FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5422, 332 aa 1>>>pF1KE5422 332 - 332 aa - 332 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2991+/-0.00107; mu= 15.6094+/- 0.064 mean_var=62.2012+/-12.862, 0's: 0 Z-trim(102.1): 27 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.162620 statistics sampled from 6776 (6796) to 6776 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16 Scan time: 2.490 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7840.1 LDHC gene_id:3948|Hs108|chr11 ( 332) 2144 512.0 2.7e-145 CCDS7839.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 332) 1745 418.4 4.1e-117 CCDS53609.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 361) 1745 418.4 4.4e-117 CCDS8691.1 LDHB gene_id:3945|Hs108|chr12 ( 334) 1584 380.6 9.7e-106 CCDS10171.1 LDHAL6B gene_id:92483|Hs108|chr15 ( 381) 1546 371.7 5.3e-103 CCDS7841.1 LDHAL6A gene_id:160287|Hs108|chr11 ( 332) 1532 368.4 4.6e-102 CCDS53611.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 241) 1247 301.5 4.6e-82 CCDS53610.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 274) 1206 291.9 4.1e-79 CCDS44549.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 ( 274) 1091 264.9 5.4e-71 CCDS58122.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 341) 487 123.2 3e-28 CCDS58123.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 357) 487 123.2 3.1e-28 CCDS7843.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 379) 487 123.2 3.2e-28 CCDS58124.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 449) 487 123.3 3.8e-28 CCDS41624.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 ( 471) 487 123.3 3.9e-28 >>CCDS7840.1 LDHC gene_id:3948|Hs108|chr11 (332 aa) initn: 2144 init1: 2144 opt: 2144 Z-score: 2721.9 bits: 512.0 E(32554): 2.7e-145 Smith-Waterman score: 2144; 100.0% identity (100.0% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-332) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS78 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLKG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS78 EMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 IPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS78 IPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 HPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS78 HPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 IIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS78 IIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 SDVVKINLNSEEEALFKKSAETLWNIQKDLIF :::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS78 SDVVKINLNSEEEALFKKSAETLWNIQKDLIF 310 320 330 >>CCDS7839.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (332 aa) initn: 1723 init1: 1723 opt: 1745 Z-score: 2216.0 bits: 418.4 E(32554): 4.1e-117 Smith-Waterman score: 1745; 75.3% identity (94.3% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-332) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLKG :.:.:.::: .:...... : :::.::.::::::::::::.:::::::::::: ::::: CCDS78 MATLKDQLIYNLLKEEQTPQNKITVVGVGAVGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLKG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSI :::::::::::. : ::.:::::.:.:::..::.::::::::::.:: :::::: :.: : CCDS78 EMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 IPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGV :: .:.:::.::.:.::::::::::..:::::.: .:::::::::::::::::.::.::: CCDS78 IPNVVKYSPNCKLLIVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 HPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYE :: :::::..:::::::::.:::.:::::.:::: : ::::.:::.::..::::..:::: CCDS78 HPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGTDKDKEQWKEVHKQVVESAYE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 IIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGV .::::::::::::::: ::. ::.::::::::::::.:::::::...:::.::.::.::. 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CCDS53 GMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLKGEMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 VIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSIIPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKIS ::.::::::::::.:: :::::: :.: ::: .:.:::.::.:.::::::::::..:::: CCDS53 VIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFIIPNVVKYSPNCKLLIVSNPVDILTYVAWKIS 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 GLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGVHPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVAL :.: .:::::::::::::::::.::.::::: :::::..:::::::::.:::.:::::.: CCDS53 GFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 KTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYEIIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVH ::: : ::::.:::.::..::::..::::.::::::::::::::: ::. ::.::::::: CCDS53 KTLHPDLGTDKDKEQWKEVHKQVVESAYEVIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVH 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 PVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGVSDVVKINLNSEEEALFKKSAETLWNIQKDLI :::::.:::::::...:::.::.::.::.::.::..:.::::: .::::.:::.:::.: CCDS53 PVSTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGISDLVKVTLTSEEEARLKKSADTLWGIQKELQ 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 F : CCDS53 F >>CCDS8691.1 LDHB gene_id:3945|Hs108|chr12 (334 aa) initn: 1554 init1: 1554 opt: 1584 Z-score: 2011.8 bits: 380.6 E(32554): 9.7e-106 Smith-Waterman score: 1584; 69.8% identity (90.9% similar) in 331 aa overlap (1-330:1-331) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDEN-SQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLK :.:.::.:: . :.. . . :::.::.: :::::::::: :.:::::::::: :::: CCDS86 MATLKEKLIAPVAEEEATVPNNKITVVGVGQVGMACAISILGKSLADELALVDVLEDKLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 GEMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKS ::::::::::::..: ::.. :::::.:::.::.::::.::::::.:: :::::: ..: CCDS86 GEMMDLQHGSLFLQTPKIVADKDYSVTANSKIVVVTAGVRQQEGESRLNLVQRNVNVFKF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 IIPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLG ::: ::.::::: :.:::::::::::..::.:::: :::::::::::::::::..:::: CCDS86 IIPQIVKYSPDCIIIVVSNPVDILTYVTWKLSGLPKHRVIGSGCNLDSARFRYLMAEKLG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 VHPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAY .::.::::::.:::::::: .:::::::::.:. :.:..:::.:.:.::..::.:..::: CCDS86 IHPSSCHGWILGEHGDSSVAVWSGVNVAGVSLQELNPEMGTDNDSENWKEVHKMVVESAY 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 EIIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNG :.:::::::.::::::: ::. :.:::: :.:::::::::.:::..:.:::.::.:. : CCDS86 EVIKLKGYTNWAIGLSVADLIESMLKNLSRIHPVSTMVKGMYGIENEVFLSLPCILNARG 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 pF1KE5 VSDVVKINLNSEEEALFKKSAETLWNIQKDLIF ...:.. .:...: : .::::.:::.::::: CCDS86 LTSVINQKLKDDEVAQLKKSADTLWDIQKDLKDL 310 320 330 >>CCDS10171.1 LDHAL6B gene_id:92483|Hs108|chr15 (381 aa) initn: 1538 init1: 1538 opt: 1546 Z-score: 1962.7 bits: 371.7 E(32554): 5.3e-103 Smith-Waterman score: 1546; 67.6% identity (88.2% similar) in 330 aa overlap (1-330:50-379) 10 20 30 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGA :.::: .:::.. . . :..:.:::. CCDS10 NFLCLGMALCPRQATRIPLNGTWLFTPVSKMATVKSELIERFTSEKPVHHSKVSIIGTGS 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 VGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLKGEMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSR :::::::::::: :.:::::::. :::::: ::::::: : . .:. .::: :.::: CCDS10 VGMACAISILLKGLSDELALVDLDEDKLKGETMDLQHGSPFTKMPNIVCSKDYFVTANSN 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 IVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSIIPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKI .::.::::::..::::: ::::::::.: .: .::.::: ::...::::::::::..::. CCDS10 LVIITAGARQEKGETRLNLVQRNVAIFKLMISSIVQYSPHCKLIIVSNPVDILTYVAWKL 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 SGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGVHPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVA :..: .:.::::::::.::::.:::.:::.: ::::::.:::::::::.:::::.::: CCDS10 SAFPKNRIIGSGCNLDTARFRFLIGQKLGIHSESCHGWILGEHGDSSVPVWSGVNIAGVP 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 LKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYEIIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRV :: :. .:::.: :.:::.::.: .::::::.:::::::::::: ::. ::::::::. CCDS10 LKDLNSDIGTDKDPEQWKNVHKEVTATAYEIIKMKGYTSWAIGLSVADLTESILKNLRRI 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 HPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGVSDVVKINLNSEEEALFKKSAETLWNIQKDL :::::..:::::: ::.::::::.::.::.....::.:. :::: .::::.:::.::. : CCDS10 HPVSTIIKGLYGIDEEVFLSIPCILGENGITNLIKIKLTPEEEAHLKKSAKTLWEIQNKL 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 IF CCDS10 KL 380 >>CCDS7841.1 LDHAL6A gene_id:160287|Hs108|chr11 (332 aa) initn: 1508 init1: 1508 opt: 1532 Z-score: 1945.9 bits: 368.4 E(32554): 4.6e-102 Smith-Waterman score: 1532; 66.7% identity (90.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLKG :.:.: .::... :.. . ::.:::::.::.::::::::: :.:::.:::: :::: CCDS78 MATIKSELIKNFAEEEAIHHNKISIVGTGSVGVACAISILLKGLSDELVLVDVDEGKLKG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSI : ::::::: :.. .:.:.::: :.::: .::.::::::..::::: ::::::.:.: . CCDS78 ETMDLQHGSPFMKMPNIVSSKDYLVTANSNLVIITAGARQKKGETRLDLVQRNVSIFKLM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 IPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGV :: :..::: ::.:.:.::::::::..::.::.: .::::::::::::::::.::..::. CCDS78 IPNITQYSPHCKLLIVTNPVDILTYVAWKLSGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYFIGQRLGI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 HPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYE : :::: :.:::::::::.:::::.::: :: :.: .:::.: :.:.:.::.::.:.:: CCDS78 HSESCHGLILGEHGDSSVPVWSGVNIAGVPLKDLNPDIGTDKDPEQWENVHKKVISSGYE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 IIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGV ..:.::::::.:.::: ::. ::::::::::::::. ::::::.:..:::.::.::.::. CCDS78 MVKMKGYTSWGISLSVADLTESILKNLRRVHPVSTLSKGLYGINEDIFLSVPCILGENGI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 SDVVKINLNSEEEALFKKSAETLWNIQKDLIF .:..:..:. :::: ..:::::::.:::.: CCDS78 TDLIKVKLTLEEEACLQKSAETLWEIQKELKL 310 320 330 >>CCDS53611.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (241 aa) initn: 1225 init1: 1225 opt: 1247 Z-score: 1586.7 bits: 301.5 E(32554): 4.6e-82 Smith-Waterman score: 1247; 74.1% identity (93.3% similar) in 239 aa overlap (1-239:1-239) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLKG :.:.:.::: .:...... : :::.::.::::::::::::.:::::::::::: ::::: CCDS53 MATLKDQLIYNLLKEEQTPQNKITVVGVGAVGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLKG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSI :::::::::::. : ::.:::::.:.:::..::.::::::::::.:: :::::: :.: : CCDS53 EMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 IPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGV :: .:.:::.::.:.::::::::::..:::::.: .:::::::::::::::::.::.::: CCDS53 IPNVVKYSPNCKLLIVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 HPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYE :: :::::..:::::::::.:::.:::::.:::: : ::::.:::.::..::::.. .. CCDS53 HPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGTDKDKEQWKEVHKQVVERVFT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 IIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGV CCDS53 E >>CCDS53610.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (274 aa) initn: 1206 init1: 1206 opt: 1206 Z-score: 1533.9 bits: 291.9 E(32554): 4.1e-79 Smith-Waterman score: 1206; 75.9% identity (93.4% similar) in 228 aa overlap (1-228:1-228) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLKG :.:.:.::: .:...... : :::.::.::::::::::::.:::::::::::: ::::: CCDS53 MATLKDQLIYNLLKEEQTPQNKITVVGVGAVGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLKG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSI :::::::::::. : ::.:::::.:.:::..::.::::::::::.:: :::::: :.: : CCDS53 EMMDLQHGSLFLRTPKIVSGKDYNVTANSKLVIITAGARQQEGESRLNLVQRNVNIFKFI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 IPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGV :: .:.:::.::.:.::::::::::..:::::.: .:::::::::::::::::.::.::: CCDS53 IPNVVKYSPNCKLLIVSNPVDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 HPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYE :: :::::..:::::::::.:::.:::::.:::: : ::::.:::.:: CCDS53 HPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGTDKDKEQWKECRYTLGDPKGA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 IIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGV CCDS53 AILKSSDVISFHCLGYNRILGGGCACCPFYLICD 250 260 270 >>CCDS44549.1 LDHA gene_id:3939|Hs108|chr11 (274 aa) initn: 1450 init1: 1087 opt: 1091 Z-score: 1388.0 bits: 264.9 E(32554): 5.4e-71 Smith-Waterman score: 1329; 62.7% identity (78.0% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-274) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALVDVALDKLKG :.:.:.::: .:...... : :::.::.::::::::::::.:::::::::::: ::::: CCDS44 MATLKDQLIYNLLKEEQTPQNKITVVGVGAVGMACAISILMKDLADELALVDVIEDKLKG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQRNVAIMKSI :::::::::::. : ::.::: CCDS44 EMMDLQHGSLFLRTPKIVSGK--------------------------------------- 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 IPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFRYLIGEKLGV ::::::..:::::.: .:::::::::::::::::.::.::: CCDS44 -------------------VDILTYVAWKISGFPKNRVIGSGCNLDSARFRYLMGERLGV 90 100 110 120 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 HPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIHKQVIQSAYE :: :::::..:::::::::.:::.:::::.:::: : ::::.:::.::..::::..:::: CCDS44 HPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLKTLHPDLGTDKDKEQWKEVHKQVVESAYE 130 140 150 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 IIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSIPCVLGRNGV .::::::::::::::: ::. ::.::::::::::::.:::::::...:::.::.::.::. CCDS44 VIKLKGYTSWAIGLSVADLAESIMKNLRRVHPVSTMIKGLYGIKDDVFLSVPCILGQNGI 190 200 210 220 230 240 310 320 330 pF1KE5 SDVVKINLNSEEEALFKKSAETLWNIQKDLIF ::.::..:.::::: .::::.:::.:::.: : CCDS44 SDLVKVTLTSEEEARLKKSADTLWGIQKELQF 250 260 270 >>CCDS58122.1 UEVLD gene_id:55293|Hs108|chr11 (341 aa) initn: 486 init1: 327 opt: 487 Z-score: 620.7 bits: 123.2 E(32554): 3e-28 Smith-Waterman score: 487; 41.8% identity (75.8% similar) in 182 aa overlap (22-203:146-321) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSTVKEQLIEKLIEDDENSQCKITIVGTGAVGMACAISILLKDLADELALV :::.:: : .:.::...: : .::.:.:. CCDS58 DLLAYIAKITEGVSDTNSKSWANHENKTVNKITVVGGGELGIACTLAISAKGIADRLVLL 120 130 140 150 160 170 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 DVALDKLKGEMMDLQHGSLFFSTSKITSGKDYSVSANSRIVIVTAGARQQEGETRLALVQ :.. . :: :::. .:. .. .:: :.::.:..:: :... ... : .:: CCDS58 DLS-EGTKGATMDLE----IFNLPNVEISKDLSASAHSKVVIFTVNS-LGSSQSYLDVVQ 180 190 200 210 220 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 RNVAIMKSIIPAIVHYSPDCKILVVSNPVDILTYIVWKISGLPVTRVIGSGCNLDSARFR :: ......::. ::: .::.:.::.:.::..::.: .:..:::: :::::: :.. CCDS58 SNVDMFRALVPALGHYSQHSVLLVASQPVEIMTYVTWKLSTFPANRVIGIGCNLDSQRLQ 230 240 250 260 270 280 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YLIGEKLGVHPTSCHGWIIGEHGDSSVPLWSGVNVAGVALKTLDPKLGTDSDKEHWKNIH :.: . : .. .. . :.:::.:...: ::: CCDS58 YIITNVLKAQTSGKEVWVIGEQGEDKVLTWSGQEEVVSHTSQVQLSNRDIMI 290 300 310 320 330 340 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KQVIQSAYEIIKLKGYTSWAIGLSVMDLVGSILKNLRRVHPVSTMVKGLYGIKEELFLSI 332 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:36:22 2016 done: Tue Nov 8 00:36:22 2016 Total Scan time: 2.490 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]