FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6643, 326 aa 1>>>pF1KE6643 326 - 326 aa - 326 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2145+/-0.00094; mu= 16.3086+/- 0.056 mean_var=63.3212+/-12.688, 0's: 0 Z-trim(104.4): 30 B-trim: 24 in 1/48 Lambda= 0.161176 statistics sampled from 7883 (7908) to 7883 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16 Scan time: 2.330 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 2207 522.0 2.6e-148 CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 1925 456.4 1.3e-128 CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 1321 315.9 2.7e-86 CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 1313 314.1 9.8e-86 CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 1281 306.6 1.7e-83 CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1274 305.0 5.3e-83 CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1272 304.5 7.3e-83 CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1095 263.4 1.7e-70 CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1082 260.4 1.4e-69 CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 1037 249.9 1.8e-66 CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 982 237.1 1.5e-62 CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 914 221.3 8.4e-58 CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 727 177.8 9.5e-45 CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 613 151.3 9.7e-37 CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 457 114.8 4e-26 CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 362 92.8 2.6e-19 CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 362 92.9 3e-19 >>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa) initn: 2207 init1: 2207 opt: 2207 Z-score: 2776.1 bits: 522.0 E(32554): 2.6e-148 Smith-Waterman score: 2207; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY :::::::::::::::::::::::::: CCDS58 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY 310 320 >>CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (290 aa) initn: 1925 init1: 1925 opt: 1925 Z-score: 2422.5 bits: 456.4 E(32554): 1.3e-128 Smith-Waterman score: 1925; 99.7% identity (100.0% similar) in 286 aa overlap (1-286:1-286) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. 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CCDS70 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAID 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY .:..:... . . .::.::. ::: CCDS70 GLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY 300 310 320 >>CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa) initn: 1257 init1: 1198 opt: 1272 Z-score: 1601.2 bits: 304.5 E(32554): 7.3e-83 Smith-Waterman score: 1272; 56.2% identity (84.9% similar) in 317 aa overlap (10-326:8-323) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN . :.::. .:..:.:::. :. .:.. .:.::..:.::::.:..:.: CCDS73 MDSKHQCLKLNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE :..:: ::: :::.:.:.:::::: .:::.: : ::.:::.:: .:. ::::::::.:. 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CCDS73 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAID 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY .:..:... . . .::.::. ::: CCDS73 GLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY 300 310 320 >>CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 (316 aa) initn: 1024 init1: 756 opt: 1095 Z-score: 1378.9 bits: 263.4 E(32554): 1.7e-70 Smith-Waterman score: 1095; 50.0% identity (77.0% similar) in 318 aa overlap (9-326:4-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN :. :..: ..::.::::.. .: : . .::::::.:::::: :..::: CCDS58 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWK----SPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE :.::: ::.::. : :.::..: .::: : : .:. . ..:: :.:::.:::.:. 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CCDS58 SYNRNWRVCALLSCTSHKDYPFHEEF 300 310 >>CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 (316 aa) initn: 1040 init1: 767 opt: 1082 Z-score: 1362.6 bits: 260.4 E(32554): 1.4e-69 Smith-Waterman score: 1082; 50.8% identity (78.2% similar) in 317 aa overlap (10-326:5-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN . :: ..::.::::.. .: : .::::::.:::::: ::.::: CCDS58 MATFVELSTKAKMPIVGLGTWK----SPLGKVKEAVKVAIDAGYRHIDCAYVYQN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE ::::::::.::: : :.:::.: .::: : .:: ..:.::. :.:.:.:.:.:. 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