FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5679, 503 aa 1>>>pF1KE5679 503 - 503 aa - 503 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1876+/-0.000444; mu= 18.5388+/- 0.027 mean_var=70.7670+/-14.556, 0's: 0 Z-trim(111.1): 192 B-trim: 672 in 2/48 Lambda= 0.152461 statistics sampled from 19416 (19622) to 19416 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16 Scan time: 6.510 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000756 (OMIM: 605340) cytochrome P450 3A7 [Homo ( 503) 3323 740.6 2.4e-213 NP_059488 (OMIM: 124010) cytochrome P450 3A4 isofo ( 503) 2982 665.6 9.1e-191 NP_001189784 (OMIM: 124010) cytochrome P450 3A4 is ( 502) 2970 663.0 5.7e-190 NP_000768 (OMIM: 145500,605325) cytochrome P450 3A ( 502) 2800 625.6 1e-178 NP_001278759 (OMIM: 145500,605325) cytochrome P450 ( 492) 2675 598.1 1.9e-170 NP_476436 (OMIM: 606534) cytochrome P450 3A43 isof ( 503) 2490 557.4 3.4e-158 XP_016867269 (OMIM: 124010) PREDICTED: cytochrome ( 449) 2481 555.4 1.2e-157 NP_073731 (OMIM: 606534) cytochrome P450 3A43 isof ( 504) 2478 554.8 2.1e-157 NP_001278758 (OMIM: 145500,605325) cytochrome P450 ( 389) 2139 480.1 4.9e-135 XP_011514145 (OMIM: 145500,605325) PREDICTED: cyto ( 389) 2139 480.1 4.9e-135 XP_016867270 (OMIM: 145500,605325) PREDICTED: cyto ( 389) 2139 480.1 4.9e-135 NP_476437 (OMIM: 606534) cytochrome P450 3A43 isof ( 420) 2089 469.2 1.1e-131 XP_016868031 (OMIM: 606534) PREDICTED: cytochrome ( 394) 1905 428.7 1.5e-119 XP_016868032 (OMIM: 606534) PREDICTED: cytochrome ( 394) 1905 428.7 1.5e-119 XP_006715922 (OMIM: 145500,605325) PREDICTED: cyto ( 381) 1883 423.8 4.3e-118 XP_016867271 (OMIM: 145500,605325) PREDICTED: cyto ( 322) 1745 393.4 5.1e-109 XP_016868033 (OMIM: 606534) PREDICTED: cytochrome ( 360) 1735 391.2 2.6e-108 XP_016868034 (OMIM: 606534) PREDICTED: cytochrome ( 360) 1735 391.2 2.6e-108 NP_001265850 (OMIM: 606534) cytochrome P450 3A43 i ( 393) 1394 316.3 1e-85 NP_001177413 (OMIM: 145500,605325) cytochrome P450 ( 140) 622 146.2 6.1e-35 NP_001159726 (OMIM: 231095,274180,614158) thrombox ( 466) 612 144.3 7.2e-34 XP_016868058 (OMIM: 231095,274180,614158) PREDICTE ( 472) 612 144.3 7.3e-34 NP_001300957 (OMIM: 231095,274180,614158) thrombox ( 514) 612 144.3 7.8e-34 NP_001052 (OMIM: 231095,274180,614158) thromboxane ( 534) 612 144.4 8e-34 NP_001124438 (OMIM: 231095,274180,614158) thrombox ( 534) 612 144.4 8e-34 NP_001159725 (OMIM: 231095,274180,614158) thrombox ( 580) 612 144.4 8.6e-34 NP_828847 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 isofo ( 509) 580 137.3 1e-31 NP_076433 (OMIM: 611485) cytochrome P450 4F12 [Hom ( 524) 569 134.9 5.6e-31 NP_001186138 (OMIM: 601270) docosahexaenoic acid o ( 520) 568 134.7 6.4e-31 NP_000887 (OMIM: 601270) docosahexaenoic acid omeg ( 520) 568 134.7 6.4e-31 XP_016882303 (OMIM: 601270) PREDICTED: docosahexae ( 520) 568 134.7 6.4e-31 NP_001186137 (OMIM: 601270) docosahexaenoic acid o ( 520) 568 134.7 6.4e-31 NP_001307219 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 is ( 444) 566 134.2 7.7e-31 NP_001307218 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 is ( 508) 566 134.2 8.6e-31 NP_775754 (OMIM: 611495) cytochrome P450 4F22 [Hom ( 531) 565 134.0 1e-30 XP_011525995 (OMIM: 611495) PREDICTED: cytochrome ( 531) 565 134.0 1e-30 XP_011525994 (OMIM: 611495) PREDICTED: cytochrome ( 531) 565 134.0 1e-30 NP_009184 (OMIM: 611545) cytochrome P450 4F8 precu ( 520) 562 133.4 1.6e-30 XP_016856462 (OMIM: 614999) PREDICTED: cytochrome ( 470) 559 132.7 2.3e-30 NP_001122404 (OMIM: 611517) phylloquinone omega-hy ( 524) 558 132.5 3e-30 NP_067010 (OMIM: 611517) phylloquinone omega-hydro ( 524) 558 132.5 3e-30 XP_005262992 (OMIM: 210370,608614) PREDICTED: cyto ( 524) 552 131.2 7.4e-30 NP_000769 (OMIM: 601310) cytochrome P450 4A11 isof ( 519) 543 129.2 2.9e-29 XP_011526510 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 375) 539 128.2 4.1e-29 XP_011526504 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 375) 539 128.2 4.1e-29 XP_006722913 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 375) 539 128.2 4.1e-29 XP_011526509 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 334) 538 127.9 4.4e-29 NP_001093242 (OMIM: 124075) cytochrome P450 4B1 is ( 512) 540 128.5 4.5e-29 XP_011526507 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 352) 538 128.0 4.6e-29 XP_011526506 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 352) 538 128.0 4.6e-29 >>NP_000756 (OMIM: 605340) cytochrome P450 3A7 [Homo sap (503 aa) initn: 3323 init1: 3323 opt: 3323 Z-score: 3951.2 bits: 740.6 E(85289): 2.4e-213 Smith-Waterman score: 3323; 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81.9% identity (94.6% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-501) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSFRKGYWTF :::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::.:::.::.:.: : : NP_000 MDLIPNLAVETWLLLAVSLVLLYLYGTRTHGLFKRLGIPGPTPLPLLGNVLSYRQGLWKF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKNAISI : :::::: :.:: :. : :.:::::::.:.::::::::::::::: .:::::::.:::. NP_000 DTECYKKYGKMWGTYEGQLPVLAITDPDVIRTVLVKECYSVFTNRRSLGPVGFMKSAISL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYS ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::::: .::::: NP_000 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMFPIIAQYGDVLVRNLRREAEKGKPVTLKDIFGAYS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFPFLTPILEALNITV :::::.:::::.:::::::::::::.:::.:.:. :::. ::: .::::::..::::... 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NP_001 SMDVITGTSFGVNIDSLNNPQDPFVESTKKFLKFGFLDPLFLSIILFPFLTPVFEALNVS 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 VFPRKVISFLTKSVKQIKEGRLKETQKHRVDFLQLMIDSQNSKDSETHKALSDLELMAQS .::. .:.::.:::...:..::.. ::::.:::::::::::::..:.::::::::: ::: NP_001 LFPKDTINFLSKSVNRMKKSRLNDKQKHRLDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELAAQS 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IIFIFAGYETTSSVLSFIIYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQLEYLDMV ::::::::::::::::: .::::::::::::.:::::.:::::::::::.:.:.:::::: NP_001 IIFIFAGYETTSSVLSFTLYELATHPDVQQKLQKEIDAVLPNKAPPTYDAVVQMEYLDMV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 VNETLRLFPVAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERF :::::::::::.::::.:::::::::.::::: .:.::.:.::::::::::::.: :::: NP_001 VNETLRLFPVAIRLERTCKKDVEINGVFIPKGSMVVIPTYALHHDPKYWTEPEEFRPERF 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 SKKNKDNIDPYIYTPFGSGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRF ::: ::.::::::::::.::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::: NP_001 SKK-KDSIDPYIYTPFGTGPRNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLDT 410 420 430 440 450 460 480 490 500 pF1KE5 GGLLLTEKPIVLKAESRDETVSGA ::: :::::::..::: :.:: NP_001 QGLLQPEKPIVLKVDSRDGTLSGE 470 480 490 >>NP_476436 (OMIM: 606534) cytochrome P450 3A43 isoform (503 aa) initn: 2490 init1: 2490 opt: 2490 Z-score: 2961.0 bits: 557.4 E(85289): 3.4e-158 Smith-Waterman score: 2490; 71.5% identity (91.0% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-502) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSFRKGYWTF ::::::.:.:::.:.:.::.:::.:::..: :::::::::::::::::. : . .: :.: NP_476 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTILFYLRGLWNF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKNAISI : :: .:: ..::.:. :::::.: :::::::::::::::::::. :.::.::.:.:.:. NP_476 DRECNEKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECYSVFTNQMPLGPMGFLKSALSF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYS ::::::::::.::::.::: :.:::::::.: ::.:::.::.:::..: ..:: ::::. NP_476 AEDEEWKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLVRSLRQEAENSKSINLKDFFGAYT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFPFLTPILEALNITV :::::.: :::..::::::::::..: ::::... ::::.: :..::::::..::::: . NP_476 MDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLDPFLLLISLFPFLTPVFEALNIGL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FPRKVISFLTKSVKQIKEGRLKETQKHRVDFLQLMIDSQNSKDSETHKALSDLELMAQSI ::. : :: .:....::.:::. :::::::.: ::::::::....:::::::::.:::: NP_476 FPKDVTHFLKNSIERMKESRLKDKQKHRVDFFQQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 IFIFAGYETTSSVLSFIIYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQLEYLDMVV :.:::.:.:::..: ::.::::::::::::.:.:::.::::::: :::...:.::::::: NP_476 IIIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 NETLRLFPVAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFS :::::::::. :. ::::::.::::.:::::..::.: :.:::::::::::::: ::::: NP_476 NETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERFS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 KKNKDNIDPYIYTPFGSGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFG :::::.:: : : :::.::::::::::::.:.:::..:.:::::::::::::::::: NP_476 KKNKDSIDLYRYIPFGAGPRNCIGMRFALTNIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDNL 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 GLLLTEKPIVLKAESRDETVSGA .: :::::::.. :: .:: NP_476 PILQPEKPIVLKVHLRDGITSGP 490 500 >>XP_016867269 (OMIM: 124010) PREDICTED: cytochrome P450 (449 aa) initn: 2531 init1: 2471 opt: 2481 Z-score: 2951.0 bits: 555.4 E(85289): 1.2e-157 Smith-Waterman score: 2481; 84.6% identity (94.1% similar) in 442 aa overlap (1-442:1-440) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSFRKGYWTF : :::.::.::::::::::.:::::::..:::::::::::::::::::: ::..::. : XP_016 MALIPDLAMETWLLLAVSLVLLYLYGTHSHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNILSYHKGFCMF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKNAISI ::::.::: ::::.:: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: XP_016 DMECHKKYGKVWGFYDGQQPVLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKSAISI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYS ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: XP_016 AEDEEWKRLRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKDVFGAYS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFPFLTPILEALNITV :::::::::::.:::::::::::::::::::::. :::: ::: ::::: ::::.::: : XP_016 MDVITSTSFGVNIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFDFLDPFFLSITVFPFLIPILEVLNICV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FPRKVISFLTKSVKQIKEGRLKETQKHRVDFLQLMIDSQNSKDSETHKALSDLELMAQSI :::.: .:: ::::..::.::..:::::::::::::::::::..:.:::::::::.:::: XP_016 FPREVTNFLRKSVKRMKESRLEDTQKHRVDFLQLMIDSQNSKETESHKALSDLELVAQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 IFIFAGYETTSSVLSFIIYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQLEYLDMVV :::::::::::::::::.::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::.::::::: XP_016 IFIFAGYETTSSVLSFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPPTYDTVLQMEYLDMVV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 NETLRLFPVAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFS ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::. XP_016 NETLRLFPIAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYALHRDPKYWTEPEKFLPERLE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 KKNKDNIDPYIYTPFGSGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFG :.. .. : : . : . : XP_016 KRKLQS--STIPTTYDEGHQLCPYGSSVSKM 430 440 >>NP_073731 (OMIM: 606534) cytochrome P450 3A43 isoform (504 aa) initn: 2476 init1: 2082 opt: 2478 Z-score: 2946.7 bits: 554.8 E(85289): 2.1e-157 Smith-Waterman score: 2478; 71.4% identity (90.9% similar) in 503 aa overlap (1-502:1-503) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSFRKGYWTF ::::::.:.:::.:.:.::.:::.:::..: :::::::::::::::::. : . .: :.: NP_073 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTILFYLRGLWNF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKNAISI : :: .:: ..::.:. :::::.: :::::::::::::::::::. :.::.::.:.:.:. NP_073 DRECNEKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECYSVFTNQMPLGPMGFLKSALSF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYS ::::::::::.::::.::: :.:::::::.: ::.:::.::.:::..: ..:: ::::. NP_073 AEDEEWKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLVRSLRQEAENSKSINLKDFFGAYT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFPFLTPILEALNITV :::::.: :::..::::::::::..: ::::... ::::.: :..::::::..::::: . 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