FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6462, 494 aa 1>>>pF1KE6462 494 - 494 aa - 494 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8449+/-0.000436; mu= 20.5726+/- 0.027 mean_var=71.5525+/-15.182, 0's: 0 Z-trim(109.1): 54 B-trim: 21 in 1/50 Lambda= 0.151622 statistics sampled from 17195 (17237) to 17195 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16 Scan time: 6.680 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016883871 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 507) 531 126.1 2.3e-28 NP_061837 (OMIM: 608094) glucose-6-phosphate excha ( 533) 531 126.1 2.4e-28 XP_016883869 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 531 126.1 2.4e-28 XP_016883866 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 531 126.1 2.4e-28 XP_016883868 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 531 126.1 2.4e-28 XP_016883867 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 531 126.1 2.4e-28 NP_001307466 (OMIM: 608094) glucose-6-phosphate ex ( 533) 531 126.1 2.4e-28 XP_011527917 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 564) 531 126.2 2.5e-28 XP_011527916 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 577) 513 122.2 3.9e-27 XP_016883870 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 508) 510 121.5 5.6e-27 XP_016883865 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 539) 510 121.6 5.8e-27 XP_016883872 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 395) 433 104.6 5.4e-22 NP_001157749 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose- ( 429) 217 57.4 9.7e-08 NP_001157752 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose- ( 429) 217 57.4 9.7e-08 NP_001458 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose-6-p ( 429) 217 57.4 9.7e-08 NP_001157750 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose- ( 451) 217 57.4 1e-07 NP_001157751 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose- ( 356) 162 45.3 0.00035 NP_001315604 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 149 42.7 0.0043 NP_055664 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycopro ( 742) 149 42.7 0.0043 NP_001315603 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 149 42.7 0.0043 XP_016865725 (OMIM: 613361) PREDICTED: MFS-type tr ( 409) 141 40.7 0.0094 >>XP_016883871 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (507 aa) initn: 864 init1: 287 opt: 531 Z-score: 630.2 bits: 126.1 E(85289): 2.3e-28 Smith-Waterman score: 901; 37.2% identity (67.3% similar) in 422 aa overlap (83-480:72-491) 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 TPSAFNTSVELPVEIWSSNHLFPSAEKATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIVGDRLNLR .::.:: :: .::::...:::.:.:: .: XP_016 RKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGIIGERLPIR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 WVLSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAVMGNWFGK . :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.:.:::: ::. .:::::: XP_016 YYLTFGMLASGAFTALFG-LGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTCLGNWFGK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 AGRGVVFGLWSACASVGNILGACLASSVLQYGYEYAFLVTASVQFAGGIVIFFGLLVSPE . ::...:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: ... : ::: :. :. :. 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XP_016 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ 480 490 500 510 520 530 >>XP_016883867 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (533 aa) initn: 926 init1: 287 opt: 531 Z-score: 629.9 bits: 126.1 E(85289): 2.4e-28 Smith-Waterman score: 938; 34.8% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (19-480:20-517) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA ... .:.:::. :. .: ::: .: :: . . : . XP_016 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEAD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE6 FNTSVELPVEIWSSNHLFPSAE-----------KATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIV : . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::. XP_016 VRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGII 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 GDRLNLRWVLSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAV :.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.:.:::: ::. XP_016 GERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFG-LGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 MGNWFGKAGRGVVFGLWSACASVGNILGACLASSVLQYGYEYAFLVTASVQFAGGIVIFF .::::::. ::...:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: ... : ::: :. 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XP_016 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ 480 490 500 510 520 530 >>NP_001307466 (OMIM: 608094) glucose-6-phosphate exchan (533 aa) initn: 926 init1: 287 opt: 531 Z-score: 629.9 bits: 126.1 E(85289): 2.4e-28 Smith-Waterman score: 938; 34.8% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (19-480:20-517) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA ... .:.:::. :. .: ::: .: :: . . : . NP_001 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEAD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE6 FNTSVELPVEIWSSNHLFPSAE-----------KATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIV : . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::. NP_001 VRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGII 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 GDRLNLRWVLSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAV :.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.:.:::: ::. 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NP_001 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ 480 490 500 510 520 530 >>XP_011527917 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (564 aa) initn: 926 init1: 287 opt: 531 Z-score: 629.6 bits: 126.2 E(85289): 2.5e-28 Smith-Waterman score: 938; 34.8% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (19-480:51-548) 10 20 30 40 pF1KE6 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSI ... .:.:::. :. .: ::: .: :: . XP_011 GEVPGGWSPGEGTAAPSSLPHTSPCASLHLYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGEL 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 pF1KE6 SEQ---WTPSAFNTSVELPVEIWSSNHLFPSAE-----------KATLFLGTLDTIFLFS . : . : . .. : .:. : . .::.:: :: . XP_011 HKYCTAWDEADVRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCA 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 YAVGLFISGIVGDRLNLRWVLSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLL ::::...:::.:.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::. 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XP_011 IVAAMGIVCFLFLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDPEMQ 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 pF1KE6 ---------SIQDDSSV-------AQVKAISFYQACCLPGVIPYSLAYACLKLVNYSFFF ::. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.: XP_011 CLLLSDGKGSIHPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLF 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 WLPFYLSNNFGWKEAEADKLSIWYDVGGIIGGTLQGFISDVLQKRAPVLALSLLLAVGSL :::.:..: .: .:: .:::::.:: : : ::: :.::: . .: ::::. .: XP_011 WLPLYITNVDHLDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTL 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 IGYSR-SPNDKSINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIV .: : . .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:. XP_011 YIFSTVSKMGLEATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAII 440 450 460 470 480 490 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 DGSGSIGAAVGQYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVREIFSLVLRRQAH ::.::.:::.: :..:. . :: :::.... .:...:. :: .:. 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XP_011 IVAAMGIVCFLFLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDPEMQ 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 pF1KE6 ---------SIQDDSSV-------AQVKAISFYQACCLPGVIPYSLAYACLKLVNYSFFF ::. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.: XP_011 CLLLSDGKGSIHPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLF 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 WLPFYLSNNFGWKEAEADKLSIWYDVGGIIGGTLQGFISDVLQKRAPVLALSLLLAVGSL :::.:..: .: .:: .:::::.:: : : ::: :.::: . .: ::::. .: XP_011 WLPLYITNVDHLDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTL 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 IGYSR-SPNDKSINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIV .: : . .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:. XP_011 YIFSTVSKMGLEATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAII 440 450 460 470 480 490 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 DGSGSIGAAVGQYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVREIFSLVLRRQAH ::.::.:::.: :..:. . :: :::.... .:... : : XP_011 DGTGSVGAALGPLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLEILKLNFPTTYKIKYRLSTY 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 ILRE XP_011 ELTRFKWLFFGSSVGSFNA 560 570 >>XP_016883870 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (508 aa) initn: 918 init1: 279 opt: 510 Z-score: 605.4 bits: 121.5 E(85289): 5.6e-27 Smith-Waterman score: 917; 34.7% identity (63.7% similar) in 490 aa overlap (19-470:20-507) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA ... .:.:::. :. .: ::: .: :: . . : . XP_016 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEAD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE6 FNTSVELPVEIWSSNHLFPSAE-----------KATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIV : . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::. XP_016 VRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGII 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 GDRLNLRWVLSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAV :.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.:.:::: ::. XP_016 GERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFG-LGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 MGNWFGKAGRGVVFGLWSACASVGNILGACLASSVLQYGYEYAFLVTASVQFAGGIVIFF .::::::. ::...:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: ... : ::: :. XP_016 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 pF1KE6 GLLVSPEEIGLSG--IEAEENFEEDSHR----PLINGGENEDEYEPNY----------SI :. :... :. . ...:. ..: : .:.. .:.. :: XP_016 FLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDPEMQCLLLSDGKGSI 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 QDDSSV-------AQVKAISFYQACCLPGVIPYSLAYACLKLVNYSFFFWLPFYLSNNFG . . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.::::.:..: XP_016 HPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVDH 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 WKEAEADKLSIWYDVGGIIGGTLQGFISDVLQKRAPVLALSLLLAVGSLIGYSR-SPNDK .: .:: .:::::.:: : : ::: :.::: . .: ::::. .: .: : XP_016 LDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYIFSTVSKMGL 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 SINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVG . .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:.::.::.:::.: XP_016 EATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAALG 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 pF1KE6 QYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVREIFSLVLRRQAHILRE :..:. . :: :::.... .:... XP_016 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLI 480 490 500 494 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 13:31:50 2016 done: Tue Nov 8 13:31:51 2016 Total Scan time: 6.680 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]