS7893.1 ELF5 gene_id:2001|Hs108|chr11 (255 aa) initn: 748 init1: 372 opt: 479 Z-score: 582.6 bits: 115.6 E(32554): 3.9e-26 Smith-Waterman score: 696; 42.4% identity (65.7% similar) in 283 aa overlap (23-299:22-254) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MILEGGGVMNLNPGNNLLHQPPAWTDSYSTCNVSSGF-----FGGQWHEIHPQYWTKYQV .::: .:. . .: . : .::.:::: .: CCDS78 MLDSVTHSTFLPNASFCDPLMSWTDLFSNEEYYPAFEHQTACDSYWTSVHPEYWTKRHV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 WEWLQHLLDTNQLDANCIPFQEFDINGEHLCSMSLQEFTRAAGTAGQLLYSNLQHLKWNG ::::: : .::.::: : .:.:.: .::::. .::..::: :. :: ::... .: CCDS78 WEWLQFCCDQYKLDTNCISFCNFNISGLQLCSMTQEEFVEAAGLCGEYLYFILQNIRTQG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 QCSSDLFQSTHNVIVKTEQTEPSIMNTWKDENYLYDTNYGSTVDLLDSKTFCRAQISMTT ..:... :... .: :: :.: : CCDS78 Y---SFFNDA-------EESKATI----KDYA---DSN-------------C------LK 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 TSHLPVAESPDMKKEQDPPAKCHTKKHNP-RGTHLWEFIRDILLNPDKNPGLIKWEDRSE :: . : :: ::..... ...:::::.::.::.:..: :...:::: . CCDS78 TSGI---------KSQD----CHSHSRTSLQSSHLWEFVRDLLLSPEENCGILEWEDREQ 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 GVFRFLKSEAVAQLWGKKKNNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGKNARG :.:: .::::.:..::..:.:. :::::::::.::::: :::::: :::::::::::.: CCDS78 GIFRVVKSEALAKMWGQRKKNDRMTYEKLSRALRYYYKTGILERVD-RRLVYKFGKNAHG 200 210 220 230 240 300 pF1KB7 WRENEN :.:.. CCDS78 WQEDKL 250 >>CCDS7892.1 ELF5 gene_id:2001|Hs108|chr11 (265 aa) initn: 748 init1: 372 opt: 479 Z-score: 582.3 bits: 115.6 E(32554): 4.1e-26 Smith-Waterman score: 696; 42.4% identity (65.7% similar) in 283 aa overlap (23-299:32-264) 10 20 30 40 pF1KB7 MILEGGGVMNLNPGNNLLHQPPAWTDSYSTCNVSSGF-----FGGQWHEIHP .::: .:. . .: . : .:: CCDS78 PSLPHSHRVMLDSVTHSTFLPNASFCDPLMSWTDLFSNEEYYPAFEHQTACDSYWTSVHP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 QYWTKYQVWEWLQHLLDTNQLDANCIPFQEFDINGEHLCSMSLQEFTRAAGTAGQLLYSN .:::: .:::::: : .::.::: : .:.:.: .::::. .::..::: :. :: CCDS78 EYWTKRHVWEWLQFCCDQYKLDTNCISFCNFNISGLQLCSMTQEEFVEAAGLCGEYLYFI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 LQHLKWNGQCSSDLFQSTHNVIVKTEQTEPSIMNTWKDENYLYDTNYGSTVDLLDSKTFC ::... .: ..:... :... .: :: :.: : CCDS78 LQNIRTQGY---SFFNDA-------EESKATI----KDYA---DSN-------------C 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 RAQISMTTTSHLPVAESPDMKKEQDPPAKCHTKKHNP-RGTHLWEFIRDILLNPDKNPGL :: . : :: ::..... ...:::::.::.::.:..: :. 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CCDS78 KFGKNAHGWQEDKL 260 >>CCDS58789.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 (363 aa) initn: 217 init1: 192 opt: 346 Z-score: 419.9 bits: 86.0 E(32554): 4.6e-17 Smith-Waterman score: 346; 28.5% identity (61.4% similar) in 249 aa overlap (47-288:39-274) 20 30 40 50 60 70 pF1KB7 LLHQPPAWTDSYSTCNVSSGFFGGQWHEIHPQYWTKYQVWEWLQHLLDTNQL-DANCIPF : :. .: .::. . : :.: . : CCDS58 GMNYGSYMEEKHMPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYGLPDVNILLF 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 QEFDINGEHLCSMSLQEFTRAAGT-AGQLLYSNLQHLKWNGQCSSDLFQSTHNVIVKTEQ : .:.:..::.:. ..: : . . ...: :.:..:. . : . : . . :. : CCDS58 Q--NIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLR-----ETPLPHLTSDDVDKALQ 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 TEPSIMNTWKDENYLYDTNYGSTVDLLDSKTFCRAQISMTTTSHLPVAESPDMKKEQDP- . : .:.. .. . :. :. : ... .. . : .: .: :.. . :: CCDS58 NSPRLMHA-RNTDLPYEPPRRSAWTGHGHPTP-QSKAAQPSPSTVPKTE--DQRPQLDPY 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 pF1KB7 ----PAKCHTKKHNPRGTHLWEFIRDILLNPDKNPGLIKWEDRSEGVFRFLKSEAVAQLW :.. . . . .::.:. . ::. ..: . : :: ..: :.. . ::. : CCDS58 QILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLE-LLSDSSNSSCITWEG-TNGEFKMTDPDEVARRW 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 GKKKNNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGKNARGWRENEN :..:.. .:.:.:::::.:::: ..:. .: :.: .::: CCDS58 GERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKY 240 250 260 270 280 290 CCDS58 PSDLPYMGSYHAHPQKMNFVAPHPPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNTRLPTSHM 300 310 320 330 340 350 >>CCDS82674.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 (455 aa) initn: 245 init1: 192 opt: 346 Z-score: 418.4 bits: 86.1 E(32554): 5.5e-17 Smith-Waterman score: 346; 28.5% identity (61.4% similar) in 249 aa overlap (47-288:131-366) 20 30 40 50 60 70 pF1KB7 LLHQPPAWTDSYSTCNVSSGFFGGQWHEIHPQYWTKYQVWEWLQHLLDTNQL-DANCIPF : :. .: .::. . : :.: . : CCDS82 GMNYGSYMEEKHMPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYGLPDVNILLF 110 120 130 140 150 160 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 QEFDINGEHLCSMSLQEFTRAAGT-AGQLLYSNLQHLKWNGQCSSDLFQSTHNVIVKTEQ : .:.:..::.:. ..: : . . ...: :.:..:. . : . : . . :. : CCDS82 Q--NIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLR-----ETPLPHLTSDDVDKALQ 170 180 190 200 210 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 TEPSIMNTWKDENYLYDTNYGSTVDLLDSKTFCRAQISMTTTSHLPVAESPDMKKEQDP- . : .:.. .. . :. :. : ... .. . : .: .: :.. . :: CCDS82 NSPRLMHA-RNTDLPYEPPRRSAWTGHGHPTP-QSKAAQPSPSTVPKTE--DQRPQLDPY 220 230 240 250 260 200 210 220 230 240 pF1KB7 ----PAKCHTKKHNPRGTHLWEFIRDILLNPDKNPGLIKWEDRSEGVFRFLKSEAVAQLW :.. . . . .::.:. . ::. ..: . : :: ..: :.. . ::. : CCDS82 QILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLE-LLSDSSNSSCITWEG-TNGEFKMTDPDEVARRW 270 280 290 300 310 320 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 GKKKNNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGKNARGWRENEN :..:.. .:.:.:::::.:::: ..:. .: :.: .::: CCDS82 GERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKY 330 340 350 360 370 380 CCDS82 PSDLPYMGSYHAHPQKMNFVAPHPPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNTRLPTSHM 390 400 410 420 430 440 300 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 15:11:15 2016 done: Sun Nov 6 15:11:16 2016 Total Scan time: 2.210 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]