FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6643, 326 aa 1>>>pF1KE6643 326 - 326 aa - 326 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0977+/-0.000381; mu= 16.8053+/- 0.024 mean_var=64.4638+/-13.292, 0's: 0 Z-trim(111.8): 48 B-trim: 1192 in 3/47 Lambda= 0.159741 statistics sampled from 20455 (20503) to 20455 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 6.360 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005980 (OMIM: 235555,604741) 3-oxo-5-beta-stero ( 326) 2207 517.5 1.5e-146 NP_001177836 (OMIM: 235555,604741) 3-oxo-5-beta-st ( 290) 1925 452.5 4.9e-127 NP_001344 (OMIM: 600449) aldo-keto reductase famil ( 323) 1321 313.3 4.2e-85 NP_995317 (OMIM: 600450,614279) aldo-keto reductas ( 323) 1313 311.5 1.5e-84 NP_001345 (OMIM: 600450,614279) aldo-keto reductas ( 323) 1313 311.5 1.5e-84 NP_001809 (OMIM: 600451,614279) aldo-keto reductas ( 323) 1282 304.4 2.1e-82 NP_003730 (OMIM: 603966) aldo-keto reductase famil ( 323) 1274 302.5 7.7e-82 NP_001240837 (OMIM: 603966) aldo-keto reductase fa ( 323) 1272 302.1 1.1e-81 NP_001619 (OMIM: 103880) aldose reductase isoform ( 316) 1095 261.3 2e-69 NP_064695 (OMIM: 604707) aldo-keto reductase famil ( 316) 1082 258.3 1.6e-68 NP_001177835 (OMIM: 235555,604741) 3-oxo-5-beta-st ( 285) 1037 247.9 1.9e-65 XP_011514543 (OMIM: 616336) PREDICTED: aldo-keto r ( 316) 1016 243.1 6e-64 XP_016867713 (OMIM: 616336) PREDICTED: aldo-keto r ( 344) 982 235.2 1.5e-61 NP_001074007 (OMIM: 616336) aldo-keto reductase fa ( 344) 982 235.2 1.5e-61 NP_001189342 (OMIM: 103830) alcohol dehydrogenase ( 325) 914 219.6 7.3e-57 NP_697021 (OMIM: 103830) alcohol dehydrogenase [NA ( 325) 914 219.6 7.3e-57 NP_006057 (OMIM: 103830) alcohol dehydrogenase [NA ( 325) 914 219.6 7.3e-57 NP_001189343 (OMIM: 103830) alcohol dehydrogenase ( 325) 914 219.6 7.3e-57 XP_016871280 (OMIM: 600449) PREDICTED: aldo-keto r ( 297) 737 178.7 1.3e-44 NP_001307956 (OMIM: 600450,614279) aldo-keto reduc ( 297) 727 176.4 6.4e-44 XP_011514718 (OMIM: 604707) PREDICTED: aldo-keto r ( 277) 699 170.0 5.3e-42 XP_005250291 (OMIM: 103880) PREDICTED: aldose redu ( 172) 635 155.1 9.9e-38 NP_001333071 (OMIM: 103880) aldose reductase isofo ( 172) 635 155.1 9.9e-38 XP_011538794 (OMIM: 103830) PREDICTED: alcohol deh ( 214) 553 136.2 5.8e-32 XP_011538793 (OMIM: 103830) PREDICTED: alcohol deh ( 214) 553 136.2 5.8e-32 XP_011514719 (OMIM: 604707) PREDICTED: aldo-keto r ( 175) 473 117.8 1.7e-26 NP_001128713 (OMIM: 600450,614279) aldo-keto reduc ( 139) 457 114.0 1.9e-25 NP_001240838 (OMIM: 603966) aldo-keto reductase fa ( 138) 445 111.2 1.3e-24 NP_003680 (OMIM: 603418) aflatoxin B1 aldehyde red ( 359) 142 41.7 0.0029 >>NP_005980 (OMIM: 235555,604741) 3-oxo-5-beta-steroid 4 (326 aa) initn: 2207 init1: 2207 opt: 2207 Z-score: 2752.2 bits: 517.5 E(85289): 1.5e-146 Smith-Waterman score: 2207; 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NP_001 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAID 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY .::.:::.. : .. :.::: ::: NP_001 GLNRNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY 300 310 320 >>NP_001809 (OMIM: 600451,614279) aldo-keto reductase fa (323 aa) initn: 1256 init1: 1197 opt: 1282 Z-score: 1600.2 bits: 304.4 E(85289): 2.1e-82 Smith-Waterman score: 1282; 56.7% identity (84.6% similar) in 319 aa overlap (8-326:6-323) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN .:. :.::. .:..:.:::. :. .:.. . .:.::..:.::::.::.:.: NP_001 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE :..:: ::: :::.:.:.:::::: .::: : :.::.:.:: .:. :::::::::... NP_001 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL :::.:::. :.::::: .. .: ::::.:: ::::::.::.:::::: ::::.:: NP_001 FPMALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNCRQLEMIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK ::::::.::: ::::::::..: ::: ::...:::..:.: :::.:. .::. .:: ::. NP_001 NKPGLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE : .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::.::.:.:.:.:: :.:: .. NP_001 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLD 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY .::.: :.: . . :::.::: ::: NP_001 GLNRNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY 300 310 320 >>NP_003730 (OMIM: 603966) aldo-keto reductase family 1 (323 aa) initn: 1257 init1: 1198 opt: 1274 Z-score: 1590.3 bits: 302.5 E(85289): 7.7e-82 Smith-Waterman score: 1274; 56.2% identity (84.9% similar) in 317 aa overlap (10-326:8-323) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN . :.::. .:..:.:::. :. .:.. .:.::..:.::::.:..:.: NP_003 MDSKHQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE :..:: ::: :::.:.:.:::::: .:::.: : ::.:::.:: .:. ::::::::.:. NP_003 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL ::..:::.:. : ::::: .. .::.:::::: ::::::.::.:::::::::::.:: NP_003 SPMSLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK ::::::.::: :::::::::.. ::: ::...:::..::: ::..:. ::. .:: ::. NP_003 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE : .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::..: :.:.:.:: :.:: :. NP_003 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAID 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY .:..:... . . .::.::. ::: NP_003 GLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY 300 310 320 >>NP_001240837 (OMIM: 603966) aldo-keto reductase family (323 aa) initn: 1257 init1: 1198 opt: 1272 Z-score: 1587.8 bits: 302.1 E(85289): 1.1e-81 Smith-Waterman score: 1272; 56.2% identity (84.9% similar) in 317 aa overlap (10-326:8-323) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN . :.::. .:..:.:::. :. .:.. .:.::..:.::::.:..:.: NP_001 MDSKHQCLKLNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE :..:: ::: :::.:.:.:::::: .:::.: : ::.:::.:: .:. ::::::::.:. 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NP_001 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAID 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY .:..:... . . .::.::. ::: NP_001 GLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY 300 310 320 >>NP_001619 (OMIM: 103880) aldose reductase isoform 1 [H (316 aa) initn: 1024 init1: 756 opt: 1095 Z-score: 1367.5 bits: 261.3 E(85289): 2e-69 Smith-Waterman score: 1095; 50.0% identity (77.0% similar) in 318 aa overlap (9-326:4-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN :. :..: ..::.::::.. .: : . .::::::.:::::: :..::: NP_001 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWK----SPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE :.::: ::.::. : :.::..: .::: : : .:. . ..:: :.:::.:::.:. NP_001 ENEVGVAIQEKLREQVVKREELFIVSKLWCTYHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL : .:::: :..: ::.:. . .:. :: ::: : ::::..:.::::. :.:.:: NP_001 WPTGFKPGKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK ::::::.::. ::.:::::.:: ::...::.. ::.:::::::. : :.. .: ::. NP_001 NKPGLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRP-WAKPEDPSLLE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE : ..... ..:::.::...:: .::..:::::: . ::: :::..::: :. ..: . NP_001 DPRIKAIAAKHNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLL 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY . :.: : :: .: .::::.:. NP_001 SYNRNWRVCALLSCTSHKDYPFHEEF 300 310 >>NP_064695 (OMIM: 604707) aldo-keto reductase family 1 (316 aa) initn: 1040 init1: 767 opt: 1082 Z-score: 1351.3 bits: 258.3 E(85289): 1.6e-68 Smith-Waterman score: 1082; 50.8% identity (78.2% similar) in 317 aa overlap (10-326:5-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN . :: ..::.::::.. .: : .::::::.:::::: ::.::: NP_064 MATFVELSTKAKMPIVGLGTWK----SPLGKVKEAVKVAIDAGYRHIDCAYVYQN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE ::::::::.::: : :.:::.: .::: : .:: ..:.::. :.:.:.:.:.:. NP_064 EHEVGEAIQEKIQEKAVKREDLFIVSKLWPTFFERPLVRKAFEKTLKDLKLSYLDVYLIH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL :..:: ::...:.:..:. . :... .::::: : ::::.::::::.. :.: .: NP_064 WPQGFKSGDDLFPKDDKGNAIGGKATFLDAWEAMEELVDEGLVKALGVSNFSHFQIEKLL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK ::::::.:::.::::::::.:: ::...:... :..:::::::. : :.. .: ::. NP_064 NKPGLKYKPVTNQVECHPYLTQEKLIQYCHSKGITVTAYSPLGSPDRP-WAKPEDPSLLE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE : .. .. ...:::::...::.:::.:.::::: . :: ::.:.:::.:..::: : NP_064 DPKIKEIAAKHKKTAAQVLIRFHIQRNVIVIPKSVTPARIVENIQVFDFKLSDEEMATIL 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY ..:.: : ..:. .:::. :: NP_064 SFNRNWRACNVLQSSHLEDYPFNAEY 300 310 326 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 15:03:15 2016 done: Tue Nov 8 15:03:16 2016 Total Scan time: 6.360 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]