FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3288, 740 aa 1>>>pF1KE3288 740 - 740 aa - 740 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7419+/-0.00144; mu= 11.9717+/- 0.088 mean_var=299.7044+/-58.524, 0's: 0 Z-trim(109.2): 182 B-trim: 99 in 2/51 Lambda= 0.074085 statistics sampled from 10546 (10733) to 10546 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16 Scan time: 3.680 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6662.1 RASEF gene_id:158158|Hs108|chr9 ( 740) 4836 531.6 1.6e-150 CCDS44803.1 CRACR2A gene_id:84766|Hs108|chr12 ( 731) 581 76.8 1.3e-13 CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 ( 207) 520 69.5 5.8e-12 CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 ( 207) 511 68.6 1.1e-11 CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 216) 494 66.8 4.1e-11 CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 196) 487 66.0 6.5e-11 CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 223) 487 66.1 7e-11 CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 228) 487 66.1 7.1e-11 CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 ( 201) 486 65.9 7.1e-11 CCDS75442.1 RAB44 gene_id:401258|Hs108|chr6 (1021) 497 68.1 7.9e-11 >>CCDS6662.1 RASEF gene_id:158158|Hs108|chr9 (740 aa) initn: 4836 init1: 4836 opt: 4836 Z-score: 2815.6 bits: 531.6 E(32554): 1.6e-150 Smith-Waterman score: 4836; 100.0% identity (100.0% similar) in 740 aa overlap (1-740:1-740) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEADGDGEELARLRSVFAACDANRSGRLEREEFRALCTELRVRPADAEAVFQRLDADRDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 MEADGDGEELARLRSVFAACDANRSGRLEREEFRALCTELRVRPADAEAVFQRLDADRDG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 AITFQEFARGFLGSLRGGRRRDWGPLDPAPAVSEAGPETHDSEEDEGDEDAAAALATSCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 AITFQEFARGFLGSLRGGRRRDWGPLDPAPAVSEAGPETHDSEEDEGDEDAAAALATSCG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 PASPGRAWQDFQARLGDEAKFIPREEQVSTLYQNINLVEPRLIQPYEHVIKNFIREIRLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 PASPGRAWQDFQARLGDEAKFIPREEQVSTLYQNINLVEPRLIQPYEHVIKNFIREIRLQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 STEMENLAIAVKRAQDKAAMQLSELEEEMDQRIQAAEHKTRKDEKRKAEEALSDLRRQYE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 STEMENLAIAVKRAQDKAAMQLSELEEEMDQRIQAAEHKTRKDEKRKAEEALSDLRRQYE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 TEVGDLQVTIKKLRKLEEQSKRVSQKEDVAALKKQIYDLSMENQKVKKDLLEAQTNIAFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 TEVGDLQVTIKKLRKLEEQSKRVSQKEDVAALKKQIYDLSMENQKVKKDLLEAQTNIAFL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 QSELDALKSDYADQSLNTERDLEIIRAYTEDRNSLERQIEILQTANRKLHDSNDGLRSAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 QSELDALKSDYADQSLNTERDLEIIRAYTEDRNSLERQIEILQTANRKLHDSNDGLRSAL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 ENSYSKFNRSLHINNISPGNTISRSSPKFIGHSPQPLGYDRSSRSSYVDEDCDSLALCDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 ENSYSKFNRSLHINNISPGNTISRSSPKFIGHSPQPLGYDRSSRSSYVDEDCDSLALCDP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 LQRTNCEVDSLPESCFDSGLSTLRDPNEYDSEVEYKHQRGFQRSHGVQESFGGDASDTDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 LQRTNCEVDSLPESCFDSGLSTLRDPNEYDSEVEYKHQRGFQRSHGVQESFGGDASDTDV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 PDIRDEETFGLEDVASVLDWKPQGSVSEGSIVSSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 PDIRDEETFGLEDVASVLDWKPQGSVSEGSIVSSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 AYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNEFRENISATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 AYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNEFRENISATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQ 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 ERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVTCEKSFLNIREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 ERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVTCEKSFLNIREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRD 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 TAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGALFCETSAKDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDKDDSRSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS66 TAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGALFCETSAKDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDKDDSRSI 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 TNLTGTNSKKSPQMKNCCNG :::::::::::::::::::: CCDS66 TNLTGTNSKKSPQMKNCCNG 730 740 >>CCDS44803.1 CRACR2A gene_id:84766|Hs108|chr12 (731 aa) initn: 677 init1: 454 opt: 581 Z-score: 357.9 bits: 76.8 E(32554): 1.3e-13 Smith-Waterman score: 859; 27.7% identity (59.5% similar) in 751 aa overlap (2-738:44-730) 10 20 30 pF1KE3 MEADGDGEELARLRSVFAACDANRSGRLERE ...:. : . . : .:::. .: . :. CCDS44 RLGQGSGQGPKGSGACLHPLDSLEQKETQEQTSGQLVMLRKAQEFFQTCDAEGKGFIARK 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 pF1KE3 EFRALCTELRVRPADAEAVFQRLDADRDGAITFQEFARGF---LGSLRGGRRRDWGPLDP ... : :: . . : ::. :::: .: .: :::. :: . : . ..: : . CCDS44 DMQRLHKELPLSLEELEDVFDALDADGNGYLTPQEFTTGFSHFFFSQNNPSQEDAG--EQ 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 APAVSEAGPETHDSEEDEGD--EDAAAALATSCGPASPGRAWQDFQARLGDEAKFIPREE . : ..:: :: :: : . : .: ::: . : . : CCDS44 VAQRHEEKVYLSRGDEDLGDMGEDEEAQF----------RMLMD---RLGAQ-KVLEDES 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 QVSTLYQNINLVEPRLIQPYEHVIKNFIREIRLQSTEMENLAIAVKRAQDKAAMQLSELE .:. :. ... ::.:.. .: . .: ... : ..: :.:: ....: CCDS44 DVKQLWLQLKKEEPHLLSNFEDFLTRIISQLQEAHEEKNELECALKRKIAAYDEEIQHLY 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 EEMDQRIQAAEHK-TRKDEKRKAEEALSDLRRQYETEVGDLQVTIKKLRKLEEQSKRVSQ :::.:.:.. ... :: .: .. ..:... . .:. .: ..:: : .. CCDS44 EEMEQQIKSEKEQFLLKDTERFQARS-QELEQKLLCKEQELEQLTQKQKRLEGQC--TAL 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 KEDVAALKKQIYDLSMENQKVKKDLLEAQTNIAFLQSELDALKSDYADQSLNTERDLEII ..: : . :.. ::.. ..: ... .. :..:..:... .:. :...:. CCDS44 HHDKHETKAENTKLKLTNQELARELERTSWELQDAQQQLESLQQEAC--KLHQEKEMEVY 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 R---AYTEDRNSLERQIEILQTANRKLHDSNDGLRSALENSYSKFNRSLHINNISPGNTI : . ... .: .:...:. :..:.: : ..: :.. . :. . . CCDS44 RVTESLQREKAGLLKQLDFLRERNKHLRDERD-------ICFQK-NKAAKANTAASRASW 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 SRSSPKFIGHSPQPLGYDRSSRSSYVDEDCDSLALCDPLQRTNCEVDSLPESCFDSGLST .. : . ::. . : ::. .:. . ... : .:.. ... : . . : . 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CCDS44 IVMYDLTDKQSFLSVRRWLSSVEEAVGDRVPVLLLGNKLD------NEKEREVPRGLGEQ 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 LAMTYGALFCETSAKDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDKDDSRSITNLTGTNSKKSPQMKNC :: . .: : :: .: : :..::::: .:.. .: : : .: .:: :.: CCDS44 LATENNLIFYECSAYSGHNTKESLLHLARFLKEQ--EDTVREDTIQVGHPAKK----KSC 680 690 700 710 720 740 pF1KE3 CNG : CCDS44 CG 730 >>CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 (207 aa) initn: 510 init1: 397 opt: 520 Z-score: 328.3 bits: 69.5 E(32554): 5.8e-12 Smith-Waterman score: 520; 45.7% identity (72.8% similar) in 173 aa overlap (542-714:9-175) 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 VSSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQKAYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNEFRENIS .:..: ::..:::. :.:. .. : .. CCDS12 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFI 10 20 30 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 ATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVTCEKSFLN .:.:.::...:. .::.: ::.::::::::::.:. .:.: : :..:.::.: :::: : CCDS12 STIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDN 40 50 60 70 80 90 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 IREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRDTAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGALFCETSA ::.:. ::. : : :..::: :. : .. : . :::::. :: : :::: CCDS12 IRNWIRNIEEHASADVEKMILGNKCDVND------KRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSA 100 110 120 130 140 150 700 710 720 730 740 pF1KE3 KDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDKDDSRSITNLTGTNSKKSPQMKNCCNG : . :. .: . :::..: . :: CCDS12 KANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEGNSPQGSNQGVKITPDQQKRSSFFRCVLL 160 170 180 190 200 >>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 (207 aa) initn: 518 init1: 388 opt: 511 Z-score: 323.1 bits: 68.6 E(32554): 1.1e-11 Smith-Waterman score: 511; 41.6% identity (71.6% similar) in 197 aa overlap (542-731:9-199) 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 VSSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQKAYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNEFRENIS .:..: ::..:::. .:.:. .. : .. CCDS10 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFI 10 20 30 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 ATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVTCEKSFLN .:.:.::...:. .::.. ::.::::::::::.:. .:.: : :..:.::.: :::: : CCDS10 STIGIDFKIRTIELDGKKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDN 40 50 60 70 80 90 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 IREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRDTAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGALFCETSA :..:. ::. : : :..::: :. : .. : . :::::. :: : :::: CCDS10 IKNWIRNIEEHASSDVERMILGNKCDMND------KRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSA 100 110 120 130 140 150 700 710 720 730 740 pF1KE3 KDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDK--DDSRSI-----TNLTGTNSKKSPQMKNCCNG :...:. :: . :::.. . .. .:: : ...: . :::. CCDS10 KSSANVEEAFFTLARDIMTKLNRKMNDSNSAGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL 160 170 180 190 200 >>CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 (216 aa) initn: 457 init1: 329 opt: 494 Z-score: 313.0 bits: 66.8 E(32554): 4.1e-11 Smith-Waterman score: 494; 41.3% identity (72.6% similar) in 208 aa overlap (536-739:17-214) 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 VSEGSIVSSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQKAYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNE :... .: .:.::..:::.:.:... ... CCDS11 MDLQRPDSYQGGAGPDFNDHVLHKTILVGDSGVGKTSLLVQFDQGK 10 20 30 40 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 FRE-NISATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVT : ..:::.:. : :.. ::: :. ::.:::::::::::....:.: :...:::::.: CCDS11 FIPGSFSATVGIGFTNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDIT 50 60 70 80 90 100 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 CEKSFLNIREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRDTAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGA ..:: ::: :. :.. :.. : :::.:::::. . .. . .. :: :: ::. CCDS11 NKSSFDNIRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKADMSS------ERVIRSEDGETLAREYGV 110 120 130 140 150 160 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 LFCETSAKDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDK---DDSRSITNLTGTNSKKSPQMKNCCNG : ::::: : :. : : .:.:.: :. . . : .: . . ...:.: .::. CCDS11 PFLETSAKTGMNVELAFLAIAKELKYRAGHQADEPSFQIRDYVESQKKRS----SCCSFM 170 180 190 200 210 >>CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 (196 aa) initn: 458 init1: 335 opt: 487 Z-score: 309.4 bits: 66.0 E(32554): 6.5e-11 Smith-Waterman score: 487; 42.3% identity (71.6% similar) in 201 aa overlap (543-739:4-194) 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 SSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQKAYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNEFREN-IS :..: ::..:::. ::... . : . . CCDS82 MCCKVMLLGDTGVGKTCFLIQFKDGAFLSGTFI 10 20 30 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 ATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVTCEKSFLN ::.:.::. :.. ::: :. ::.:::::::::::....:.: :...:::::.: ..:: : CCDS82 ATVGIDFRNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDITNKSSFDN 40 50 60 70 80 90 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 IREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRDTAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGALFCETSA :: :. :.. :.. : :::.:::::. ... . .. :: :: ::. : :::: CCDS82 IRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKADM------SSERVIRSEDGETLAREYGVPFLETSA 100 110 120 130 140 700 710 720 730 740 pF1KE3 KDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDK---DDSRSITNLTGTNSKKSPQMKNCCNG : : :. : : .:.:.: :. . . : .: . . ...:.: .::. CCDS82 KTGMNVELAFLAIAKELKYRAGHQADEPSFQIRDYVESQKKRS----SCCSFM 150 160 170 180 190 >>CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 (223 aa) initn: 458 init1: 335 opt: 487 Z-score: 308.9 bits: 66.1 E(32554): 7e-11 Smith-Waterman score: 487; 42.3% identity (71.6% similar) in 201 aa overlap (543-739:31-221) 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 SSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQKAYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNEFREN-IS :..: ::..:::. ::... . : . . CCDS32 MTGTPGAVATRDGEAPERSPPCSPSYDLTGKVMLLGDTGVGKTCFLIQFKDGAFLSGTFI 10 20 30 40 50 60 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 ATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVTCEKSFLN ::.:.::. :.. ::: :. ::.:::::::::::....:.: :...:::::.: ..:: : CCDS32 ATVGIDFRNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDITNKSSFDN 70 80 90 100 110 120 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 IREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRDTAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGALFCETSA :: :. :.. :.. : :::.:::::. ... . .. :: :: ::. : :::: CCDS32 IRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKADM------SSERVIRSEDGETLAREYGVPFLETSA 130 140 150 160 170 700 710 720 730 740 pF1KE3 KDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDK---DDSRSITNLTGTNSKKSPQMKNCCNG : : :. : : .:.:.: :. . . : .: . . ...:.: .::. CCDS32 KTGMNVELAFLAIAKELKYRAGHQADEPSFQIRDYVESQKKRS----SCCSFM 180 190 200 210 220 >>CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 (228 aa) initn: 458 init1: 335 opt: 487 Z-score: 308.8 bits: 66.1 E(32554): 7.1e-11 Smith-Waterman score: 487; 42.3% identity (71.6% similar) in 201 aa overlap (543-739:36-226) 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 SSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQKAYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNEFREN-IS :..: ::..:::. ::... . : . . CCDS54 EAHGAEPVLLREAARPFTQTLRLCVPSGNSKVMLLGDTGVGKTCFLIQFKDGAFLSGTFI 10 20 30 40 50 60 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 ATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVTCEKSFLN ::.:.::. :.. ::: :. ::.:::::::::::....:.: :...:::::.: ..:: : CCDS54 ATVGIDFRNKVVTVDGVRVKLQIWDTAGQERFRSVTHAYYRDAQALLLLYDITNKSSFDN 70 80 90 100 110 120 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 IREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRDTAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGALFCETSA :: :. :.. :.. : :::.:::::. ... . .. :: :: ::. : :::: CCDS54 IRAWLTEIHEYAQRDVVIMLLGNKADM------SSERVIRSEDGETLAREYGVPFLETSA 130 140 150 160 170 700 710 720 730 740 pF1KE3 KDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDK---DDSRSITNLTGTNSKKSPQMKNCCNG : : :. : : .:.:.: :. . . : .: . . ...:.: .::. CCDS54 KTGMNVELAFLAIAKELKYRAGHQADEPSFQIRDYVESQKKRS----SCCSFM 180 190 200 210 220 >>CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 (201 aa) initn: 475 init1: 381 opt: 486 Z-score: 308.8 bits: 65.9 E(32554): 7.1e-11 Smith-Waterman score: 486; 38.2% identity (69.3% similar) in 199 aa overlap (542-738:9-201) 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 VSSSRKPISALSPQTDLVDDNAKSFSSQKAYKIVLAGDAAVGKSSFLMRLCKNEFRENIS .:..: ::..:::: .:.:. . . :. CCDS31 MNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYI 10 20 30 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 ATLGVDFQMKTLIVDGERTVLQLWDTAGQERFRSIAKSYFRKADGVLLLYDVTCEKSFLN .:.::::...:. .::. ::.::::::::::.:..::.: : :....:::: ..:. : CCDS31 STIGVDFKIRTIELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYAN 40 50 60 70 80 90 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 IREWVDMIEDAAHETVPIMLVGNKADIRDTAATEGQKCVPGHFGEKLAMTYGALFCETSA ...:.. :. : :.: .:::::.:. .: : . ....: . : : :::: CCDS31 VKQWLQEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTT------KKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSA 100 110 120 130 140 150 700 710 720 730 740 pF1KE3 KDGSNIVEAVLHLAREVKKRTDKDDSRSIT--NLTGTNSKKSPQMKNCCNG :...:. .: . .: :.::: . . :: .. .: .:: CCDS31 KNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAASGGERPNLKIDSTPVKPAGGGCC 160 170 180 190 200 >>CCDS75442.1 RAB44 gene_id:401258|Hs108|chr6 (1021 aa) initn: 528 init1: 413 opt: 497 Z-score: 307.8 bits: 68.1 E(32554): 7.9e-11 Smith-Waterman score: 520; 37.5% identity (67.1% similar) in 240 aa overlap (502-739:804-1021) 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 GGDASDTDVPDIRDEETFGLEDVASVLDWKPQGSVSEGSIVSSSRKPISALSPQTDLVDD : . :.... : :... .::.. 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CCDS75 EEGLKD------SLVKVAPKRPPKRFGCCS 1000 1010 1020 740 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 05:37:30 2016 done: Sun Nov 6 05:37:31 2016 Total Scan time: 3.680 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]