Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6496
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6496, 532 aa
1>>>pF1KE6496 532 - 532 aa - 532 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6237+/-0.000871; mu= 18.2366+/- 0.053
mean_var=89.1851+/-17.881, 0's: 0 Z-trim(108.5): 23 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.135809
statistics sampled from 10263 (10279) to 10263 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7231.1 SLC18A3 gene_id:6572|Hs108|chr10 ( 532) 3483 692.5 3.1e-199
CCDS6013.1 SLC18A1 gene_id:6570|Hs108|chr8 ( 525) 1034 212.7 8.5e-55
CCDS7599.1 SLC18A2 gene_id:6571|Hs108|chr10 ( 514) 1014 208.8 1.3e-53
CCDS47815.1 SLC18A1 gene_id:6570|Hs108|chr8 ( 472) 944 195.0 1.6e-49
CCDS47814.1 SLC18A1 gene_id:6570|Hs108|chr8 ( 493) 580 123.7 4.8e-28
>>CCDS7231.1 SLC18A3 gene_id:6572|Hs108|chr10 (532 aa)
initn: 3483 init1: 3483 opt: 3483 Z-score: 3690.4 bits: 692.5 E(32554): 3.1e-199
Smith-Waterman score: 3483; 99.8% identity (99.8% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
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CCDS72 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IAHMRGGGEGPTRTPEVWEPTLPLPTPANASAYTANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IAHMRGGGEGPTRTPEVWEPTLPLPTPANASAYTANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDVPLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDVPLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRALGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRALGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARARANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARARANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLPAFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 CNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLPAFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFGIALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFGIALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 YAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSLGMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSLGMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 ERDVLLDEPPQGLYDAVRLRERPVSGQDGEPRSPPGPFDECEDDYNYYYTRS
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CCDS72 ERDVLLDEPPQGLYDAVRLRERPVSGQDGEPRSPPGPFDACEDDYNYYYTRS
490 500 510 520 530
>>CCDS6013.1 SLC18A1 gene_id:6570|Hs108|chr8 (525 aa)
initn: 1171 init1: 510 opt: 1034 Z-score: 1097.3 bits: 212.7 E(32554): 8.5e-55
Smith-Waterman score: 1134; 38.3% identity (67.9% similar) in 517 aa overlap (25-510:13-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
:.: : .:.::::.: :::::::::. :.::::: .
CCDS60 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
CCDS60 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
: :. . . .. :. : : ...::::::::..::::::. ::. .:..: .
CCDS60 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
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CCDS60 PMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQGIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARAR
.:.::. ...: ::. :::...:::.:: .:::.:: ..:.:. : : . .: : ..
CCDS60 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
:. :::. :. :::: :.::.. :. .:.::::. :: .:: . .:..:.:.::
CCDS60 AK---GTPLFMLLKDPYILVAAGSICFANMGVAILEPTLPIWMMQTMCSPKWQLGLAFLP
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
CCDS60 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 IALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSL
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CCDS60 IGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGPSTGGAIVKAIGFPWLMV
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE6 GMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSERDVLL--DEPPQGLYDAVR--LRERPVSGQDG
:. :..:::. ::. .. :. ..: : : . . :.. .: :. :.:.
CCDS60 ITGVINIVYAPLCYYLRS----PPAKEEKLAILSQDCPMETRMYATQKPTKEFPL-GEDS
470 480 490 500 510
510 520 530
pF1KE6 EPRSPPGPFDECEDDYNYYYTRS
.
CCDS60 DEEPDHEE
520
>>CCDS7599.1 SLC18A2 gene_id:6571|Hs108|chr10 (514 aa)
initn: 1138 init1: 467 opt: 1014 Z-score: 1076.2 bits: 208.8 E(32554): 1.3e-53
Smith-Waterman score: 1154; 37.7% identity (69.9% similar) in 522 aa overlap (17-513:3-513)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSE-AVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPD
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CCDS75 MALSELALVRWLQESRRSRKLILFIVFLALLLDNMLLTVVVPIIPS
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KE6 Y---IAHMRGGGE----GPTRTPEVWEPTLPLPTPA-NASAYTANTSASPTAAWPA----
: : : ... : :..: . . . . :.. :.:.. . : :
CCDS75 YLYSIKHEKNATEIQTARPVHTASISDSFQSIFSYYDNSTMVTGNATRDLTLHQTATQHM
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KE6 ---GSALRPRYPTESED-----VKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDVPLLIGL
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CCDS75 VTNASAVPSDCPSEDKDLLNENVQVGLLFASKATVQLITNPFIGLLTNRIGYPIPIFAGF
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 GVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRALGVALA
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CCDS75 CIMFVSTIMFAFSSSYAFLLIARSLQGIGSSCSSVAGMGMLASVYTDDEERGNVMGIALG
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARARANLPVG
...: ::.::::..::::.:: .:::::::. :.:. . : : .: .:.. . :
CCDS75 GLAMGVLVGPPFGSVLYEFVGKTAPFLVLAALVLLDGAIQLFVLQP----SRVQPESQKG
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 TPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLPAFVPHV
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CCDS75 TPLTTLLKDPYILIAAGSICFANMGIAMLEPALPIWMMETMCSRKWQLGVAFLPASISYL
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 LGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFGIALVDT
.:. . :: .. .:: . ::. ..:.: .: ... :.. :. :.:..::.
CCDS75 IGTNIFGILAHKMG--RWLCALLGMIIVGVSILCIPFAKNIYGLIAPNFGVGFAIGMVDS
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 ALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSLGMGLAN
...: ...:::.::::::::::::::... ..::.:: ..: :....:: : .:. .
CCDS75 SMMPIMGYLVDLRHVSVYGSVYAIADVAFCMGYAIGPSAGGAIAKAIGFPWLMTIIGIID
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 LLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSER-DVLLDE--PPQG-LYDAVRLRERPVSGQDGEPRSPP
.:.::. ..::. .. :. .:.:. : . .: .. :. :.: : .:
CCDS75 ILFAPLCFFLRS----PPAKEEKMAILMDHNCPIKTKMYTQNNIQSYPI-GEDEESESD
470 480 490 500 510
520 530
pF1KE6 GPFDECEDDYNYYYTRS
>>CCDS47815.1 SLC18A1 gene_id:6570|Hs108|chr8 (472 aa)
initn: 1081 init1: 510 opt: 944 Z-score: 1002.6 bits: 195.0 E(32554): 1.6e-49
Smith-Waterman score: 1043; 40.0% identity (69.2% similar) in 438 aa overlap (25-435:13-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
:.: : .:.::::.: :::::::::. :.::::: .
CCDS47 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
CCDS47 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
: :. . . .. :. : : ...::::::::..::::::. ::. .:..: .
CCDS47 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
:.. :. .:: :::.:::. :. ::.::.:::.::.:....:..:.:. : .. ::.::
CCDS47 PMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQGIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARAR
.:.::. ...: ::. :::...:::.:: .:::.:: ..:.:. : : . .: : ..
CCDS47 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
:. :::. :. :::: :.::.. :. .:.::::. :: .:: . .:..:.:.::
CCDS47 AK---GTPLFMLLKDPYILVAAGSICFANMGVAILEPTLPIWMMQTMCSPKWQLGLAFLP
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
CCDS47 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 IALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSL
:..::....: .. :::.::.:::::::::::... ...:.:
CCDS47 IGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGYSESGLPHGDPDVCNPEA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 GMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSERDVLLDEPPQGLYDAVRLRERPVSGQDGEPRS
CCDS47 HEGISSGGGQ
470
>>CCDS47814.1 SLC18A1 gene_id:6570|Hs108|chr8 (493 aa)
initn: 957 init1: 529 opt: 580 Z-score: 616.9 bits: 123.7 E(32554): 4.8e-28
Smith-Waterman score: 961; 36.0% identity (63.4% similar) in 517 aa overlap (25-510:13-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
:.: : .:.::::.: :::::::::. :.::::: .
CCDS47 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
CCDS47 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
: :. . . .. :. : : ...::::::::..::::::. ::. .:..: .
CCDS47 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
:.. :. .:: :::.:::. :. ::.::.:::.::.:....:..:.:. : .. ::.::
CCDS47 PMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQGIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARAR
.:.::. ...: ::. :::...:::.:: .:::.:: ..:.:. : : . .: : ..
CCDS47 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
:. :::. :. :::: :.: :.:.::
CCDS47 AK---GTPLFMLLKDPYILVAA--------------------------------GLAFLP
290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
CCDS47 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 IALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSL
:..::....: .. :::.::.:::::::::::... ...:.:: ..: ::...:: : .
CCDS47 IGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGPSTGGAIVKAIGFPWLMV
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500
pF1KE6 GMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSERDVLL--DEPPQGLYDAVR--LRERPVSGQDG
:. :..:::. ::. .. :. ..: : : . . :.. .: :. :.:.
CCDS47 ITGVINIVYAPLCYYLRS----PPAKEEKLAILSQDCPMETRMYATQKPTKEFPL-GEDS
440 450 460 470 480
510 520 530
pF1KE6 EPRSPPGPFDECEDDYNYYYTRS
.
CCDS47 DEEPDHEE
490
532 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:52:53 2016 done: Tue Nov 8 13:52:53 2016
Total Scan time: 2.290 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]