FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6364, 354 aa 1>>>pF1KE6364 354 - 354 aa - 354 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2613+/-0.000918; mu= 16.3812+/- 0.056 mean_var=63.0269+/-12.500, 0's: 0 Z-trim(104.7): 38 B-trim: 17 in 1/49 Lambda= 0.161552 statistics sampled from 8020 (8055) to 8020 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16 Scan time: 1.900 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6176.1 CLVS1 gene_id:157807|Hs108|chr8 ( 354) 2378 563.0 1.3e-160 CCDS34525.1 CLVS2 gene_id:134829|Hs108|chr6 ( 327) 1789 425.7 2.7e-119 CCDS32324.1 RLBP1 gene_id:6017|Hs108|chr15 ( 317) 689 169.3 3.9e-42 CCDS13332.2 TTPAL gene_id:79183|Hs108|chr20 ( 342) 624 154.2 1.5e-37 CCDS6178.1 TTPA gene_id:7274|Hs108|chr8 ( 278) 481 120.8 1.4e-27 CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 400) 257 68.7 9.7e-12 CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 360) 246 66.1 5.2e-11 CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 406) 246 66.1 5.8e-11 >>CCDS6176.1 CLVS1 gene_id:157807|Hs108|chr8 (354 aa) initn: 2378 init1: 2378 opt: 2378 Z-score: 2996.7 bits: 563.0 E(32554): 1.3e-160 Smith-Waterman score: 2378; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGPVSLLPKYQKLNTWNGDLAKMTHLQAGLSPETIEKARLELNENPDVLHQDIQQVRDMI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 MGPVSLLPKYQKLNTWNGDLAKMTHLQAGLSPETIEKARLELNENPDVLHQDIQQVRDMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 ITRPDIGFLRTDDAFILRFLRARKFHQADAFRLLAQYFQYRQLNLDMFKNFKADDPGIKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 ITRPDIGFLRTDDAFILRFLRARKFHQADAFRLLAQYFQYRQLNLDMFKNFKADDPGIKR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ALIDGFPGVLENRDHYGRKILLLFAANWDQSRNSFTDILRAILLSLEVLIEDPELQINGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 ALIDGFPGVLENRDHYGRKILLLFAANWDQSRNSFTDILRAILLSLEVLIEDPELQINGF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 ILIIDWSNFSFKQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVHFVNQPWYIHALYTLIKPFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 ILIIDWSNFSFKQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVHFVNQPWYIHALYTLIKPFL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 KDKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDMGTWARTLLGPDYSDENDYTH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 KDKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDMGTWARTLLGPDYSDENDYTH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 TSYNAMHVKHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEEKGENENTQPLLALD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 TSYNAMHVKHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEEKGENENTQPLLALD 310 320 330 340 350 >>CCDS34525.1 CLVS2 gene_id:134829|Hs108|chr6 (327 aa) initn: 1649 init1: 1649 opt: 1789 Z-score: 2255.3 bits: 425.7 E(32554): 2.7e-119 Smith-Waterman score: 1789; 79.8% identity (92.5% similar) in 332 aa overlap (23-354:1-327) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGPVSLLPKYQKLNTWNGDLAKMTHLQAGLSPETIEKARLELNENPDVLHQDIQQVRDMI ::::::::::::.::::::::::::.::::::.::::. 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CCDS34 KEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNV 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KE6 TSYNAMHVKHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEEKGENENTQPLLALD ::. : ::. .:.: ::: ::::::::. .::. .:.:.:: ::::.:: CCDS34 DSYS-MPVKE----VEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD 280 290 300 310 320 >>CCDS32324.1 RLBP1 gene_id:6017|Hs108|chr15 (317 aa) initn: 704 init1: 569 opt: 689 Z-score: 870.0 bits: 169.3 E(32554): 3.9e-42 Smith-Waterman score: 689; 39.2% identity (71.6% similar) in 278 aa overlap (30-296:40-314) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MGPVSLLPKYQKLNTWNGDLAKMTHLQAGLSPETIEKARLELNENPDVLHQDIQQVRDM : .:..::. :::: .. .. ......: CCDS32 MVPEEEQELRAQLEQLTTKDHGPVFGPCSQLPRHTLQKAKDELNEREETREEAVRELQEM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE6 IITRPDIG----------FLRTDDAFILRFLRARKFHQADAFRLLAQYFQYRQLNLDMFK . .. : . :..:.:::.:::::. . :..:: : ..: ..: CCDS32 VQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGFFLRFIRARKFNVGRAYELLRGYVNFRLQYPELFD 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 NFKADDPGIKRALID-GFPGVLENRDHYGRKILLLFAANWDQSRNSFTDILRAILLSLEV ... : : :. :.:::: .::.::: ..:. ::.... .: .::.: . :: CCDS32 SLS---PEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAYCFILEK 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 LIEDPELQINGFILIIDWSNFSFKQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVHFVNQPWY :.:. : ::::: .: ....:...::..: : :. .. ::::::::: ..::..:::: CCDS32 LLENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHFIHQPWY 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 IHALYTLIKPFLKDKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDMGTWARTLL . . :...:::::.: .:.:.::..:....: : ..:::.:::::: :: . :. :. 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CCDS13 V--RKEYPNLSTSLDDAFLLRFLRARKFDYDRALQLLVNYHSCRRSWPEVFNNLKPS--A 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 IKRALIDGFPGVLENRDHYGRKILLLFAANWDQSRNSFTDILRAILLSLEVLIEDPELQI .: .: .:: :: . : : ... . : : .:. .::: :.:: ::.. : :. CCDS13 LKDVLASGFLTVLPHTDPRGCHVVCIRPDRWIPSNYPITENIRAIYLTLEKLIQSEETQV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 NGFILIIDWSNFSFKQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVHFVNQPWYIHALYTLIK ::.... :... :...::.. : : : .: :::.:: :. .:: ::.: .......:: CCDS13 NGIVILADYKGVSLSKASHFGPFIAKKVIGILQDGFPIRIKAVHVVNEPRIFKGIFAIIK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 PFLKDKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDMGTWARTLLGPDYSDEND ::::.: .:.::::..::::: . .::.:.::: : .:: .:: ..:.: CCDS13 PFLKEKIANRFFLHGSDLNSLHTNLPRSILPKEYGGTAGELDTATWNAVLL----ASEDD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 YTHTSYNAMHVKHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEEKGENENTQPLLALD . CCDS13 FVKEFCQPVPACDSILGQTLLPEGLTSDAQCDDSLRAVKSQLYSCY 300 310 320 330 340 >>CCDS6178.1 TTPA gene_id:7274|Hs108|chr8 (278 aa) initn: 491 init1: 399 opt: 481 Z-score: 608.8 bits: 120.8 E(32554): 1.4e-27 Smith-Waterman score: 481; 38.4% identity (69.0% similar) in 203 aa overlap (73-273:49-247) 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 NENPDVLHQDIQQVRDMIITRPDIGFLRTDDAFILRFLRARKFHQADAFRLLAQYFQYRQ :.:.::::::: : :.::: .:...: CCDS61 DHSPLLQPGLAALRRRAREAGVPLAPLPLTDSFLLRFLRARDFDLDLAWRLLKNYYKWRA 20 30 40 50 60 70 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 LNLDMFKNFKADDP-GIKRALIDGFPGVLENRDHYGRKILLLFAANWDQSRNSFTDILRA .. ... . :. .: :. :::..:: : :.:. :.:: . . :..:. CCDS61 ECPEISADLHPRSIIGLLKA---GYHGVLRSRDPTGSKVLIYRIAHWDPKVFTAYDVFRV 80 90 100 110 120 130 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 ILLSLEVLIEDPELQINGFILIIDWSNFSFKQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVH :.. :..... : : ::. :.: ...:..: ..:::. : : :::: . :.: CCDS61 SLITSELIVQEVETQRNGIKAIFDLEGWQFSHAFQITPSVAKKIAAVLTDSFPLKVRGIH 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 FVNQPWYIHALYTLIKPFLKDKTRKRIFLHGNNLN-SLHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDM ..:.: .::....::::: .: ..:: .:::: . :: : . :..:: :.:: CCDS61 LINEPVIFHAVFSMIKPFLTEKIKERIHMHGNNYKQSLLQHF-PDILPLEYGGEEFSMED 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 GTWARTLLGPDYSDENDYTHTSYNAMHVKHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEE CCDS61 ICQEWTNFIMKSEDYLSSISESIQ 260 270 >>CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (400 aa) initn: 180 init1: 101 opt: 257 Z-score: 324.3 bits: 68.7 E(32554): 9.7e-12 Smith-Waterman score: 262; 26.9% identity (59.7% similar) in 238 aa overlap (54-279:21-249) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 THLQAGLSPETIEKARLELNENPDVLHQDIQQVRDMIITRPDIGFLRTDDAFILRFLRAR ..:.:.. . :. :: :.::.:::: CCDS13 MSGRVGDLSPKQAETLAKFRENVQDVLPALPN-----PDDYFLLRWLRAR 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 KFHQADAFRLLAQYFQYRQLNLDMFKNFKADDPGIKRALIDGFPGVLENRDHYGRKILLL .: . :: .:...:. ..:. . . . : . . . :: : . :. : . 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CCDS54 NFDLQKSEDMLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQP--PEVIQ-LYDS--GGLCGYDYEGCPVYF 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 pF1KE6 LFAANWDQS----RNSFTDILRAILLSLEVLIEDPELQ-------INGFILIIDWSNFSF . .. : . : :..: . :.:... ::: :. ....: ..:. CCDS54 NIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSL 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 KQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVHFVNQPWYIHALYTLIKPFLKDKTRKRIFLH :. : . . . . :. ..: . .. . : . . ..:.: :....::..: . CCDS54 KHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVIL 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 pF1KE6 GNNLNS-LHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDMGTWARTLLGPDYSDE--NDYTHTSYNAMHV :.: .. : ..: :. :: :::::. : :. . : .:. : ..: .. CCDS54 GDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPD-GN-PKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQY 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KE6 KHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEEKGENENTQPLLALD .:: : CCDS54 EHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKMGEQQSAREMTEVLP 280 290 300 310 320 330 >>CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (406 aa) initn: 157 init1: 87 opt: 246 Z-score: 310.3 bits: 66.1 E(32554): 5.8e-11 Smith-Waterman score: 249; 24.7% identity (57.1% similar) in 275 aa overlap (54-313:21-283) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 THLQAGLSPETIEKARLELNENPDVLHQDIQQVRDMIITRPDIGFLRTDDAFILRFLRAR ....:.. :. .:: :.::.:::: CCDS13 MSSRVGDLSPQQQEALARFRENLQDLLPILPN-----ADDYFLLRWLRAR 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 KFHQADAFRLLAQYFQYR-QLNLDMFKNFKADDPGIKRALIDGFPGVLENRDHYGRKILL .: . .: .....: : .:: . ... : . . : :. : : . :. : . . CCDS13 NFDLQKSEDMLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQP--PEVIQ-LYDS--GGLCGYDYEGCPVYF 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 pF1KE6 LFAANWDQS----RNSFTDILRAILLSLEVLIEDPELQ-------INGFILIIDWSNFSF . .. : . : :..: . :.:... ::: :. ....: ..:. CCDS13 NIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSL 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 KQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVHFVNQPWYIHALYTLIKPFLKDKTRKRIFLH :. : . . . . :. ..: . .. . : . . ..:.: :....::..: . CCDS13 KHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVIL 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 pF1KE6 GNNLNS-LHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDMGTWARTLLGPDYSDE--NDYTHTSYNAMHV :.: .. : ..: :. :: :::::. : :. . : .:. : ..: .. CCDS13 GDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPD-GN-PKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQY 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 pF1KE6 KHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEEKGENENTQPLLALD .:: : CCDS13 EHTRSVGRGSSLQVENEILFPGCVLRWQFASDGGDIGFGVFLKTKMGEQQSAREMTEVLP 280 290 300 310 320 330 354 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:29:36 2016 done: Tue Nov 8 12:29:36 2016 Total Scan time: 1.900 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]