Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2295
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2295, 2136 aa
  1>>>pF1KE2295 2136 - 2136 aa - 2136 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1548+/-0.00116; mu= 7.2754+/- 0.070
 mean_var=179.3537+/-36.285, 0's: 0 Z-trim(108.3): 28  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.095768
 statistics sampled from 10099 (10114) to 10099 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.311), width:  16
 Scan time:  6.540

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7281.1 TET1 gene_id:80312|Hs108|chr10          (2136) 14256 1983.6       0
CCDS47120.1 TET2 gene_id:54790|Hs108|chr4          (2002) 1809 263.9 5.2e-69
CCDS46339.2 TET3 gene_id:200424|Hs108|chr2         (1795) 1727 252.5 1.2e-65


>>CCDS7281.1 TET1 gene_id:80312|Hs108|chr10               (2136 aa)
 initn: 14256 init1: 14256 opt: 14256  Z-score: 10646.2  bits: 1983.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 14256; 99.9% identity (100.0% similar) in 2136 aa overlap (1-2136:1-2136)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MSRSRHARPSRLVRKEDVNKKKKNSQLRKTTKGANKNVASVKTLSPGKLKQLIQERDVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MSRSRHARPSRLVRKEDVNKKKKNSQLRKTTKGANKNVASVKTLSPGKLKQLIQERDVKK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 KTEPKPPVPVRSLLTRAGAARMNLDRTEVLFQNPESLTCNGFTMALRSTSLSRRLSQPPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KTEPKPPVPVRSLLTRAGAARMNLDRTEVLFQNPESLTCNGFTMALRSTSLSRRLSQPPL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VVAKSKKVPLSKGLEKQHDCDYKILPALGVKHSENDSVPMQDTQVLPDIETLIGVQNPSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VVAKSKKVPLSKGLEKQHDCDYKILPALGVKHSENDSVPMQDTQVLPDIETLIGVQNPSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 LKGKSQETTQFWTQRVEDSKINIPTHSGPAAEILPGPLEGTRCGEGLFSEETLNDTSGSP
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LKGKSQETTQFWSQRVEDSKINIPTHSGPAAEILPGPLEGTRCGEGLFSEETLNDTSGSP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 KMFAQDTVCAPFPQRVTPKVTSQGNPSIQLEELGSRVESLKLSDSYLDPIKSEHDCYPTS
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KMFAQDTVCAPFPQRATPKVTSQGNPSIQLEELGSRVESLKLSDSYLDPIKSEHDCYPTS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SLNKVIPDLNLRNCLALGGSTSPTSVIKFLLAGSKQATLGAKPDHQEAFEATANQQEVSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SLNKVIPDLNLRNCLALGGSTSPTSVIKFLLAGSKQATLGAKPDHQEAFEATANQQEVSD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 TTSFLGQAFGAIPHQWELPGADPVHGEALGETPDLPEIPGAIPVQGEVFGTILDQQETLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TTSFLGQAFGAIPHQWELPGADPVHGEALGETPDLPEIPGAIPVQGEVFGTILDQQETLG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 MSGSVVPDLPVFLPVPPNPIATFNAPSKWPEPQSTVSYGLAVQGAIQILPLGSGHTPQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MSGSVVPDLPVFLPVPPNPIATFNAPSKWPEPQSTVSYGLAVQGAIQILPLGSGHTPQSS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SNSEKNSLPPVMAISNVENEKQVHISFLPANTQGFPLAPERGLFHASLGIAQLSQAGPSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SNSEKNSLPPVMAISNVENEKQVHISFLPANTQGFPLAPERGLFHASLGIAQLSQAGPSK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 SDRGSSQVSVTSTVHVVNTTVVTMPVPMVSTSSSSYTTLLPTLEKKKRKRCGVCEPCQQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SDRGSSQVSVTSTVHVVNTTVVTMPVPMVSTSSSSYTTLLPTLEKKKRKRCGVCEPCQQK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 TNCGECTYCKNRKNSHQICKKRKCEELKKKPSVVVPLEVIKENKRPQREKKPKVLKADFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TNCGECTYCKNRKNSHQICKKRKCEELKKKPSVVVPLEVIKENKRPQREKKPKVLKADFD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 NKPVNGPKSESMDYSRCGHGEEQKLELNPHTVENVTKNEDSMTGIEVEKWTQNKKSQLTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NKPVNGPKSESMDYSRCGHGEEQKLELNPHTVENVTKNEDSMTGIEVEKWTQNKKSQLTD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 HVKGDFSANVPEAEKSKNSEVDKKRTKSPKLFVQTVRNGIKHVHCLPAETNVSFKKFNIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HVKGDFSANVPEAEKSKNSEVDKKRTKSPKLFVQTVRNGIKHVHCLPAETNVSFKKFNIE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 EFGKTLENNSYKFLKDTANHKNAMSSVATDMSCDHLKGRSNVLVFQQPGFNCSSIPHSSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EFGKTLENNSYKFLKDTANHKNAMSSVATDMSCDHLKGRSNVLVFQQPGFNCSSIPHSSH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 SIINHHASIHNEGDQPKTPENIPSKEPKDGSPVQPSLLSLMKDRRLTLEQVVAIEALTQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SIINHHASIHNEGDQPKTPENIPSKEPKDGSPVQPSLLSLMKDRRLTLEQVVAIEALTQL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 SEAPSENSSPSKSEKDEESEQRTASLLNSCKAILYTVRKDLQDPNLQGEPPKLNHCPSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SEAPSENSSPSKSEKDEESEQRTASLLNSCKAILYTVRKDLQDPNLQGEPPKLNHCPSLE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 KQSSCNTVVFNGQTTTLSNSHINSATNQASTKSHEYSKVTNSLSLFIPKSNSSKIDTNKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KQSSCNTVVFNGQTTTLSNSHINSATNQASTKSHEYSKVTNSLSLFIPKSNSSKIDTNKS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 IAQGIITLDNCSNDLHQLPPRNNEVEYCNQLLDSSKKLDSDDLSCQDATHTQIEEDVATQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IAQGIITLDNCSNDLHQLPPRNNEVEYCNQLLDSSKKLDSDDLSCQDATHTQIEEDVATQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 LTQLASIIKINYIKPEDKKVESTPTSLVTCNVQQKYNQEKGTMQQKPPSSVHNNHGSSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS72 LTQLASIIKINYIKPEDKKVESTPTSLVTCNVQQKYNQEKGTIQQKPPSSVHNNHGSSLT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 KQKNPTQKKTKSTPSRDRRKKKPTVVSYQENDRQKWEKLSYMYGTICDIWIASKFQNFGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KQKNPTQKKTKSTPSRDRRKKKPTVVSYQENDRQKWEKLSYMYGTICDIWIASKFQNFGQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 FCPHDFPTVFGKISSSTKIWKPLAQTRSIMQPKTVFPPLTQIKLQRYPESAEEKVKVEPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FCPHDFPTVFGKISSSTKIWKPLAQTRSIMQPKTVFPPLTQIKLQRYPESAEEKVKVEPL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 DSLSLFHLKTESNGKAFTDKAYNSQVQLTVNANQKAHPLTQPSSPPNQCANVMAGDDQIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DSLSLFHLKTESNGKAFTDKAYNSQVQLTVNANQKAHPLTQPSSPPNQCANVMAGDDQIR
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 FQQVVKEQLMHQRLPTLPGISHETPLPESALTLRNVNVVCSGGITVVSTKSEEEVCSSSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FQQVVKEQLMHQRLPTLPGISHETPLPESALTLRNVNVVCSGGITVVSTKSEEEVCSSSF
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE2 GTSEFSTVDSAQKNFNDYAMNFFTNPTKNLVSITKDSELPTCSCLDRVIQKDKGPYYTHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GTSEFSTVDSAQKNFNDYAMNFFTNPTKNLVSITKDSELPTCSCLDRVIQKDKGPYYTHL
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE2 GAGPSVAAVREIMENRYGQKGNAIRIEIVVYTGKEGKSSHGCPIAKWVLRRSSDEEKVLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GAGPSVAAVREIMENRYGQKGNAIRIEIVVYTGKEGKSSHGCPIAKWVLRRSSDEEKVLC
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE2 LVRQRTGHHCPTAVMVVLIMVWDGIPLPMADRLYTELTENLKSYNGHPTDRRCTLNENRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LVRQRTGHHCPTAVMVVLIMVWDGIPLPMADRLYTELTENLKSYNGHPTDRRCTLNENRT
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE2 CTCQGIDPETCGASFSFGCSWSMYFNGCKFGRSPSPRRFRIDPSSPLHEKNLEDNLQSLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 CTCQGIDPETCGASFSFGCSWSMYFNGCKFGRSPSPRRFRIDPSSPLHEKNLEDNLQSLA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE2 TRLAPIYKQYAPVAYQNQVEYENVARECRLGSKEGRPFSGVTACLDFCAHPHRDIHNMNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TRLAPIYKQYAPVAYQNQVEYENVARECRLGSKEGRPFSGVTACLDFCAHPHRDIHNMNN
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE2 GSTVVCTLTREDNRSLGVIPQDEQLHVLPLYKLSDTDEFGSKEGMEAKIKSGAIEVLAPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GSTVVCTLTREDNRSLGVIPQDEQLHVLPLYKLSDTDEFGSKEGMEAKIKSGAIEVLAPR
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE2 RKKRTCFTQPVPRSGKKRAAMMTEVLAHKIRAVEKKPIPRIKRKNNSTTTNNSKPSSLPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RKKRTCFTQPVPRSGKKRAAMMTEVLAHKIRAVEKKPIPRIKRKNNSTTTNNSKPSSLPT
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE2 LGSNTETVQPEVKSETEPHFILKSSDNTKTYSLMPSAPHPVKEASPGFSWSPKTASATPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LGSNTETVQPEVKSETEPHFILKSSDNTKTYSLMPSAPHPVKEASPGFSWSPKTASATPA
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE2 PLKNDATASCGFSERSSTPHCTMPSGRLSGANAAAADGPGISQLGEVAPLPTLSAPVMEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PLKNDATASCGFSERSSTPHCTMPSGRLSGANAAAADGPGISQLGEVAPLPTLSAPVMEP
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE2 LINSEPSTGVTEPLTPHQPNHQPSFLTSPQDLASSPMEEDEQHSEADEPPSDEPLSDDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LINSEPSTGVTEPLTPHQPNHQPSFLTSPQDLASSPMEEDEQHSEADEPPSDEPLSDDPL
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE2 SPAEEKLPHIDEYWSDSEHIFLDANIGGVAIAPAHGSVLIECARRELHATTPVEHPNRNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SPAEEKLPHIDEYWSDSEHIFLDANIGGVAIAPAHGSVLIECARRELHATTPVEHPNRNH
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE2 PTRLSLVFYQHKNLNKPQHGFELNKIKFEAKEAKNKKMKASEQKDQAANEGPEQSSEVNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PTRLSLVFYQHKNLNKPQHGFELNKIKFEAKEAKNKKMKASEQKDQAANEGPEQSSEVNE
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      
pF1KE2 LNQIPSHKALTLTHDNVVTVSPYALTHVAGPYNHWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LNQIPSHKALTLTHDNVVTVSPYALTHVAGPYNHWV
             2110      2120      2130      

>>CCDS47120.1 TET2 gene_id:54790|Hs108|chr4               (2002 aa)
 initn: 2130 init1: 999 opt: 1809  Z-score: 1352.5  bits: 263.9 E(32554): 5.2e-69
Smith-Waterman score: 1859; 35.1% identity (62.6% similar) in 1070 aa overlap (941-1970:653-1674)

              920       930       940       950       960       970
pF1KE2 SKSEKDEESEQRTASLLNSCKAILYTVRKDLQDPNLQGEPPKLNHCPSLEKQSSCNTVVF
                                     .: :. : .  : .: :. . :: :.:   
CCDS47 KTTQLEHKSQMYQVEMNQGQSQGTVDQHLQFQKPSHQVHFSKTDHLPKAHVQSLCGTRFH
            630       640       650       660       670       680  

                       980       990        1000      1010         
pF1KE2 -----NGQTTTLSN----SHINSATNQAS--TKSHEYSKVTNSLSLFIPKSNSSKIDTNK
            ..::  : .    .:.:. ....   ..::  ..  .. .     :.::..  :.
CCDS47 FQQRADSQTEKLMSPVLKQHLNQQASETEPFSNSHLLQHKPHKQAAQTQPSQSSHLPQNQ
            690       700       710       720       730       740  

    1020      1030       1040       1050      1060      1070       
pF1KE2 SIAQGIITLDNCSNDLHQLP-PR-NNEVEYCNQLLDSSKKLDSDDLSCQDATHTQIE-ED
       .  : .  . :  . :. .: :. ::. .  .... ..:  .      : .  ...: ..
CCDS47 QQQQKL-QIKNKEEILQTFPHPQSNNDQQREGSFFGQTKVEECFHGENQYSKSSEFETHN
             750       760       770       780       790       800 

       1080      1090      1100       1110      1120      1130     
pF1KE2 VATQLTQLASIIKINYIKPEDKKVESTPTSL-VTCNVQQKYNQEKGTMQQKPPSSVHNNH
       :   : .. .: . :  .: .. ..:.  .. :.:. . .  .:.  .  .:   . :. 
CCDS47 VQMGLEEVQNINRRN--SPYSQTMKSSACKIQVSCSNNTHLVSENKEQTTHPELFAGNKT
             810         820       830       840       850         

        1140      1150      1160      1170      1180      1190     
pF1KE2 GSSLTKQKNPTQKKTKSTPSRDRRKKKPTVVSYQENDRQKWEKLSYMYGTICDIWIASKF
        .    :  :..      :..:  ..      .::.. :: .. : . :        :  
CCDS47 QNLHHMQYFPNN----VIPKQDLLHR-----CFQEQE-QKSQQASVLQGYKNRNQDMSGQ
     860       870           880             890       900         

          1200        1210      1220      1230       1240      1250
pF1KE2 Q--NFGQ--FCPHDFPTVFGKISSSTKIWKPLAQTRSIMQPKTV-FPPLTQIKLQRYPES
       :  ...:  .  :.  .::   ...       ..:..  :  :     :    ::.  ..
CCDS47 QAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGG------SHTQTPPQKDTQKHAALRWHLLQKQEQQ
     910       920       930             940       950       960   

             1260      1270      1280      1290      1300      1310
pF1KE2 AEEKVKVEPLDSLSLFHLKTESNGKAFTDKAYNSQVQLTVNANQKAHPLTQPSSPPNQCA
         .. ..:   :     .:.: . :       .. .. .   :.  . .:.  .:: .: 
CCDS47 QTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKP------HACMHTAPPENKTWKKVTKQENPPASCD
           970       980             990      1000      1010       

             1320      1330      1340      1350         1360       
pF1KE2 NVMAGDDQIRFQQVVKEQLMHQRLPTLPGISHETPLPESALTLRN---VNVVCSGGITVV
       ::         ::    . :.:.:  . . :    . ..::::..   :.:  :: .::.
CCDS47 NV---------QQKSIIETMEQHLKQFHAKSL---FDHKALTLKSQKQVKVEMSGPVTVL
               1020      1030      1040         1050      1060     

      1370                 1380      1390      1400      1410      
pF1KE2 STKSE-----------EEVCSSSFGTSEFSTVDSAQKNFNDYAMNFFTNPTKNLVS--IT
       . ..            :.  .::  :    :. :. .:: .   ... .: :::..  . 
CCDS47 TRQTTAAELDSHTPALEQQTTSSEKTPTKRTAASVLNNFIESPSKLLDTPIKNLLDTPVK
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

         1420      1430      1440      1450      1460      1470    
pF1KE2 KDSELPTCSCLDRVIQKDKGPYYTHLGAGPSVAAVREIMENRYGQKGNAIRIEIVVYTGK
        . ..:.: :....:.::.::.::::::::.:::.:::::.:.::::.::::: :.::::
CCDS47 TQYDFPSCRCVEQIIEKDEGPFYTHLGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVIYTGK
        1130      1140      1150      1160      1170      1180     

         1480      1490      1500      1510      1520      1530    
pF1KE2 EGKSSHGCPIAKWVLRRSSDEEKVLCLVRQRTGHHCPTAVMVVLIMVWDGIPLPMADRLY
       :::::.::::::::.::::.:::.:::::.:.:: : .::.:.::.::.:::: .::.::
CCDS47 EGKSSQGCPIAKWVVRRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLADKLY
        1190      1200      1210      1220      1230      1240     

         1540      1550      1560      1570      1580      1590    
pF1KE2 TELTENLKSYNGHPTDRRCTLNENRTCTCQGIDPETCGASFSFGCSWSMYFNGCKFGRSP
       .::::.:..: :  :.:::.:::.:::.:::.::::::::::::::::::.:::::.:: 
CCDS47 SELTETLRKY-GTLTNRRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKFARSK
        1250       1260      1270      1280      1290      1300    

         1600      1610      1620      1630      1640      1650    
pF1KE2 SPRRFRIDPSSPLHEKNLEDNLQSLATRLAPIYKQYAPVAYQNQVEYENVARECRLGSKE
        ::.:..  ..: .:..::..::.:.: .:: ::. :: ::.::.:::. : ::::: ::
CCDS47 IPRKFKLLGDDPKEEEKLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIEYEHRAPECRLGLKE
         1310      1320      1330      1340      1350      1360    

         1660      1670      1680      1690      1700      1710    
pF1KE2 GRPFSGVTACLDFCAHPHRDIHNMNNGSTVVCTLTREDNRSLGVIPQDEQLHVLPLYKLS
       :::::::::::::::: :::.:::.::::.:::::::::: .:  :.:::::::::::.:
CCDS47 GRPFSGVTACLDFCAHAHRDLHNMQNGSTLVCTLTREDNREFGGKPEDEQLHVLPLYKVS
         1370      1380      1390      1400      1410      1420    

         1720      1730      1740      1750      1760      1770    
pF1KE2 DTDEFGSKEGMEAKIKSGAIEVLAPRRKKRTCFTQPVPRSGKKRAAMMTEVLAHKIRAVE
       :.::::: :..: : .::::.::.  :.:   ...:: .. ..:     .. :.:. ..:
CCDS47 DVDEFGSVEAQEEKKRSGAIQVLSSFRRKVRMLAEPV-KTCRQRKLEAKKAAAEKLSSLE
         1430      1440      1450      1460       1470      1480   

         1780      1790      1800       1810      1820      1830   
pF1KE2 KKPIPRIKRKNNSTTTNNSKPSSLPT-LGSNTETVQPEVKSETEPHFILKSSDNTKTYSL
       ..     :.:.  . :.... .:    :.   .   : ...  .:. . :.  . .  . 
CCDS47 NSSNKNEKEKSAPSRTKQTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQPQPLQKQPPQPQQQQR
          1490      1500      1510      1520      1530      1540   

            1840      1850      1860      1870      1880      1890 
pF1KE2 -MPSAPH-PVKEASPGFSWSPKTASATPAPLKNDATASCGFSERSSTPHCTMPSGRLSGA
        . . :: :  :.  ..: : .:      :  : ..   . :. :.    : : .  : .
CCDS47 PQQQQPHHPQTESVNSYSASGSTNPYMRRP--NPVSPYPNSSHTSDIYGSTSPMNFYSTS
          1550      1560      1570        1580      1590      1600 

            1900      1910       1920      1930      1940      1950
pF1KE2 NAAAADGPGISQLGEVAPLP-TLSAPVMEPLINSEPSTGVTEPLTPHQPNHQPSFLTSPQ
       . ::  :  ... . . : :  :.  .. :  . . . .: .  .:.  ...:.  ..:.
CCDS47 SQAA--GSYLNSSNPMNPYPGLLNQNTQYPSYQCNGNLSV-DNCSPYLGSYSPQ--SQPM
              1610      1620      1630       1640      1650        

             1960      1970      1980      1990      2000      2010
pF1KE2 DLASSPMEEDEQHSEADEPPSDEPLSDDPLSPAEEKLPHIDEYWSDSEHIFLDANIGGVA
       ::   : ..    :. . ::                                        
CCDS47 DLYRYPSQDPL--SKLSLPPIHTLYQPRFGNSQSFTSKYLGYGNQNMQGDGFSSCTIRPN
       1660        1670      1680      1690      1700      1710    

>--
 initn: 528 init1: 414 opt: 510  Z-score: 382.5  bits: 84.4 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 510; 50.0% identity (78.1% similar) in 160 aa overlap (1991-2136:1844-2002)

             1970      1980      1990      2000      2010      2020
pF1KE2 EQHSEADEPPSDEPLSDDPLSPAEEKLPHIDEYWSDSEHIFLDANIGGVAIAPAHGSVLI
                                     :: :::::. ::: .:::::.::.:::.::
CCDS47 GGLHKLSDANGQEKQPLALVQGVASGAEDNDEVWSDSEQSFLDPDIGGVAVAPTHGSILI
          1820      1830      1840      1850      1860      1870   

             2030      2040      2050      2060      2070          
pF1KE2 ECARRELHATTPVEHPNRNHPTRLSLVFYQHKNLNKPQHGFELNKIKFEAKEAKNKK---
       :::.::::::::...::::::::.::::::::..:.:.::. : . :. :..:..:.   
CCDS47 ECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLVFYQHKSMNEPKHGLALWEAKM-AEKAREKEEEC
          1880      1890      1900      1910      1920       1930  

               2080      2090      2100        2110      2120      
pF1KE2 ---------MKASEQKDQAANEGPEQSSEVNELNQIPS--HKALTLTHDNVVTVSPYALT
                .:.  .: .     :...:: . :  : :  ......: :..::.::::.:
CCDS47 EKYGPDYVPQKSHGKKVKREPAEPHETSEPTYLRFIKSLAERTMSVTTDSTVTTSPYAFT
           1940      1950      1960      1970      1980      1990  

       2130      
pF1KE2 HVAGPYNHWV
       .:.::::...
CCDS47 RVTGPYNRYI
           2000  

>>CCDS46339.2 TET3 gene_id:200424|Hs108|chr2              (1795 aa)
 initn: 1717 init1: 958 opt: 1727  Z-score: 1292.0  bits: 252.5 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 2049; 31.6% identity (57.0% similar) in 1510 aa overlap (585-2013:51-1446)

          560       570       580       590       600       610    
pF1KE2 HVVNTTVVTMPVPMVSTSSSSYTTLLPTLEKKKRKRCGVCEPCQQKTNCGECTYCKNRKN
                                     .:::::::.::::..  ::: :: : ::. 
CCDS46 PQRQVMVGSFPGSGLSMAGSESQLRGGGDGRKKRKRCGTCEPCRRLENCGACTSCTNRR-
               30        40        50        60        70          

          620       630       640       650       660       670    
pF1KE2 SHQICKKRKCEELKKKPSVVVPLEVIKENKRPQREKKPKVLKADFDNKPVNGPKSESMDY
       .::::: :::: :::: ...  .: :: ..      .  ..:.  . .::.::   .:: 
CCDS46 THQICKLRKCEVLKKKVGLLKEVE-IKAGEGAGPWGQGAAVKTGSELSPVDGPVPGQMDS
      80        90       100        110       120       130        

          680       690       700        710                   720 
pF1KE2 SRCGHGEEQKLELNPHTVENVTKNED-SMTGIEVEKWTQNKK------------SQLTD-
       .   ::. ..:  .   :... .    :. :     :  ..:            ..: : 
CCDS46 GPVYHGDSRQLSASGVPVNGAREPAGPSLLGTG-GPWRVDQKPDWEAAPGPAHTARLEDA
      140       150       160       170        180       190       

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 HVKGDFSANVPEAEKSKNSEVDKKRTKSPKLFVQTVRNGIKHVHCLPAETNVSFKKFNIE
       :    ::: : :: .: ..   .      . . . . :. .  .  :   ... . ..  
CCDS46 HDLVAFSA-VAEAVSSYGALSTRLYETFNREMSREAGNNSRGPRPGPEGCSAGSEDLDTL
       200        210       220       230       240       250      

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 EFGKTLENNSYKFLKDTANHKNAMSSVATDMSCDHLKGRSNVLVFQQPGFNCSSIPHSSH
       . . .:  ...:       . :  .    :.  . :.:. . .:..  : .   .:    
CCDS46 QTALALARHGMK-----PPNCNCDGPECPDY-LEWLEGKIKSVVMEG-GEERPRLP---G
        260            270       280        290        300         

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 SIINHHASIHNEGDQPKTPENIPSKEPKDGSPVQPSLLSLMKDRRLTLEQVVAIEALTQL
        .   .:..   . .:    ..:.  :..: :.. : ::. :.. ..:. ..::::::::
CCDS46 PLPPGEAGLPAPSTRPLLSSEVPQISPQEGLPLSQSALSIAKEKNISLQTAIAIEALTQL
        310       320       330       340       350       360      

                 910       920       930       940       950       
pF1KE2 SEA---PSENSSPSKSEKDEESEQRTASLLNSCKAILYTVRKDLQDPNLQGEPPKLNHCP
       : :   :: .:.:. :    :.         :  : . . .. :. :.    ::.     
CCDS46 SSALPQPS-HSTPQASCPLPEAL--------SPPAPFRSPQSYLRAPSWPVVPPE-----
        370        380               390       400       410       

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KE2 SLEKQSSCNTVVFNGQTTTLSNSHINSATNQASTKSHEYSKVTNSLSLFIPKSNSSKIDT
                                            :.:. . . : : : .  ...  
CCDS46 -------------------------------------EHSSFAPDSSAFPPATPRTEFPE
                                                 420       430     

      1020      1030       1040      1050      1060      1070      
pF1KE2 NKSIAQGIITLDNCSNDLHQLP-PRNNEVEYCNQLLDSSKKLDSDDLSCQDATHTQIEED
           : :  :      .   .: :  . .   .::: :..   .. ..  .:  :. .  
CCDS46 ----AWGTDTPPATPRSSWPMPRPSPDPMAELEQLLGSASDYIQSVFKRPEALPTKPKVK
             440       450       460       470       480       490 

       1080      1090      1100      1110      1120      1130      
pF1KE2 VATQLTQLASIIKINYIKPEDKKVESTPTSLVTCNVQQKYNQEKGTMQQKPPSSVHNNHG
       : .  .. :   .     :  ..   ::.:    ...::    . ..::      : .: 
CCDS46 VEAPSSSPAPAPS-----PVLQREAPTPSS--EPDTHQK---AQTALQQ------HLHHK
             500            510         520          530           

        1140      1150      1160      1170      1180      1190     
pF1KE2 SSL-TKQKNPTQKKTKSTPSRDRRKKKPTVVSYQENDRQKWEKLSYMYGTICDIWIASKF
        ::  .: . :.  . : ::       :.    .  ::   ::              .:.
CCDS46 RSLFLEQVHDTSFPAPSEPSAPGWWPPPSSPVPRLPDRPPKEK-------------KKKL
         540       550       560       570                    580  

        1200      1210        1220       1230      1240      1250  
pF1KE2 QNFGQFCPHDFPTVFGKISSSTK--IWKPLAQTRS-IMQPKTVFPPLTQIKLQRYPESAE
        .     :   :.   : . . :  . ::.   .:   . . .:::. :: :.     : 
CCDS46 PT-----PAGGPVGTEKAAPGIKPSVRKPIQIKKSRPREAQPLFPPVRQIVLEGLRSPAS
                 590       600       610       620       630       

           1260           1270      1280      1290      1300       
pF1KE2 EKVKVEPLDSL-----SLFHLKTESNGKAFTDKAYNSQVQLTVNANQKAHPLTQPSSPPN
       ..:...:   :     :   :  : .   :. .   ...   ..  ..  :.:  .  :.
CCDS46 QEVQAHPPAPLPASQGSAVPLPPEPSLALFAPSPSRDSLLPPTQEMRSPSPMT--ALQPG
       640       650       660       670       680       690       

      1310           1320      1330      1340           1350       
pF1KE2 QCANVMAGDDQI-----RFQQVVKEQLMHQRLPTLPGISHET-----PLPESALTLRN--
       . . .  .::..     .:.    ...     :..:  . :.     : ::: .. :.  
CCDS46 STGPLPPADDKLEELIRQFEAEFGDSFGLPGPPSVPIQDPENQQTCLPAPESPFATRSPK
         700       710       720       730       740       750     

         1360      1370        1380      1390      1400      1410  
pF1KE2 -VNVVCSGGITVVSTKS--EEEVCSSSFGTSEFSTVDSAQKNFNDYAMNFFTNPTKNLVS
        ...  ::..::.::     ::  . .  :.  . .  . ..: .  .... .:::.:..
CCDS46 QIKIESSGAVTVLSTTCFHSEEGGQEATPTKAENPLTPTLSGFLESPLKYLDTPTKSLLD
         760       770       780       790       800       810     

              1420      1430      1440      1450      1460         
pF1KE2 ITK---DSELPTCSCLDRVIQKDKGPYYTHLGAGPSVAAVREIMENRYGQKGNAIRIEIV
             ..:.:::.:......::.::::::::.::.::..::.::.:::.::.::::: :
CCDS46 TPAKRAQAEFPTCDCVEQIVEKDEGPYYTHLGSGPTVASIRELMEERYGEKGKAIRIEKV
         820       830       840       850       860       870     

    1470      1480      1490      1500      1510      1520         
pF1KE2 VYTGKEGKSSHGCPIAKWVLRRSSDEEKVLCLVRQRTGHHCPTAVMVVLIMVWDGIPLPM
       .:::::::::.::::::::.:: . :::.:::::.:.:::: .::.:.::..:.:::  .
CCDS46 IYTGKEGKSSRGCPIAKWVIRRHTLEEKLLCLVRHRAGHHCQNAVIVILILAWEGIPRSL
         880       890       900       910       920       930     

    1530      1540      1550      1560      1570      1580         
pF1KE2 ADRLYTELTENLKSYNGHPTDRRCTLNENRTCTCQGIDPETCGASFSFGCSWSMYFNGCK
       .: :: :::..:..: :.::.::: ::..:::.::: ::.::::::::::::::::::::
CCDS46 GDTLYQELTDTLRKY-GNPTSRRCGLNDDRTCACQGKDPNTCGASFSFGCSWSMYFNGCK
         940       950        960       970       980       990    

    1590      1600      1610      1620      1630      1640         
pF1KE2 FGRSPSPRRFRIDPSSPLHEKNLEDNLQSLATRLAPIYKQYAPVAYQNQVEYENVARECR
       ..:: .::.::.  ..: .:. :. ..:.:::..::.::. :: ::::::  :..: .::
CCDS46 YARSKTPRKFRLAGDNPKEEEVLRKSFQDLATEVAPLYKRLAPQAYQNQVTNEEIAIDCR
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

    1650      1660      1670      1680      1690      1700         
pF1KE2 LGSKEGRPFSGVTACLDFCAHPHRDIHNMNNGSTVVCTLTREDNRSLGVIPQDEQLHVLP
       :: ::::::.:::::.::::: :.: ::. :: :::::::.:::: .: ::.::::::::
CCDS46 LGLKEGRPFAGVTACMDFCAHAHKDQHNLYNGCTVVCTLTKEDNRCVGKIPEDEQLHVLP
         1060      1070      1080      1090      1100      1110    

    1710      1720      1730        1740      1750       1760      
pF1KE2 LYKLSDTDEFGSKEGMEAKIKSGAIEVLA--PRRKKRTCFTQPVP-RSGKKRAAMMTEVL
       :::...::::::.:...::. ::::.::.  ::. .:     : : .: ..:     .. 
CCDS46 LYKMANTDEFGSEENQNAKVGSGAIQVLTAFPREVRRL----PEPAKSCRQRQLEARKAA
         1120      1130      1140      1150          1160      1170

       1770        1780      1790      1800      1810      1820    
pF1KE2 AHKIRAV-EKKPIP-RIKRKNNSTTTNNSKPSSLPTLGSNTETVQPEVKSETEPHFI-LK
       :.: .   ::   : .::..    .  .: :.     : . . ..: .: : . ::  .:
CCDS46 AEKKKIQKEKLSTPEKIKQEALELAGITSDPGLSLKGGLSQQGLKPSLKVEPQNHFSSFK
             1180      1190      1200      1210      1220      1230

            1830          1840      1850        1860      1870     
pF1KE2 SSDNT--KTYSLM----PSAPHPVKEASPGFSW--SPKTASATPAPLKNDATASCGFSER
        : :.  ..::..    :: :. .. .    :.  .:. .:..    :    .   ..  
CCDS46 YSGNAVVESYSVLGNCRPSDPYSMNSVYSYHSYYAQPSLTSVNGFHSKYALPSFSYYGFP
             1240      1250      1260      1270      1280      1290

        1880             1890      1900                1910        
pF1KE2 SSTPHCTMPSGRL-------SGANAAAADGPGISQL----------GEVAPLPTLSAPV-
       ::.:  ..::  :       ::....    : .  :          .: : ::. ..:. 
CCDS46 SSNP--VFPSQFLGPGAWGHSGSSGSFEKKPDLHALHNSLSPAYGGAEFAELPSQAVPTD
               1300      1310      1320      1330      1340        

       1920        1930      1940       1950      1960      1970   
pF1KE2 -MEPLIN-SEPS-TGVTEPLTPHQPN-HQPSFLTSPQDLASSPMEEDEQHSEADEPPSDE
         .:  . ..:.  :  : : :. :  :. :   ::   .:. .... ..  .:   . :
CCDS46 AHHPTPHHQQPAYPGPKEYLLPKAPLLHSVSRDPSPFAQSSNCYNRSIKQEPVDPLTQAE
     1350      1360      1370      1380      1390      1400        

          1980      1990      2000      2010      2020      2030   
pF1KE2 PLSDDPLSPAEEKLPHIDEYWSDSEHIFLDANIGGVAIAPAHGSVLIECARRELHATTPV
       :.  :  . ..  : ....  . : :.. . . :: ...:                    
CCDS46 PVPRDAGKMGKTPLSEVSQNGGPS-HLWGQYS-GGPSMSPKRTNGVGGSWGVFSSGESPA
     1410      1420      1430        1440      1450      1460      

          2040      2050      2060      2070      2080      2090   
pF1KE2 EHPNRNHPTRLSLVFYQHKNLNKPQHGFELNKIKFEAKEAKNKKMKASEQKDQAANEGPE
                                                                   
CCDS46 IVPDKLSSFGASCLAPSHFTDGQWGLFPGEGQQAASHSGGRLRGKPWSPCKFGNSTSALA
       1470      1480      1490      1500      1510      1520      

>--
 initn: 595 init1: 425 opt: 553  Z-score: 415.4  bits: 90.3 E(32554): 8.1e-17
Smith-Waterman score: 553; 35.1% identity (62.5% similar) in 339 aa overlap (1826-2136:1470-1795)

        1800      1810      1820      1830      1840        1850   
pF1KE2 SSLPTLGSNTETVQPEVKSETEPHFILKSSDNTKTYSLMPSAPHPVKEASPGF--SWSPK
                                     :. ....    ::    ... :.  . . .
CCDS46 GGPSMSPKRTNGVGGSWGVFSSGESPAIVPDKLSSFGASCLAPSHFTDGQWGLFPGEGQQ
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

          1860      1870         1880      1890        1900        
pF1KE2 TASATPAPLKNDATASCGFSERSST---PHCTMPSGRLSGA--NAAAADGPGISQL----
       .:: . . :..   . : :.. .:.   :  :     :...  :.:   .::...     
CCDS46 AASHSGGRLRGKPWSPCKFGNSTSALAGPSLTEKPWALGAGDFNSALKGSPGFQDKLWNP
    1500      1510      1520      1530      1540      1550         

           1910      1920       1930      1940      1950      1960 
pF1KE2 --GEVAPLPTLSAPVMEPLINSEP-STGVTEPLTPHQPNHQPSFLTSPQDLASSPMEEDE
         :: . .:. .:  ..   .:     : .: :     ...   : .: .:  .:     
CCDS46 MKGEEGRIPAAGASQLDRAWQSFGLPLGSSEKLFGALKSEEK--LWDPFSLEEGP-----
    1560      1570      1580      1590      1600        1610       

            1970      1980      1990      2000      2010      2020 
pF1KE2 QHSEADEPPSDEPLSDDPLSPAEEKLPHIDEYWSDSEHIFLDANIGGVAIAPAHGSVLIE
           :.::::   ....  . . :.  . .: :::::: ::: ::::::.::::::.:::
CCDS46 ----AEEPPSKGAVKEEKGGGGAEE--EEEELWSDSEHNFLDENIGGVAVAPAHGSILIE
               1620      1630        1640      1650      1660      

            2030      2040      2050      2060        2070         
pF1KE2 CARRELHATTPVEHPNRNHPTRLSLVFYQHKNLNKPQHGFEL--NKIKFEAKEAKNKKMK
       :::::::::::...::: ::::.:::::::::::.:.::. :   :.:  :..:. .. .
CCDS46 CARRELHATTPLKKPNRCHPTRISLVFYQHKNLNQPNHGLALWEAKMKQLAERARARQEE
       1670      1680      1690      1700      1710      1720      

    2080         2090         2100            2110      2120       
pF1KE2 ASEQ---KDQAANEGPEQS---SEVNELNQ------IPSHKALTLTHDNVVTVSPYALTH
       :..    ...:   : ...   . : : .:      .:...::..  :..:::: :: :.
CCDS46 AARLGLGQQEAKLYGKKRKWGGTVVAEPQQKEKKGVVPTRQALAVPTDSAVTVSSYAYTK
       1730      1740      1750      1760      1770      1780      

      2130      
pF1KE2 VAGPYNHWV
       :.:::..:.
CCDS46 VTGPYSRWI
       1790     




2136 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 15:27:14 2016 done: Sun Nov  6 15:27:16 2016
 Total Scan time:  6.540 Total Display time:  0.400

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com