FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4441, 458 aa 1>>>pF1KE4441 458 - 458 aa - 458 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7460+/-0.00044; mu= 21.2155+/- 0.027 mean_var=70.4847+/-14.492, 0's: 0 Z-trim(110.2): 170 B-trim: 137 in 1/51 Lambda= 0.152766 statistics sampled from 18307 (18486) to 18307 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16 Scan time: 6.390 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 3044 680.5 2.5e-195 XP_011542692 (OMIM: 118508) PREDICTED: neuronal ac ( 329) 2166 486.9 3.5e-137 NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 1809 408.3 2.2e-113 XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1423 323.3 9.7e-88 XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1423 323.3 9.7e-88 NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 1423 323.3 9.7e-88 NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 1399 318.1 4.3e-86 NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 1303 296.8 8.5e-80 NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 1291 294.2 5.3e-79 NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 1291 294.2 5.4e-79 XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 1275 290.6 5.8e-78 NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 1265 288.4 2.7e-77 NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 1254 286.1 1.6e-76 XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 1205 275.2 2.5e-73 XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 1192 272.4 2.1e-72 XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 1190 271.9 2.5e-72 XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 1190 271.9 2.5e-72 XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 1190 271.9 2.5e-72 NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 1190 271.9 2.7e-72 XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1189 271.7 3.1e-72 XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1189 271.7 3.1e-72 XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1179 269.5 1.4e-71 XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1179 269.5 1.4e-71 NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 1157 264.7 4.2e-70 NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 1132 259.1 1.8e-68 NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 1106 253.4 9.8e-67 XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489) 1106 253.4 9.9e-67 XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1094 250.7 5.6e-66 XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1094 250.7 5.6e-66 XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245) 1057 242.3 1.1e-63 XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243) 1044 239.5 7.7e-63 NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 967 222.7 1.6e-57 XP_011526826 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 556) 957 220.6 8.3e-57 NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 949 218.8 2.6e-56 NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 949 218.8 2.7e-56 XP_005273454 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 917 211.6 2.8e-54 XP_016868492 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 917 211.6 2.8e-54 NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 884 204.5 5.2e-52 XP_011519478 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 486) 863 199.9 1.3e-50 XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 853 197.6 5e-50 XP_016883114 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 451) 740 172.7 1.8e-42 NP_001243502 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ( 451) 740 172.7 1.8e-42 NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 734 171.4 4.7e-42 NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 726 169.6 1.5e-41 XP_016868493 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 721 168.4 2.6e-41 XP_011542691 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 721 168.4 2.6e-41 XP_016855669 (OMIM: 118507,605375) PREDICTED: neur ( 332) 653 153.4 8.5e-37 XP_011519479 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 401) 642 151.1 5.2e-36 NP_647536 (OMIM: 609756) CHRNA7-FAM7A fusion prote ( 412) 640 150.6 7.2e-36 XP_011520455 (OMIM: 609756) PREDICTED: CHRNA7-FAM7 ( 412) 640 150.6 7.2e-36 >>NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine recept (458 aa) initn: 3044 init1: 3044 opt: 3044 Z-score: 3627.8 bits: 680.5 E(85289): 2.5e-195 Smith-Waterman score: 3044; 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100.0% identity (100.0% similar) in 329 aa overlap (130-458:1-329) 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 IHSIKVPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTF :::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTF 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 FPFDRQNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FPFDRQNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 YPFITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 YPFITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFL 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 LVIEEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LVIEEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLF 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 LQKLPKLLCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LQKLPKLLCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSI 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 RYISRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 RYISRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH 280 290 300 310 320 >>NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcholine (468 aa) initn: 2051 init1: 1221 opt: 1809 Z-score: 2156.6 bits: 408.3 E(85289): 2.2e-113 Smith-Waterman score: 2029; 67.6% identity (84.7% similar) in 444 aa overlap (13-453:28-454) 10 20 30 40 pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFN---SIAENEDALLRHLFQGYQK : ..: :.. :::..::.::. ::: :.. NP_000 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 WVRPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHS ::::: : :: ::. ::: :::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::. NP_000 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 IKVPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPF :.:::.:.: ::::::.::::::::. ::.... ::::.:::::.::::::.::::::: NP_000 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGT-STKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPF 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 DRQNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYSYPF : ::::::::::::::..::.:: ...::..::::::::::..: : :::: :. ::. NP_000 DLQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPY 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI .:::::..::::::::::::::.::::::::::::::.::::. : :::::::::::::: NP_000 VTYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK ::::::::::::::::::.: ::::::::.::::.::.:::::::.. ::: :...::. NP_000 EEIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 LPKLLCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYI :::::::..::::: . .:::.. ..: : :: : :::::: NP_000 LPKLLCMRSHVDRYFT-QKEETES---------------GSGPKSSRNTLEAALDSIRYI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 SRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH .::. ::. . .::.::::.::::::.::: ::.::..::. .:.:.. : NP_000 TRHIMKENDVREVVEDWKFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHI 410 420 430 440 450 460 NP_000 GNANK >>XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neuronal (529 aa) initn: 1579 init1: 860 opt: 1423 Z-score: 1696.2 bits: 323.3 E(85289): 9.7e-88 Smith-Waterman score: 1558; 52.4% identity (74.0% similar) in 477 aa overlap (15-446:46-520) 10 20 30 40 pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWV :.. : .: .:.:: :..:::.::..:. XP_011 LWWLLLTPAGGEEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQG-GSHTETEDRLFKHLFRGYNRWA 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 RPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIK ::: ...:.. : :::.:.::.:::::::.:::::::::::.:.:::::: :.:.: :.. XP_011 RPVPNTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLR 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDR :::: .:.:::::..::::.: . :::. . :.::: :.::: :::::..::::::::. XP_011 VPSEMIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQ 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 QNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPF :::.::::::::: . .:: ....:: ::....::: :.:: : .... . :: XP_011 QNCKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPD 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI .::.::.::::::::. :::::: .: ::::::::::: :::..: :::.:::::::.: XP_011 VTYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLI 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK :::::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::::: :: : : ::. .: XP_011 TEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPST-HTMPHWVRGALLGC 320 330 340 350 360 370 350 360 370 pF1KE4 LPKLLCMKD--------HVDRYS-SP---------EKEESQPVVK--------GKVLEK- .:. : :. : : . :: . :: . ::. :.: . XP_011 VPRWLLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSV 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 pF1KE4 ----------------KKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDW : . :..:: .: ..:: ....::. :...: :.: .:: XP_011 GTLCSHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDW 440 450 460 470 480 490 420 430 440 450 pF1KE4 KFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH :.::.:.::::::::.:: :.. .: XP_011 KYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI 500 510 520 >>XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neuronal (529 aa) initn: 1579 init1: 860 opt: 1423 Z-score: 1696.2 bits: 323.3 E(85289): 9.7e-88 Smith-Waterman score: 1558; 52.4% identity (74.0% similar) in 477 aa overlap (15-446:46-520) 10 20 30 40 pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWV :.. : .: .:.:: :..:::.::..:. XP_006 LWWLLLTPAGGEEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQG-GSHTETEDRLFKHLFRGYNRWA 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 RPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIK ::: ...:.. : :::.:.::.:::::::.:::::::::::.:.:::::: :.:.: :.. XP_006 RPVPNTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLR 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDR :::: .:.:::::..::::.: . :::. . :.::: :.::: :::::..::::::::. XP_006 VPSEMIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQ 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 QNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPF :::.::::::::: . .:: ....:: ::....::: :.:: : .... . :: XP_006 QNCKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPD 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI .::.::.::::::::. :::::: .: ::::::::::: :::..: :::.:::::::.: XP_006 VTYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLI 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK :::::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::::: :: : : ::. .: XP_006 TEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPST-HTMPHWVRGALLGC 320 330 340 350 360 370 350 360 370 pF1KE4 LPKLLCMKD--------HVDRYS-SP---------EKEESQPVVK--------GKVLEK- .:. : :. : : . :: . :: . ::. :.: . XP_006 VPRWLLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSV 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 pF1KE4 ----------------KKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDW : . :..:: .: ..:: ....::. :...: :.: .:: XP_006 GTLCSHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDW 440 450 460 470 480 490 420 430 440 450 pF1KE4 KFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH :.::.:.::::::::.:: :.. .: XP_006 KYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI 500 510 520 >>NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcholine (529 aa) initn: 1579 init1: 860 opt: 1423 Z-score: 1696.2 bits: 323.3 E(85289): 9.7e-88 Smith-Waterman score: 1558; 52.4% identity (74.0% similar) in 477 aa overlap (15-446:46-520) 10 20 30 40 pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWV :.. : .: .:.:: :..:::.::..:. NP_000 LWWLLLTPAGGEEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQG-GSHTETEDRLFKHLFRGYNRWA 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 RPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIK ::: ...:.. : :::.:.::.:::::::.:::::::::::.:.:::::: :.:.: :.. NP_000 RPVPNTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLR 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDR :::: .:.:::::..::::.: . :::. . :.::: :.::: :::::..::::::::. NP_000 VPSEMIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQ 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 QNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPF :::.::::::::: . .:: ....:: ::....::: :.:: : .... . :: NP_000 QNCKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPD 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI .::.::.::::::::. :::::: .: ::::::::::: :::..: :::.:::::::.: NP_000 VTYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLI 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK :::::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::::: :: : : ::. .: NP_000 TEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPST-HTMPHWVRGALLGC 320 330 340 350 360 370 350 360 370 pF1KE4 LPKLLCMKD--------HVDRYS-SP---------EKEESQPVVK--------GKVLEK- .:. : :. : : . :: . :: . ::. :.: . NP_000 VPRWLLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSV 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 pF1KE4 ----------------KKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDW : . :..:: .: ..:: ....::. :...: :.: .:: NP_000 GTLCSHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDW 440 450 460 470 480 490 420 430 440 450 pF1KE4 KFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH :.::.:.::::::::.:: :.. .: NP_000 KYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI 500 510 520 >>NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal acetyl (627 aa) initn: 1472 init1: 801 opt: 1399 Z-score: 1666.6 bits: 318.1 E(85289): 4.3e-86 Smith-Waterman score: 1399; 59.7% identity (81.0% similar) in 352 aa overlap (1-350:11-359) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVLHS .:: .:.:. :. :.. .. :. :. ::..::.::.:: ::: . NP_000 MELGGPGAPRLLPP-LLLLLGTGL-LRASSHVETRAHAEERLLKKLFSGYNKWSRPVANI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 NDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSESL .:.. : :::.:.::.:::::::.::::::.:::: :.::::.: :: .. ::..::: . NP_000 SDVVLVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWVKQEWHDYKLRWDPADYENVTSIRIPSELI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 WLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCSMK : :::::..:::: : . .::. . .: : ::::: :::::..::::::::.:::.:: NP_000 WRPDIVLYNNADGDFAVTHLTKAHLFHDGRVQWTPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCTMK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 FGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPFITYSFV ::::::: . .::. .. ::. ::...::: :..: : ..:. . :: :::.:: NP_000 FGSWTYDKAKIDLVNMHSRVDQLDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIYPDITYAFV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 LRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEIIPS .::::::::. :::::: .: ::::::::::. :::..: :::.:::::::.: ::::: NP_000 IRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSECGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 SSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKLLC .: ::::::::::: ::::::::..::::.:::::: : : : ::.:.::. .:.:: NP_000 TSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRT-HTMPTWVRRVFLDIVPRLLL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 MKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKK :: NP_000 MKRPSVVKDNCRRLIESMHKMASAPRFWPEPEGEPPATSGTQSLHPPSPSFCVPLDVPAE 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 210 init1: 178 opt: 200 Z-score: 238.5 bits: 53.8 E(85289): 1.5e-06 Smith-Waterman score: 200; 46.0% identity (74.6% similar) in 63 aa overlap (392-454:564-623) 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 EESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDWKF : .:.....::. :.: : .: .:::. NP_000 KKEPSSVSPSATVKTRSTKAPPPHLPLSPALTRAVEGVQYIADHLKAEDTDFSVKEDWKY 540 550 560 570 580 590 430 440 450 pF1KE4 VAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH ::.:.::::::.:.:: . :.: .: : :: NP_000 VAMVIDRIFLWMFIIVCLLGTVGLFLPP---WLAGMI 600 610 620 >>NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine recept (494 aa) initn: 1431 init1: 735 opt: 1303 Z-score: 1553.6 bits: 296.8 E(85289): 8.5e-80 Smith-Waterman score: 1403; 47.6% identity (75.0% similar) in 456 aa overlap (29-450:34-487) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVLHSNDTIKVYF :. :...::. :....::: . .: . :.: NP_004 SKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVTVHF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 GLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSESLWLPDIVLF . :.::..::: ::.: ::.::.. :.:.::::.: .: ::....::....: :::::. NP_004 EVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDIVLY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 ENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCSMKFGSWTYDG .:: : :. ::...: :: ..::::: .:::: ::.::::::.::::.:::::::: NP_004 NNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYDK 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPFITYSFVLRRLPLFY . .::..:. .:: .::..:.::::..:.:.: . . . : ::::: .::::.:: NP_004 AEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLPMFY 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 TLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEIIPSSSKVIPLI :. :::::: .::::::::::::: :::..: :::.::::::::: : :::.: :.::. NP_004 TINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPLV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 GEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKLLCMKDHVDRY :::::: ::::::::.:::::.:.:.:. .: : : ::: .::. ::..: :. .:. NP_004 GEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTT-HTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLDKT 310 320 330 340 350 360 360 370 380 pF1KE4 SS------PEKEESQPVVKGKV------------LEKKKQKQLSDGEKVLV--------- . :. .:. :::. .. .:...:. ... : NP_004 RGTGSDAVPRGLARRPA-KGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVVE 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 -----AFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVL .: . .:...:....:... ..: .:::.::.:.::.:::.:.:: : :.. NP_004 NSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAG 430 440 450 460 470 480 450 pF1KE4 IFTPALKMWLHSYH .: : NP_004 LFLQPLLGNTGKS 490 >>NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylchol (489 aa) initn: 1300 init1: 722 opt: 1291 Z-score: 1539.4 bits: 294.2 E(85289): 5.3e-79 Smith-Waterman score: 1291; 53.0% identity (77.9% similar) in 366 aa overlap (3-366:15-369) 10 20 30 40 pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVL : ..:.:.. .: . .. : : :...::. :.. .::: NP_001 MGSGPLSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVARAS------EAEHRLFERLFEDYNEIIRPVA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 HSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSE . .: . ..: ...:::: ::: ::.: ::.:::: :.:.::.:::.:::: . ..::.. NP_001 NVSDPVIIHFEVSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPSDYGGAEFMRVPAQ 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 SLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCS ..: :::::..:: : :. . ::...: .: :.: ::: .:::: .:::.:::: :::. NP_001 KIWKPDIVLYNNAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKIDVTYFPFDYQNCT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 MKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPFITYS ::::::.:: . .::.::. ... ::....::: :..: :.: . . . :: :::: NP_001 MKFGSWSYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEEIYPDITYS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 FVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEII . .::::::::. :::::: .::::::::::::: :::..: :::.::::::::: : : NP_001 LYIRRLPLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 PSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKL ::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::.:. .: : : ::: .::. ::.. NP_001 PSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTT-HTMPSWVKTVFLNLLPRV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 LCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHV . : : .: : . ..: NP_001 MFMT----RPTSNEGNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKGCKEGYPCQDGMCGYCHHRR 360 370 380 390 400 >>NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcholine (505 aa) initn: 1442 init1: 722 opt: 1291 Z-score: 1539.2 bits: 294.2 E(85289): 5.4e-79 Smith-Waterman score: 1380; 45.3% identity (71.7% similar) in 488 aa overlap (3-446:15-495) 10 20 30 40 pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVL : ..:.:.. .: . .. : : :...::. :.. .::: NP_000 MGSGPLSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVARAS------EAEHRLFERLFEDYNEIIRPVA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 HSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSE . .: . ..: ...:::: ::: ::.: ::.:::: :.:.::.:::.:::: . ..::.. NP_000 NVSDPVIIHFEVSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPSDYGGAEFMRVPAQ 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 SLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCS ..: :::::..:: : :. . ::...: .: :.: ::: .:::: .:::.:::: :::. NP_000 KIWKPDIVLYNNAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKIDVTYFPFDYQNCT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 MKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPFITYS ::::::.:: . .::.::. ... ::....::: :..: :.: . . . :: :::: NP_000 MKFGSWSYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEEIYPDITYS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 FVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEII . .::::::::. :::::: .::::::::::::: :::..: :::.::::::::: : : NP_000 LYIRRLPLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 PSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKL ::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::.:. .: : : ::: .::. ::.. NP_000 PSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTT-HTMPSWVKTVFLNLLPRV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 pF1KE4 LCMK--------------------DHVDRYSSPEKE---ESQPVVKG----------KV- . : .... .: :.. :. : : :. NP_000 MFMTRPTSNEGNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKGCKEGYPCQDGMCGYCHHRRIKIS 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 pF1KE4 -----LEKKKQKQLSDGEKVLVAF---LEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQ : ...... :. : :. ...: .:..::....: .. ... .:::.::. NP_000 NFSANLTRSSSSESVDAVLSLSALSPEIKEAIQSVKYIAENMKAQNEAKEIQDDWKYVAM 420 430 440 450 460 470 430 440 450 pF1KE4 VLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH :.::::::.: .: . :.. .: NP_000 VIDRIFLWVFTLVCILGTAGLFLQPLMAREDA 480 490 500 458 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 00:37:21 2016 done: Sun Nov 6 00:37:22 2016 Total Scan time: 6.390 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]