Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5647
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5647, 490 aa
1>>>pF1KE5647 490 - 490 aa - 490 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9832+/-0.000337; mu= 19.8730+/- 0.021
mean_var=63.0380+/-12.736, 0's: 0 Z-trim(115.0): 183 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.161537
statistics sampled from 24944 (25134) to 24944 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 8.940
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 3295 776.5 0
XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 3295 776.5 0
NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 3045 718.3 1.2e-206
NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 2841 670.7 2.5e-192
NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 2639 623.7 3.7e-178
NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 2273 538.3 1.6e-152
NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 2273 538.3 1.6e-152
NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 2088 495.2 1.4e-139
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 1980 470.1 6.4e-132
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 1697 404.1 4.6e-112
NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 1688 402.0 1.9e-111
XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 1688 402.1 2.2e-111
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 1677 399.5 1.1e-110
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 1667 397.1 5.8e-110
NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 1647 392.5 1.5e-108
XP_011524854 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1476 352.6 1.5e-96
XP_011524853 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1476 352.6 1.5e-96
XP_016881873 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 573) 1476 352.7 1.6e-96
XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 1461 349.1 1.5e-95
NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 1449 346.3 1.2e-94
XP_005258626 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 422) 1312 314.4 4.1e-85
XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 1299 311.3 3.4e-84
XP_011524849 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 386) 1296 310.6 5.1e-84
XP_011524848 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 416) 1296 310.6 5.4e-84
NP_001122397 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 i ( 431) 1296 310.6 5.5e-84
NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 1269 304.4 4.4e-82
NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 1225 294.1 6e-79
NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 1188 285.5 2.3e-76
XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 491) 1163 279.7 1.3e-74
XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 1163 279.7 1.3e-74
NP_060251 (OMIM: 615967) cytochrome P450 2W1 precu ( 490) 1133 272.7 1.7e-72
XP_011513742 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 564) 1078 259.9 1.4e-68
XP_011513743 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 475) 1077 259.6 1.4e-68
NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 1041 251.3 5.2e-66
NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 1030 248.7 2.9e-65
XP_011524855 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 456) 1026 247.7 5.1e-65
XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 974 235.5 1.6e-61
XP_011524857 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 415) 961 232.6 1.7e-60
XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 945 228.8 2.4e-59
XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 941 227.9 4.6e-59
XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 941 227.9 4.6e-59
XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 928 225.0 4.5e-58
XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 848 206.2 1.4e-52
XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 848 206.2 1.4e-52
XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 848 206.2 1.4e-52
XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 848 206.2 1.4e-52
XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 848 206.2 1.4e-52
XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 848 206.2 1.4e-52
XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 848 206.2 1.4e-52
XP_016881872 (OMIM: 608054) PREDICTED: cytochrome ( 293) 846 205.7 1.5e-52
>>NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C9 pr (490 aa)
initn: 3295 init1: 3295 opt: 3295 Z-score: 4145.7 bits: 776.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3295; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 PFYQLCFIPV
::::::::::
NP_000 PFYQLCFIPV
490
>>XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cytochro (490 aa)
initn: 3295 init1: 3295 opt: 3295 Z-score: 4145.7 bits: 776.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3295; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 PFYQLCFIPV
::::::::::
XP_016 PFYQLCFIPV
490
>>NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C19 p (490 aa)
initn: 3045 init1: 3045 opt: 3045 Z-score: 3830.8 bits: 718.3 E(85289): 1.2e-206
Smith-Waterman score: 3045; 91.4% identity (97.3% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
:: .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::.
NP_000 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
:::::::::::. .:::::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::::.:
NP_000 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
:::.:::::::::::::::::::::.:.:.::::::::: :::::::::::::::.:::
NP_000 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
.: :::::::::::::.:::.:::::::.::::::.:: ::::::.: ::.::.:::::
NP_000 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_000 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
:.:::::::::::.:::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_000 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
::.:::::::::::::::.:: :::::::: ::::::::::.:::.::::::::::::::
NP_000 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 PFYQLCFIPV
::::::::::
NP_000 PFYQLCFIPV
490
>>NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isoform (490 aa)
initn: 2841 init1: 2841 opt: 2841 Z-score: 3573.9 bits: 670.7 E(85289): 2.5e-192
Smith-Waterman score: 2841; 81.8% identity (95.1% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
:: :.::::::::.::::::::::::.:: ::::::.::::::. .::.::::::.:::
NP_000 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::: ::.::..:.:.::.:::::.:
NP_000 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
.::: :::::::.:::::::.:::..::::::::.:::: .:::.::.:::. .: :..
NP_000 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
:::.::..::::::.:::. .:::::::.:::.::::: ::::.::: :..:.::::::
NP_000 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::.::::::.:::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::.:::::
NP_000 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
::::.::::::::.::.::::::::::. :::::::..::::::::::: ::::..::::
NP_000 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
:: ::::::::::.:.::.:: ::::::::.::::::::: ::::..: ::..:.:. ::
NP_000 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 PFYQLCFIPV
:.::::::::
NP_000 PLYQLCFIPV
490
>>NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isoform a (490 aa)
initn: 2639 init1: 2639 opt: 2639 Z-score: 3319.4 bits: 623.7 E(85289): 3.7e-178
Smith-Waterman score: 2639; 78.0% identity (92.9% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
:. .:::::::: .::.:::::: : ::::::::::.:::.::: .::: ::.::.:::
NP_000 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
::::::.:::..::::.:::::::::::: :::::::: :...: ..:.::. ::::.:
NP_000 YGPVFTVYFGMNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
..:.::::::::.::.::...:::..::.:::::.:::: .:: :::::::.:::::.
NP_000 VVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
.::: ::::::: :.:.:::.:::::::.:::.:: :: :::.::.: .:..::: ::::
NP_000 RSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::.::::::::::::::::::..::::.::::::::::::::::::::.::: :
NP_000 TTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
:.::..::::: : :::::::::::::. :::::::.::::::..::: ::::..::::
NP_000 LVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
:: ::::::::::::.::.:: ::::::::.:::::::::. : :::.:: :..:..:.:
NP_000 KSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 PFYQLCFIPV
: ::.:::::
NP_000 PSYQICFIPV
490
>>NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (420 aa)
initn: 2273 init1: 2273 opt: 2273 Z-score: 2859.4 bits: 538.3 E(85289): 1.6e-152
Smith-Waterman score: 2273; 78.3% identity (93.3% similar) in 420 aa overlap (71-490:1-420)
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 NILQIGIKDISKSLTNLSKVYGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIF
..::::.:::::::::::: ::::::::
NP_001 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 PLAERANRGFGIVFSNGKKWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTK
:...: ..:.::. ::::.::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_001 PISQRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 ASPCDPTFILGCAPCNVICSIIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFS
::::::::::::::::::::..:.::::::::.::.::...:::..::.:::::.::::
NP_001 ASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 PIIDYFPGTHNKLLKNVAFMKSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPS
.:: :::::::.:::::. .::: ::::::: :.:.:::.:::::::.:::.:: :: :
NP_001 LLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKS
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 EFTIESLENTAVDLFGAGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQ
::.::.: .:..::: ::::::::::::.::::::::::::::::::..::::.::::::
NP_001 EFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 DRSHMPYTDAVVHEVQRYIDLLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKE
::::::::::::::.::: ::.::..::::: : :::::::::::::. :::::::.::
NP_001 DRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKE
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 FPNPEMFDPHHFLDEGGNFKKSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKS
::::..::: ::::..:::::: ::::::::::::.::.:: ::::::::.:::::::::
NP_001 FPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKS
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KE5 LVDPKNLDTTPVVNGFASVPPFYQLCFIPV
. : :::.:: :..:..:.:: ::.:::::
NP_001 VDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (420 aa)
initn: 2273 init1: 2273 opt: 2273 Z-score: 2859.4 bits: 538.3 E(85289): 1.6e-152
Smith-Waterman score: 2273; 78.3% identity (93.3% similar) in 420 aa overlap (71-490:1-420)
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 NILQIGIKDISKSLTNLSKVYGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIF
..::::.:::::::::::: ::::::::
NP_001 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 PLAERANRGFGIVFSNGKKWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTK
:...: ..:.::. ::::.::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_001 PISQRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 ASPCDPTFILGCAPCNVICSIIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFS
::::::::::::::::::::..:.::::::::.::.::...:::..::.:::::.::::
NP_001 ASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 PIIDYFPGTHNKLLKNVAFMKSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPS
.:: :::::::.:::::. .::: ::::::: :.:.:::.:::::::.:::.:: :: :
NP_001 LLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKS
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 EFTIESLENTAVDLFGAGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQ
::.::.: .:..::: ::::::::::::.::::::::::::::::::..::::.::::::
NP_001 EFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 DRSHMPYTDAVVHEVQRYIDLLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKE
::::::::::::::.::: ::.::..::::: : :::::::::::::. :::::::.::
NP_001 DRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKE
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 FPNPEMFDPHHFLDEGGNFKKSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKS
::::..::: ::::..:::::: ::::::::::::.::.:: ::::::::.:::::::::
NP_001 FPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKS
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KE5 LVDPKNLDTTPVVNGFASVPPFYQLCFIPV
. : :::.:: :..:..:.:: ::.:::::
NP_001 VDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (388 aa)
initn: 2088 init1: 2088 opt: 2088 Z-score: 2626.9 bits: 495.2 E(85289): 1.4e-139
Smith-Waterman score: 2088; 79.5% identity (93.7% similar) in 380 aa overlap (111-490:9-388)
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 EAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRS
::. ::::.::::::::: :::::::::::
NP_001 MFLQPIAKGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRS
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 IEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICSIIFHKRFDYKDQQFLNLMEK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::::.::.::..
NP_001 IEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKR
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 LNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFMKSYILEKVKEHQESMDMNNP
.:::..::.:::::.:::: .:: :::::::.:::::. .::: ::::::: :.:.:::
NP_001 FNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNP
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 QDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVT
.:::::::.:::.:: :: :::.::.: .:..::: ::::::::::::.:::::::::::
NP_001 RDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVT
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 AKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYIDLLPTSLPHAVTCDIKFRNYL
:::::::..::::.::::::::::::::::::::.::: ::.::..::::: : ::::::
NP_001 AKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYL
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 IPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFKKSKYFMPFSAGKRICVGEAL
:::::::. :::::::.::::::..::: ::::..:::::: ::::::::::::.::.:
NP_001 IPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGL
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490
pF1KE5 AGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVPPFYQLCFIPV
: ::::::::.:::::::::. : :::.:: :..:..:.:: ::.:::::
NP_001 ARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
340 350 360 370 380
>>NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precursor (493 aa)
initn: 1974 init1: 1620 opt: 1980 Z-score: 2489.4 bits: 470.1 E(85289): 6.4e-132
Smith-Waterman score: 1980; 57.7% identity (83.9% similar) in 485 aa overlap (5-489:8-491)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNL
:.:.. . :::.:.::: . .::::: :::.:::..:. .:.: ::.: :
NP_000 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 SKVYGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNG
.. .::::::: : . .::.:::.::::::.: .:::::: .: : .:.: ::.:.::
NP_000 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLP-AFHAHRDRGIIFNNG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KKWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNV
::.:::::: ::::.::::.. :.:.:.::. :.: ::::...: ::::..:::::::
NP_000 PTWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ICSIIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNV
: .:.:.:.:::.:..:: :: .:::...::.::.:. ::: .. :.::.: :..:::
NP_000 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFMKSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGA
: .: :. :.::::..:.: : :.:. ::.:..::::::. .:.... :..::: :
NP_000 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQR
:::::::::::.::.:.:.::. :..:::.:::: .: : ..::..::: ::::::.::
NP_000 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 YIDLLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGG
.: :.:..::: .: : ::.:::::::... .: :::.::.:::.:: : :.:::.:.:
NP_000 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 NFKKSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFA
.:: : :: :::.:::.:.::.:: :::::.: .:::.:::: :::::..: .:. ::.
NP_000 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARMELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE5 SVPPFYQLCFIPV
.:: :.:: ::
NP_000 CIPPRYKLCVIPRS
480 490
>>NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Homo sa (494 aa)
initn: 1675 init1: 1675 opt: 1697 Z-score: 2132.9 bits: 404.1 E(85289): 4.6e-112
Smith-Waterman score: 1697; 50.4% identity (81.1% similar) in 486 aa overlap (4-489:8-493)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTN
::.:. ::. ..:.:.::: ..:::::::::::: ::: ::.. ... .:: .
NP_000 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LSKVYGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSN
.:. ::::::...: . .::: :..::::::.: .::::::: . .:.:..:::
NP_000 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GKKWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCN
:.. :..::::. :::.::.:::.::.:.:::: :.. :: :... ::::.:. . :
NP_000 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 VICSIIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKN
:: ::.: ::::.:..::.:.. . .... .. :. . :: .. ..:: ... .:.
NP_000 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VAFMKSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFG
. ....: .::...:...: :.:.:::: ::..:..:..: .:: ...: :...::
NP_000 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 AGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQ
:::::.::::::..:::.::::: :::.:::.::::.::.: ..::..::::.::.::.:
NP_000 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 RYIDLLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEG
:. :.:: .: : :. : :::....:::: .. : :::.: . : ::. :.:.::::.
NP_000 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 GNFKKSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGF
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