FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3158, 376 aa 1>>>pF1KE3158 376 - 376 aa - 376 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3587+/-0.000954; mu= 10.8866+/- 0.057 mean_var=90.7962+/-17.986, 0's: 0 Z-trim(105.4): 90 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.134599 statistics sampled from 8330 (8426) to 8330 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16 Scan time: 2.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 ( 376) 2559 507.4 8.5e-144 CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 ( 305) 1191 241.7 6.6e-64 CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 402) 1068 217.9 1.3e-56 CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 428) 991 202.9 4.3e-52 CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 ( 438) 707 147.8 1.8e-35 CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 ( 400) 624 131.6 1.2e-30 CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 384) 589 124.8 1.2e-28 CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 419) 589 124.9 1.3e-28 >>CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 (376 aa) initn: 2559 init1: 2559 opt: 2559 Z-score: 2695.1 bits: 507.4 E(32554): 8.5e-144 Smith-Waterman score: 2559; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS57 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 VFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS57 VFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVAT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 EKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS57 EKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 RKHIIWMNHYLVSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLTTDLQNTFGQLQLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS57 RKHIIWMNHYLVSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLTTDLQNTFGQLQLR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 VVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICKCDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS57 VVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICKCDI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEENPTSQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS57 LKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEENPTSQN 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 NDIQPHSVVEDVHPSP :::::::::::::::: CCDS57 NDIQPHSVVEDVHPSP 370 >>CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 (305 aa) initn: 1149 init1: 728 opt: 1191 Z-score: 1260.8 bits: 241.7 E(32554): 6.6e-64 Smith-Waterman score: 1191; 55.4% identity (81.0% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETG : .:.. ....:: :...:.. :.: ....: :..::.:.:::.. :::::.: CCDS47 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLSFPDSNGKAIWTAHLNITFQVGNEITSELGESG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 VFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVAT ::: : :.::.::.. ::: ::::.: : ::: : ...:::::::::::::.::.::. CCDS47 VFGNHSPLERVSGVVALPEGWNQNACHPLTNFSRPKQADSWLALIERGGCTFTHKINVAA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 EKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG ::::.:::::: :::..:::: ::. :..:.:::.:::: ::.: :.::: .:...::: CCDS47 EKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSIQKGVYVTVIIEVG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RKHIIWMNHYLVSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQN---RRWQRLTTDLQNTFGQL : :. :..::.. . .::.::: . . :: :. : :: ... ::..... :: CCDS47 RMHMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLT-PRVPNSFTRRRSQIKTDVKKAIDQL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 QLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICK ::::.::::::.. : :.::.::. :::.:.:::::::::::: :::::.: : :::.:: CCDS47 QLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFHKACIDPWLLAHRTCPMCK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 CDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEENPT ::::: CCDS47 CDILKT 300 >>CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (402 aa) initn: 1036 init1: 628 opt: 1068 Z-score: 1129.9 bits: 217.9 E(32554): 1.3e-56 Smith-Waterman score: 1072; 44.7% identity (74.5% similar) in 380 aa overlap (11-374:5-378) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMK-FSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGET : .. ::. :. : .. . .. : ..:.: ...:.. : : CCDS14 MNQENRSSFFWLLVIFTFLLKITASFSMSAYVTVTYYN---ETSNYTAIETCEC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 GVFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVA ::.: .: . . ::. :... .::. :: :: .: . :.::::::.:::..::..: CCDS14 GVYGLASPVANAMGVVGIPKNNNYQACDHNTEFSNTK--KPWIALIERGNCTFSEKIQTA 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 TEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEV ...:..:.:::.: ::::.. : . . :.:..::::::::.:.. :..:. .: :.:: CCDS14 GRRNADAVVIYNAPETGNQTIQMANFGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEV 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GRKHIIWMNHYL-----VSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLTTDLQNTF :.:: :.::: ::: :.:.::..::::: .:: :: :.:. ..: .: .... CCDS14 GKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAI 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 GQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCP :.::::..:.::.::.:.::::..:.: :::::.::::::.:.:::.:.:::.: : ::: CCDS14 GRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEE .:::::::.:::.: ::.:. ::: .:::. .. : ::.. .:.. .: .. : ..: CCDS14 MCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYAS-VQGTDE 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KE3 NPT-----SQNNDIQ-----PHSVVEDVHPSP : : :...: .::. :: : CCDS14 PPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS 350 360 370 380 390 400 >>CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (428 aa) initn: 1204 init1: 628 opt: 991 Z-score: 1048.7 bits: 202.9 E(32554): 4.3e-52 Smith-Waterman score: 1170; 50.1% identity (76.8% similar) in 367 aa overlap (34-374:39-404) 10 20 30 40 50 pF1KE3 LKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISF---HVG-NHVLSELGET : .:: ::.:.:. :.: :... ::.: CCDS14 VSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNRTVWELSEE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 GVFGRSSTLKRVAGVIVPPEGK-IQNACNPNTIFSR-----SKYSETWLALIERGG-CTF ::.:..: :. ::::.:::.: :::::.: :. : . .:::::.::: ::: CCDS14 GVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGCTF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 TQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVL ..::..: :.::::..:.: ::: :.:.:: : . :.:..::::::::.:.. :..:. CCDS14 ADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQ 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 pF1KE3 ITAVVEVGRKHIIWMNHYL-----VSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLT .: :.:::.:: :.::: ::: :.:.::..::::: .:: :: :.:. ..: CCDS14 VTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLK 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 TDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWI .: ....:.::::..:.::.::.:.::::..:.: :::::.::::::.:.:::.:.:::. CCDS14 ADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 LPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSD : : :::.:::::::.:::.: ::.:. ::: .:::. .. : ::.. .:.. .: .. CCDS14 LEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYAS 310 320 330 340 350 360 350 360 370 pF1KE3 KVIHVEENPT-----SQNNDIQ-----PHSVVEDVHPSP : ..: : : :...: .::. :: : CCDS14 -VQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIK 370 380 390 400 410 420 CCDS14 S >>CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 (438 aa) initn: 730 init1: 445 opt: 707 Z-score: 750.5 bits: 147.8 E(32554): 1.8e-35 Smith-Waterman score: 729; 32.5% identity (64.2% similar) in 388 aa overlap (15-376:15-389) 10 20 30 40 pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRA-SVVWM-AYMNISFHV---------- :.::..: . :. . : . :. :..::.. CCDS34 MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 ---GNHVLSELGETGVFGRSSTLKRVAG-VIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLAL : .. .: : : .:. : . . : :.. .. . ::.::: :. ...:.:: CCDS34 GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTRGKNWIAL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 IERGGCTFTQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIF : .:.::. .::. : ..::.:.:.:: .. :... : : . ::.:..:: . :: :: CCDS34 IPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIV 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE3 HLIKKGVLITAVVEVG----RKHIIWMNHYLVS--FVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARI :..... .: . .: .:.. . .:: :... .::...::.:.:. : CCDS34 SLLERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFYYIQRFRYANA 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 QNRRWQRLTTDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFF ..: .:: ......::.:..:.::.: . . :.:..:.: :::::.:::: :.:.: CCDS34 RDRNQRRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLF 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 HKNCIDPWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEE-ETN ::.:.:::.: : :::.:: .:::.::: : .. ..:: . : . CCDS34 HKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGI---------PPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPT 310 320 330 340 350 340 350 360 370 pF1KE3 NEVSPAGTSDKVIH---VEENPTSQNNDIQPHSVVEDVHPSP :... :.:: ... : .:. .. . .::.:. : : CCDS34 NQIT--GASDTTVNESSVTLDPAVRT--VGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVS 360 370 380 390 400 CCDS34 SDSDISLIMAMEVGLSDVELSTDQDCEEVKS 410 420 430 >>CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 (400 aa) initn: 635 init1: 320 opt: 624 Z-score: 664.0 bits: 131.6 E(32554): 1.2e-30 Smith-Waterman score: 675; 34.0% identity (62.0% similar) in 379 aa overlap (9-366:3-370) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCC----RASVV-WM-AYMNISF--HVGNHV :: :: .: :.. : :. .. :. : .:: . : . CCDS20 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 LSELGETGVFGRSSTLKRVAGVI-VP--PEGKIQNACNPNTIF----SRSKYSETWLALI . ..:.: :: :: . . :.. :: : : ... : :.: : .. . :.::. CCDS20 VWSVSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEG-CAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALV 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 ERGGCTFTQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFH :::::: .:. ::....::.:..:: :: ..:: : . ..::.::. :: ::.. CCDS20 ARGGCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE3 LIKKGVLITAVVEVGRKHII-WMNHYLVSFVIVTTAT-----LAYFIFYHIHRLCLARIQ :..::. .: .. :: .:. ... : :: .. : ::..:::.:.:. . : CCDS20 LVQKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQ 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 NRRWQRLTTDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFH : . ....::: :..::.:.. :. ....:..:.: .: .::.::: :::.:: CCDS20 IGS-QSHRKETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFH 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 KNCIDPWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNE . :::::.: : :::.:: :..:.:: : :: .: .:.: :: .. . CCDS20 RICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYW-----G-EPGDV---QEMPAPESPPGRDPAAN 300 310 320 330 340 340 350 360 370 pF1KE3 VSPAGTSDKVIHVEENPTSQNNDIQPHSVVEDVHPSP .: : .: :... . .:. CCDS20 LSLALPDDDGSDDSSPPSASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS 350 360 370 380 390 400 >>CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (384 aa) initn: 513 init1: 412 opt: 589 Z-score: 627.5 bits: 124.8 E(32554): 1.2e-28 Smith-Waterman score: 603; 35.5% identity (66.4% similar) in 262 aa overlap (58-306:57-314) 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 SQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETGVFGRSSTLKRVAGVIVPP---EGKIQN . : .: .: .: : .. : .: .. CCDS64 ADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADH 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 -ACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMF .:.:.: : . :.::..::.::: .::. :. ..: .:.::: . . : : CCDS64 LGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPV-TMT 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 HQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG---------RKHIIWMNHYLVSF : . :...::: .:.: .:. ..:.. . .. :: : ..... .:: CCDS64 HPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVS---ISF 150 160 170 180 190 200 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 VIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLTTDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGD ... . :..::: :... . ..: .:: ......: :.::.::.: .:. : CCDS64 IVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFD 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 SCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGT :..:.: :: ::.:::: ::: :::.:.:::. : :::.:: .:::.::: CCDS64 HCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTD 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 EPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEENPTSQNNDIQPHSVVEDVHP CCDS64 NVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGDNSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAV 330 340 350 360 370 380 >>CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (419 aa) initn: 513 init1: 412 opt: 589 Z-score: 627.0 bits: 124.9 E(32554): 1.3e-28 Smith-Waterman score: 603; 35.5% identity (66.4% similar) in 262 aa overlap (58-306:57-314) 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 SQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETGVFGRSSTLKRVAGVIVPP---EGKIQN . : .: .: .: : .. : .: .. 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