FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4253, 1013 aa 1>>>pF1KE4253 1013 - 1013 aa - 1013 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8463+/-0.000977; mu= 15.0691+/- 0.059 mean_var=113.6976+/-22.672, 0's: 0 Z-trim(108.1): 44 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.120281 statistics sampled from 9923 (9964) to 9923 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16 Scan time: 4.330 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013) 6732 1179.9 0 CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 ( 991) 6560 1150.0 0 CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 711) 755 142.6 2.8e-33 CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 715) 755 142.6 2.8e-33 CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 730) 755 142.6 2.8e-33 CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 663) 733 138.8 3.7e-32 CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 681) 733 138.8 3.8e-32 CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 727) 733 138.8 4e-32 CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 748) 733 138.8 4.1e-32 CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1782) 700 133.3 4.4e-30 CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1783) 700 133.3 4.4e-30 CCDS9807.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1804) 700 133.3 4.5e-30 CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11 (1042) 688 131.1 1.2e-29 CCDS41474.1 SIPA1L2 gene_id:57568|Hs108|chr1 (1722) 681 130.0 4.2e-29 CCDS33007.1 SIPA1L3 gene_id:23094|Hs108|chr19 (1781) 679 129.6 5.5e-29 >>CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013 aa) initn: 6732 init1: 6732 opt: 6732 Z-score: 6314.1 bits: 1179.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6732; 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