FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2785, 198 aa 1>>>pF1KE2785 198 - 198 aa - 198 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4715+/-0.00082; mu= 4.6567+/- 0.049 mean_var=191.8806+/-38.518, 0's: 0 Z-trim(114.1): 933 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.092589 statistics sampled from 13828 (14848) to 13828 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16 Scan time: 0.970 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS6397.2 ZFP41 gene_id:286128|Hs109|chr8 ( 199) 1438 203.4 7.5e-53 CCDS6398.1 GLI4 gene_id:2738|Hs109|chr8 ( 376) 581 89.3 3.4e-18 CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 ( 350) 570 87.8 8.9e-18 CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs109|chr22 ( 446) 569 87.7 1.2e-17 CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 ( 527) 570 87.9 1.2e-17 CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 ( 364) 567 87.4 1.2e-17 CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 ( 563) 570 88.0 1.2e-17 CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 ( 474) 567 87.5 1.4e-17 CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 ( 498) 567 87.5 1.5e-17 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs109|chr8 ( 682) 569 87.9 1.5e-17 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 616) 567 87.6 1.7e-17 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 658) 567 87.6 1.8e-17 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 670) 567 87.6 1.8e-17 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 682) 567 87.7 1.9e-17 CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs109|chr19 ( 314) 560 86.4 2.1e-17 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs109|chr19 ( 488) 562 86.8 2.3e-17 CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs109|chr19 ( 418) 560 86.5 2.5e-17 CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs109|chr19 ( 419) 560 86.5 2.5e-17 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs109|chr3 ( 754) 564 87.3 2.6e-17 CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs109|chr17 ( 511) 558 86.3 3.5e-17 CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs109|chr17 ( 521) 558 86.3 3.5e-17 CCDS74207.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs109|chr18 ( 307) 554 85.6 3.6e-17 CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs109|chr17 ( 522) 557 86.2 3.9e-17 CCDS9257.1 ZNF664 gene_id:144348|Hs109|chr12 ( 261) 550 85.0 4.6e-17 CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs109|chr18 ( 494) 554 85.8 5e-17 CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs109|chr8 ( 590) 554 85.8 5.6e-17 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs109|chr3 ( 544) 553 85.7 5.8e-17 CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs109|chr8 ( 686) 554 85.9 6.2e-17 CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs109|chr8 ( 697) 554 85.9 6.3e-17 CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs109|chr1 ( 470) 550 85.2 6.9e-17 CCDS2011.1 ZNF514 gene_id:84874|Hs109|chr2 ( 400) 548 84.9 7.5e-17 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs109|chr5 ( 461) 549 85.1 7.5e-17 CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs109|chr18 ( 534) 548 85.0 9.1e-17 CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs109|chr17 ( 807) 551 85.6 9.2e-17 CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs109|chr8 ( 529) 546 84.7 1.1e-16 CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs109|chr10 ( 561) 546 84.8 1.1e-16 CCDS2720.2 ZNF501 gene_id:115560|Hs109|chr3 ( 271) 540 83.6 1.2e-16 CCDS56408.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs109|chr6 ( 390) 542 84.1 1.3e-16 CCDS54330.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs109|chr19 ( 390) 542 84.1 1.3e-16 CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs109|chr7 ( 446) 543 84.3 1.3e-16 CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs109|chr19 ( 591) 545 84.6 1.3e-16 CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs109|chr19 ( 676) 545 84.7 1.4e-16 CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs109|chr19 ( 697) 545 84.7 1.4e-16 CCDS2708.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs109|chr3 ( 426) 541 84.0 1.5e-16 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs109|chr16 ( 585) 543 84.4 1.5e-16 CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs109|chr19 ( 670) 544 84.6 1.5e-16 CCDS46807.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs109|chr3 ( 452) 541 84.0 1.6e-16 CCDS42462.1 ZNF554 gene_id:115196|Hs109|chr19 ( 538) 542 84.2 1.6e-16 CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs109|chr6 ( 538) 542 84.2 1.6e-16 CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs109|chr9 ( 630) 543 84.4 1.6e-16 >>CCDS6397.2 ZFP41 gene_id:286128|Hs109|chr8 (199 aa) initn: 1438 init1: 1438 opt: 1438 Z-score: 1062.5 bits: 203.4 E(33420): 7.5e-53 Smith-Waterman score: 1438; 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CCDS63 EGAGGALRSLLRSLPRRARCSAGFGPESSAERPAGQPPGAVPCAQPRGAWRVTLVQQAAA 100 110 120 130 140 150 40 50 60 70 80 pF1KE2 GDRKPPERPTV--PRKPRTEPCLSPEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQR----KK : . ::: . :.. . . : .: ::: . ... :: .: CCDS63 GPEGAPERAAELGVNFGRSRQGSARGAKPHRCEACGKSFKYN----SLLLKHQRIHTGEK 160 170 180 190 200 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 PYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKC :: : :::. :. . :.:.:.::::::..:.:::.:: ::: :.: : :.::::.:: CCDS63 PYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKC 210 220 230 240 250 260 150 160 170 180 190 pF1KE2 GECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP ::::.::. .:::..::. ::::::: :..::::: .:: ::.::. : .:: CCDS63 GECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCG 270 280 290 300 310 320 CCDS63 KAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE 330 340 350 360 370 >>CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 (350 aa) initn: 558 init1: 558 opt: 570 Z-score: 432.9 bits: 87.8 E(33420): 8.9e-18 Smith-Waterman score: 582; 43.0% identity (66.2% similar) in 207 aa overlap (3-198:97-303) 10 20 pF1KE2 MEKPAGRKKKTP---TPREEADVQKSALREEK : . :..:.: : .:. : . ...: CCDS75 KAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKK 70 80 90 100 110 120 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 -VSGDRKPPERPT-VPRK-PRTEPCLSPED-----EEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPF ..:.: : :. . :. . .::. . : : : . . : CCDS75 TITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIH 130 140 150 160 170 180 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 QRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEK .:::::::::. :. ... . :::.:::::: .: .::::: :::.. ::: :.::: CCDS75 TGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEK 190 200 210 220 230 240 150 160 170 180 190 pF1KE2 PFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP :..:.::::::. .:.: :::. :::::::::..::::: .: :: :.. : :.:: CCDS75 PYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKC 250 260 270 280 290 300 CCDS75 TKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV 310 320 330 340 350 >>CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs109|chr22 (446 aa) initn: 867 init1: 569 opt: 569 Z-score: 430.8 bits: 87.7 E(33420): 1.2e-17 Smith-Waterman score: 569; 61.7% identity (85.2% similar) in 115 aa overlap (84-198:277-391) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 PEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEK :::.::. ::. : :.. :::::.:::.: CCDS13 TGERPYQCKECGKSFNQSSGLSQHRKIHTLKKPHECDLCGKAFCHRSHLIRHQRIHTGKK 250 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 PFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYEC :.:: .::::: .::.. .:..:::::::.:: .:::::. .:.:..::. ::::::::: CCDS13 PYKCDECGKAFSQSSNLIEHRKTHTGEKPYKCQKCGKAFSQSSSLIEHQRIHTGEKPYEC 310 320 330 340 350 360 180 190 pF1KE2 THCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP .::::: .:: ::.::. : ::: CCDS13 CQCGKAFCHSSALIQHQRIHTGKKPYTCECGKAFRHRSALIEHYKTHTREKPYVCNLCGK 370 380 390 400 410 420 >-- initn: 1384 init1: 497 opt: 498 Z-score: 379.6 bits: 78.2 E(33420): 8.2e-15 Smith-Waterman score: 500; 37.9% identity (62.6% similar) in 203 aa overlap (2-198:50-251) 10 20 30 pF1KE2 MEKPAGRKKKTPTPRE-EADVQKSALREEKV : : :.. . : . .. .: ...... CCDS13 ESQQGLFPGEDLGDPFLQERGLEQMAVIYKEIPLGEQDEENDDYEGNFSLCSSPVQHQSI 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 pF1KE2 SGDRKPPERP----TVPRKPRTEPCLSPEDEEHV-FDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKK .: . : .: : ..:: : ... :. ..: : : : CCDS13 PPGTRPQDDELFGQTFLQKSDLSMCQIIHSEEPSPCDCAETDRGDSGPNAPHRTP-QPAK 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 PYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKC :: : :::. :.... .:: .::::::..: .::::: .:: . .:: ::::::..: CCDS13 PYACRECGKAFSQSSHLLRHLVIHTGEKPYECCECGKAFSQSSHLLRHQIIHTGEKPYEC 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 pF1KE2 GECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP :::::: .: : .::: :::..:::: .::: :. :: : .:.. : ..: CCDS13 RECGKAFRQSSALTQHQKIHTGKRPYECRECGKDFSRSSSLRKHERIHTGERPYQCKECG 200 210 220 230 240 250 CCDS13 KSFNQSSGLSQHRKIHTLKKPHECDLCGKAFCHRSHLIRHQRIHTGKKPYKCDECGKAFS 260 270 280 290 300 310 >>CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs109|chr7 (527 aa) initn: 558 init1: 558 opt: 570 Z-score: 430.7 bits: 87.9 E(33420): 1.2e-17 Smith-Waterman score: 582; 43.0% identity (66.2% similar) in 207 aa overlap (3-198:274-480) 10 20 pF1KE2 MEKPAGRKKKTP---TPREEADVQKSALREEK : . :..:.: : .:. : . ...: CCDS69 KAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKK 250 260 270 280 290 300 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 -VSGDRKPPERPT-VPRK-PRTEPCLSPED-----EEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPF ..:.: : :. . :. . .::. . : : : . . : CCDS69 TITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIH 310 320 330 340 350 360 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 QRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEKPFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEK .:::::::::. :. ... . :::.:::::: .: .::::: :::.. ::: :.::: CCDS69 TGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEK 370 380 390 400 410 420 150 160 170 180 190 pF1KE2 PFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYECTHCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP :..:.::::::. .:.: :::. :::::::::..::::: .: :: :.. : :.:: CCDS69 PYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKC 430 440 450 460 470 480 CCDS69 TKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV 490 500 510 520 >>CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs109|chr9 (364 aa) initn: 567 init1: 567 opt: 567 Z-score: 430.5 bits: 87.4 E(33420): 1.2e-17 Smith-Waterman score: 567; 63.5% identity (87.0% similar) in 115 aa overlap (84-198:196-310) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 PEDEEHVFDAFDASFKDDFEGVPVFIPFQRKKPYECSECGRIFKHKTDHIRHQRVHTGEK .:::.:::::. :.. . :.:::.::::: CCDS75 TGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEK 170 180 190 200 210 220 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 PFKCAQCGKAFRHSSDVTKHQRTHTGEKPFKCGECGKAFNCGSNLLKHQKTHTGEKPYEC :..:: ::::: .:...:.::::::::::.::.::::::. ..::. :::::::::::.: CCDS75 PYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKC 230 240 250 260 270 280 180 190 pF1KE2 THCGKAFAYSSCLIRHQKRHPRKKP ..::: :. :: ::::. : .:: CCDS75 NECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECG 290 300 310 320 330 340 >-- initn: 575 init1: 546 opt: 547 Z-score: 416.0 bits: 84.7 E(33420): 7.7e-17 Smith-Waterman score: 548; 48.7% identity (77.0% similar) in 152 aa overlap (50-198:21-170) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 VQKSALREEKVSGDRKPPERPTVPRKPRTEPCLSPEDEEHVFDAFD---ASFKDDFEGVP : :::... : .: . ..:.. 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