Result of FASTA (omim) for pFN21AE5736
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5736, 832 aa
  1>>>pF1KE5736 832 - 832 aa - 832 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5196+/-0.000499; mu= 19.9732+/- 0.031
 mean_var=85.3884+/-17.667, 0's: 0 Z-trim(108.9): 407  B-trim: 80 in 1/52
 Lambda= 0.138795
 statistics sampled from 16559 (16983) to 16559 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.199), width:  16
 Scan time:  9.850

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004054 (OMIM: 603017) cadherin-17 precursor [Ho ( 832) 5468 1106.0       0
NP_001138135 (OMIM: 603017) cadherin-17 precursor  ( 832) 5468 1106.0       0
XP_011515092 (OMIM: 603017) PREDICTED: cadherin-17 ( 752) 4233 858.7       0
NP_004053 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 1 pre ( 829) 1288 269.0   6e-71
NP_001191674 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 3  ( 790) 1030 217.4 2.1e-55
NP_001191673 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 2  ( 807) 1030 217.4 2.1e-55
XP_005255827 (OMIM: 603118) PREDICTED: cadherin-16 ( 651) 1023 215.9 4.7e-55
NP_001191675 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 4  ( 732)  938 198.9 6.9e-50
NP_077741 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 839)  903 191.9 9.8e-48
NP_001932 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 896)  903 192.0   1e-47
XP_011521106 (OMIM: 601364) PREDICTED: cadherin-13 ( 612)  833 177.8 1.3e-43
NP_001248 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 1 pre ( 713)  833 177.9 1.4e-43
NP_001207417 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 2  ( 760)  833 177.9 1.5e-43
NP_001207418 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 3  ( 674)  824 176.1 4.8e-43
XP_006714498 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864421 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864413 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864414 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_005248285 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864415 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864419 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864417 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864418 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864416 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
NP_001278885 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1  ( 790)  791 169.5 5.3e-41
NP_004925 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1 pre ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_016864420 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790)  791 169.5 5.3e-41
XP_011512230 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 724)  784 168.1 1.3e-40
XP_011521109 (OMIM: 603118) PREDICTED: cadherin-16 ( 766)  772 165.7 7.2e-40
NP_004939 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 840)  724 156.1 6.1e-37
NP_077739 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 894)  724 156.1 6.4e-37
NP_001207419 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 4  ( 459)  705 152.1 5.3e-36
NP_001239268 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 3 [ ( 842)  698 150.9 2.2e-35
NP_001239267 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 2 [ ( 879)  698 150.9 2.3e-35
NP_001785 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 1 prep ( 916)  698 150.9 2.4e-35
NP_001161139 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 2  ( 574)  673 145.8 5.4e-34
XP_016864429 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574)  673 145.8 5.4e-34
XP_016864428 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574)  673 145.8 5.4e-34
XP_016864430 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574)  673 145.8 5.4e-34
XP_016864427 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  673 145.8 5.4e-34
NP_001278886 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 3  ( 575)  673 145.8 5.4e-34
XP_016864425 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  673 145.8 5.4e-34
XP_011512232 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  673 145.8 5.4e-34
XP_016864424 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  673 145.8 5.4e-34
XP_016864426 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  673 145.8 5.4e-34
XP_011512231 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 622)  630 137.2 2.2e-31
XP_016878318 (OMIM: 603008) PREDICTED: cadherin-8  ( 621)  594 130.0 3.3e-29
XP_016864422 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 567)  582 127.5 1.6e-28
XP_016864423 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 567)  582 127.5 1.6e-28
XP_011538341 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3418)  548 121.3 7.2e-26


>>NP_004054 (OMIM: 603017) cadherin-17 precursor [Homo s  (832 aa)
 initn: 5468 init1: 5468 opt: 5468  Z-score: 5918.2  bits: 1106.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5468; 99.8% identity (100.0% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-832)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_004 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIKVKDIN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
              550       560       570       580       590       600

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pF1KE5 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
              670       680       690       700       710       720

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pF1KE5 INGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 INGTHARLSTRHTEFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830  
pF1KE5 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
              790       800       810       820       830  

>>NP_001138135 (OMIM: 603017) cadherin-17 precursor [Hom  (832 aa)
 initn: 5468 init1: 5468 opt: 5468  Z-score: 5918.2  bits: 1106.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5468; 99.8% identity (100.0% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-832)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIKVKDIN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
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pF1KE5 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
              430       440       450       460       470       480

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pF1KE5 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
              490       500       510       520       530       540

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pF1KE5 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
              550       560       570       580       590       600

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pF1KE5 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
              610       620       630       640       650       660

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pF1KE5 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
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pF1KE5 INGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INGTHARLSTRHTEFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
              730       740       750       760       770       780

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pF1KE5 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
              790       800       810       820       830  

>>XP_011515092 (OMIM: 603017) PREDICTED: cadherin-17 iso  (752 aa)
 initn: 4213 init1: 4213 opt: 4233  Z-score: 4582.3  bits: 858.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4746; 90.1% identity (90.4% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-752)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE5 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
XP_011 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIKVKDIN
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pF1KE5 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
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pF1KE5 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
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pF1KE5 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
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pF1KE5 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
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pF1KE5 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
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pF1KE5 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
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pF1KE5 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
              490       500       510       520       530       540

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pF1KE5 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
              550       560       570       580       590       600

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pF1KE5 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                 
XP_011 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVG-----------------
              610       620       630       640                    

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
                                                                   
XP_011 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 INGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
          ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ---THARLSTRHTEFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
              650       660       670       680       690       700

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pF1KE5 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
              710       720       730       740       750  

>>NP_004053 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 1 precurs  (829 aa)
 initn: 810 init1: 376 opt: 1288  Z-score: 1394.7  bits: 269.0 E(85289): 6e-71
Smith-Waterman score: 1288; 30.4% identity (63.0% similar) in 776 aa overlap (66-828:65-826)

          40        50        60        70         80        90    
pF1KE5 FSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTFELTGETDNIFVIERE-GLLYYNRALDRETRSTHNL
                                     :.. :... . :.:  .:::::: .. ..:
NP_004 GNFPLYLTKLPLPREGAEGQIVLSGDSGKATEGPFAMDPDSGFLLVTRALDREEQAEYQL
           40        50        60        70        80        90    

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE5 QVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDINDNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLD
       ::.    .: .. :: :. ..::: ::. : : :. :.. . ...::: :::...:.: :
NP_004 QVTLEMQDGHVLWGPQPVLVHVKDENDQVPHFSQAIYRARLSRGTRPGIPFLFLEASDRD
          100       110       120       130       140       150    

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE5 DPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYFQINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVK
       .:.: :..: ..:. : :   .  .::.. . ::..:. .::  :. : . .:.:...::
NP_004 EPGTANSDLRFHILSQAPAQPSPDMFQLEPRLGALALSPKGSTSLDHALERTYQLLVQVK
          160       170       180       190       200       210    

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE5 DMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLV
       ::: :. .. . :..:.. . :. : . .:....::    .: ...::.:.   ..: : 
NP_004 DMGDQA-SGHQATATVEVSIIESTWVSLEPIHLAENLKVLYPHHMAQVHWSGGDVHYHL-
          220        230       240       250       260       270   

          280       290       300       310       320       330    
pF1KE5 DKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDREEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDIN
         :. :  :: .. ::..:::. :::: .  :.. . :.. .:.  . :::.:: : : :
NP_004 --ESHPPGPFEVNAEGNLYVTRELDREAQAEYLLQVRAQNSHGEDYAAPLELHVLVMDEN
              280       290       300       310       320       330

          340       350       360       370       380       390    
pF1KE5 DNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDG-L
       :: : ::    .  . :    :. .  :.:.: :  .. :: . :...   :.  ..:  
NP_004 DNVPICPPRDPTVSIPELSPPGTEVTRLSAEDADAPGSPNSHVVYQLLSPEPEDGVEGRA
              340       350       360       370       380       390

           400       410        420         430       440       450
pF1KE5 FLIQTYAGMLQLAKQSLKK-QDTPQYNLTIEVSDKD--FKTLCFVQINVIDINDQIPIFE
       : ..  .: . :.   :.  :.     :.....  .  :.. : :.. : ::::. : : 
NP_004 FQVDPTSGSVTLGVLPLRAGQNILLLVLAMDLAGAEGGFSSTCEVEVAVTDINDHAPEFI
              400       410       420       430       440       450

              460       470        480        490       500        
pF1KE5 KSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDAD-EPFTGSSKIL-YHIIKGDSEGRLGVDTDPHT
        :. : ..: ::.. :. .  . : ::: ::   . ... . : .::.:: .:.: .:  
NP_004 TSQIGPISLPEDVEPGTLVAMLTAIDADLEP---AFRLMDFAIERGDTEGTFGLDWEP--
              460       470       480          490       500       

      510         520       530       540       550       560      
pF1KE5 NTGYVIIK--KPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQF
       ..:.: ..  : :..:.:   ..:  ...   :: :   . .. :  :..:  :   :..
NP_004 DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVVVVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVMPPPKL
         510       520       530        540       550       560    

        570       580       590       600       610       620      
pF1KE5 SQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLD
       .:. ..:.:  ..  :. . ..  .:: .  . .:: .:..::: :.. .::. ..  :.
NP_004 DQESYEASVPISAPAGSFLLTIQPSDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHTAQSLQ
          570       580       590       600       610       620    

         630       640       650       660       670       680     
pF1KE5 -REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGS
         . :. : : : : ..    ::. . . . .. .   :        . ..: : .  : 
NP_004 GAQPGDTYTVLVEAQDTDEPRLSASAPLVIHFLKAPPAPALTLAPVPSQYLCTPRQDHGL
          630       640       650       660       670       680    

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pF1KE5 LIF-EATDDDQHLFRGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVL
       ..   . : :    .:: ..:.:: . ..: ::... .::.:: :.      : ::... 
NP_004 IVSGPSKDPDLASGHGP-YSFTLGPNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPREHIIP
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pF1KE5 IRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC-VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGII
       . .. ...  .  .. . :  : : :::.:.: .:.. :.::   :::::. ::..:::.
NP_004 VVVSHNAQ--MWQLL-VRVIVCRCNVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLVAIGIF
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pF1KE5 LAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
       : ..: .   .. ::  . :..  .:    
NP_004 LILIFTHWTMSRKKDPDQPADSVPLKATV 
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       .:.: :..: ..:. : :   .  .::.. . ::..:. .::  :. : . .:.:...::
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       ::: :. .. . :..:.. . :. : . .:....::    .: ...::.:.   ..: : 
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         :. :  :: .. ::..:::. :::: .  :.. . :.. .:.  . :::.:: : : :
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pF1KE5 FLIQTYAGMLQLAKQSLKK-QDTPQYNLTIEVSDKD--FKTLCFVQINVIDINDQIPIFE
       : ..  .: . :.   :.  :.     :.....  .  :.. : :.. : ::::. : : 
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pF1KE5 NTGYVIIK--KPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQF
       ..:.: ..  : :..:.:   ..:  ...   :: :   . .. :  :..:  :   :..
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       .:. ..:.:  ..  :. . ..  .:: .  . .:: .:..::: :.. .::. ..  : 
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pF1KE5 REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSL
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pF1KE5 IFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIR
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       .. ...  .  .. . :  : : :::.:.: .:.. :.::   :::::. ::..:::.: 
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pF1KE5 VVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
       ..: .   .. ::  . :..  .:    
NP_001 LIFTHWTMSRKKDPDQPADSVPLKATV 
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>>NP_001191673 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 2 prec  (807 aa)
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NP_001 GNFPLYLTKLPLPREGAEGQIVLSGDSGKATEGPFAMDPDSGFLLVTRALDREEQAEYQL
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       ::.    .: .. :: :. ..::: ::. : : :. :.. . ...::: :::...:.: :
NP_001 QVTLEMQDGHVLWGPQPVLVHVKDENDQVPHFSQAIYRARLSRGTRPGIPFLFLEASDRD
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pF1KE5 DPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYFQINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVK
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NP_001 EPGTANSDLRFHILSQAPAQPSPDMFQLEPRLGALALSPKGSTSLDHALERTYQLLVQVK
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pF1KE5 DMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLV
       ::: :. .. . :..:.. . :. : . .:....::    .: ...::.:.   ..: : 
NP_001 DMGDQA-SGHQATATVEVSIIESTWVSLEPIHLAENLKVLYPHHMAQVHWSGGDVHYHL-
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pF1KE5 DKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDREEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDIN
         :. :  :: .. ::..:::. :::: .  :.. . :.. .:.  . :::.:: : : :
NP_001 --ESHPPGPFEVNAEGNLYVTRELDREAQAEYLLQVRAQNSHGEDYAAPLELHVLVMDEN
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pF1KE5 DNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDG-L
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NP_001 DNVPICPPRDPTVSIPELSPPGTEVTRLSAEDADAPGSPNSHVVYQLLSPEPEDGVEGRA
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pF1KE5 FLIQTYAGMLQLAKQSLKK-QDTPQYNLTIEVSDKD--FKTLCFVQINVIDINDQIPIFE
       : ..  .: . :.   :.  :.     :.....  .  :.. : :.. : ::::. : : 
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pF1KE5 NTGYVIIK--KPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQF
       ..:.: ..  : :..:.:   ..:  ...   :: :   . .. :  :..:  :   :..
NP_001 DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVVVVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVMPPPKL
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pF1KE5 SQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLD
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NP_001 DQESYEASVPISAPAGSFLLTIQPSDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHTAQSLQ
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pF1KE5 -REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGS
         . :. : : : : ...  .:. :   .:         ::  .:. ::.    .:.:..
NP_001 GAQPGDTYTVLVEAQDTA-LTLAPVPSQYLCT-------PR--QDH-GLI----VSGPSK
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pF1KE5 LIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLI
             : :    .:: ..:.:: . ..: ::... .::.:: :.      : ::... .
NP_001 ------DPDLASGHGP-YSFTLGPNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPREHIIPV
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pF1KE5 RINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC-VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGIIL
        .. ...  .  .. . :  : : :::.:.: .:.. :.::   :::::. ::..:::.:
NP_001 VVSHNAQ--MWQLL-VRVIVCRCNVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLVAIGIFL
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        ..: .   .. ::  . :..  .:    
NP_001 ILIFTHWTMSRKKDPDQPADSVPLKATV 
     780       790       800        

>>XP_005255827 (OMIM: 603118) PREDICTED: cadherin-16 iso  (651 aa)
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pF1KE5 ATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYFQINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNL
                                     ::.. . ::..:. .::  :. : . .:.:
XP_005                              MFQLEPRLGALALSPKGSTSLDHALERTYQL
                                            10        20        30 

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE5 VISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGA
       ...::::: :. .. . :..:.. . :. : . .:....::    .: ...::.:.   .
XP_005 LVQVKDMGDQA-SGHQATATVEVSIIESTWVSLEPIHLAENLKVLYPHHMAQVHWSGGDV
              40         50        60        70        80        90

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pF1KE5 QYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDREEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVK
       .: :   :. :  :: .. ::..:::. :::: .  :.. . :.. .:.  . :::.:: 
XP_005 HYHL---ESHPPGPFEVNAEGNLYVTRELDREAQAEYLLQVRAQNSHGEDYAAPLELHVL
                 100       110       120       130       140       

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pF1KE5 VKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLP
       : : ::: : ::    .  . :    :. .  :.:.: :  .. :: . :...   :.  
XP_005 VMDENDNVPICPPRDPTVSIPELSPPGTEVTRLSAEDADAPGSPNSHVVYQLLSPEPEDG
       150       160       170       180       190       200       

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pF1KE5 MDG-LFLIQTYAGMLQLAKQSLKK-QDTPQYNLTIEVSDKD--FKTLCFVQINVIDINDQ
       ..:  : ..  .: . :.   :.  :.     :.....  .  :.. : :.. : ::::.
XP_005 VEGRAFQVDPTSGSVTLGVLPLRAGQNILLLVLAMDLAGAEGGFSSTCEVEVAVTDINDH
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pF1KE5 IPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDAD-EPFTGSSKIL-YHIIKGDSEGRLGVD
        : :  :. : ..: ::.. :. .  . : ::: ::   . ... . : .::.:: .:.:
XP_005 APEFITSQIGPISLPEDVEPGTLVAMLTAIDADLEP---AFRLMDFAIERGDTEGTFGLD
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pF1KE5 TDPHTNTGYVIIK--KPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVN
        .:  ..:.: ..  : :..:.:   ..:  ...   :: :   . .. :  :..:  : 
XP_005 WEP--DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVVVVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVM
            330       340       350       360        370       380 

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pF1KE5 EAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFS
         :...:. ..:.:  ..  :. . ..  .:: .  . .:: .:..::: :.. .::. .
XP_005 PPPKLDQESYEASVPISAPAGSFLLTIQPSDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHT
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pF1KE5 VAPLD-REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPL
       .  :.  . :. : : : : ..    ::. . . . .. .   :        . ..: : 
XP_005 AQSLQGAQPGDTYTVLVEAQDTDEPRLSASAPLVIHFLKAPPAPALTLAPVPSQYLCTPR
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pF1KE5 SAPGSLIF-EATDDDQHLFRGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEER
       .  : ..   . : :    .:: ..:.:: . ..: ::... .::.:: :.      : :
XP_005 QDHGLIVSGPSKDPDLASGHGP-YSFTLGPNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPR
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pF1KE5 EYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC-VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLL
       :... . .. ...  .  .. . :  : : :::.:.: .:.. :.::   :::::. ::.
XP_005 EHIIPVVVSHNAQ--MWQLL-VRVIVCRCNVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLV
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pF1KE5 VIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
       .:::.: ..: .   .. ::  . :..  .:    
XP_005 AIGIFLILIFTHWTMSRKKDPDQPADSVPLKATV 
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>>NP_001191675 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 4 prec  (732 aa)
 initn: 829 init1: 245 opt: 938  Z-score: 1016.7  bits: 198.9 E(85289): 6.9e-50
Smith-Waterman score: 938; 28.8% identity (60.6% similar) in 632 aa overlap (209-828:112-729)

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pF1KE5 YFQINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENI
                                     ... ::: . :. .. . :..:.. . :. 
NP_001 RALDREEQAEYQLQVTLEMQDGHVLWGPQPVLVHVKDENDQA-SGHQATATVEVSIIEST
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pF1KE5 WKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPL
       : . .:....::    .: ...::.:.   ..: :   :. :  :: .. ::..:::. :
NP_001 WVSLEPIHLAENLKVLYPHHMAQVHWSGGDVHYHL---ESHPPGPFEVNAEGNLYVTREL
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pF1KE5 DREEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNS
       ::: .  :.. . :.. .:.  . :::.:: : : ::: : ::    .  . :    :. 
NP_001 DREAQAEYLLQVRAQNSHGEDYAAPLELHVLVMDENDNVPICPPRDPTVSIPELSPPGTE
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pF1KE5 IGTLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDG-LFLIQTYAGMLQLAKQSLKK-QDTP
       .  :.:.: :  .. :: . :...   :.  ..:  : ..  .: . :.   :.  :.  
NP_001 VTRLSAEDADAPGSPNSHVVYQLLSPEPEDGVEGRAFQVDPTSGSVTLGVLPLRAGQNIL
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pF1KE5 QYNLTIEVSDKD--FKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQA
          :.....  .  :.. : :.. : ::::. : :  :. : ..: ::.. :. .  . :
NP_001 LLVLAMDLAGAEGGFSSTCEVEVAVTDINDHAPEFITSQIGPISLPEDVEPGTLVAMLTA
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pF1KE5 TDAD-EPFTGSSKIL-YHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIK--KPLDFETAAVSNIV
        ::: ::   . ... . : .::.:: .:.: .:  ..:.: ..  : :..:.:   ..:
NP_001 IDADLEP---AFRLMDFAIERGDTEGTFGLDWEP--DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVV
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pF1KE5 FKAENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTA
         ...   :: :   . .. :  :..:  :   :...:. ..:.:  ..  :. . ..  
NP_001 VVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVMPPPKLDQESYEASVPISAPAGSFLLTIQP
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pF1KE5 KDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLD-REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSS
       .:: .  . .:: .:..::: :.. .::. ..  :.  . :. : : : : ..    ::.
NP_001 SDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHTAQSLQGAQPGDTYTVLVEAQDTDEPRLSA
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pF1KE5 VSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIF-EATDDDQHLFRGPHFTFSLG
        . . . .. .   :        . ..: : .  : ..   . : :    .:: ..:.::
NP_001 SAPLVIHFLKAPPAPALTLAPVPSQYLCTPRQDHGLIVSGPSKDPDLASGHGP-YSFTLG
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pF1KE5 SG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC
        . ..: ::... .::.:: :.      : ::... . .. ...   . .:   :  : :
NP_001 PNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPREHIIPVVVSHNAQM-WQLLVR--VIVCRC
              620       630       640       650        660         

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pF1KE5 -VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASE
        :::.:.: .:.. :.::   :::::. ::..:::.: ..: .   .. ::  . :..  
NP_001 NVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLVAIGIFLILIFTHWTMSRKKDPDQPADSVP
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        830  
pF1KE5 VKPLRS
       .:    
NP_001 LKATV 
       730   

>>NP_077741 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc3b p  (839 aa)
 initn: 637 init1: 231 opt: 903  Z-score: 978.0  bits: 191.9 E(85289): 9.8e-48
Smith-Waterman score: 908; 30.5% identity (61.4% similar) in 603 aa overlap (239-816:137-721)

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE5 LVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPG
                                     : :: :  : :::  : :. . ::. .: .
NP_077 KEVTVLLEHQKKVSKTRHTRETVLRRAKRRW-APIPCSMQENSLGPFPLFLQQVE-SDAA
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pF1KE5 AQYSL--------VDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDREEKDAYVFYAVAKDEYGKPL
        .:..        :::: :  : .  :  :... :.:.:::: :.. . : :.   :   
NP_077 QNYTVFYSISGRGVDKEPLNLFYIERDT-GNLFCTRPVDREEYDVFDLIAYASTADGYSA
          170       180       190        200       210       220   

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pF1KE5 SYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTLTAHDRDEENTANSFLNYR
       . :: . ..:.: ::: :.    .  ::: :. : :...:.. : :::: .: .. :.: 
NP_077 DLPLPLPIRVEDENDNHPVFTEAIYNFEVLESSRPGTTVGVVCATDRDEPDTMHTRLKYS
           230       240       250       260       270       280   

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pF1KE5 IVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNLTIEVSDKDFKTLCFVQ----
       :..:::. :  ::: ..  .:..  ... : .. . .:.: ..:.: : . . ..     
NP_077 ILQQTPRSP--GLFSVHPSTGVITTVSHYLDREVVDKYSLIMKVQDMDGQFFGLIGTSTC
           290         300       310       320       330       340 

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pF1KE5 -INVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEPFTGSSKILYHIIKGD
        :.: : ::. : :... :   ...:.. ..  :: :   : :   :.. .. . :.::.
NP_077 IITVTDSNDNAPTFRQNAY--EAFVEENAFNVEILRIPIEDKDLINTANWRVNFTILKGN
             350       360         370       380       390         

         500       510       520       530       540        550    
pF1KE5 SEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGV-KYNASSFAKFT
        .:.. ..:: .:: : . . :::..:     :. . ..:  :..  . . .: . :  :
NP_077 ENGHFKISTDKETNEGVLSVVKPLNYEENRQVNLEIGVNNEAPFARDIPRVTALNRALVT
     400       410       420       430       440       450         

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pF1KE5 LIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPE---GLDISYSLRGDTRGWLK
       . : :..:.:. .  .  ....:..:.:.:...  : :::   :  . :.   : .::. 
NP_077 VHVRDLDEGPECTPAAQYVRIKENLAVGSKINGYKAYDPENRNGNGLRYKKLHDPKGWIT
     460       470       480       490       500       510         

             620       630           640       650       660       
pF1KE5 IDHVTGEIFSVAPLDREAGSP----YRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRL
       ::...: :..   ::::. .:    : . :.:  .  .. : .. . . . :::::::..
NP_077 IDEISGSIITSKILDREVETPKNELYNITVLA--IDKDDRSCTGTLAVNIEDVNDNPPEI
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