FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9563, 479 aa 1>>>pF1KE9563 479 - 479 aa - 479 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1802+/-0.000896; mu= 19.1968+/- 0.054 mean_var=125.8901+/-41.803, 0's: 0 Z-trim(107.9): 303 B-trim: 1171 in 2/48 Lambda= 0.114308 statistics sampled from 9327 (9857) to 9327 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16 Scan time: 2.400 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 3247 547.4 1.2e-155 CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 2918 493.1 2.5e-139 CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 2916 492.7 3.1e-139 CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 797 143.4 5.5e-34 CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 782 140.8 2.7e-33 CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 782 140.9 2.8e-33 CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 782 140.9 2.9e-33 CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 782 140.9 2.9e-33 CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 753 136.2 8.9e-32 CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 709 128.7 1e-29 CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 685 124.7 1.6e-28 CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 626 115.2 1.6e-25 CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 608 112.1 1.2e-24 CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 597 110.3 4.2e-24 CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 541 101.1 2.5e-21 CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 535 100.0 4.5e-21 CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 523 98.0 1.8e-20 CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 523 98.1 1.8e-20 CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 517 97.0 3.5e-20 CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 506 95.3 1.3e-19 CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 506 95.3 1.4e-19 CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 476 90.4 4.4e-18 CCDS53867.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 387) 475 90.1 4.4e-18 CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 469 89.1 8.5e-18 CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 469 89.1 8.7e-18 CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 469 89.1 8.8e-18 CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 469 89.1 8.8e-18 CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 469 89.2 9.1e-18 CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 469 89.2 9.4e-18 CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 467 88.8 1.1e-17 CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 467 88.8 1.1e-17 CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 466 88.7 1.3e-17 CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 456 87.1 4.3e-17 CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 ( 419) 454 86.7 5.1e-17 CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 529) 452 86.5 7.4e-17 CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 546) 452 86.5 7.6e-17 CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 549) 452 86.5 7.6e-17 CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 448 85.8 1.1e-16 CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 444 85.0 1.5e-16 CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 444 85.0 1.6e-16 CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 424 81.8 1.7e-15 CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 416 80.7 4.8e-15 CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 404 78.6 1.8e-14 CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 403 78.4 1.9e-14 CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 396 77.2 4.2e-14 CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 396 77.2 4.2e-14 CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 389 76.1 9.1e-14 CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 377 74.1 3.7e-13 CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 374 73.4 4.3e-13 CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 374 73.6 5.1e-13 >>CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (479 aa) initn: 3247 init1: 3247 opt: 3247 Z-score: 2907.6 bits: 547.4 E(32554): 1.2e-155 Smith-Waterman score: 3247; 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CCDS74 LAERPERPEFVLQNADYCRKKGHDS 430 440 >>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (432 aa) initn: 2916 init1: 2916 opt: 2916 Z-score: 2613.1 bits: 492.7 E(32554): 3.1e-139 Smith-Waterman score: 2916; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 DAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 DAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 VSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 VSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 YLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 YLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQDFGYT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 IYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 IYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 LAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLADKMLTTVEKKVMIHD :::::::::::: CCDS74 LAERPERPEFVL 430 >>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 (520 aa) initn: 626 init1: 268 opt: 797 Z-score: 723.7 bits: 143.4 E(32554): 5.5e-34 Smith-Waterman score: 797; 36.4% identity (69.3% similar) in 352 aa overlap (64-409:28-373) 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 DGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITL :...:. . . .. . .: .: . : CCDS43 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFIL 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 LTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHF ..:.:: ::..:: ..:: :.::.::.::.::: .. .:.:: .. ...: :..:.. 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CCDS43 SKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSG 360 370 380 390 400 410 >>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (429 aa) initn: 644 init1: 324 opt: 782 Z-score: 711.2 bits: 140.8 E(32554): 2.7e-33 Smith-Waterman score: 782; 35.6% identity (62.6% similar) in 396 aa overlap (66-452:10-397) 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 GADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEK-VVIGSILTLITLL ..:.: . . : ...: :: . :. 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CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILF 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 TIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFF . :: ::..:: ..:.. ..: ::.::.::: .. .:.:: .. ...: : ::. : CCDS60 GVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLG-YWAFGRVF 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 CNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYP--VRQNGKCMAKMILSVWLLSAS ::.. :.::.::::::: ::.::::::.:.. :: :: : : :: .: :: :: CCDS60 CNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMA--LLCVWALSLV 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 ITLPPLFGWAQNVNDDK-VCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAA :.. ::::: : . .:. .: :... ::...:. .::.:....: :: ..: .:.. . CCDS60 ISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESR 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 KHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRLLK-HERKNISIFKREQKAATTLG : :. . :: . : . . . . : : : . :.::.::: ::: CCDS60 GLK-SGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFSREKKAAKTLG 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 IIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRD :.:: :..:::::::. :. . : : . .:::: :: :::.:: ... 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CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILF 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 TIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFF . :: ::..:: ..:.. ..: ::.::.::: .. .:.:: .. ...: : ::. : CCDS60 GVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLG-YWAFGRVF 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 CNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYP--VRQNGKCMAKMILSVWLLSAS ::.. :.::.::::::: ::.::::::.:.. :: :: : : :: .: :: :: CCDS60 CNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMA--LLCVWALSLV 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 ITLPPLFGWAQNVNDDK-VCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAA :.. ::::: : . .:. .: :... ::...:. .::.:....: :: ..: .:.. . 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CCDS34 ISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESR 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 KHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRLLK-HERKNISIFKREQKAATTLG : :. . :: . : . . . . : : : . :.::.::: ::: CCDS34 GLK-SGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFSREKKAAKTLG 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 IIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRD :.:: :..:::::::. :. . : : . .:::: :: :::.:: ... 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CCDS13 GEPGSAGAGGDVNGTAAVG-GLVVS---AQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACNR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 KLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI .:. .::.::.::.::: ....:.:: :.: . : : ::. ::.:. :.::.:::::: CCDS13 HLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPF-SATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASI 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 pF1KE9 MTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVN-DDK ..::.::.:::.:. . : ::. .. . : .. .:... ... ::.:: . : :.. CCDS13 LSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVPPDER 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 VCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPD-SVIA : :... ::...:.. .::.::.:.. :: ..: .:: :... : : . : .. 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CCDS59 NVTAIALDRYWSITRHMEYTLRTR-KCVSNVMIALTWALSAVISLAPLLFGWGETYSEGS 140 150 160 170 180 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 KVCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDS-VI . : .:.. .:...::. :::.:. :.::.:..:::::. ....: . : : : .. CCDS59 EECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYKAAKFRVGSRKTNS---VSPISEAV 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 ALNGIVKLQKEVEECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLS .. .: . : . . .. : . ..::.:: .::..:.:..::.:::: CCDS59 EVKDSAKQPQMVFTVRHATVTFQPEGDTWR-EQKEQRAALMVGILIGVFVLCWIPFFLTE 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 TARPFICGTSCSC-IP-LWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRN :. ::: :: .: . ::::::.::..::.::. ::.. ........ :. CCDS59 LISPL-----CSCDIPAIW-KSIFLWLGYSNSFFNPLIYTAFNKNYNSAFKNFFSRQH 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 INRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLAD 479 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 15:23:57 2016 done: Sun Nov 6 15:23:58 2016 Total Scan time: 2.400 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]