FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1928, 466 aa 1>>>pF1KE1928 466 - 466 aa - 466 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4433+/-0.00143; mu= -10.1107+/- 0.084 mean_var=393.8407+/-82.991, 0's: 0 Z-trim(108.9): 118 B-trim: 82 in 1/52 Lambda= 0.064627 statistics sampled from 10444 (10546) to 10444 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16 Scan time: 2.960 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 2916 286.5 4.2e-77 CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 1817 184.0 2.9e-46 CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 1613 165.0 1.6e-40 CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 1608 164.5 2e-40 CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 1489 153.4 4.4e-37 CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 1470 151.6 1.5e-36 CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 1229 129.2 9.8e-30 CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 1161 122.9 8.4e-28 CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 1142 121.3 4.2e-27 CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 964 104.7 4.5e-22 CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 859 94.7 2.3e-19 CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 859 94.7 2.4e-19 CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 803 89.5 9.5e-18 CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 793 88.5 1.6e-17 CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 795 88.8 1.7e-17 CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 791 88.4 2.1e-17 CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 792 88.5 2.2e-17 CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 786 87.9 2.9e-17 CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 777 87.1 5.2e-17 CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 774 86.8 6.6e-17 CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 767 86.1 9.5e-17 CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 765 86.0 1.2e-16 CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 750 84.5 2.8e-16 CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 745 84.1 4e-16 CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 743 84.0 5.1e-16 CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 738 83.4 6.1e-16 CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 733 83.0 8.5e-16 CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 732 82.8 8.5e-16 CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 731 82.8 9.4e-16 CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 729 82.6 1e-15 CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 728 82.5 1.1e-15 CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 728 82.5 1.3e-15 CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 724 82.1 1.5e-15 CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 723 82.1 1.9e-15 CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 714 81.2 2.8e-15 CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 692 79.1 1.2e-14 CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 422) 681 78.0 2.1e-14 CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 677 77.7 2.7e-14 CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 674 77.4 3.4e-14 CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 647 74.9 1.9e-13 CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 646 74.8 2.2e-13 CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 643 74.5 2.6e-13 CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 641 74.3 2.7e-13 CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 637 73.9 3.4e-13 CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 637 74.0 3.8e-13 CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 636 74.0 4.8e-13 CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 627 73.0 7.4e-13 CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 606 71.1 2.8e-12 CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 598 70.3 4.7e-12 CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 596 70.1 5.1e-12 >>CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 (466 aa) initn: 2916 init1: 2916 opt: 2916 Z-score: 1497.8 bits: 286.5 E(32554): 4.2e-77 Smith-Waterman score: 2916; 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58.1% identity (82.5% similar) in 458 aa overlap (7-462:13-458) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSTRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYA ::.:::: :: : . : . : : . . . :::: ::.: : CCDS87 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSA-SPSSSVRL-- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 SSPGGVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRF :. . :..: : .:: .. .:::.:.:.: :: ::.::: ::::::::: CCDS87 ---GSFRSPRAGAGAL------LRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRF 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVE ::.:.::::::::: : .:: : .:: .: .: ..:.:::::... : .. ::.:: CCDS87 ANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVE 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 RDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFL ::.::::. :...:.:: .::.::..: ::.:::.:.:.::.::::.:::..:: :: CCDS87 RDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 KKLHEEEIQELQAQIQEQHVQ-IDVDVS-KPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYK :::::::...::.... :.:: ..:... ::.:::::::.: ::::.::::::::::::: CCDS87 KKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYK 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 SKFADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFA ::.::::.:::::..:::::::: .: :::.::::::::.:.::::.: ::.::.::.:: CCDS87 SKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFA 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 VEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRIS .::..:: .::..:....::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 LEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRIS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE1 LPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE .:. .:.:::.. : . : :.::..:.::::.:::.:.:..:..... CCDS87 VPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAH 410 420 430 440 450 460 CCDS87 SY 470 >>CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (432 aa) initn: 1693 init1: 1598 opt: 1608 Z-score: 839.2 bits: 164.5 E(32554): 2e-40 Smith-Waterman score: 1608; 58.1% identity (85.9% similar) in 427 aa overlap (47-465:8-431) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVYATRSSAVRLRSSVPG :..: :.:: . . . . :: :: CCDS11 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLG---PG 10 20 30 80 90 100 110 120 pF1KE1 VRL--------LQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQN .:: : :::::: :.:. ::.::..:..:..:::::::.::.::::::::: CCDS11 TRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNAGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQN 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 KILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREK : : :::.::... ..:.:.:. :.:::: ..:::: ..::.::::::::.:. .:.: CCDS11 KALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAELRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHEEEIQELQAQ ::.: : ::::.: ..::..:.:.:::::::::.:::.::: ::.:.::::..::: : CCDS11 LQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEATLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQ 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 IQEQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDA . .:.:....::.::::::::...: :::..:..:..::::::.::::::..:: :: . CCDS11 LARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAEL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 LRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDE :::::.:...::::.:::::....:.::::::::::::.:: . :::.::....::..: CCDS11 LRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEE 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 IQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNL :..:.::::::.:::::::::.:::::::::::::::::.::..:. .::.:..:::.: CCDS11 GQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETSL 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 pF1KE1 DSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE :. . . : ::....:::: :::.::.:..:.: :. CCDS11 DTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRDGEVIKESKQEHKDVM 400 410 420 430 >>CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (431 aa) initn: 1555 init1: 1460 opt: 1489 Z-score: 779.2 bits: 153.4 E(32554): 4.4e-37 Smith-Waterman score: 1489; 55.7% identity (83.6% similar) in 422 aa overlap (47-458:8-426) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVYATRSSAVRLRSSVPG :..: :.:: . . . . :: :: CCDS45 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLG---PG 10 20 30 80 90 100 110 120 pF1KE1 VRL--------LQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQN .:: : :::::: :.:. ::.::..:..:..:::::::.::.::::::::: CCDS45 TRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNAGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQN 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 KILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREK : : :::.::... ..:.:.:. :.:::: ..:::: ..::.::::::::.:. .:.: CCDS45 KALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAELRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHEEEIQELQAQ ::.: : ::::.: ..::..:.:.:::::::::.:::.::: ::.:.::::..::: : CCDS45 LQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEATLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQ 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 IQEQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDA . .:.:....::.::::::::...: :::..:..:..::::::.::::::..:: :: . CCDS45 LARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAEL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 LRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDE :::::.:...::::.:::::....:.::::::::::::.:: . :::.::....::..: CCDS45 LRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEE 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 IQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLR--ET :..:.::::::.:::::::::.:::::::::::::::::.::..:. .::.:..: .. CCDS45 GQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGGKS 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 pF1KE1 NLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE . :. :. ..: :... . :..: : CCDS45 TKDGENHKVTRYLKSLTIRVIPIQAHQIVNGTPPARG 400 410 420 430 >>CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (438 aa) initn: 1555 init1: 1460 opt: 1470 Z-score: 769.5 bits: 151.6 E(32554): 1.5e-36 Smith-Waterman score: 1470; 59.1% identity (86.3% similar) in 386 aa overlap (47-424:8-390) 20 30 40 50 60 70 pF1KE1 GPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVYATRSSAVRLRSSVPG :..: :.:: . . . . :: :: CCDS59 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLG---PG 10 20 30 80 90 100 110 120 pF1KE1 VRL--------LQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQN .:: : :::::: :.:. ::.::..:..:..:::::::.::.::::::::: CCDS59 TRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNAGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQN 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 KILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREK : : :::.::... ..:.:.:. :.:::: ..:::: ..::.::::::::.:. .:.: CCDS59 KALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAELRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHEEEIQELQAQ ::.: : ::::.: ..::..:.:.:::::::::.:::.::: ::.:.::::..::: : CCDS59 LQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEATLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQ 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 IQEQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSEAANRNNDA . .:.:....::.::::::::...: :::..:..:..::::::.::::::..:: :: . CCDS59 LARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAEL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 LRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDE :::::.:...::::.:::::....:.::::::::::::.:: . :::.::....::..: CCDS59 LRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEE 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 IQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNL :..:.::::::.:::::::::.:::::::::::::::::.::..:. .::.:..: CCDS59 GQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGQYS 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 pF1KE1 DSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE CCDS59 RASWEGHWSPAPSSRACRLLQTGTEDQGKGIQLSLGAFVTLQRS 400 410 420 430 >>CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 (499 aa) initn: 1290 init1: 704 opt: 1229 Z-score: 647.3 bits: 129.2 E(32554): 9.8e-30 Smith-Waterman score: 1229; 50.8% identity (77.0% similar) in 421 aa overlap (7-422:11-418) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSTRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASS ::::::..:: .:: :. : . . :. : ::: ::: CCDS75 MSFGSEHYLCSSSSYRKVFG---DGSRLSARLSGAGGA------GGFRSQSLSRSNVASS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 PGGVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFAN . :. : .. : : . .:..:.: : : ..:.: ::::: .:: :::::: CCDS75 AACSSAS-SLGLGLAYRRPPA---SDGLDLSQAAARTNEYKIIRTNEKEQLQGLNDRFAV 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 YIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGK--SRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVE .:.::. :: ::. : ::: :. . ::.:.:...:.:.:: :... .. .... .: CCDS75 FIEKVHQLETQNRALEAELAALRQRHAEPSRVGELFQRELRDLRAQLEEASSARSQALLE 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 RDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFL ::.:::...::: . .:: :: :: .:.. ..:::.:.:::::::.::::: .:.::. CCDS75 RDGLAEEVQRLRARCEEESRGREGAERALKAQQRDVDGATLARLDLEKKVESLLDELAFV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 KKLHEEEIQELQAQIQ---EQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWY ...:.::. :: : .: . ...:: :.:::::.:::..: ::::.:::::: ::::: CCDS75 RQVHDEEVAELLATLQASSQAAAEVDVTVAKPDLTSALREIRAQYESLAAKNLQSAEEWY 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 KSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENF :::::.:.: : :...:.: ...: :::::.:. : :...:.:.:::::::. :.:: CCDS75 KSKFANLNEQAARSTEAIRASREEIHEYRRQLQARTIEIEGLRGANESLERQILELEERH 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 AVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRI ..:.:.:::.::.:.....: : ::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:. CCDS75 SAEVAGYQDSIGQLENDLRNTKSEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRF 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE1 SLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE : ..:.:: CCDS75 STSGLSISGLNPLPNPSYLLPPRILSATTSKVSSTGLSLKKEEEEEEASKVASKKTSQIG 410 420 430 440 450 460 >>CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 (543 aa) initn: 1218 init1: 956 opt: 1161 Z-score: 612.6 bits: 122.9 E(32554): 8.4e-28 Smith-Waterman score: 1161; 49.0% identity (80.5% similar) in 394 aa overlap (25-413:13-402) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSTRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRP--STSRSLYASSPG : .: :: : :.. :..: ::.:: :.: . CCDS75 MSSFSYEPYYSTSYKRRYVETP-RVHI--SSVRSGYSTARSAYSSYSA 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQ-DSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANY : .. :. : :: : . . ...:.: . ::....:. ::.::..::.::::::.. CCDS75 PV-SSSLSVRRSYSSSSGSLMPSLENLDLSQVAAISNDLKSIRTQEKAQLQDLNDRFASF 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGK--SRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVER :..:. ::::::.: ::: :. . . ::. :::.:.:.:: ... ::.: .. :: CCDS75 IERVHELEQQNKVLEAELLVLRQKHSEPSRFRALYEQEIRDLRLAAEDATNEKQALQGER 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 DNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLK ..: : . :. . .::.:.::.::. :. :. .:.:.::: .::....::..::.::: CCDS75 EGLEETLRNLQARYEEEVLSREDAEGRLMEARKGADEAALARAELEKRIDSLMDEISFLK 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 KLHEEEIQELQAQIQEQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKF :.::::: ::::::: ......::.::::.:::.:.: :::..::::.:.::::.::.: CCDS75 KVHEEEIAELQAQIQYAQISVEMDVTKPDLSAALKDIRAQYEKLAAKNMQNAEEWFKSRF 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 ADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEA . :.:.: .:.::.: ::.: .: :: ... : :..: .: ::.::.:..:.:.. .. CCDS75 TVLTESAAKNTDAVRAAKDEVSESRRLLKAKTLEIEACRGMNEALEKQLQELEDKQNADI 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 ANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLPL . .::::..:..:... : ::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::.:.:. CCDS75 SAMQDTINKLENELRTTKSEMARYLKEYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRLSFTS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE1 PNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE CCDS75 VGSITSGYSQSSQVFGRSAYGGLQTSSYLMSTRSFPSYYTSHVQEEQIEVEETIEAAKAE 410 420 430 440 450 460 >>CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 (916 aa) initn: 1053 init1: 562 opt: 1142 Z-score: 600.0 bits: 121.3 E(32554): 4.2e-27 Smith-Waterman score: 1142; 46.4% identity (78.9% similar) in 407 aa overlap (9-412:12-413) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSTRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSP :.:::. .. :: :.: : : ...: :: ::: : : : CCDS60 MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFRS-QSWSRGS---PSTVSSSYKRSM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GGVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANY . . :::. : :. .. . :.: .. ... . ..: .:.::: .:: ::::::.: CCDS60 LAPRLAYSSAM-LSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 IDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKS--RLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVER :.::..:::::: . ::.. :. . : .::: :..:.:::: .......::.:... CCDS60 IEKVHYLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 DNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLK :.: ::: ::.:...:: :...: .....:.:...:::....:..::.:::.:.:::. CCDS60 DHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 KLHEEEIQELQAQIQEQHVQIDV-DVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK . ::::. .: :::: .:. .. : : :...::...:.: :: . .:...::::.: . CCDS60 SNHEEEVADLLAQIQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKCR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 FADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVE .: :.:::..:..:.:.::.: .:::::.:: . :.....::.::::::. ..:: . 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CCDS13 DKVRQLEAHNRSLEGEAAALRQQQAGRSAMGELYEREVREMRGAVLRLGAARGQLRLEQE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 NLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKK .: ::: ..:..:..: :::::: . ... . ...: ::.::..:...:::: ..:.. CCDS13 HLLEDIAHVRQRLDDEARQREEAEAAARALARFAQEAEAARVDLQKKAQALQEECGYLRR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LHEEEIQELQAQIQ-----EQHVQIDV-DVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEW :.::. :: .::: . ..: .. :. : :.:.:::..: : :. :... ..::: CCDS13 HHQEEVGELLGQIQGSGAAQAQMQAETRDALKCDVTSALREIRAQLEGHAVQSTLQSEEW 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 YKSKFADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEEN .. .. :::::. :.::.:.:..: ::::::.:. : :..:::.:..::::: :.:. 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