FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9618, 399 aa 1>>>pF1KE9618 399 - 399 aa - 399 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3428+/-0.000756; mu= 13.4056+/- 0.046 mean_var=102.6008+/-20.551, 0's: 0 Z-trim(112.0): 22 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.126619 statistics sampled from 12807 (12824) to 12807 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.394), width: 16 Scan time: 3.300 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7691.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 ( 399) 2730 508.8 3.6e-144 CCDS53590.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 ( 257) 1755 330.5 1.1e-90 CCDS12523.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 389) 899 174.3 1.7e-43 CCDS46069.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 352) 882 171.2 1.4e-42 CCDS74361.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 234) 797 155.5 4.7e-38 CCDS7273.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 747) 681 134.6 2.8e-31 CCDS44412.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 452) 536 108.0 1.8e-23 CCDS81469.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 444) 462 94.5 2.1e-19 >>CCDS7691.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 (399 aa) initn: 2730 init1: 2730 opt: 2730 Z-score: 2701.7 bits: 508.8 E(32554): 3.6e-144 Smith-Waterman score: 2730; 100.0% identity (100.0% similar) in 399 aa overlap (1-399:1-399) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MAFWGWRAAAALRLWGRVVERVEAGGGVGPFQACGCRLVLGGRDDVSAGLRGSHGARGEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 MAFWGWRAAAALRLWGRVVERVEAGGGVGPFQACGCRLVLGGRDDVSAGLRGSHGARGEP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LDPARPLQRPPRPEVPRAFRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 LDPARPLQRPPRPEVPRAFRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 GKLSLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 GKLSLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 ELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 ELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 ASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 ASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 RFLLHVVDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLAWHPRSRDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 RFLLHVVDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLAWHPRSRDV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 AQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 AQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK 370 380 390 >>CCDS53590.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 (257 aa) initn: 1755 init1: 1755 opt: 1755 Z-score: 1741.9 bits: 330.5 E(32554): 1.1e-90 Smith-Waterman score: 1755; 100.0% identity (100.0% similar) in 257 aa overlap (143-399:1-257) 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 GSGGSSDKGKLSLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYD :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYD 10 20 30 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 LPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDG 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 LERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIV 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 FFGEPLPQRFLLHVVDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 FFGEPLPQRFLLHVVDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLA 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 pF1KE9 WHPRSRDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 WHPRSRDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK 220 230 240 250 >>CCDS12523.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (389 aa) initn: 984 init1: 610 opt: 899 Z-score: 894.2 bits: 174.3 E(32554): 1.7e-43 Smith-Waterman score: 985; 45.7% identity (70.8% similar) in 359 aa overlap (59-395:3-353) 30 40 50 60 70 80 pF1KE9 GPFQACGCRLVLGGRDDVSAGLRGSHGARGEPLDPARPLQRPPRPEVPRAFRRQPRAAAP :: ::..::. .: . : . 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CCDS12 PTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEY 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 PGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSL : .. .... .:.: : ..:::::::::: :: ::. . :: .::::..:::: CCDS12 PLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSL 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 pF1KE9 EVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRD--------------LVGPLAWHPRS--RDVAQLGDV .:.::::: . :.::::::.. : : . . .. :::: ::. CCDS12 QVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGEC 270 280 290 300 310 320 370 380 390 pF1KE9 VHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK .: .:.::::: .:..:::.:: ...: CCDS12 DQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPPAKDEARTTE 330 340 350 360 370 380 >>CCDS46069.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (352 aa) initn: 962 init1: 610 opt: 882 Z-score: 878.1 bits: 171.2 E(32554): 1.4e-42 Smith-Waterman score: 968; 48.7% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (109-395:9-316) 80 90 100 110 120 130 pF1KE9 FRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK--GKLSLQDVAELIRARA :.... :..... .:.:. ::. .... CCDS46 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSER 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE9 CQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLA :.::. .::::::: .::::::::..:::.::..: :::::::::. .: ..:.:::.:: CCDS46 CRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALA 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE9 KELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATC ::::::..::.. :::.:::.::::::: :::::: :::..:. :::::::: .. : CCDS46 KELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHC 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 TV--CQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMAD . :.. .: .. .... .:.: : ..:::::::::: :: ::. . :: .: CCDS46 VSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVD 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 pF1KE9 LLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRD--------------LVGPLAWHPRS-- :::..::::.:.::::: . :.::::::.. : : . . .. CCDS46 LLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAY 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 pF1KE9 RDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK :::: ::. .: .:.::::: .:..:::.:: ...: CCDS46 RDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPP 280 290 300 310 320 330 CCDS46 AKDEARTTEREKPQ 340 350 >>CCDS74361.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (234 aa) initn: 758 init1: 610 opt: 797 Z-score: 796.7 bits: 155.5 E(32554): 4.7e-38 Smith-Waterman score: 797; 52.3% identity (80.9% similar) in 220 aa overlap (109-323:9-228) 80 90 100 110 120 130 pF1KE9 FRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK--GKLSLQDVAELIRARA :.... :..... .:.:. ::. .... CCDS74 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSER 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE9 CQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLA :.::. .::::::: .::::::::..:::.::..: :::::::::. .: ..:.:::.:: CCDS74 CRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALA 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE9 KELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATC ::::::..::.. :::.:::.::::::: :::::: :::..:. :::::::: .. : CCDS74 KELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHC 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 TV--CQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMAD . :.. .: .. .... .:.: : ..:::::::::: :: ::. . :: .: CCDS74 VSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVD 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 LLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLAWHPRSRDVAQLGDVVHGVESL :::..::::. CCDS74 LLLVMGTSLQGRGLAG 220 230 >>CCDS7273.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (747 aa) initn: 694 init1: 266 opt: 681 Z-score: 674.9 bits: 134.6 E(32554): 2.8e-31 Smith-Waterman score: 683; 34.7% identity (63.7% similar) in 366 aa overlap (40-378:140-494) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 AALRLWGRVVERVEAGGGVGPFQACGCRLVLGGRDDVSAG----LRGSHGARGEPLDPAR .: ::.. : : :. ... : : CCDS72 PSREPPLADNLYDEDDDDEGEEEEEAAAAAIGYRDNLLFGDEIITNGFHSCESDEEDRAS 110 120 130 140 150 160 70 80 90 100 110 pF1KE9 PLQRP---PRPEV-PRAFRRQ-------PRAAAPSFFFSSIKGGR-RSISFSVGASSVVG . :::.. : .: .: ::. ... .: . .... . .... CCDS72 HASSSDWTPRPRIGPYTFVQQHLMIGTDPRTILKDLLPETIPPPELDDMTLWQIVINILS 170 180 190 200 210 220 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 SGGSSDKGKL--SLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQY . : : ...:...:.. :....:..:::.:. ::::::: .:.:. : CCDS72 EPPKRKKRKDINTIEDAVKLLQ--ECKKIIVLTGAGVSVSCGIPDFRSR-DGIYARLAVD 230 240 250 260 270 280 180 190 200 210 220 pF1KE9 --DLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQN ::: :.:.:.. .: ..:.::: .:::.:::...:.. : :. : .: ::: :::: CCDS72 FPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQN 290 300 310 320 330 340 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 IDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTG---- :: ::.:.:: ..... ::.::.:.: .:. : .:.:.. . ::::: : . CCDS72 IDTLEQVAGI--QRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPL 350 360 370 380 390 400 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 -VVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLI ..::.:::::: ::..: . : .:::...:.::.:.: : . .. ::..:: CCDS72 AIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILI 410 420 430 440 450 460 350 360 370 380 390 pF1KE9 NRDLVGPLAWHPRSR-DVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK ::. :: :. . :: ::: .. : . :: CCDS72 NRE---PL---PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPVKLSEITEKPPRTQ 470 480 490 500 510 CCDS72 KELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEK 520 530 540 550 560 570 >>CCDS44412.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (452 aa) initn: 525 init1: 229 opt: 536 Z-score: 534.9 bits: 108.0 E(32554): 1.8e-23 Smith-Waterman score: 536; 41.1% identity (69.1% similar) in 207 aa overlap (179-378:1-199) 150 160 170 180 190 200 pF1KE9 STPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNV .:.. .: ..:.::: .:::.:::...:.. CCDS44 MFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSL 10 20 30 210 220 230 240 250 260 pF1KE9 THYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDI : :. : .: ::: :::::: ::.:.:: ..... ::.::.:.: .:. : . CCDS44 CHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGI--QRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAV 40 50 60 70 80 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 RADVMADRVPRCPVCTG-----VVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSL :.:.. . ::::: : . ..::.:::::: ::..: . : .:::...:.:: CCDS44 RGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSL 90 100 110 120 130 140 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 EVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLAWHPRSR-DVAQLGDVVHGVESLVELLGWTE .:.: : . .. ::..::::. :: :. . :: ::: .. : . :: CCDS44 KVRPVALIPSSIPHEVPQILINRE---PL---PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEY 150 160 170 180 190 200 390 pF1KE9 EMRDLVQRETGKLDGPDK CCDS44 AKLCCNPVKLSEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLD 210 220 230 240 250 260 >>CCDS81469.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (444 aa) initn: 451 init1: 155 opt: 462 Z-score: 462.0 bits: 94.5 E(32554): 2.1e-19 Smith-Waterman score: 462; 41.0% identity (67.6% similar) in 188 aa overlap (198-378:12-191) 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 LQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYT :.:::...:.. : :. : .: ::: :: CCDS81 MCLCSGRKTILEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYT 10 20 30 40 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 QNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTG-- :::: ::.:.:: ..... ::.::.:.: .:. : .:.:.. . ::::: : . CCDS81 QNIDTLEQVAGI--QRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADE 50 60 70 80 90 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 ---VVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRL ..::.:::::: ::..: . : .:::...:.::.:.: : . .. ::.. CCDS81 PLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQI 100 110 120 130 140 150 350 360 370 380 390 pF1KE9 LINRDLVGPLAWHPRSR-DVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK ::::. :: :. . :: ::: .. : . :: CCDS81 LINRE---PL---PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPVKLSEITEKPPR 160 170 180 190 200 210 CCDS81 TQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCME 220 230 240 250 260 270 399 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 06:22:46 2016 done: Sun Nov 6 06:22:47 2016 Total Scan time: 3.300 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]