Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2518
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2518, 1456 aa
1>>>pF1KE2518 1456 - 1456 aa - 1456 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2794+/-0.00043; mu= 24.7087+/- 0.027
mean_var=100.8176+/-20.083, 0's: 0 Z-trim(113.0): 305 B-trim: 34 in 1/53
Lambda= 0.127734
statistics sampled from 21741 (22104) to 21741 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 12.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002429 (OMIM: 153618) macrophage mannose recept (1456) 10319 1913.8 0
NP_001182570 (OMIM: 604939) secretory phospholipas (1461) 2397 453.9 4.2e-126
XP_016859087 (OMIM: 604939) PREDICTED: secretory p (1463) 2327 441.0 3.2e-122
XP_011509122 (OMIM: 604939) PREDICTED: secretory p (1463) 2327 441.0 3.2e-122
NP_031392 (OMIM: 604939) secretory phospholipase A (1463) 2327 441.0 3.2e-122
XP_005246449 (OMIM: 604939) PREDICTED: secretory p (1463) 2327 441.0 3.2e-122
XP_016859088 (OMIM: 604939) PREDICTED: secretory p (1383) 2291 434.3 3.1e-120
NP_001007268 (OMIM: 604939) secretory phospholipas (1324) 2256 427.9 2.6e-118
NP_006030 (OMIM: 612264) C-type mannose receptor 2 (1479) 2251 427.0 5.4e-118
XP_011523845 (OMIM: 612264) PREDICTED: C-type mann (1156) 2224 421.9 1.4e-116
XP_016859090 (OMIM: 604939) PREDICTED: secretory p ( 795) 1506 289.4 7.5e-77
NP_002340 (OMIM: 604524) lymphocyte antigen 75 pre (1722) 1480 285.0 3.5e-75
XP_016859089 (OMIM: 604939) PREDICTED: secretory p ( 844) 592 121.0 4e-26
XP_016859091 (OMIM: 604939) PREDICTED: secretory p ( 776) 562 115.4 1.7e-24
NP_004377 (OMIM: 600826) neurocan core protein pre (1321) 357 77.9 5.8e-13
XP_006720482 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2568) 350 76.9 2.2e-12
NP_068767 (OMIM: 600347) brevican core protein iso ( 911) 337 74.0 5.8e-12
XP_011508168 (OMIM: 600347) PREDICTED: brevican co ( 911) 337 74.0 5.8e-12
XP_016857536 (OMIM: 600347) PREDICTED: brevican co ( 956) 337 74.1 6e-12
XP_011519615 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2530) 340 75.1 7.9e-12
XP_016877475 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2553) 340 75.1 8e-12
XP_011519616 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2492) 332 73.6 2.2e-11
XP_016877476 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2515) 332 73.6 2.2e-11
NP_037359 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) aggr (2530) 332 73.6 2.2e-11
XP_016877474 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2553) 332 73.6 2.2e-11
NP_001119808 (OMIM: 118661,143200) versican core p ( 655) 320 70.8 4.1e-11
NP_001157570 (OMIM: 118661,143200) versican core p (1642) 320 71.2 7.6e-11
NP_001157569 (OMIM: 118661,143200) versican core p (2409) 320 71.4 9.8e-11
NP_004376 (OMIM: 118661,143200) versican core prot (3396) 320 71.5 1.2e-10
NP_001126 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) aggr (2431) 317 70.8 1.5e-10
XP_016882280 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 243) 275 62.0 6.6e-09
XP_016882279 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 293) 275 62.1 7.5e-09
XP_016882274 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 310) 275 62.1 7.7e-09
XP_016882275 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 310) 275 62.1 7.7e-09
XP_016882277 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 310) 275 62.1 7.7e-09
XP_016882278 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 310) 275 62.1 7.7e-09
XP_016882276 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 310) 275 62.1 7.7e-09
NP_001191047 (OMIM: 616838) C-type lectin domain f ( 378) 275 62.2 8.9e-09
NP_001193948 (OMIM: 151445) low affinity immunoglo ( 320) 273 61.8 1e-08
NP_001993 (OMIM: 151445) low affinity immunoglobul ( 321) 273 61.8 1e-08
NP_001207429 (OMIM: 151445) low affinity immunoglo ( 321) 273 61.8 1e-08
XP_005272519 (OMIM: 151445) PREDICTED: low affinit ( 321) 273 61.8 1e-08
NP_004985 (OMIM: 120361,613073) matrix metalloprot ( 707) 272 61.9 2e-08
NP_001289439 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 269 61.3 2.6e-08
NP_001289438 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 269 61.3 2.6e-08
NP_001289437 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 269 61.3 2.6e-08
NP_001121363 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 610) 269 61.3 2.6e-08
NP_004521 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV col ( 660) 269 61.4 2.8e-08
NP_473375 (OMIM: 135600,601894,614101) fibronectin ( 657) 265 60.6 4.6e-08
NP_997639 (OMIM: 135600,601894,614101) fibronectin (2176) 265 61.2 1e-07
>>NP_002429 (OMIM: 153618) macrophage mannose receptor 1 (1456 aa)
initn: 10319 init1: 10319 opt: 10319 Z-score: 10274.7 bits: 1913.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10319; 99.7% identity (99.9% similar) in 1456 aa overlap (1-1456:1-1456)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLPLLLVFASVIPGAVLLLDTRQFLIYNEDHKRCVDAVSPSAVQTAACNQDAESQKFRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MRLPLLLVFASVIPGAVLLLDTRQFLIYNEDHKRCVDAVSPSAVQTAACNQDAESQKFRW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VSESQIMSVAFKLCLGVPSKTDWVAITLYACDSKSEFQKWECKNDTLLGIKGEDLFFNYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VSESQIMSVAFKLCLGVPSKTDWVAITLYACDSKSEFQKWECKNDTLLGIKGEDLFFNYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NRQEKNIMLYKGSGLWSRWKIYGTTDNLCSRGYEAMYTLLGNANGAICAFPFKFENKWYA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
NP_002 NRQEKNIMLYKGSGLWSRWKIYGTTDNLCSRGYEAMYTLLGNANGATCAFPFKFENKWYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DCTSAGRSDGWLWCGTTTDYDTDKLFGYCPLKFEGSESLWNKDPLTSVSYQINSKSALTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DCTSAGRSDGWLWCGTTTDYDTDKLFGYCPLKFEGSESLWNKDPLTSVSYQINSKSALTW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HQARKSCQQQNAELLSITEIHEQTYLTGLTSSLTSGLWIGLNSLSFNSGWQWSDRSPFRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HQARKSCQQQNAELLSITEIHEQTYLTGLTSSLTSGLWIGLNSLSFNSGWQWSDRSPFRY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LNWLPGSPSAEPGKSCVSLNPGKNAKWENLECVQKLGYICKKGNTTLNSFVIPSESDVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LNWLPGSPSAEPGKSCVSLNPGKNAKWENLECVQKLGYICKKGNTTLNSFVIPSESDVPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HCPSQWWPYAGHCYKIHRDEKKIQRDALTTCRKEGSDLASIHTIEEFDFIISQLGYEPND
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::.:::::::::::::
NP_002 HCPSQWWPYAGHCYKIHRDEKKIQRDALTTCRKEGGDLTSIHTIEELDFIISQLGYEPND
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ELWIGLNDIKIQMYFEWSDGTPVTFTKWLRGEPSHENNRQEDCVVMKGKDGYWADRGCEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ELWIGLNDIKIQMYFEWSDGTPVTFTKWLRGEPSHENNRQEDCVVMKGKDGYWADRGCEW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PLGYICKMKSRSQGPEIVEVEKGCRKGWKKHHFYCYMIGHTLSTFAEANQTCNNENAYLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PLGYICKMKSRSQGPEIVEVEKGCRKGWKKHHFYCYMIGHTLSTFAEANQTCNNENAYLT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TIEDRYEQAFLTSFVGLRPEKYFWTGLSDIQTKGTFQWTIEEEVRFTHWNSDMPGRKPGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TIEDRYEQAFLTSFVGLRPEKYFWTGLSDIQTKGTFQWTIEEEVRFTHWNSDMPGRKPGC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VAMRTGIAGGLWDVLKCDEKAKFVCKHWAEGVTHPPKPTTTPEPKCPEDWGASSRTSLCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VAMRTGIAGGLWDVLKCDEKAKFVCKHWAEGVTHPPKPTTTPEPKCPEDWGASSRTSLCF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KLYAKGKHEKKTWFESRDFCRALGGDLASINNKEEQQTIWRLITASGSYHKLFWLGLTYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KLYAKGKHEKKTWFESRDFCRALGGDLASINNKEEQQTIWRLITASGSYHKLFWLGLTYG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 SPSEGFTWSDGSPVSYENWAYGEPNNYQNVEYCGELKGDPTMSWNDINCEHLNNWICQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SPSEGFTWSDGSPVSYENWAYGEPNNYQNVEYCGELKGDPTMSWNDINCEHLNNWICQIQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 KGQTPKPEPTPAPQDNPPVTEDGWVIYKDYQYYFSKEKETMDNARAFCKRNFGDLVSIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KGQTPKPEPTPAPQDNPPVTEDGWVIYKDYQYYFSKEKETMDNARAFCKRNFGDLVSIQS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 ESEKKFLWKYVNRNDAQSAYFIGLLISLDKKFAWMDGSKVDYVSWATGEPNFANEDENCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ESEKKFLWKYVNRNDAQSAYFIGLLISLDKKFAWMDGSKVDYVSWATGEPNFANEDENCV
850 860 870 880 890 900
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pF1KE2 TMYSNSGFWNDINCGYPNAFICQRHNSSINATTVMPTMPSVPSGCKEGWNFYSNKCFKIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TMYSNSGFWNDINCGYPNAFICQRHNSSINATTVMPTMPSVPSGCKEGWNFYSNKCFKIF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 GFMEEERKNWQEARKACIGFGGNLVSIQNEKEQAFLTYHMKDSTFSAWTGLNDVNSEHTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GFMEEERKNWQEARKACIGFGGNLVSIQNEKEQAFLTYHMKDSTFSAWTGLNDVNSEHTF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 LWTDGRGVHYTNWGKGYPGGRRSSLSYEDADCVVIIGGASNEAGKWMDDTCDSKRGYICQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LWTDGRGVHYTNWGKGYPGGRRSSLSYEDADCVVIIGGASNEAGKWMDDTCDSKRGYICQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 TRSDPSLTNPPATIQTDGFVKYGKSSYSLMRQKFQWHEAETYCKLHNSLIASILDPYSNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TRSDPSLTNPPATIQTDGFVKYGKSSYSLMRQKFQWHEAETYCKLHNSLIASILDPYSNA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 FAWLQMETSNERVWIALNSNLTDNQYTWTDKWRVRYTNWAADEPKLKSACVYLDLDGYWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FAWLQMETSNERVWIALNSNLTDNQYTWTDKWRVRYTNWAADEPKLKSACVYLDLDGYWK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 TAHCNESFYFLCKRSDEIPATEPPQLPGRCPESDHTAWIPFHGHCYYIESSYTRNWGQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TAHCNESFYFLCKRSDEIPATEPPQLPGRCPESDHTAWIPFHGHCYYIESSYTRNWGQAS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 LECLRMGSSLVSIESAAESSFLSYRVEPLKSKTNFWIGLFRNVEGTWLWINNSPVSFVNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LECLRMGSSLVSIESAAESSFLSYRVEPLKSKTNFWIGLFRNVEGTWLWINNSPVSFVNW
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 NTGDPSGERNDCVALHASSGFWSNIHCSSYKGYICKRPKIIDAKPTHELLTTKADTRKMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NTGDPSGERNDCVALHASSGFWSNIHCSSYKGYICKRPKIIDAKPTHELLTTKADTRKMD
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 PSKPSSNVAGVVIIVILLILTGAGLAAYFFYKKRRVHLPQEGAFENTLYFNSQSSPGTSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PSKPSSNVAGVVIIVILLILTGAGLAAYFFYKKRRVHLPQEGAFENTLYFNSQSSPGTSD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450
pF1KE2 MKDLVGNIEQNEHSVI
::::::::::::::::
NP_002 MKDLVGNIEQNEHSVI
1450
>>NP_001182570 (OMIM: 604939) secretory phospholipase A2 (1461 aa)
initn: 952 init1: 304 opt: 2397 Z-score: 2384.9 bits: 453.9 E(85289): 4.2e-126
Smith-Waterman score: 2427; 29.2% identity (58.8% similar) in 1493 aa overlap (8-1453:23-1461)
10 20 30 40
pF1KE2 MRLPLLLVFASVIPGAVL-LLDTRQFLIYNEDHKRCVDAVSPSAV
: :.. : .: : :.: .:. :.:..: . :..
NP_001 MLLSPSLLLLLLLGAPRGCAEGVAAALTPERLLEWQDKGIFVIQSESLKKCIQA-GKSVL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 QTAACNQDAESQKFRWVSESQIMSVAFKLCLGVPSKTDWVAITLYACDSKSEFQKWECKN
:.: . . ..:::. ..... . :::. .. ..:: ::: .:.:.
NP_001 TLENCKQANKHMLWKWVSNHGLFNIGGSGCLGLNFSAPEQPLSLYECDSTLVSLRWRCNR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 DTLLGIKGEDLFFNYGNRQEKNIMLYKGSGLWSRWKIYGTTD-NLCSRGYEAMYTLLGNA
. : ..:. . .. . . .: ::. ..: .. ..:. ::.
NP_001 KMITGP------LQYSVQVAHDNTVVASRKYIHKWISYGSGGGDICEYLHKDLHTIKGNT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 NGAICAFPFKFENKWYADCTSAGRSDGWLWCGTTTDYDTDKLFGYCPLKFE---GSESLW
.: : :::.....:. .:: :: : :::.::. :. :. .:.:: : ...:
NP_001 HGMPCMFPFQYNHQWHHECTREGREDDLLWCATTSRYERDEKWGFCPDPTSAEVGCDTIW
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 NKDPLTSVSYQINSKSALTWHQARKSCQQQNAELLSITEIHEQTYLTGLTSSLTSGLWIG
.:: . . ::.: :.:.: .:..:::.:.. :::::. :.... :: : .:.:
NP_001 EKDLNSHICYQFNLLSSLSWSEAHSSCQMQGGTLLSITDETEENFIREHMSSKTVEVWMG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE2 LNSLSFNSGWQWSDRSPFRYLNWLPGSPSAEP--GKSCVSLNPGKNAKWENLECVQKLGY
::.:. ..:::::: .:. :::: : . :: : ... . :.. .: . : :
NP_001 LNQLDEHAGWQWSDGTPLNYLNWSP-EVNFEPFVEDHCGTFSSFMPSAWRSRDCESTLPY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 ICKKGNTTLNSFVIPSES--DVPTHCPSQWWPYAGHCYKIHRDEKKIQRDALTTCRKEGS
:::: . .. .. ... ::: : :: .:::....:: ..:: .:. ..:
NP_001 ICKKYLNHIDHEIVEKDAWKYYATHCEPGWNPYNRNCYKLQKEEKT-WHEALRSCQADNS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 DLASIHTIEEFDFIISQLGYEPNDELWIGLNDIKIQMYFEWSDGTPVTFTKWLRGEPSHE
: .: .. : .:... :: : .: ::::.. :: . ::::. . : ::.: ::
NP_001 ALIDITSLAEVEFLVTLLGDENASETWIGLSSNKIPVSFEWSNDSSVIFTNWHTLEPHIF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
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: .: .: .:.. : :.:: .:.::::.::... ..::: .:.: .
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.:. . : : :: . . :::.. . : :.:: :.. ::. .:. :
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::. . ::.. . .:. .. .. .. ::.:.. .: . : . ::: .:: :. .:
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.:: ... :. :.. :. ..: .:::.: . :: : : :
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