Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3413
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3413, 346 aa
1>>>pF1KE3413 346 - 346 aa - 346 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6726+/-0.00105; mu= 1.0298+/- 0.061
mean_var=272.5949+/-59.783, 0's: 0 Z-trim(111.9): 634 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.077681
statistics sampled from 11951 (12729) to 11951 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.391), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 2363 278.1 7.6e-75
CCDS6678.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 338) 1255 153.9 1.8e-37
CCDS6677.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 325) 1133 140.2 2.3e-33
CCDS65075.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 275) 1100 136.4 2.6e-32
CCDS55324.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 243) 1089 135.1 5.7e-32
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 887 112.6 4.3e-25
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 844 107.8 1.3e-23
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 830 106.2 3.6e-23
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 814 104.4 1.2e-22
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 813 104.3 1.3e-22
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 814 104.8 2.3e-22
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 814 104.9 2.4e-22
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 814 104.9 2.4e-22
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 810 104.4 3.2e-22
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 810 104.4 3.2e-22
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 810 104.4 3.2e-22
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 810 104.4 3.2e-22
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 747 97.0 2.6e-20
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 730 95.2 1.2e-19
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 730 95.2 1.2e-19
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 709 92.9 6.3e-19
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 709 92.9 6.3e-19
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 707 93.0 1.1e-18
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 705 92.7 1.2e-18
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 707 93.0 1.2e-18
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 696 91.5 2e-18
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 685 90.1 3.3e-18
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 684 90.0 3.7e-18
CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 253) 680 89.3 3.7e-18
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 684 90.0 3.9e-18
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 686 90.4 3.9e-18
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 681 89.7 5.4e-18
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 681 89.8 5.4e-18
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 681 89.8 5.9e-18
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 673 88.7 8e-18
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 671 88.4 8.6e-18
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 664 87.8 2e-17
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 664 87.9 2.2e-17
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 660 87.5 3.1e-17
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 660 87.5 3.2e-17
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 660 87.5 3.3e-17
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 643 85.4 9.2e-17
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 643 85.4 9.6e-17
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 643 85.5 9.9e-17
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 629 83.6 2.1e-16
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 628 83.7 2.7e-16
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 627 83.7 3.4e-16
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 627 83.8 4e-16
CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 628 84.3 6.8e-16
CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512) 628 84.3 7e-16
>>CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 (346 aa)
initn: 2363 init1: 2363 opt: 2363 Z-score: 1457.2 bits: 278.1 E(32554): 7.6e-75
Smith-Waterman score: 2363; 100.0% identity (100.0% similar) in 346 aa overlap (1-346:1-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCHA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATRWYRAPELLYGARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATRWYRAPELLYGARQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 YDQGVDLWSVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQVWPELTELPDYNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YDQGVDLWSVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQVWPELTELPDYNKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQYFFTAPLPAHPSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQYFFTAPLPAHPSEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE3 PIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
310 320 330 340
>>CCDS6678.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 (338 aa)
initn: 2018 init1: 1114 opt: 1255 Z-score: 786.2 bits: 153.9 E(32554): 1.8e-37
Smith-Waterman score: 2115; 90.5% identity (90.5% similar) in 359 aa overlap (1-346:1-338)
10 20 30 40
pF1KE3 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVE-------------TGEIVALKKVALRRLEDGFPNQ
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS66 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVEPRVGWQCLPSILQTGEIVALKKVALRRLEDGFPNQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ALREIKALQEMEDNQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ALREIKALQEMEDNQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 LQMLLKGVAFCHANNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LQMLLKGVAFCHANNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 WYRAPELLYGARQYDQGVDLWSVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ---------------------SVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQV
190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 WPELTELPDYNKISFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 WPELTELPDYNKISFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQY
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 FFTAPLPAHPSELPIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FFTAPLPAHPSELPIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
280 290 300 310 320 330
>>CCDS6677.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 (325 aa)
initn: 2189 init1: 1114 opt: 1133 Z-score: 712.5 bits: 140.2 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 2151; 93.9% identity (93.9% similar) in 346 aa overlap (1-346:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCHA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATRWYRAPELLYGARQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATR-------------
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 YDQGVDLWSVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQVWPELTELPDYNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 --------SVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQVWPELTELPDYNKI
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQYFFTAPLPAHPSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQYFFTAPLPAHPSEL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE3 PIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
280 290 300 310 320
>>CCDS65075.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 (275 aa)
initn: 1740 init1: 1089 opt: 1100 Z-score: 693.4 bits: 136.4 E(32554): 2.6e-32
Smith-Waterman score: 1680; 92.5% identity (92.5% similar) in 281 aa overlap (1-281:1-260)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCHA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATRWYRAPELLYGARQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATR-------------
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 YDQGVDLWSVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQVWPELTELPDYNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 --------SVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQVWPELTELPDYNKI
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQYFFTAPLPAHPSEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKLPCLPIHLSCRFLSV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE3 PIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
>>CCDS55324.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 (243 aa)
initn: 1113 init1: 1089 opt: 1089 Z-score: 687.4 bits: 135.1 E(32554): 5.7e-32
Smith-Waterman score: 1089; 100.0% identity (100.0% similar) in 167 aa overlap (1-167:1-167)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCHA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATRWYRAPELLYGARQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATRSSLSCRTTTRSPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 YDQGVDLWSVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQVWPELTELPDYNKI
CCDS55 RSRCPCPWRRCCLTSLPRHWICWVNSFSTLLTSASQLPRLSSISTSSQLPCLPIHLSCRF
190 200 210 220 230 240
>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa)
initn: 826 init1: 374 opt: 887 Z-score: 563.9 bits: 112.6 E(32554): 4.3e-25
Smith-Waterman score: 887; 45.3% identity (73.3% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVALRRLEDGFPNQALREIKALQEMED
::.. . .::::..:.:.:::. :::..:::::. : .: :. :.:::. :.:..
CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELK-
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 NQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQ-RPLAQAQVKSYLQMLLKGVAFCH
. .:.: : . . :.:::. .:: . . . : .:::: .::.::.:::
CCDS11 HPNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 ANNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATRWYRAPELLYGAR
.. ..:::::: ::::. : .:.:::::::.:. : :::.:.: ::::::.: :..
CCDS11 SHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVP-LRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 QYDQGVDLWSVGCIMGELLNGSPLFPGKNDIEQLCYVLRILGTPNPQVWPELTELPDYNK
: .::.::.:::..:... . :::: ..:.:: ..:.::::. ..:: .:.:::: :
CCDS11 FYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDY-K
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ISFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQYFFTAPLPAHPSE
:: . . :::..:.. :.. ::: :.: : : :::.:. :: : :: ..: :. ..
CCDS11 GSFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYF-SSPEPSPAAR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE3 LPIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
. ::.
CCDS11 QYVLQRFRH
300
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10 20 30 40
pF1KE3 MDQYCILGRIGEGAHGIVFKAKHVETGEIVALKKVAL-RRLE--DGFPNQAL
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CCDS39 MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTAL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 REIKALQEMEDNQYVVQLKAVFPHGGGFVLAFEFMLSDLAEVVRHAQRPLAQAQVKSYLQ
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CCDS39 REIKLLQEL-SHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYML
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 MLLKGVAFCHANNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVF-SPDGSRLYTHQVATRW
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CCDS39 MTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPN--RAYTHQVVTRW
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170 180 190 200 210 220
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CCDS39 YRAPELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQW
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230 240 250 260 270 280
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CCDS39 PDMCSLPDY--VTFKSFPGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYF
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. : :. .:: :
CCDS39 SNRPGPTPGCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
300 310 320 330 340
>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 (298 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKEL-N
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CCDS88 HPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCH
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pF1KE3 ANNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFS-PDGSRLYTHQVATRWYRAPELLYGA
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CCDS88 SHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVP--VRTYTHEVVTLWYRAPEILLGC
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CCDS88 KYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDY-
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CCDS88 KPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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pF1KE3 PSELPIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
CCDS88 RL
>>CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 (297 aa)
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:..: . .::::..:.:.:..: ::..::.::. :. :.: :. :.:::. :.:..
CCDS44 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELR-
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CCDS44 HPNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVFC
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pF1KE3 HANNIVHRDLKPANLLISASGQLKIADFGLARVFSPDGSRLYTHQVATRWYRAPELLYGA
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CCDS44 HSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIP-IRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGS
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CCDS44 ARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDY-
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pF1KE3 KISFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQYFFTAPLPAHPS
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CCDS44 KNTFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM
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>>CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 (292 aa)
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CCDS47 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELK-
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CCDS47 HKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHS
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CCDS47 RNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIP-VRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKL
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CCDS47 YSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPG-NDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYK
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CCDS47 PYPMYPATT-SLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
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346 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 04:44:01 2016 done: Sun Nov 6 04:44:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]