FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1909, 444 aa 1>>>pF1KE1909 444 - 444 aa - 444 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9156+/-0.000416; mu= 20.4202+/- 0.026 mean_var=75.5066+/-14.887, 0's: 0 Z-trim(111.3): 20 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.147598 statistics sampled from 19797 (19809) to 19797 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16 Scan time: 8.060 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004170 (OMIM: 191060) tryptophan 5-hydroxylase ( 444) 2976 643.5 3.2e-184 NP_775489 (OMIM: 607478,608516,613003) tryptophan ( 490) 2243 487.5 3.4e-137 NP_000268 (OMIM: 261600,612349) phenylalanine-4-hy ( 452) 1626 356.0 1.1e-97 NP_000351 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxy ( 497) 1422 312.6 1.4e-84 XP_011518637 (OMIM: 191290,605407) PREDICTED: tyro ( 501) 1422 312.6 1.5e-84 NP_954987 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxy ( 524) 1422 312.7 1.5e-84 NP_954986 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxy ( 528) 1422 312.7 1.5e-84 XP_016874859 (OMIM: 261600,612349) PREDICTED: phen ( 240) 772 173.9 3.9e-43 >>NP_004170 (OMIM: 191060) tryptophan 5-hydroxylase 1 [H (444 aa) initn: 2976 init1: 2976 opt: 2976 Z-score: 3428.2 bits: 643.5 E(85289): 3.2e-184 Smith-Waterman score: 2976; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRASLIFSLKNEVGGLIKALKIFQEKHVNLLHIESRKSKRRNSEF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 MIEDNKENKDHSLERGRASLIFSLKNEVGGLIKALKIFQEKHVNLLHIESRKSKRRNSEF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 EIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTLKEDGMETVPWFPKKISDLDHCAN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 EIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTLKEDGMETVPWFPKKISDLDHCAN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 RVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 RVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 LNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRD 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 FLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGHVPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 FLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGHVPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 SEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSSISELKHALSGHAKVKPFDPKITC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 SEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSSISELKHALSGHAKVKPFDPKITC 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 KQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPFGVKYNPYTRSIQILKDTKSITSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 KQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPFGVKYNPYTRSIQILKDTKSITSA 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 MNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI :::::::::::::::::::::::: NP_004 MNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI 430 440 >>NP_775489 (OMIM: 607478,608516,613003) tryptophan 5-hy (490 aa) initn: 2213 init1: 2213 opt: 2243 Z-score: 2584.1 bits: 487.5 E(85289): 3.4e-137 Smith-Waterman score: 2243; 71.7% identity (92.5% similar) in 442 aa overlap (4-440:45-486) 10 20 pF1KE1 MIEDNKENKDHS-----LERGRASLIFSLKNEV :.: :: : : :.....::::::: NP_775 RRGFSLDSAVPEEHQLLGSSTLNKPNSGKNDDKGNKGSSKREAATESGKTAVVFSLKNEV 20 30 40 50 60 70 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 GGLIKALKIFQEKHVNLLHIESRKSKRRNSEFEIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLS :::.:::..::::.::..:::::::.::.:: ::::::. .. ..:....::: .:.... 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NP_000 SVKFDPYTLAIDVLDSPQAVRRSLEGVQDELDTLAHALSAIG 460 470 480 490 >>XP_011518637 (OMIM: 191290,605407) PREDICTED: tyrosine (501 aa) initn: 1426 init1: 1402 opt: 1422 Z-score: 1639.2 bits: 312.6 E(85289): 1.5e-84 Smith-Waterman score: 1449; 50.3% identity (78.7% similar) in 431 aa overlap (14-438:80-500) 10 20 30 40 pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRA--SLIFSLK-NEVGGLIKALKIFQE ..:.: .:.:: . .. ..: .:.:.:. XP_011 RKEREAAVAAAAAAVPSEPGDPLEAVAFEEKEGKAVLNLLFSPRATKPSALSRAVKVFET 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 pF1KE1 KHVNLLHIESRKSKRRNS---EFEIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTL .... :.:.: ..: . ..: :: .. : .:. :: ..: .:. : . 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XP_011 SVKFDPYTLAIDVLDSPQAVRRSLEGVQDELDTLAHALSAIG 460 470 480 490 500 >>NP_954987 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxygena (524 aa) initn: 1426 init1: 1402 opt: 1422 Z-score: 1638.9 bits: 312.7 E(85289): 1.5e-84 Smith-Waterman score: 1449; 50.3% identity (78.7% similar) in 431 aa overlap (14-438:103-523) 10 20 30 40 pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRA--SLIFSLK-NEVGGLIKALKIFQE ..:.: .:.:: . .. ..: .:.:.:. NP_954 RKEREAAVAAAAAAVPSEPGDPLEAVAFEEKEGKAVLNLLFSPRATKPSALSRAVKVFET 80 90 100 110 120 130 50 60 70 80 90 pF1KE1 KHVNLLHIESRKSKRRNS---EFEIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTL .... :.:.: ..: . ..: :: .. : .:. :: ..: .:. : . NP_954 FEAKIHHLETRPAQRPRAGGPHLEYFVRLEVRR---GDLAALL---SGVRQVS-ED---V 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 KEDGMETVPWFPKKISDLDHCANRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKH . . :::::.:.:.::.: . : . .:: :::::.:.:::.::: .:..:..:.: NP_954 RSPAGPKVPWFPRKVSELDKCHHLVTKFDPDLDLDHPGFSDQVYRQRRKLIAEIAFQYRH 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 GDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDV :::::.::.: ::: :: :. :. :: :::: :.:. . :: .. ::::::::::::: NP_954 GDPIPRVEYTAEEIATWKEVYTTLKGLYATHACGEHLEAFALLERFSGYREDNIPQLEDV 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 SNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGH : ::::::::..::::: :: ::::..::::::.::::.::.:.:...:::: ::::::: NP_954 SRFLKERTGFQLRPVAGLLSARDFLASLAFRVFQCTQYIRHASSPMHSPEPDCCHELLGH 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 VPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSS ::.::. .::::::.:::::::::.: ..::.: :.::::::::::.:.....::::::: NP_954 VPMLADRTFAQFSQDIGLASLGASDEEIEKLSTLYWFTVEFGLCKQNGEVKAYGAGLLSS 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ISELKHALSGHAKVKPFDPKITCKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPF .:: : :: . ... :::. . : :.:.:::::::: :::.:.: ... :.::: NP_954 YGELLHCLSEEPEIRAFDPEAAAVQPYQDQTYQSVYFVSESFSDAKDKLRSYASRIQRPF 430 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 pF1KE1 GVKYNPYTRSIQILKDTKSITSAMNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI .::..::: .:..: . ... ... .: .::... ::. . NP_954 SVKFDPYTLAIDVLDSPQAVRRSLEGVQDELDTLAHALSAIG 490 500 510 520 >>NP_954986 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxygena (528 aa) initn: 1426 init1: 1402 opt: 1422 Z-score: 1638.9 bits: 312.7 E(85289): 1.5e-84 Smith-Waterman score: 1449; 50.3% identity (78.7% similar) in 431 aa overlap (14-438:107-527) 10 20 30 40 pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRA--SLIFSLK-NEVGGLIKALKIFQE ..:.: .:.:: . .. ..: .:.:.:. NP_954 RKEREAAVAAAAAAVPSEPGDPLEAVAFEEKEGKAVLNLLFSPRATKPSALSRAVKVFET 80 90 100 110 120 130 50 60 70 80 90 pF1KE1 KHVNLLHIESRKSKRRNS---EFEIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTL .... :.:.: ..: . ..: :: .. : .:. :: ..: .:. : . NP_954 FEAKIHHLETRPAQRPRAGGPHLEYFVRLEVRR---GDLAALL---SGVRQVS-ED---V 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 KEDGMETVPWFPKKISDLDHCANRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKH . . :::::.:.:.::.: . : . .:: :::::.:.:::.::: .:..:..:.: NP_954 RSPAGPKVPWFPRKVSELDKCHHLVTKFDPDLDLDHPGFSDQVYRQRRKLIAEIAFQYRH 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 GDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDV :::::.::.: ::: :: :. :. :: :::: :.:. . :: .. ::::::::::::: NP_954 GDPIPRVEYTAEEIATWKEVYTTLKGLYATHACGEHLEAFALLERFSGYREDNIPQLEDV 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 SNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGH : ::::::::..::::: :: ::::..::::::.::::.::.:.:...:::: ::::::: NP_954 SRFLKERTGFQLRPVAGLLSARDFLASLAFRVFQCTQYIRHASSPMHSPEPDCCHELLGH 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 VPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSS ::.::. .::::::.:::::::::.: ..::.: :.::::::::::.:.....::::::: NP_954 VPMLADRTFAQFSQDIGLASLGASDEEIEKLSTLYWFTVEFGLCKQNGEVKAYGAGLLSS 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ISELKHALSGHAKVKPFDPKITCKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPF .:: : :: . ... :::. . : :.:.:::::::: :::.:.: ... :.::: NP_954 YGELLHCLSEEPEIRAFDPEAAAVQPYQDQTYQSVYFVSESFSDAKDKLRSYASRIQRPF 430 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 pF1KE1 GVKYNPYTRSIQILKDTKSITSAMNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI .::..::: .:..: . ... ... .: .::... ::. . NP_954 SVKFDPYTLAIDVLDSPQAVRRSLEGVQDELDTLAHALSAIG 490 500 510 520 >>XP_016874859 (OMIM: 261600,612349) PREDICTED: phenylal (240 aa) initn: 768 init1: 604 opt: 772 Z-score: 895.3 bits: 173.9 E(85289): 3.9e-43 Smith-Waterman score: 772; 54.4% identity (78.1% similar) in 215 aa overlap (9-222:26-235) 10 20 30 40 pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRASLIFSLKNEVGGLIKALKIFQEKHV .:. . : :::::::.:::.: :.:..:.:. : XP_016 MSTAVLENPGLGRKLSDFGQETSYIEDNCNQNGAISLIFSLKEEVGALAKVLRLFEENDV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 NLLHIESRKSKRRNSEFEIFVDCDINR-EQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTLKEDGM :: ::::: :. ...:.:.:. : :..:...:. .. .: .. XP_016 NLTHIESRPSRLKKDEYEFFTHLDKRSLPALTNIIKILRHDIGATVHELS-----RDKKK 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ETVPWFPKKISDLDHCANRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIP .::::::. :..::. ::..: ::.::::::::::: ::: ::: :::.:.::.::.::: XP_016 DTVPWFPRTIQELDRFANQILSYGAELDADHPGFKDPVYRARRKQFADIAYNYRHGQPIP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 KVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLK .::. ::: :::::::. :..:: :::: :: . .::: ::::..:::::::::::.::. XP_016 RVEYMEEEKKTWGTVFKTLKSLYKTHACYEYNHIFPLLEKYCGFHEDNIPQLEDVSQFLQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 ERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGHVPLLA XP_016 IPAVL 240 444 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 15:15:28 2016 done: Sun Nov 6 15:15:30 2016 Total Scan time: 8.060 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]