FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7922, 347 aa 1>>>pF1KB7922 347 - 347 aa - 347 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5913+/-0.000854; mu= 11.0227+/- 0.051 mean_var=114.8602+/-23.987, 0's: 0 Z-trim(109.9): 54 B-trim: 541 in 1/50 Lambda= 0.119671 statistics sampled from 11157 (11209) to 11157 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16 Scan time: 2.630 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5762.1 TFEC gene_id:22797|Hs108|chr7 ( 347) 2276 403.6 1.2e-112 CCDS59076.1 TFEC gene_id:22797|Hs108|chr7 ( 280) 1681 300.8 8.6e-82 CCDS34738.1 TFEC gene_id:22797|Hs108|chr7 ( 318) 1681 300.9 9.5e-82 CCDS46866.2 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 357) 972 178.5 7.4e-45 CCDS43107.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 413) 972 178.6 8.3e-45 CCDS54607.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 468) 972 178.6 9.1e-45 CCDS46865.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 504) 972 178.6 9.7e-45 CCDS43106.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 520) 972 178.6 9.9e-45 CCDS2913.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 ( 419) 886 163.7 2.5e-40 CCDS14315.3 TFE3 gene_id:7030|Hs108|chrX ( 575) 772 144.1 2.7e-34 CCDS4858.1 TFEB gene_id:7942|Hs108|chr6 ( 476) 728 136.5 4.4e-32 CCDS64425.1 TFEB gene_id:7942|Hs108|chr6 ( 490) 728 136.5 4.5e-32 CCDS64424.1 TFEB gene_id:7942|Hs108|chr6 ( 391) 686 129.2 5.8e-30 >>CCDS5762.1 TFEC gene_id:22797|Hs108|chr7 (347 aa) initn: 2276 init1: 2276 opt: 2276 Z-score: 2135.7 bits: 403.6 E(32554): 1.2e-112 Smith-Waterman score: 2276; 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CCDS46 VTDPLLSSVSPGASKTSSRRSSMSMEETEHTC 480 490 500 >>CCDS43106.1 MITF gene_id:4286|Hs108|chr3 (520 aa) initn: 883 init1: 648 opt: 972 Z-score: 916.5 bits: 178.6 E(32554): 9.9e-45 Smith-Waterman score: 972; 57.9% identity (79.5% similar) in 297 aa overlap (60-343:222-515) 30 40 50 60 70 80 pF1KB7 HTTLDSDAGLTENPLTKLLAIGKEDDNAQWHMEDVIEDIIGMESSFKEE--G-ADSPLLM .:.:::.:::..:::..:: : : : : CCDS43 EKEGFYKFEEQNRAESECPGMNTHSRASCMQMDDVIDDIISLESSYNEEILGLMDPALQM 200 210 220 230 240 250 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 QRTL--SGSILDVYSGEQGISPINMGLT-SASCPSSLP-MKREITETDTRALAKERQKKD :: ::...:.: :.::. : ::: : :::..:: .:::.::...::::::::::: CCDS43 ANTLPVSGNLIDLY-GNQGLPPP--GLTISNSCPANLPNIKRELTESEARALAKERQKKD 260 270 280 290 300 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 NHNLIERRRRYNINYRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVEYIKWLQKEQQRAREL ::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::::::::.::. ::.:::::.:: CCDS43 NHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKEL 310 320 330 340 350 360 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 EHRQKKLEQANRRLLLRIQELEIQARTHGLPTLASLG--TVDLGAHVTKQQSHPEQNSVD :.::::::.:::.:::::::::.:::.::: . : : . :: .. ::. :. : : CCDS43 ENRQKKLEHANRHLLLRIQELEMQARAHGLSLIPSTGLCSPDLVNRIIKQEPVLENCSQD 370 380 390 400 410 420 270 280 290 300 310 pF1KB7 YCQQLT-VSQGPSPELCDQAIAFSDPLSYFTDLS--FSAALKEEQRLDGMLLDDTISPFG :. . .. . .: : .:.:.. :. :. . .:. : ..:. .:.:::.:: : CCDS43 LLQHHADLTCTTTLDLTDGTITFNNNLGTGTEANQAYSVPTKMGSKLEDILMDDTLSPVG 430 440 450 460 470 480 320 330 340 pF1KB7 -TDPLLSATSPAVSKESSRRSSFSSDDGDEL ::::::..::..:: ::::::.: .. 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CCDS29 TLSPVGVTDPLLSSVSPGASKTSSRRSSMSMEETEHTC 390 400 410 >>CCDS14315.3 TFE3 gene_id:7030|Hs108|chrX (575 aa) initn: 772 init1: 614 opt: 772 Z-score: 729.3 bits: 144.1 E(32554): 2.7e-34 Smith-Waterman score: 873; 46.9% identity (70.3% similar) in 360 aa overlap (17-343:222-573) 10 20 30 40 pF1KB7 MTLDHQIINPTLKWSQPAVPSGGPLVQHAHTTLDSDAGLTENPLTK :: . : . :::: . .: . : CCDS14 QQARRQQVKQYLSTTLGPKLASQALTPPPGPASAQPLPAPEAAHTT--GPTGSAPNSPMA 200 210 220 230 240 50 60 70 80 90 pF1KB7 LLAIGKEDDNAQWHMEDVIEDIIGMESSFKEE------GADSPLLMQRTL--SGSILDVY ::.::. ... ...:::..::..:::...: :. . : . :: ::..:::: CCDS14 LLTIGSSSEK---EIDDVIDEIISLESSYNDEMLSYLPGGTTGLQLPSTLPVSGNLLDVY 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 SGEQGISPINMGLTSASCPSSLP-MKREITETDTRALAKERQKKDNHNLIERRRRYNINY :. ::.. . .: :::. :: .::::.::...:: :::::::::::::::::.::: CCDS14 SS-QGVATPAI-TVSNSCPAELPNIKREISETEAKALLKERQKKDNHNLIERRRRFNIND 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 RIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVEYIKWLQKEQQRARELEHRQKKLEQANRRLL ::::::::::::.::.:::::::::::::.::. :::::::...:: ::..:::::: : CCDS14 RIKELGTLIPKSSDPEMRWNKGTILKASVDYIRKLQKEQQRSKDLESRQRSLEQANRSLQ 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 pF1KB7 LRIQELEIQARTHGLPTLASLGTVDLGAHVTKQQSHPEQNSVDY---------------C :::::::.::. ::::. . : ..:.. .... .::: ... 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