FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7309, 911 aa 1>>>pF1KB7309 911 - 911 aa - 911 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4546+/-0.000966; mu= 5.9832+/- 0.058 mean_var=154.6373+/-30.996, 0's: 0 Z-trim(110.1): 83 B-trim: 91 in 2/49 Lambda= 0.103138 statistics sampled from 11277 (11359) to 11277 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16 Scan time: 4.550 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 6079 917.1 0 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 3148 481.0 4.2e-135 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 1304 206.5 1e-52 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 1223 194.4 4.4e-49 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 1113 178.0 3.5e-44 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 1040 167.2 6e-41 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 943 152.8 1.9e-36 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 912 148.1 3.7e-35 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 902 146.7 1.3e-34 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 864 141.0 5.1e-33 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 820 134.5 5.1e-31 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 808 132.7 1.7e-30 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 777 128.1 4.7e-29 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 770 127.1 1.1e-28 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 762 125.8 2e-28 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 753 124.5 4.6e-28 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 742 122.9 1.6e-27 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 741 122.7 2.2e-27 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 737 122.1 2.6e-27 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 721 119.8 1.7e-26 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 694 115.7 2.6e-25 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 682 113.9 8.1e-25 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 643 108.1 3.7e-23 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 566 96.7 1.2e-19 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 548 94.0 8.3e-19 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 547 93.8 8.6e-19 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 548 94.0 8.7e-19 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 548 94.0 9.1e-19 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 548 94.0 9.1e-19 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 548 94.0 9.3e-19 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 548 94.0 9.4e-19 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 547 93.9 9.6e-19 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 544 93.5 1.6e-18 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 530 91.3 5.9e-18 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 530 91.3 6e-18 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 443 78.4 4e-14 >>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa) initn: 6079 init1: 6079 opt: 6079 Z-score: 4895.6 bits: 917.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6079; 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CCDS13 EG-------DPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTAS 680 690 700 710 720 730 790 800 810 820 830 pF1KB7 SKGLSPRFPKQKL---FPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADK .: :: :... : : . .. . . :: :. ..: . : : :. . : CCDS13 AK-TPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQ-YIDADTDDEGQLLYSVDSSPPK---SLPGSTSPK 740 750 760 770 780 840 850 860 870 880 890 pF1KB7 PSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKD-SSQEGCKMENHLFAPEI : : .. :.: .::. .:: :: . . . : :.:: ::.:::. .:.. CCDS13 FSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNC---IYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHI-SPDV 790 800 810 820 830 840 900 910 pF1KB7 HSNPGDTGYCPTRETSM . :: .. ::. :. CCDS13 RVLPGGGAHGSTRDQSI 850 >>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 (500 aa) initn: 1258 init1: 561 opt: 1304 Z-score: 1059.8 bits: 206.5 E(32554): 1e-52 Smith-Waterman score: 1304; 46.3% identity (73.3% similar) in 469 aa overlap (39-485:43-497) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 LNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN .:::: . ..:. .:.:::::: CCDS63 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 pF1KB7 TH----------ESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS . : ::.::: : .::::::: :: .:..::::.::.::..:::: CCDS63 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL-----RREAETMREREGEEFDNTCCP : ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : .. :...: : ..:.. :: CCDS63 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESE-QDFSQGPCP 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 DKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQL :.:::..::::.::.::.:....::.:.:.: : ..: . ::. : :: : CCDS63 TVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--QL-----L 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 AHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV .: :::.::: :..:::: .. .:.. :.::::::::.:.:. :.:: .... CCDS63 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS ...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: ::: CCDS63 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 SLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA .. .:::.. : :::.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.: CCDS63 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 pF1KB7 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNLKDAFARS-MELID ::: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.::.:..::: ::.. CCDS63 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLR 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KB7 VAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNN . :. : :.:..:. :. CCDS63 L---KGRERASTRSSGGDDFWF 490 500 >>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 (494 aa) initn: 1196 init1: 873 opt: 1223 Z-score: 994.7 bits: 194.4 E(32554): 4.4e-49 Smith-Waterman score: 1223; 40.6% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (22-481:10-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR ::: . . . . .. .::::. . . :.. :.:: CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB7 LGKLRDC--NTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS :..: .: . ..... .::::. .. :..::: : :: ... : :..:: . .: . CCDS16 LAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKK : .:.:.: .: .:..::... .:.:.. ::. :... . . : . . .: CCDS16 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKC 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 LWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEA .: .::::.:: :...:..:.:.:..:.... ..:.:::: : :. .. : .::. CCDS16 VWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVET 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRR .::.:::.:::::..::::: .: . .:..:.:::::.::.. ::. . .... ::.. CCDS16 ACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQ 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEK .:: .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: . :. CCDS16 AVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQ 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 DEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVN .. : : ::: ::::: ::::::::::::::: :::. ... . ::..::::: :.: CCDS16 SHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIIN 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 NFSEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESAN :: ..:..:. : : :.. : .: . .:. . : . .:: .: .. : ::. : CCDS16 NFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGG----EGKTGGSRS-DLDNLPPEPAGKEAP 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 TKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSA . .: CCDS16 SCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK 470 480 490 >>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa) initn: 941 init1: 398 opt: 1113 Z-score: 906.7 bits: 178.0 E(32554): 3.5e-44 Smith-Waterman score: 1113; 40.6% identity (74.2% similar) in 419 aa overlap (32-441:14-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 AEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRL : .:.: ::::: .. : .: : : .:: CCDS12 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 GKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQ .:: : :..::.:::::.....:.:::: : :: .:. . :.:::.... :::.: . CCDS12 ERLRACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRD 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB7 ELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDK----RK :: :::::: :: :: : ....:. : : . : : .: . :. CCDS12 ELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 KLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDN-RQLAHV .: :....:.:..:.:..: ::. :.......: :.:.:... .: :. . . :.: . CCDS12 RLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQ :.::.:::..:.::: :.. .: :...:::.::.::.::.::...: . . .. .. CCDS12 ETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLE 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF . :....: .:.: ...::::: ::.:::.:.:: :.:::.::: ... .:. :: CCDS12 RAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVH 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 FAEKDEDATK-FTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPI .::.. : . :.:.:::.:::.:.::::::::. :..: :..:. ..:.:..:.:. CCDS12 LAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPV 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PIIVNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKA : ..::. :.: : .:..: . . ::. CCDS12 TSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALW 410 420 430 440 450 460 >>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa) initn: 1026 init1: 381 opt: 1040 Z-score: 848.6 bits: 167.2 E(32554): 6e-41 Smith-Waterman score: 1040; 40.2% identity (70.7% similar) in 413 aa overlap (37-441:11-422) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 PGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD : .:::: . . . : .: :...:. CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRT-GKLHMMEEMCALSFGQELDY : .....:::::::. ..:::::::: :: :: . : :::.. .:: ::: .:. : CCDS42 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 WGIDEIYLESCCQARYHQK-KEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKR--KKLWDL ::.. .:: ::: : .. .. .. : .. . :.. :..: ... CCDS42 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRT 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 LEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVCIA .:.:.::.::.::: ::..:...: ..: .:::. ... .. :.:. .::.::. CCDS42 FEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRI-IEAICIG 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 WFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQI ::: : ..::. : :: .: : :::.:::::: :::.....: . :.: . .... CCDS42 WFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTLRV 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 FRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDED- .:.:::. ..::::: :::.::.::.: : :. .:..:. ... :::.: . :. : CCDS42 LRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDL 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 pF1KB7 --ATK-FTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVN ..: ::::::. ::. :.::::::::.:: :. :.:.::.: ..:....:::: .: . CCDS42 ETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYH 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 NFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANT .: . :.: : . .: . : CCDS42 SFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 400 410 420 >>CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 (630 aa) initn: 778 init1: 492 opt: 943 Z-score: 767.9 bits: 152.8 E(32554): 1.9e-36 Smith-Waterman score: 981; 31.4% identity (64.1% similar) in 615 aa overlap (22-627:28-606) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLD : : :..: . . .::.: .. ::. CCDS57 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 RLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEM : : : :: ....... :. . ..::::: : : :::::::::::. .. CCDS57 RYPDTLLG-----SSERDFF-----YHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 CALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPD : .. .:: ..:. . .:: .:...... :.:. .:.: . :: : CCDS57 CISAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADT--DTAGESALPTMT-- 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLA :...: .:.:..:. : .. :. .::..:.:: ..:.: . .. .: ... : CCDS57 ARQRVWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 ----HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSV ....:. ::.:::::. ..:....: .. ...::..::::::. . .:.. CCDS57 VAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDN---- 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS ..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.::. CCDS57 ---EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFA 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 SLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA ...:.::: .:.:::::::.::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..:::::: CCDS57 TVMFYAEKGSSASKFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIA 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 pF1KB7 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSIVS-MNLKDAFARSMELID ::.:.::.:::..:....: .: : :. : : :: ..:: . :. : : .: . CCDS57 LPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQS 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KB7 VAVEKAGESANTKD-SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLN :.: : . .. .. .:: : . . : ... ::.. .::. .: CCDS57 SEDEQAFVSKSGSSFETQHHHLLHCLEKTTNH---EFVDEQVFEESCMEVA------TVN 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KB7 NTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQ :: ::. ::.:. . . .. . .. :. . . . .. .: . .. : :. CCDS57 RPSSHSPS-LSSQQ-GVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQE-LSTIQIRCV-ER 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 pF1KB7 LAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQR ..... .. : . .: .. : .: : .. CCDS57 TPLSNSRSSLNAKMEECVK--LNCEQPYVTTAIISIPTPPVTTPEGDDRPESPEYSGGNI 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 pF1KB7 ARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLK CCDS57 VRVSAL 630 >>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa) initn: 1200 init1: 737 opt: 912 Z-score: 744.7 bits: 148.1 E(32554): 3.7e-35 Smith-Waterman score: 1339; 44.0% identity (75.8% similar) in 459 aa overlap (37-483:17-469) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 PGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD :..::::... : :: :.:.:::::: CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLT 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYW :...:..::.::::.. ..::.:::.:. : .:::: :::::.:::.:..:: ::..:: CCDS16 CHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYW 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB7 GIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNE------------ELRREAETMREREGEEFDNTCCPD ::.:....:::. ::...::. .: . : .. :.: :.::. . CCDS16 GINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQ 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLA :::.: .:.: ..::..:: :. .. : .:. .... :.:. : :...: : CCDS16 LRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GEVDDPV-LE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQ :: .:::::: : .:. ..: . ::.:.:::.::...:.:.:.:. . ... ... CCDS16 GVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIE 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF :. .::::.:.:::.:::::::::.::.::: :::.::.:.:::.:::..:: ::: :.. CCDS16 NMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIY 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 FAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIP .:::. ....:::: .:::::.:::::::: .: :: ::.... : : :.::.:::: CCDS16 SVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPIT 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 IIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGE :: :.::..:..:: . ..: :. .. . .:..: .:. :. . ... ..: CCDS16 IIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHE---LPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGI 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 SANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQH .. ::.: CCDS16 VVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK 470 480 490 >>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX (647 aa) initn: 834 init1: 503 opt: 902 Z-score: 734.7 bits: 146.7 E(32554): 1.3e-34 Smith-Waterman score: 948; 35.8% identity (69.6% similar) in 438 aa overlap (20-448:27-442) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWR-T ::: : .... .. . .::.: :. :. : CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPG--VKASRGDEVLVVNVSGRRFET-WKNT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 LDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMME ::: : : :: .... .. :. . .:::::: : : .:::::::.:: . CCDS14 LDRYPDTLLG-----SSEKEFF-----YDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 EMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCC . : .: .:: ..:. . .:: .:...:.. :.: .. :. . .: . CCDS14 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAG-- 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KB7 PDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLP---ELQETDEFGQLND . :..:: .:.:..:.:: .. :. .::..:.:: ..:.: ..... .. CCDS14 SSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGE 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 NRQLAH--VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESN : ....:. :: :::::....:.. .:... ...::..::::::. ... ... CCDS14 RFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKND 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 KSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIM .: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:. 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CCDS62 LTNMSRSSPSELSLNDSLR 460 470 911 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:19:44 2016 done: Tue Nov 8 04:19:45 2016 Total Scan time: 4.550 Total Display time: 0.200 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]