FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5736, 832 aa 1>>>pF1KE5736 832 - 832 aa - 832 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0034+/-0.00121; mu= 16.8869+/- 0.073 mean_var=80.0150+/-16.107, 0's: 0 Z-trim(102.0): 189 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.143380 statistics sampled from 6552 (6742) to 6552 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16 Scan time: 3.240 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6260.1 CDH17 gene_id:1015|Hs108|chr8 ( 832) 5468 1141.7 0 CCDS10823.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 829) 1288 277.1 8.7e-74 CCDS58471.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 790) 1030 223.7 9.7e-58 CCDS56002.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 807) 1030 223.7 9.9e-58 CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 732) 938 204.7 4.9e-52 CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 ( 896) 903 197.5 8.7e-50 CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 713) 833 182.9 1.6e-45 CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 760) 833 183.0 1.7e-45 CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 674) 824 181.1 5.7e-45 CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 790) 791 174.3 7.4e-43 CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 781) 730 161.7 4.6e-39 CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 840) 724 160.4 1.2e-38 CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 894) 724 160.4 1.2e-38 CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 842) 698 155.0 4.8e-37 CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 916) 698 155.1 5.2e-37 CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 574) 673 149.8 1.3e-35 CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 575) 673 149.8 1.3e-35 CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20 ( 832) 655 146.2 2.3e-34 CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 754) 539 122.1 3.5e-27 CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18 ( 999) 540 122.4 3.9e-27 CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 819) 537 121.7 5e-27 CCDS81472.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 (1381) 531 120.6 1.9e-26 CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4 (4981) 533 121.3 4.2e-26 CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1040) 490 112.1 5.2e-24 CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1059) 490 112.1 5.3e-24 CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18 (1049) 488 111.7 7e-24 CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 693) 480 109.9 1.5e-23 CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 796) 480 109.9 1.7e-23 CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 485 111.2 2.6e-23 CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 630) 460 105.8 2.5e-22 CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 785) 460 105.8 3e-22 CCDS48141.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1100) 462 106.3 3e-22 CCDS43976.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1101) 462 106.3 3e-22 CCDS55462.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1148) 462 106.3 3.1e-22 CCDS54930.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 750) 447 103.1 1.9e-21 CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 447 103.1 2e-21 CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 447 103.1 2.3e-21 CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5 ( 788) 439 101.5 6.1e-21 CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18 (1118) 441 101.9 6.2e-21 CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 437 101.1 8.7e-21 CCDS4242.1 PCDHAC2 gene_id:56134|Hs108|chr5 (1007) 438 101.3 8.7e-21 CCDS73146.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 (1079) 438 101.3 9.3e-21 CCDS53540.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 (1114) 438 101.3 9.5e-21 CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 437 101.1 9.7e-21 CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 433 100.2 1.5e-20 CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 433 100.3 1.7e-20 CCDS4317.1 FAT2 gene_id:2196|Hs108|chr5 (4349) 440 102.0 2.3e-20 CCDS47177.1 FAT1 gene_id:2195|Hs108|chr4 (4588) 440 102.0 2.4e-20 CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 429 99.4 2.6e-20 CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 927) 429 99.4 3e-20 >>CCDS6260.1 CDH17 gene_id:1015|Hs108|chr8 (832 aa) initn: 5468 init1: 5468 opt: 5468 Z-score: 6111.1 bits: 1141.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5468; 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CCDS10 DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVVVVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVMPPPKL 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE5 SQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLD .:. ..:.: .. :. . .. .:: . . .:: .:..::: :.. .::. .. :. CCDS10 DQESYEASVPISAPAGSFLLTIQPSDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHTAQSLQ 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KE5 -REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGS . :. : : : : .. ::. . . . .. . : . ..: : . : CCDS10 GAQPGDTYTVLVEAQDTDEPRLSASAPLVIHFLKAPPAPALTLAPVPSQYLCTPRQDHGL 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE5 LIF-EATDDDQHLFRGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVL .. . : : .:: ..:.:: . ..: ::... .::.:: :. : ::... CCDS10 IVSGPSKDPDLASGHGP-YSFTLGPNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPREHIIP 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 pF1KE5 IRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC-VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGII . .. ... . .. . : : : :::.:.: .:.. :.:: :::::. ::..:::. CCDS10 VVVSHNAQ--MWQLL-VRVIVCRCNVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLVAIGIF 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE5 LAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS : ..: . .. :: . :.. .: CCDS10 LILIFTHWTMSRKKDPDQPADSVPLKATV 810 820 >>CCDS58471.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 (790 aa) initn: 916 init1: 376 opt: 1030 Z-score: 1150.1 bits: 223.7 E(32554): 9.7e-58 Smith-Waterman score: 1206; 30.2% identity (62.9% similar) in 774 aa overlap (66-828:65-787) 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 FSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTFELTGETDNIFVIERE-GLLYYNRALDRETRSTHNL :.. :... . :.: .:::::: .. ..: CCDS58 GNFPLYLTKLPLPREGAEGQIVLSGDSGKATEGPFAMDPDSGFLLVTRALDREEQAEYQL 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 QVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDINDNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLD ::. .: .. :: :. ..::: ::. : : :. :.. . ...::: :::...:.: : CCDS58 QVTLEMQDGHVLWGPQPVLVHVKDENDQVPHFSQAIYRARLSRGTRPGIPFLFLEASDRD 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 DPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYFQINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVK .:.: :..: ..:. : : . .::.. . ::..:. .:: :. : . .:.:...:: CCDS58 EPGTANSDLRFHILSQAPAQPSPDMFQLEPRLGALALSPKGSTSLDHALERTYQLLVQVK 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 DMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLV ::: :. .. . :..:.. . :. : . .:....:: .: ...::.:. ..: : CCDS58 DMGDQA-SGHQATATVEVSIIESTWVSLEPIHLAENLKVLYPHHMAQVHWSGGDVHYHL- 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 DKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDREEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDIN :. : :: .. ::..:::. :::: . :.. . :.. .:. . :::.:: : : : CCDS58 --ESHPPGPFEVNAEGNLYVTRELDREAQAEYLLQVRAQNSHGEDYAAPLELHVLVMDEN 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 DNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDG-L :: : :: . . : :. . :.:.: : .. :: . :... :. ..: CCDS58 DNVPICPPRDPTVSIPELSPPGTEVTRLSAEDADAPGSPNSHVVYQLLSPEPEDGVEGRA 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 FLIQTYAGMLQLAKQSLKK-QDTPQYNLTIEVSDKD--FKTLCFVQINVIDINDQIPIFE : .. .: . :. :. :. :..... . :.. : :.. : ::::. : : CCDS58 FQVDPTSGSVTLGVLPLRAGQNILLLVLAMDLAGAEGGFSSTCEVEVAVTDINDHAPEFI 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 KSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDAD-EPFTGSSKIL-YHIIKGDSEGRLGVDTDPHT :. : ..: ::.. :. . . : ::: :: . ... . : .::.:: .:.: .: CCDS58 TSQIGPISLPEDVEPGTLVAMLTAIDADLEP---AFRLMDFAIERGDTEGTFGLDWEP-- 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE5 NTGYVIIK--KPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQF ..:.: .. : :..:.: ..: ... :: : . .. : :..: : :.. CCDS58 DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVVVVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVMPPPKL 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE5 SQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLD .:. ..:.: .. :. . .. .:: . . .:: .:..::: :.. .::. .. : CCDS58 DQESYEASVPISAPAGSFLLTIQPSDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHTAQSL- 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KE5 REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSL ....: :.. . .:....:. :. ::. .:.:.. CCDS58 -QGAQP-----------GDTYT-------VLVEAQDT------DH-GLI----VSGPSK- 630 640 650 690 700 710 720 730 740 pF1KE5 IFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIR : : .:: ..:.:: . ..: ::... .::.:: :. : ::... . CCDS58 -----DPDLASGHGP-YSFTLGPNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPREHIIPVV 660 670 680 690 700 750 760 770 780 790 800 pF1KE5 INDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC-VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILA .. ... . .. . : : : :::.:.: .:.. :.:: :::::. ::..:::.: CCDS58 VSHNAQ--MWQLL-VRVIVCRCNVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLVAIGIFLI 710 720 730 740 750 760 810 820 830 pF1KE5 VVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS ..: . .. :: . :.. .: CCDS58 LIFTHWTMSRKKDPDQPADSVPLKATV 770 780 790 >>CCDS56002.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 (807 aa) initn: 916 init1: 376 opt: 1030 Z-score: 1149.9 bits: 223.7 E(32554): 9.9e-58 Smith-Waterman score: 1243; 31.0% identity (63.2% similar) in 775 aa overlap (66-828:65-804) 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 FSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTFELTGETDNIFVIERE-GLLYYNRALDRETRSTHNL :.. :... . :.: .:::::: .. ..: CCDS56 GNFPLYLTKLPLPREGAEGQIVLSGDSGKATEGPFAMDPDSGFLLVTRALDREEQAEYQL 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 QVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDINDNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLD ::. .: .. :: :. ..::: ::. : : :. :.. . ...::: :::...:.: : CCDS56 QVTLEMQDGHVLWGPQPVLVHVKDENDQVPHFSQAIYRARLSRGTRPGIPFLFLEASDRD 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 DPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYFQINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVK .:.: :..: ..:. : : . .::.. . ::..:. .:: :. : . .:.:...:: CCDS56 EPGTANSDLRFHILSQAPAQPSPDMFQLEPRLGALALSPKGSTSLDHALERTYQLLVQVK 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 DMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLV ::: :. .. . :..:.. . :. : . .:....:: .: ...::.:. ..: : CCDS56 DMGDQA-SGHQATATVEVSIIESTWVSLEPIHLAENLKVLYPHHMAQVHWSGGDVHYHL- 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 DKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDREEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDIN :. : :: .. ::..:::. :::: . :.. . :.. .:. . :::.:: : : : CCDS56 --ESHPPGPFEVNAEGNLYVTRELDREAQAEYLLQVRAQNSHGEDYAAPLELHVLVMDEN 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 DNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDG-L :: : :: . . : :. . :.:.: : .. :: . :... :. ..: CCDS56 DNVPICPPRDPTVSIPELSPPGTEVTRLSAEDADAPGSPNSHVVYQLLSPEPEDGVEGRA 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 FLIQTYAGMLQLAKQSLKK-QDTPQYNLTIEVSDKD--FKTLCFVQINVIDINDQIPIFE : .. .: . :. :. :. :..... . :.. : :.. : ::::. : : CCDS56 FQVDPTSGSVTLGVLPLRAGQNILLLVLAMDLAGAEGGFSSTCEVEVAVTDINDHAPEFI 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 KSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDAD-EPFTGSSKIL-YHIIKGDSEGRLGVDTDPHT :. : ..: ::.. :. . . : ::: :: . ... . : .::.:: .:.: .: CCDS56 TSQIGPISLPEDVEPGTLVAMLTAIDADLEP---AFRLMDFAIERGDTEGTFGLDWEP-- 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE5 NTGYVIIK--KPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQF ..:.: .. : :..:.: ..: ... :: : . .. : :..: : :.. CCDS56 DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVVVVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVMPPPKL 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE5 SQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLD .:. ..:.: .. :. . .. .:: . . .:: .:..::: :.. .::. .. :. CCDS56 DQESYEASVPISAPAGSFLLTIQPSDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHTAQSLQ 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KE5 -REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGS . :. : : : : ... .:. : .: :: .:. ::. .:.:.. CCDS56 GAQPGDTYTVLVEAQDTA-LTLAPVPSQYLCT-------PR--QDH-GLI----VSGPSK 630 640 650 660 690 700 710 720 730 740 pF1KE5 LIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLI : : .:: ..:.:: . ..: ::... .::.:: :. : ::... . CCDS56 ------DPDLASGHGP-YSFTLGPNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPREHIIPV 670 680 690 700 710 720 750 760 770 780 790 800 pF1KE5 RINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC-VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGIIL .. ... . .. . : : : :::.:.: .:.. :.:: :::::. ::..:::.: CCDS56 VVSHNAQ--MWQLL-VRVIVCRCNVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLVAIGIFL 730 740 750 760 770 810 820 830 pF1KE5 AVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS ..: . .. :: . :.. .: CCDS56 ILIFTHWTMSRKKDPDQPADSVPLKATV 780 790 800 >>CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 (732 aa) initn: 829 init1: 245 opt: 938 Z-score: 1047.7 bits: 204.7 E(32554): 4.9e-52 Smith-Waterman score: 938; 28.8% identity (60.6% similar) in 632 aa overlap (209-828:112-729) 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YFQINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENI ... ::: . :. .. . :..:.. . :. CCDS58 RALDREEQAEYQLQVTLEMQDGHVLWGPQPVLVHVKDENDQA-SGHQATATVEVSIIEST 90 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 WKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPL : . .:....:: .: ...::.:. ..: : :. : :: .. ::..:::. : CCDS58 WVSLEPIHLAENLKVLYPHHMAQVHWSGGDVHYHL---ESHPPGPFEVNAEGNLYVTREL 150 160 170 180 190 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 DREEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNS ::: . :.. . :.. .:. . :::.:: : : ::: : :: . . : :. CCDS58 DREAQAEYLLQVRAQNSHGEDYAAPLELHVLVMDENDNVPICPPRDPTVSIPELSPPGTE 200 210 220 230 240 250 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 IGTLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDG-LFLIQTYAGMLQLAKQSLKK-QDTP . :.:.: : .. :: . :... :. ..: : .. .: . :. :. :. CCDS58 VTRLSAEDADAPGSPNSHVVYQLLSPEPEDGVEGRAFQVDPTSGSVTLGVLPLRAGQNIL 260 270 280 290 300 310 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 QYNLTIEVSDKD--FKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQA :..... . :.. : :.. : ::::. : : :. : ..: ::.. :. . . : CCDS58 LLVLAMDLAGAEGGFSSTCEVEVAVTDINDHAPEFITSQIGPISLPEDVEPGTLVAMLTA 320 330 340 350 360 370 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 TDAD-EPFTGSSKIL-YHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIK--KPLDFETAAVSNIV ::: :: . ... . : .::.:: .:.: .: ..:.: .. : :..:.: ..: CCDS58 IDADLEP---AFRLMDFAIERGDTEGTFGLDWEP--DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVV 380 390 400 410 420 430 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 FKAENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTA ... :: : . .. : :..: : :...:. ..:.: .. :. . .. CCDS58 VVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVMPPPKLDQESYEASVPISAPAGSFLLTIQP 440 450 460 470 480 490 600 610 620 630 640 pF1KE5 KDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLD-REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSS .:: . . .:: .:..::: :.. .::. .. :. . :. : : : : .. ::. CCDS58 SDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHTAQSLQGAQPGDTYTVLVEAQDTDEPRLSA 500 510 520 530 540 550 650 660 670 680 690 700 pF1KE5 VSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIF-EATDDDQHLFRGPHFTFSLG . . . .. . : . ..: : . : .. . : : .:: ..:.:: CCDS58 SAPLVIHFLKAPPAPALTLAPVPSQYLCTPRQDHGLIVSGPSKDPDLASGHGP-YSFTLG 560 570 580 590 600 610 710 720 730 740 750 760 pF1KE5 SG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC . ..: ::... .::.:: :. : ::... . .. ... . .: : : : CCDS58 PNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPREHIIPVVVSHNAQM-WQLLVR--VIVCRC 620 630 640 650 660 770 780 790 800 810 820 pF1KE5 -VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASE :::.:.: .:.. :.:: :::::. ::..:::.: ..: . .. :: . :.. CCDS58 NVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLVAIGIFLILIFTHWTMSRKKDPDQPADSVP 670 680 690 700 710 720 830 pF1KE5 VKPLRS .: CCDS58 LKATV 730 >>CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 (896 aa) initn: 637 init1: 231 opt: 903 Z-score: 1007.3 bits: 197.5 E(32554): 8.7e-50 Smith-Waterman score: 908; 30.5% identity (61.4% similar) in 603 aa overlap (239-816:137-721) 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 LVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWKAPKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPG : :: : : ::: : :. . ::. .: . CCDS32 KEVTVLLEHQKKVSKTRHTRETVLRRAKRRW-APIPCSMQENSLGPFPLFLQQVE-SDAA 110 120 130 140 150 160 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 AQYSL--------VDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDREEKDAYVFYAVAKDEYGKPL .:.. :::: : : . : :... :.:.:::: :.. . : :. : CCDS32 QNYTVFYSISGRGVDKEPLNLFYIERDT-GNLFCTRPVDREEYDVFDLIAYASTADGYSA 170 180 190 200 210 220 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 SYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTLTAHDRDEENTANSFLNYR . :: . ..:.: ::: :. . ::: :. : :...:.. : :::: .: .. :.: CCDS32 DLPLPLPIRVEDENDNHPVFTEAIYNFEVLESSRPGTTVGVVCATDRDEPDTMHTRLKYS 230 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 pF1KE5 IVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNLTIEVSDKDFKTLCFVQ---- :..:::. : ::: .. .:.. ... : .. . .:.: ..:.: : . . .. CCDS32 ILQQTPRSP--GLFSVHPSTGVITTVSHYLDREVVDKYSLIMKVQDMDGQFFGLIGTSTC 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 -INVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEPFTGSSKILYHIIKGD :.: : ::. : :... : ...:.. .. :: : : : :.. .. . :.::. CCDS32 IITVTDSNDNAPTFRQNAY--EAFVEENAFNVEILRIPIEDKDLINTANWRVNFTILKGN 350 360 370 380 390 500 510 520 530 540 550 pF1KE5 SEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGV-KYNASSFAKFT .:.. ..:: .:: : . . :::..: :. . ..: :.. . . .: . : : CCDS32 ENGHFKISTDKETNEGVLSVVKPLNYEENRQVNLEIGVNNEAPFARDIPRVTALNRALVT 400 410 420 430 440 450 560 570 580 590 600 610 pF1KE5 LIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPE---GLDISYSLRGDTRGWLK . : :..:.:. . . ....:..:.:.:... : ::: : . :. : .::. CCDS32 VHVRDLDEGPECTPAAQYVRIKENLAVGSKINGYKAYDPENRNGNGLRYKKLHDPKGWIT 460 470 480 490 500 510 620 630 640 650 660 pF1KE5 IDHVTGEIFSVAPLDREAGSP----YRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRL ::...: :.. ::::. .: : . :.: . .. : .. . . . :::::::.. CCDS32 IDEISGSIITSKILDREVETPKNELYNITVLA--IDKDDRSCTGTLAVNIEDVNDNPPEI 520 530 540 550 560 570 670 680 690 700 710 720 pF1KE5 AKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGS--LQNDWEVSKINGTH ..: . .:.: . ... :.: :. . .: : ::: . : .. : ..:.: : CCDS32 LQEY--VVICKPKMGYTDIL--AVDPDEPVHGAP-FYFSLPNTSPEISRLWSLTKVNDTA 580 590 600 610 620 630 730 740 750 760 770 780 pF1KE5 ARLS-TRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQTGIPT :::: ... :. ::.. : ..: : . : :..: :.. . : ....::. CCDS32 ARLSYQKNAGFQ--EYTIPITVKD--RAGQAATKLLRVNLCECTHPTQCRATSRSTGVIL 640 650 660 670 680 790 800 810 820 830 pF1KE5 VGMAV-GILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS :. .::: :.....:..: . ::: CCDS32 GKWAILAILLGIALLFSVLLTLVCGVFGATKGKRFPEDLAQQNLIISNTEAPGDDRVCSA 690 700 710 720 730 740 CCDS32 NGFMTQTTNNSSQGFCGTMGSGMKNGGQETIEMMKGGNQTLESCRGAGHHHTLDSCRGGH 750 760 770 780 790 800 >>CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 (713 aa) initn: 747 init1: 260 opt: 833 Z-score: 930.5 bits: 182.9 E(32554): 1.6e-45 Smith-Waterman score: 874; 29.3% identity (60.1% similar) in 639 aa overlap (179-785:72-702) 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 NATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYFQINNKTGAISL---TREGSQELNPAKNP ::..:. : ..: : :. . :..: CCDS58 AEFIEDQSILNLTFSDCKGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHARTP 50 60 70 80 90 100 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 SYN-----LVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWKAPKPVEMVENSTDPHPIKIT . .... ::. :. .. :. . .. . .. . .:. . ::. .: : . 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CCDS58 VNDNAPFIYPTVAEV--CDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDP-FKFEIHKQAVPDKVWKI 580 590 600 610 620 630 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 SKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGS--CFRPA ::::.::: .: . .... .: . : ..:.:.::. .:..: : ::: ... : . 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CCDS58 HAEDMAELVIVGGKDIQGSLQDIFK-FARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVG 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 pF1KE5 QVRWND-PG-AQYSLVDK--EKLPRFPFSIDQE-GDIYVTQPLDREEKDAYVFYAVAKDE .: .: : ... :. : .. :. : :... :.. ::. :::: .: ... . : CCDS58 KVVDSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDV 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 YGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTLTAHDRDEENTANS :: : :. ..: : : ::: : . .:.:. :... .:: : :. : :. CCDS58 NGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNA 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 pF1KE5 FLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAG-MLQLAKQSLKKQDT---PQYNLTIEVSDK---- .: : : .::: : ..: :. : .. ... .: ..: :.:.: ::..: CCDS58 LLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLD 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 -DFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEPFTGSSK . . : . : ::. : : :... . .:. .: .:... . : :.: ::. . CCDS58 VGLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQ--ATVEEGAVG-VIVNLTVEDKDDPTTGAWR 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 ILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLVFGVKYN : ::.:. . . :.:.:: :.. . ::::.: .: ....:.:: .::: :.:. CCDS58 AAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYG 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 ASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLD---ISYSLR :: : . : ::::.: : ... .::...:. . .:.: ::..:. : ::. CCDS58 PSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVY 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 pF1KE5 GDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREA----GSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMD : :::.:. ..: . ..: ::::. .: : . .: . :. .... . . : : CCDS58 KDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLED 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 VNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQND-WEV :::: : . . . : . . .:. :.: : : : : : . . .. . :.. CCDS58 VNDNAPFIYPTVAEV--CDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDP-FKFEIHKQAVPDKVWKI 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 SKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGS--CFRPA ::::.::: .: . .... .: . : ..:.:.::. .:..: : ::: ... : . CCDS58 SKINNTHALVSLLQ-NLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAG 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 pF1KE5 GHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS . . ..:.: CCDS58 ALRFSLPSVLLLSLFSLACL 750 760 >>CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 (674 aa) initn: 747 init1: 260 opt: 824 Z-score: 920.9 bits: 181.1 E(32554): 5.7e-45 Smith-Waterman score: 824; 31.4% identity (61.1% similar) in 532 aa overlap (274-785:141-663) 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 PVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQE-GDIYVTQPLDREE ::.: :. : :... :.. ::. :::: CCDS58 IVGGKDIQGSLQVVDSDRPERSKFRLTGKGVDQE--PKGIFRINENTGSVSVTRTLDREV 120 130 140 150 160 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 KDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIGTL .: ... . : :: : :. ..: : : ::: : . .:.:. :... . CCDS58 IAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRM 170 180 190 200 210 220 370 380 390 400 410 pF1KE5 TAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAG-MLQLAKQSLKKQDT---PQY :: : :. : :..: : : .::: : ..: :. : .. ... .: ..: :.: CCDS58 TAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKY 230 240 250 260 270 280 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 NLTIEVSDK-----DFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQ .: ::..: . . : . : ::. : : :... . .:. .: .:... CCDS58 ELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQ--ATVEEGAVG-VIVNLT 290 300 310 320 330 340 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 ATDADEPFTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKA . : :.: ::. . : ::.:. . . :.:.:: :.. . ::::.: .: ....:. CCDS58 VEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKV 350 360 370 380 390 400 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 ENPEPLVFGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDP :: .::: :.:. :: : . : ::::.: : ... .::...:. . .:.: :: CCDS58 ENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDP 410 420 430 440 450 460 600 610 620 630 640 pF1KE5 EGLD---ISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREA----GSPYRVQVVATEVGGSS ..:. : ::. : :::.:. ..: . ..: ::::. .: : . .: . :. 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CCDS38 DKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTH-LDFRFSH-LGPFKDATMLKIIVGDVD 330 340 350 360 370 570 580 590 600 610 pF1KE5 EAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLD------ISYSLRGDTRGWLKIDHV : : ::. . .: :.. ::: ::.: :.::.. . :.:... : ...:: CCDS38 EPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDR--FFNIDAN 380 390 400 410 420 430 620 630 640 650 660 670 pF1KE5 TGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLF :: : .. :::: : . :.:.:. . .: : . ..:::::::.::..: .. CCDS38 TGTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDLLSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD-II 440 450 460 470 480 490 680 690 700 710 720 730 pF1KE5 FCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLF-RGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHT :. : ::..: . :. : ::.:.: : .. .. .. . . : . ::. CCDS38 VCEN-SKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRRR 500 510 520 530 540 550 740 750 760 770 780 790 pF1KE5 DFE---EREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVG : . : . : :.::: : : . .: . :.: . . : .. . ..:...: CCDS38 RFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLSTG 560 570 580 590 600 610 800 810 820 830 pF1KE5 ILLTTLLVIGIILAVV--FIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS :.. :: . :.::.: :: ....: CCDS38 ALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLIISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAFDIT 620 630 640 650 660 670 832 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 06:13:47 2016 done: Tue Nov 8 06:13:48 2016 Total Scan time: 3.240 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]