Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2256
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2256, 419 aa
1>>>pF1KE2256 419 - 419 aa - 419 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64704883 residues in 91410 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6924+/-0.000423; mu= -8.1699+/- 0.027
mean_var=562.9361+/-115.838, 0's: 0 Z-trim(124.8): 169 B-trim: 2468 in 1/58
Lambda= 0.054056
statistics sampled from 48627 (48848) to 48627 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.796), E-opt: 0.2 (0.534), width: 16
Scan time: 5.070
The best scores are: opt bits E(91410)
NP_000788 (OMIM: 126452,143465,601696) D(4) dopami ( 419) 2932 242.9 1.2e-63
NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 414) 860 81.4 5.1e-15
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 709 69.6 1.8e-11
NP_387512 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 367) 596 60.7 7.5e-09
NP_001269492 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dop ( 400) 596 60.7 7.9e-09
XP_016861318 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dop ( 400) 596 60.7 7.9e-09
NP_000787 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 400) 596 60.7 7.9e-09
NP_001277738 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dop ( 400) 596 60.7 7.9e-09
XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine r ( 443) 539 56.4 1.8e-07
NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443) 539 56.4 1.8e-07
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 491 52.6 2.5e-06
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 454 49.7 1.8e-05
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 454 49.7 1.8e-05
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 454 49.8 1.9e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 439 48.6 4.3e-05
XP_005265876 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic re ( 328) 418 46.8 0.00011
XP_006714884 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic re ( 331) 418 46.8 0.00011
XP_005265875 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic re ( 366) 418 46.8 0.00011
XP_011532740 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic re ( 389) 418 46.8 0.00012
XP_011532739 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic re ( 402) 418 46.9 0.00012
XP_011542714 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 308) 414 46.4 0.00013
XP_016868585 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 317) 414 46.4 0.00013
XP_011542713 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 324) 414 46.4 0.00013
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 414 46.5 0.00013
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 414 46.5 0.00014
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 414 46.5 0.00014
XP_011532737 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic re ( 556) 418 47.0 0.00015
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 407 46.1 0.00023
XP_006712545 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 456) 407 46.1 0.00024
NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 407 46.1 0.00024
NP_001243689 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine re ( 458) 403 45.8 0.00029
NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458) 403 45.8 0.00029
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 377 43.7 0.0012
NP_076917 (OMIM: 601305) 5-hydroxytryptamine recep ( 357) 368 42.9 0.0017
NP_000789 (OMIM: 126453,143465,606798) D(1B) dopam ( 477) 370 43.2 0.0018
XP_011543044 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholi ( 460) 369 43.1 0.0018
NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine ( 460) 369 43.1 0.0018
NP_001006632 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 360 42.4 0.003
NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 360 42.4 0.003
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 360 42.4 0.003
XP_024302416 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 360 42.4 0.003
NP_001006630 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 360 42.4 0.003
NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 360 42.4 0.003
NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine ( 466) 360 42.4 0.003
NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 360 42.4 0.003
NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 360 42.4 0.003
NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390) 339 40.7 0.0084
>>NP_000788 (OMIM: 126452,143465,601696) D(4) dopamine r (419 aa)
initn: 2932 init1: 2932 opt: 2932 Z-score: 1264.3 bits: 242.9 E(91410): 1.2e-63
Smith-Waterman score: 2932; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAGQGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLVCVSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAGQGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLVCVSVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMDVMLCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMDVMLCT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNRQGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLNDVRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNRQGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLNDVRGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DPAVCRLEDRDYVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGRAPRRPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DPAVCRLEDRDYVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGRAPRRPSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PGPPSPTPPAPRLPQDPCGPDCAPPAPGLPRGPCGPDCAPAAPSLPQDPCGPDCAPPAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PGPPSPTPPAPRLPQDPCGPDCAPPAPGLPRGPCGPDCAPAAPSLPQDPCGPDCAPPAPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LPPDPCGSNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGRERKAMRVLPVVVGAFLLCWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LPPDPCGSNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGRERKAMRVLPVVVGAFLLCWT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE2 PFFVVHITQALCPACSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVFNAEFRNVFRKALRACC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PFFVVHITQALCPACSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVFNAEFRNVFRKALRACC
370 380 390 400 410
>>NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine receptor (414 aa)
initn: 618 init1: 222 opt: 860 Z-score: 391.1 bits: 81.4 E(91410): 5.1e-15
Smith-Waterman score: 868; 40.8% identity (62.3% similar) in 390 aa overlap (43-418:43-414)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 LAGRGPAAGASAGASAGLAGQGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLVCVSVATERALQTPTNSF
:::.... :: :::..:. :.:::: :: .
NP_057 LERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVSREKALQTTTNYL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 IVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMDVMLCTASIFNLCAISVD
:::::.::::.: ::.: :: :: : : .: :: ....:::.:::::.::::::.:
NP_057 IVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVG-EWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTASILNLCAISID
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 RFVAVAVPLRYN-RQGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLNDVRGRDPAVCRLEDRD
:..:::.:. :: : ...:: ..:. .:.:: ... :.: :::.. : : . .
NP_057 RYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNA---DQNECIIANPA
140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 YVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGRAPRRPSGPGPPSPTPPAP
.:::::. ::..: . ::.: . :.: :: ... . : .: :
NP_057 FVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRR----RRKRVNTKRSSRAFRAHLRAPLKEAA
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300
pF1KE2 RLPQDPCGPDCAPPAPGLPRGPCGPDCAPAAPSLPQ----DPC--GPDCAPPAPGLPPDP
: :. . .: : .: :: : :: : .: .:. :.
NP_057 RRAQELEMEMLSSTSP-----PERTRYSPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPA-KPEK
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE2 CGSNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGR-------ERKAMRVLPVVVGAFLLC
: : : . :: :. . : : .: :.:: ..: .:.:.:..:
NP_057 NGHAKDHPKI--AKIFEIQTMPNGKTRTSLKTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIIC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 WTPFFVVHITQALCPACSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVFNAEFRNVFRKALRAC
: :::..:: . : :..:: : :: :::::::::.::.:::.:: :::..: : :. :
NP_057 WLPFFITHILNIHCD-CNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILH-C
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 C
>>NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamine re (422 aa)
initn: 657 init1: 195 opt: 709 Z-score: 327.4 bits: 69.6 E(91410): 1.8e-11
Smith-Waterman score: 709; 32.5% identity (61.2% similar) in 418 aa overlap (18-418:16-417)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAG-----QGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLV
:: ..: ..:.. : ..:. :.:.. ::: ::. :
NP_000 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVL-GNACV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 CVSVATERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMD
...: ::.::. .: .: :::..::....::::. . .: . : :. :: ..:.:
NP_000 VAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLN-KWTLGQVTCDLFIALD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VMLCTASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNRQGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLN
:. ::.::..::::..::. :.. :. : . :: ::. :::.. .. : . :
NP_000 VLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWR
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 DVRGR-DPAVCRL-EDRDYVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGR
. : :: .: . .:. :..::. .:..: :::.:: ::. :... . .:
NP_000 TPEDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRA-ARFRIRKTVK----
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 APRRPSGPGPPSPTPPAPRLPQDPCGPDCAPPAP-GLPRGPCGPDCAPAAPSLPQDPCGP
. .: . :::. .. : . . :. : :: .: .: .
NP_000 -KVEKTGADTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAAL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE2 DCAP------PAPGLP-PDPCG-SNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGRERKA
. :: :. : . ::: :.. .. ... .:. .. ::::.
NP_000 EVIEVHRVGNSKEHLPLPSEAGPTPCAP------ASFERKNERNAEAKRKMALA-RERKT
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 MRVLPVVVGAFLLCWTPFFVVHITQALCPA-CSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVF
...: ...:.:.::: :::.: .. .: . : .: : . ..:::: :: ::::::. :
NP_000 VKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYF
350 360 370 380 390 400
410
pF1KE2 NAEFRNVFRKALRACC
: .:.:.:.: .. :
NP_000 NKDFQNAFKKIIK-CKFCRQ
410 420
>>NP_387512 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopamine r (367 aa)
initn: 871 init1: 403 opt: 596 Z-score: 280.4 bits: 60.7 E(91410): 7.5e-09
Smith-Waterman score: 868; 40.7% identity (63.5% similar) in 403 aa overlap (21-418:16-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAGQGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLVCVSVA
:: ...:. : : .. :: :.. ::.:::..:
NP_387 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMDVMLCT
:::::: :: ..::::.::::.: ::.: :: :: ::.: .: ::.....:::.::
NP_387 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 ASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNR---QGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLNDV
:::.::::::.::..::..:..:.. :.. :: :.: :.:.:. ::. :.: :.: .
NP_387 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFN-T
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RGRDPAVCRLEDRDYVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGRAPRR
: ::.:: . . :.:.:::: ::.:: . .:.: . :.. :: : : :
NP_387 TG-DPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQ----RRRK---RILTR
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSGPGPPSPTPPAPRLPQDPCGPDCAPPAPGLPRGPCGPDCAPAAPSLPQ--DPCGPDCA
.. .: ::.:. .:: :: : . . : : :
NP_387 QNS--------------------QCNSVRPGFPQQTLSPD--PAHLELKRYYSIC-QDTA
230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 PPAPGLPPDPCGSNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGRERKAMRVLPVVVGAF
.::. :.. . .: . .: ::.:: ... .:.:::
NP_387 LGGPGFQER--GGELKREEKTRNSLMPL----------------REKKATQMVAIVLGAF
270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LLCWTPFFVVHITQALCPACSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVFNAEFRNVFRKAL
..:: :::..:. .. : .: : :.: ::.::::::::::::::::.:: :::..: : :
NP_387 IVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKIL
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RACC
.:
NP_387 -SC
>>NP_001269492 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopamin (400 aa)
initn: 871 init1: 403 opt: 596 Z-score: 280.0 bits: 60.7 E(91410): 7.9e-09
Smith-Waterman score: 884; 40.9% identity (63.7% similar) in 408 aa overlap (21-418:16-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAGQGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLVCVSVA
:: ...:. : : .. :: :.. ::.:::..:
NP_001 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMDVMLCT
:::::: :: ..::::.::::.: ::.: :: :: ::.: .: ::.....:::.::
NP_001 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 ASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNR---QGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLNDV
:::.::::::.::..::..:..:.. :.. :: :.: :.:.:. ::. :.: :.: .
NP_001 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFN-T
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: ::.:: . . :.:.:::: ::.:: . .:.: . :.. :: .. : .
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.. :: :. : : : .: : : : :: . : .. .
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: :: : . :: ... . : :. : ::.:: ... .
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: : : .:
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:: ...:. : : .. :: :.. ::.:::..:
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: :: : . :: ... . : :. : ::.:: ... .
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:: ...:. : : .. :: :.. ::.:::..:
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: : : .:
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Smith-Waterman score: 835; 39.8% identity (61.0% similar) in 410 aa overlap (43-418:43-443)
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:::.... :: :::..:. :.:::: :: .
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NP_000 DMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPPSHHQLTLP
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NP_000 IYTTFNIEFRKAFLKILH-C
430 440
419 residues in 1 query sequences
64704883 residues in 91410 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Jul 20 18:04:05 2018 done: Fri Jul 20 18:04:06 2018
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]