Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1875
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1875, 398 aa
1>>>pF1KE1875 398 - 398 aa - 398 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5683+/-0.000878; mu= 3.6504+/- 0.053
mean_var=180.5995+/-36.041, 0's: 0 Z-trim(113.6): 11 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.095437
statistics sampled from 14182 (14192) to 14182 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.436), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6535.1 B4GALT1 gene_id:2683|Hs108|chr9 ( 398) 2723 386.7 2.1e-107
CCDS506.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 ( 372) 1339 196.1 4.5e-50
CCDS55596.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 ( 401) 1339 196.1 4.8e-50
CCDS1222.1 B4GALT3 gene_id:8703|Hs108|chr1 ( 393) 1122 166.2 4.7e-41
CCDS2986.1 B4GALT4 gene_id:8702|Hs108|chr3 ( 344) 937 140.7 2e-33
CCDS13420.1 B4GALT5 gene_id:9334|Hs108|chr20 ( 388) 833 126.4 4.4e-29
CCDS82245.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 ( 343) 788 120.2 2.9e-27
CCDS11900.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 ( 382) 780 119.1 6.8e-27
CCDS4429.1 B4GALT7 gene_id:11285|Hs108|chr5 ( 327) 430 70.9 1.9e-12
>>CCDS6535.1 B4GALT1 gene_id:2683|Hs108|chr9 (398 aa)
initn: 2723 init1: 2723 opt: 2723 Z-score: 2041.8 bits: 386.7 E(32554): 2.1e-107
Smith-Waterman score: 2723; 100.0% identity (100.0% similar) in 398 aa overlap (1-398:1-398)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRLREPLLSGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLAGRDLSRLPQLVGVSTPL
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CCDS65 MRLREPLLSGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLAGRDLSRLPQLVGVSTPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QGGSNSAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QGGSNSAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 IIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE1 HTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
370 380 390
>>CCDS506.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 1323 init1: 809 opt: 1339 Z-score: 1012.4 bits: 196.1 E(32554): 4.5e-50
Smith-Waterman score: 1366; 54.0% identity (74.2% similar) in 383 aa overlap (16-397:6-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRLREPLLSGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYYLAGRDLSRLPQLVGVSTPL
:..:.:.:. .. .: ::. :... :. :. .:. :
CCDS50 MSRLLGGTLERVCKAVLLLCLLHFLVAVILYF---DV-YAQHLAFFSRFS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QGGSNSAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVP
: : . ::. .. .:: ..:. :. : .. :::
CCDS50 ARGPAHALHPAASSSSSSSNCSRPNATASSSGLPE-------VPSALPGP----------
50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAI
:: .:: ::. : ::: .::::. :. :: : ..::.: :::::.: ::. . ::.
CCDS50 --TAPTLPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQRENPGVLMGGRYTPPDCTPAQTVAV
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KE1 IIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALK-DY
:::::.:..::.:::.::::.:.::.: ::.::::: :. ::::::::::: :::: :
CCDS50 IIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGVYVINQHGEDTFNRAKLLNVGFLEALKEDA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DYTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLT
: ::.::::::.::.:.: ::: .::::...::::::: :::. ::::::.::: :::
CCDS50 AYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRLPYAGYFGGVSGLSKAQFLR
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 INGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRI
::::::.::::::::::::::. . ::.::::. .:: :::.:.:::.:::::::: .:
CCDS50 INGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRMIKHDRDKHNEPNPQRFTKI
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390
pF1KE1 AHTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
.:: :: ::..:. ::::.:.: ::.:.:::::: :
CCDS50 QNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSWPPRG
330 340 350 360 370
>>CCDS55596.1 B4GALT2 gene_id:8704|Hs108|chr1 (401 aa)
initn: 1323 init1: 809 opt: 1339 Z-score: 1011.9 bits: 196.1 E(32554): 4.8e-50
Smith-Waterman score: 1370; 53.5% identity (73.8% similar) in 389 aa overlap (10-397:29-394)
10 20 30 40
pF1KE1 MRLREPLLSGSAAMPGASLQRACRLLVAVCALHLGVTLVYY
: . . :..:.:.:. .. .: ::. :... :
CCDS55 MAVEVQEQWPCLPAAGCPGPLGGPVAACGMSRLLGGTLERVCKAVLLLCLLHFLVAVILY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LAGRDLSRLPQLVGVSTPLQGGSNSAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSS
. :. .:. : : : . ::. .. .:: ..:. :.
CCDS55 F---DV-YAQHLAFFSRFSARGPAHALHPAASSSSSSSNCSRPNATASSSGLPE------
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 PVVDSGPGPASNLTSVPVPHTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDLELVAKQNPNV
: .. ::: :: .:: ::. : ::: .::::. :. :: : ..::.:
CCDS55 -VPSALPGP------------TAPTLPPCPDSPPGLVGRLLIEFTSPMPLERVQRENPGV
120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTI
:::::.: ::. . ::.:::::.:..::.:::.::::.:.::.: ::.::::: :.
CCDS55 LMGGRYTPPDCTPAQTVAVIIPFRHREHHLRYWLHYLHPILRRQRLRYGVYVINQHGEDT
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 FNRAKLLNVGFQEALK-DYDYTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSL
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CCDS55 FNRAKLLNVGFLEALKEDAAYDCFIFSDVDLVPMDDRNLYRCGDQPRHFAIAMDKFGFRL
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 PYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRM
::. ::::::.::: ::: ::::::.::::::::::::::. . ::.::::. .:: ::
CCDS55 PYAGYFGGVSGLSKAQFLRINGFPNEYWGWGGEDDDIFNRISLTGMKISRPDIRIGRYRM
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KE1 IRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
:.:.:::.:::::::: .: .:: :: ::..:. ::::.:.: ::.:.:::::: :
CCDS55 IKHDRDKHNEPNPQRFTKIQNTKLTMKRDGIGSVRYQVLEVSRQPLFTNITVDIGRPPSW
340 350 360 370 380 390
CCDS55 PPRG
400
>>CCDS1222.1 B4GALT3 gene_id:8703|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 1124 init1: 576 opt: 1122 Z-score: 850.6 bits: 166.2 E(32554): 4.7e-41
Smith-Waterman score: 1122; 55.4% identity (77.2% similar) in 307 aa overlap (97-396:39-344)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVD-SGPGPA-SNLTSVP-VPH--
: :..:. : : : . :::. .: .:
CCDS12 PCTLALLVGSQLAVMMYLSLGGFRSLSALFGRDQGPTFDYSHPRDVYSNLSHLPGAPGGP
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPV-DLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAI
. .:: :::.:::::::. . :. :: .: ....:: :. :::: : : ..::
CCDS12 PAPQGLPYCPERSPLLVGPVSVSFS-PVPSLAEIVERNPRVEPGGRYRPAGCEPRSRTAI
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYD
:.: : :..::. ::.::: :::::: ::::::.:::. :::::::::: .:::.: .
CCDS12 IVPHRAREHHLRLLLYHLHPFLQRQQLAYGIYVIHQAGNGTFNRAKLLNVGVREALRDEE
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290
pF1KE1 YTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQ-PRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLT
. :. . ::::.: :::: : : . :::..:::.:::.:::: :::::::::. .:.:
CCDS12 WDCLFLHDVDLLPENDHNLYVCDPRGPRHVAVAMNKFGYSLPYPQYFGGVSALTPDQYLK
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 INGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRI
.:::::.::::::::::: .:. . ::.:::: . ::. .:..: :: :: ::.::: .
CCDS12 MNGFPNEYWGWGGEDDDIATRVRLAGMKISRPPTSVGHYKMVKHRGDKGNEENPHRFDLL
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390
pF1KE1 AHTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
..:... .::.::::::.: . ::::.::.::::
CCDS12 VRTQNSWTQDGMNSLTYQLLARELGPLYTNITADIGTDPRGPRAPSGPRYPPGSSQAFRQ
310 320 330 340 350 360
CCDS12 EMLQRRPPARPGPLSTANHTALRGSH
370 380 390
>>CCDS2986.1 B4GALT4 gene_id:8702|Hs108|chr3 (344 aa)
initn: 937 init1: 871 opt: 937 Z-score: 713.8 bits: 140.7 E(32554): 2e-33
Smith-Waterman score: 937; 50.4% identity (73.5% similar) in 272 aa overlap (122-393:69-339)
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 SQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHTTALSLPACPEESPLLVGPMLIEFNMPVDL
: . : :: :: : : . :. . :
CCDS29 QEIPKAKEFMANFHKTLILGKGKTLTNEASTKKVELDNCPSVSPYLRGQSKLIFKPDLTL
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 ELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGI
: : .::.:. : :: :..: . ..:::..: :::..:: : : .::: ::::::::::
CCDS29 EEVQAENPKVSRG-RYRPQECKALQRVAILVPHRNREKHLMYLLEHLHPFLQRQQLDYGI
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 YVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISV
:::.:: ::::::::::. ::::. .. ::.: ::::.: :: : :.: .:.:. :
CCDS29 YVIHQAEGKKFNRAKLLNVGYLEALKEENWDCFIFHDVDLVPENDFNLYKCEEHPKHLVV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 AMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFPNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRP
. .. :. : : :::::.:::..::. .::: ::::::::::::. :. .. :.::::
CCDS29 GRNSTGYRLRYSGYFGGVTALSREQFFKVNGFSNNYWGWGGEDDDLRLRVELQRMKISRP
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 NAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKETMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQIT
::. :. :.::: :: : .:. . ..... .:::.: .:....:.. ::: .::
CCDS29 LPEVGKYTMVFHTRDKGNEVNAERMKLLHQVSRVWRTDGLSSCSYKLVSVEHNPLYINIT
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 VDIGTPS
::
CCDS29 VDFWFGA
340
>>CCDS13420.1 B4GALT5 gene_id:9334|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 786 init1: 713 opt: 833 Z-score: 635.6 bits: 126.4 E(32554): 4.4e-29
Smith-Waterman score: 833; 43.6% identity (71.6% similar) in 303 aa overlap (99-397:82-380)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHT-TALSL
::. .: . . . :.. .:. : ..
CCDS13 LIRDNVRTIGAQVYEQVLRSAYAKRNSSVNDSDYPLDLNHSETFLQTTTFLPEDFTYFAN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 PACPEESPLLVGPMLI---EFNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPF
.:::. : . ::. : :..: :: .: .:..:.::.. : ::. ::::.:::
CCDS13 HTCPERLPSMKGPIDINMSEIGMDYIHELFSK-DPTIKLGGHWKPSDCMPRWKVAILIPF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCF
:::.::: . .: :.::::.:....::..:.: :::: :.:::::::.:: :. :.
CCDS13 RNRHEHLPVLFRHLLPMLQRQRLQFAFYVVEQVGTQPFNRAMLFNVGFQEAMKDLDWDCL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFP
.: ::: :: .:.: : : ..:::... .::. . :::...:::::.:. .:: :::::
CCDS13 IFHDVDHIPESDRNYYGCGQMPRHFATKLDKYMYLLPYTEFFGGVSGLTVEQFRKINGFP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTKE
: .:::::::::..::. :.:.:::.. .:. . : : . . . :. . ..::
CCDS13 NAFWGWGGEDDDLWNRVQNAGYSVSRPEGDTGKYKSIPH-HHRGEVQFLGRYALLRKSKE
300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KE1 TMLSDGLNSLTYQVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
. ::::.:.: .. :: .:::.. ::
CCDS13 RQGLDGLNNLNY-FANITYDALYKNITVNL-TPELAQVNEY
350 360 370 380
>>CCDS82245.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 (343 aa)
initn: 757 init1: 692 opt: 788 Z-score: 602.9 bits: 120.2 E(32554): 2.9e-27
Smith-Waterman score: 788; 40.6% identity (70.3% similar) in 303 aa overlap (96-394:36-333)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SAAAIGQSSGELRTGGARPPPPLGASSQPRPGGDSSPVVDSGPGPASNLTSVPVPHTTAL
:: : .:. ... : .: : .
CCDS82 RMMRVSNRSLLAFIFFFSLSSSCLYFIYVAPGIDYPEGNNSSDYLVQTTTYLPENFTYSP
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SLPACPEESPLLVGPMLIEFN-MPVD-LELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIP
:: :::. : . : . .. . . : .. . ... ... ::.. :.:: :::..::
CCDS82 YLP-CPEKLPYMRGFLNVNVSEVSFDEIHQLFSKDLDIEPGGHWRPKDCKPRWKVAVLIP
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FRNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTC
::::.::: .. .: :.::.:.:....:::.:.: :::: :.::::.::.:: . :
CCDS82 FRNRHEHLPIFFLHLIPMLQKQRLEFAFYVIEQTGTQPFNRAMLFNVGFKEAMKDSVWDC
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FVFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGF
.: ::: .: ::.: : : .:::... .::. . ::: ..:::::.:. .:: ::::
CCDS82 VIFHDVDHLPENDRNYYGCGEMPRHFAAKLDKYMYILPYKEFFGGVSGLTVEQFRKINGF
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PNNYWGWGGEDDDIFNRLVFRGMSISRPNAVVGRCRMIRHSRDKKNEPNPQRFDRIAHTK
:: .:::::::::..::. . :....::.. .:. . : : . . . :. . ..:
CCDS82 PNAFWGWGGEDDDLWNRVHYAGYNVTRPEGDLGKYKSIPH-HHRGEVQFLGRYKLLRYSK
250 260 270 280 290 300
370 380 390
pF1KE1 ETMLSDGLNSLTY--QVLDVQRYPLYTQITVDIGTPS
: . ::::.: : ..: :.: :::.:.:..
CCDS82 ERQYIDGLNNLIYRPKIL-VDR--LYTNISVNLMPELAPIEDY
310 320 330 340
>>CCDS11900.1 B4GALT6 gene_id:9331|Hs108|chr18 (382 aa)
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70 80 90 100 110 120
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: : .:. ... : .: : .
CCDS11 VQARGIMLRENVKTIGHMIRLYTNKNSTLNGTDYPEGNNSSDYLVQTTTYLPENFTYSPY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LPACPEESPLLVGPMLIEFN-MPVD-LELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPF
:: :::. : . : . .. . . : .. . ... ... ::.. :.:: :::..:::
CCDS11 LP-CPEKLPYMRGFLNVNVSEVSFDEIHQLFSKDLDIEPGGHWRPKDCKPRWKVAVLIPF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RNRQEHLKYWLYYLHPVLQRQQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCF
:::.::: .. .: :.::.:.:....:::.:.: :::: :.::::.::.:: . :
CCDS11 RNRHEHLPIFFLHLIPMLQKQRLEFAFYVIEQTGTQPFNRAMLFNVGFKEAMKDSVWDCV
170 180 190 200 210 220
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pF1KE1 VFSDVDLIPMNDHNAYRCFSQPRHISVAMDKFGFSLPYVQYFGGVSALSKQQFLTINGFP
.: ::: .: ::.: : : .:::... .::. . ::: ..:::::.:. .:: :::::
CCDS11 IFHDVDHLPENDRNYYGCGEMPRHFAAKLDKYMYILPYKEFFGGVSGLTVEQFRKINGFP
230 240 250 260 270 280
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: .:::::::::..::. . :....::.. .:. . : : . . . :. . ..::
CCDS11 NAFWGWGGEDDDLWNRVHYAGYNVTRPEGDLGKYKSIPH-HHRGEVQFLGRYKLLRYSKE
290 300 310 320 330 340
370 380 390
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. ::::.: : ..: :.: :::.:.:..
CCDS11 RQYIDGLNNLIYRPKIL-VDR--LYTNISVNLMPELAPIEDY
350 360 370 380
>>CCDS4429.1 B4GALT7 gene_id:11285|Hs108|chr5 (327 aa)
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Smith-Waterman score: 430; 35.1% identity (64.9% similar) in 208 aa overlap (175-378:92-294)
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 FNMPVDLELVAKQNPNVKMGGRYAPRDCVSPHKVAIIIPFRNRQEHLKYWLYYLHPVLQR
::..:...:::.: :.: .. ... :.:
CCDS44 RGQGQETSGPPRACPPEPPPEHWEEDASWGPHRLAVLVPFRERFEELLVFVPHMRRFLSR
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pF1KE1 QQLDYGIYVINQAGDTIFNRAKLLNVGFQEALKDYDYTCFVFSDVDLIPMNDHNAYRCFS
... . :::.::. :::: :.:::: :. .. :: ... ::::.:.:.. : :
CCDS44 KKIRHHIYVLNQVDHFRFNRAALINVGFLESSNSTDY--IAMHDVDLLPLNEELDYG-FP
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. . :: .. : : ::. ::::.. ::. : .:::: :::... :.
CCDS44 EAGPFHVASPELHPLYHYKTYVGGILLLSKQHYRLCNGMSNRFWGWGREDDEFYRRIKGA
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:... ::.... . .:: .: . :. ::: :. ... :::.. :.:
CCDS44 GLQLFRPSGITTGYKTFRHLHDPAWRKRDQK--RIAAQKQEQFKVDREGGLNTVKYHVAS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]