FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6763, 840 aa 1>>>pF1KE6763 840 - 840 aa - 840 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8917+/-0.00119; mu= 17.8895+/- 0.071 mean_var=77.9110+/-15.416, 0's: 0 Z-trim(103.1): 27 B-trim: 45 in 2/47 Lambda= 0.145303 statistics sampled from 7256 (7266) to 7256 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 3.090 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 ( 840) 5577 1179.5 0 CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 831) 3536 751.6 1.3e-216 CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 837) 3535 751.4 1.5e-216 CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 838) 3534 751.2 1.7e-216 CCDS8177.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 830) 2571 549.3 9.9e-156 CCDS9254.1 ATP6V0A2 gene_id:23545|Hs108|chr12 ( 856) 2248 481.6 2.5e-135 CCDS53670.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 614) 2069 444.0 3.7e-124 >>CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 (840 aa) initn: 5577 init1: 5577 opt: 5577 Z-score: 6314.8 bits: 1179.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5577; 99.9% identity (99.9% similar) in 840 aa overlap (1-840:1-840) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILRFLEDEMQNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LERILRFLEDEMQNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 FLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 FLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINRE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 RMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKICD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 RMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKICD 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 GFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKVQ ::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 GFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKVQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 KMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 KMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQSK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 TAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVMLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 TAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVMLL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 AALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 AALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 WSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 WSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSYK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 MKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWCC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWCC 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE6 FDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 FDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKPF 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE6 ILRASHRKSQLQASRIQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGEEFNFGDVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 ILRASHRKSQLQASRIQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGEEFNFGDVF 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE6 VHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIVGVFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 VHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIVGVFI 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE6 IFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDGTAEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 IFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDGTAEE 790 800 810 820 830 840 >>CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (831 aa) initn: 3490 init1: 1574 opt: 3536 Z-score: 4002.6 bits: 751.6 E(32554): 1.3e-216 Smith-Waterman score: 3542; 61.6% identity (85.1% similar) in 844 aa overlap (1-840:1-831) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES : .:::::: :.::::: :::::::.:::::: :::.::: .:: ::::::::::::: CCDS11 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LERILRFLEDEMQN-EIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ ..: :::.: :... .: .. ..: .:.::.:: ::. .::.:.::.: : ::.:::. CCDS11 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINR .::::::::..:.:::.::. ..:: . :..:.::: . . .:::.:::::: CCDS11 NFLELTELKFILRKTQQFFD---EMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGVINR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 ERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKIC ::. .:::.:::.:::::.:. .:.. ::::::: . ..:..::::.::.::....:::: CCDS11 ERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKIC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 DGFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKV .::::..::::: ::.:: .::.:..:: :..:::.::::.:: :: : . :.::: CCDS11 EGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 QKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQS .::::.:: ::.:::::::.:.:::.: ::.: :. ::..: : :::.. :.. .:. CCDS11 RKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 KTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVML . .:::.:.::::: ::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: ::: .: CCDS11 NQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGILMT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 LAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGS : :.::.: : :.::::..::...: : :::.:::::.::.::::::::::::::::::: CCDS11 LFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLNIFGS 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSY ::::.::: . .:. .... . :::.::.::: ::.:::::::::::.:.::::::::. CCDS11 SWSVRPMF-TYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGV-FGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSF 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 KMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWC ::::::::::..:.::: :::::::::.. ::: . ::::.::. ::::::..:..:: CCDS11 KMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWT 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 CFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKP .:.:.:..:::.::::::::::.: .:. . ::. :. .: :.::.::. ::::::.:: CCDS11 AYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLFKP 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 FILRASH-RKSQLQASRIQEDATENIEGD--SSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGEEFNF ..:: .. :...: .: :. : ...:. .... . : .. .. ..::.: CCDS11 LVLRRQYLRRKHL--------GTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEFDF 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 GDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIV ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ::.... .: . CCDS11 GDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGL 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 GVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDG .:..:..::.::::::::::::::::::::::::::::::: : :.:: ::::.:: .: CCDS11 VLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREG 770 780 790 800 810 820 840 pF1KE6 TAEE :: CCDS11 KFEE 830 >>CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (837 aa) initn: 3537 init1: 1574 opt: 3535 Z-score: 4001.4 bits: 751.4 E(32554): 1.5e-216 Smith-Waterman score: 3537; 61.7% identity (84.2% similar) in 852 aa overlap (1-840:1-837) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES : .:::::: :.::::: :::::::.:::::: :::.::: .:: ::::::::::::: CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LERILRFLEDEMQN-EIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ ..: :::.: :... .: .. ..: .:.::.:: ::. .::.:.::.: : ::.:::. CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINR .::::::::..:.:::.::. ..:: . :..:.::: . . .:::.:::::: CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFD---EMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGVINR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 ERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKIC ::. .:::.:::.:::::.:. .:.. ::::::: . ..:..::::.::.::....:::: CCDS45 ERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKIC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 DGFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKV .::::..::::: ::.:: .::.:..:: :..:::.::::.:: :: : . :.::: CCDS45 EGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 QKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQS .::::.:: ::.:::::::.:.:::.: ::.: :. ::..: : :::.. :.. .:. CCDS45 RKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 KTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVML . .:::.:.::::: ::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: ::: .: CCDS45 NQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGILMT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 LAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGS : :.::.: : :.::::..::...: : :::.:::::.::.::::::::::::::::::: CCDS45 LFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLNIFGS 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSY ::::.::: . .:. .... . :::.::.::: ::.:::::::::::.:.::::::::. CCDS45 SWSVRPMF-TYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGV-FGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSF 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 KMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWC ::::::::::..:.::: :::::::::.. ::: . ::::.::. ::::::..:..:: CCDS45 KMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWT 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 CFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKP .:.:.:..:::.::::::::::.: .:. . ::. :. .: :.::.::. ::::::.:: CCDS45 AYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLFKP 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 FILRASH-RKSQLQAS-----RI-----QEDATENIEGDSSSPSSRSGQRTSADTHGALD ..:: .. :...: . :. .::: : :. :. : :..... : : CCDS45 LVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDA-EIIQHDQLSTHSEDADEPSED------ 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE6 DHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQ : :.:::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ::. CCDS45 ---EVFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLS 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 TRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPF ... .: . .:..:..::.::::::::::::::::::::::::::::::: : :.:: :: CCDS45 VKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPF 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE6 SFKHILDGTAEE ::.:: .: :: CCDS45 SFEHIREGKFEE 830 >>CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (838 aa) initn: 3471 init1: 1574 opt: 3534 Z-score: 4000.2 bits: 751.2 E(32554): 1.7e-216 Smith-Waterman score: 3540; 61.6% identity (84.9% similar) in 848 aa overlap (1-840:1-838) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES : .:::::: :.::::: :::::::.:::::: :::.::: .:: ::::::::::::: CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LERILRFLEDEMQN-EIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ ..: :::.: :... .: .. ..: .:.::.:: ::. .::.:.::.: : ::.:::. CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFF-ETETN---LADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAG .::::::::..:.:::.:: :.: . .:: . :..:.::: . . .:::.:: CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFDEAELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 VINRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKI ::::::. .:::.:::.:::::.:. .:.. ::::::: . ..:..::::.::.::.... CCDS45 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 KKICDGFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSW ::::.::::..::::: ::.:: .::.:..:: :..:::.::::.:: :: : . : CCDS45 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LIKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMT .:::.::::.:: ::.:::::::.:.:::.: ::.: :. ::..: : :::.. :.. CCDS45 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 TVQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHG .:.. .:::.:.::::: ::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: ::: CCDS45 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 TVMLLAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN .: : :.::.: : :.::::..::...: : :::.:::::.::.::::::::::::::: CCDS45 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 IFGSSWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTF ::::::::.::: . .:. .... . :::.::.::: ::.:::::::::::.:.::::: CCDS45 IFGSSWSVRPMF-TYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGV-FGGPYPFGIDPIWNIATNKLTF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 LNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMII :::.::::::::::..:.::: :::::::::.. ::: . ::::.::. ::::::..:. CCDS45 LNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIF 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 FKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWML .:: .:.:.:..:::.::::::::::.: .:. . ::. :. .: :.::.::. ::::: CCDS45 YKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWML 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 LIKPFILRASH-RKSQLQASRIQEDATENIEGD--SSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGE :.::..:: .. :...: .: :. : ...:. .... . : .. .. .. CCDS45 LFKPLVLRRQYLRRKHL--------GTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDAD 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 EFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGW ::.:::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ::.... CCDS45 EFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSL 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 GGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKH .: . .:..:..::.::::::::::::::::::::::::::::::: : :.:: ::::.: CCDS45 AGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEH 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE6 ILDGTAEE : .: :: CCDS45 IREGKFEE >>CCDS8177.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 (830 aa) initn: 2011 init1: 779 opt: 2571 Z-score: 2909.3 bits: 549.3 E(32554): 9.9e-156 Smith-Waterman score: 2571; 49.6% identity (73.3% similar) in 836 aa overlap (1-830:1-825) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES : :.:::::. : :::: . ::: ::..:::::::.:.::: .:..:::.:: .::::: CCDS81 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LERILRFLEDEMQNEIVVQLLEKSPL-TPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ ::. . ::..:.. .: :. : .: ::... .. :.: ::... :::::. CCDS81 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINR .. .: .:.. . : . : . . . ::. . : .. ...:.::... CCDS81 QLHQLQLHAAVLRQGH---EPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGP-HQDLRVNFVAGAVEP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 ERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKIC .. ..:::::: ::: . .: :.. ::: ::: : :.: : :::. :::.:: CCDS81 HKAPALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKIT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 DGFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKV : :. :.: .. : :.... . ..: :. .:: ...: .. ..: CCDS81 DCFHCHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 QKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRAL-EQGMELSGSSMAPIMTTVQ .:::::: ::.:....:..:.::: : : : ...:: ...:: . :..: . CCDS81 HKMKAVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAH---RIP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 SKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVM . :::. :::.:::.::.:::::::: :.:.:::::::::::::::::::: ::: .: CCDS81 CRDMPPTLIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLM 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 LLAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFG .: :: :.: : : . ..::::.:::.::::.::::.::::::.:::.:::.. .:: CCDS81 FLFALAMVLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFP 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SSWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNS :.::: : .. :. . . .: ::: . ::..: ::::::::::.::.:.:.:::: CCDS81 SGWSVAAMANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLG-PYPFGIDPIWSLAANHLSFLNS 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 YKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKW .:::::::::.:.:.:::.:..:::..: . ..:. .::. :.: :::::::..:.:: CCDS81 FKMKMSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKW 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 CCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIK : . . ::::::::::::::..: : : :: .:. ::. .::.:: :: .:: CCDS81 LCVWAARAASAPSILIHFINMFLFSHSPS-NRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGT 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 PFILRASHRKSQLQASRIQEDATENIEGDSSSP-SSRSGQRTSADTHGALDDHGE-EFNF :. : ::. .:. : . :: : . : .: .: .. . :.:::. : :. CCDS81 PLHLLHRHRR-RLR-RRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVP 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 GDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIV ..:..::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::.::: :: :.. CCDS81 SEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVA 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 GVFI--IFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHIL .: . :::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::: : :::.:::.: CCDS81 AVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATD 770 780 790 800 810 820 840 pF1KE6 DGTAEE CCDS81 D 830 >>CCDS9254.1 ATP6V0A2 gene_id:23545|Hs108|chr12 (856 aa) initn: 2906 init1: 1005 opt: 2248 Z-score: 2543.2 bits: 481.6 E(32554): 2.5e-135 Smith-Waterman score: 2892; 52.5% identity (78.7% similar) in 851 aa overlap (1-830:1-842) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES : :.:::: :::.::::: .:: :.. ::: :::::.:::.::.:::::::.::.::: CCDS92 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LERILRFLEDEM-QNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ ::::: .: .:. . .: . : :: .: .... .. :.::: ::.:...:.. :.. CCDS92 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLA---DDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGV ..::: : ..:. :. : . .... ..: . ....::. . . . .::::..:. CCDS92 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQ-RLGAKLGFVSGL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 INRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIK ::. .. .::..:::.:.: . ....:.: :::: : : :. .:.: . :::. .:.: CCDS92 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 KICDGFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWL :::: .. ::: :. : ::::. :..:.:..:: ::. .::.. ...: .:: . .: . CCDS92 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 IKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTT :.:.::::.::.::::..:::..:.:::.: : :: ..::::.: . ::... .:. CCDS92 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 VQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGT . .: .::: :::::: ::::::::::::::::.::: .::::::::::::::: ::: CCDS92 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VMLLAALWMILNERR-LLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN ::.: :: ..::: . :.:. .:: ::.:::..::::.::.:::::::::::::.: CCDS92 VMFLFALLLVLNENHPRLNQS--QEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVN 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 IFGSSWSVQPMFRNG----------TWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPI .:::.:.:. :. .. :: :.... :::::.::::. : :::.::::: CCDS92 LFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRG-PYPLGIDPI 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 WNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILC ::::.:.::::::.::::::::::..:.:::::..:::..::. .:: : :::..:.:: CCDS92 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 LFGYLVFMIIFKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVV .::::.:::..:: :....:. ::::::.::::::: : .:. :: :. :: ..: CCDS92 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSG--LYTGQEYVQRVLLV 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 pF1KE6 MALISVPWMLLIKP-FILRASHRKSQLQASR-----IQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRT .. .::: ..: :: :.: . .: . ..: :..:. :.. . .: . . :.. CCDS92 VTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEV-SLLGSQDIEEGNHQ 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KE6 SADTHGALDDHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW : : . ::::::.... :.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS92 VED--GCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KE6 TMVMNSGLQTRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYV .:.: ::.. :.. .. ..:.:::::. ::::::::::::::.::::::::::::: CCDS92 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV 780 790 800 810 820 830 820 830 840 pF1KE6 GDGYKFSPFSFKHILDGTAEE : : :: :::: CCDS92 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA 840 850 >>CCDS53670.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 (614 aa) initn: 1505 init1: 779 opt: 2069 Z-score: 2342.6 bits: 444.0 E(32554): 3.7e-124 Smith-Waterman score: 2069; 53.4% identity (75.7% similar) in 614 aa overlap (222-830:3-609) 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 ICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKICDGFRATVYPCPE :.: : :::. :::.:: : :. :.: . CCDS53 MTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFHCHVFPFLQ 10 20 30 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 RAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKVQKMKAVYHILNM . : :.... . ..: :. .:: ...: .. ..:.:::::: ::. CCDS53 QEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMKAVYLALNQ 40 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 CNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRAL-EQGMELSGSSMAPIMTTVQSKTAPPTFNRTN :....:..:.::: : : : ...:: ...:: . :..: . . :::. ::: CCDS53 CSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVA---HRIPCRDMPPTLIRTN 100 110 120 130 140 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 KFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVMLLAALWMILNER .:::.::.:::::::: :.:.:::::::::::::::::::: ::: .:.: :: :.: : CCDS53 RFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAEN 150 160 170 180 190 200 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 RLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWSVQPMFRNG : . ..::::.:::.::::.::::.::::::.:::.:::.. .:: :.::: : .. CCDS53 RPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQS 210 220 230 240 250 260 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 TWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIV :. . . .: ::: . ::..: ::::::::::.::.:.:.::::.:::::::::.: CCDS53 GWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLG-PYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVILGVV 270 280 290 300 310 320 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 QMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWCCFDVHVSQHAP .:.:::.:..:::..: . ..:. .::. :.: :::::::..:.:: : . . :: CCDS53 HMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARAASAP 330 340 350 360 370 380 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 SILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKPFILRASHRKSQ ::::::::::::..: : : :: .:. ::. .::.:: :: .:: :. : ::. . CCDS53 SILIHFINMFLFSHSPS-NRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHRR-R 390 400 410 420 430 440 680 690 700 710 720 pF1KE6 LQASRIQEDATENIEGDSSSP-SSRSGQRTSADTHGALDDHGE-EFNFGDVFVHQAIHTI :. : . :: : . : .: .: .. . :.:::. : :. ..:..::::::: CCDS53 LR-RRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHTI 450 460 470 480 490 500 730 740 750 760 770 780 pF1KE6 EYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIVGVFI--IFAVFA :.::::.::::::::::::::::::::::::.::: :: :...: . :::.:: CCDS53 EFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAFA 510 520 530 540 550 560 790 800 810 820 830 840 pF1KE6 VLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDGTAEE :.::::::.::::::::::::::::::::::: : :::.:::.: CCDS53 VMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD 570 580 590 600 610 840 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 16:08:33 2016 done: Tue Nov 8 16:08:34 2016 Total Scan time: 3.090 Total Display time: 0.180 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]