FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5679, 503 aa 1>>>pF1KE5679 503 - 503 aa - 503 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4402+/-0.000959; mu= 17.0545+/- 0.057 mean_var=69.4995+/-14.362, 0's: 0 Z-trim(104.6): 81 B-trim: 157 in 1/49 Lambda= 0.153845 statistics sampled from 7909 (7992) to 7909 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16 Scan time: 3.060 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 3323 747.1 1.1e-215 CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 3300 742.0 3.9e-214 CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 2982 671.4 6.5e-193 CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 2800 631.0 9.4e-181 CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 2490 562.2 4.8e-160 CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 2478 559.5 3.1e-159 CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 2089 473.1 2.6e-133 CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 1394 318.9 6.7e-87 CCDS55134.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 140) 622 147.3 1.1e-35 CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 466) 612 145.3 1.4e-34 CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 534) 612 145.4 1.5e-34 CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 580) 612 145.4 1.6e-34 CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 608 144.5 2.7e-34 CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 580 138.2 2e-32 CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 569 135.8 1.1e-31 CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 568 135.6 1.3e-31 CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 568 135.6 1.3e-31 CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 ( 531) 565 134.9 2.1e-31 CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 562 134.3 3.3e-31 CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 558 133.4 6.1e-31 CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 543 130.0 6.1e-30 CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 512) 540 129.4 9.5e-30 CCDS5856.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 460) 538 128.9 1.2e-29 CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 537 128.7 1.5e-29 CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 511) 535 128.3 2.1e-29 CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 523 125.6 1.3e-28 CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 497) 522 125.4 1.5e-28 CCDS30707.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 519) 522 125.4 1.5e-28 CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 508 122.3 1.3e-27 CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 489 118.0 2.4e-26 CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 477 115.4 1.5e-25 CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 ( 490) 466 112.9 8.1e-25 CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 466 113.0 8.8e-25 CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 464 112.5 1.1e-24 CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 ( 490) 461 111.8 1.7e-24 CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 490) 456 110.7 3.8e-24 CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 ( 491) 455 110.5 4.4e-24 CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 490) 453 110.0 6e-24 CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 452 109.8 7e-24 CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 449 109.2 1.1e-23 CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 441 107.4 3.9e-23 CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 425 103.8 4.5e-22 CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 419 102.4 8.9e-22 CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 ( 494) 416 101.8 1.8e-21 CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 414 101.4 2.4e-21 CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 412 101.0 3.3e-21 CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 411 100.7 3.9e-21 CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 ( 493) 408 100.1 6.1e-21 CCDS5319.2 CYP2W1 gene_id:54905|Hs108|chr7 ( 490) 401 98.5 1.8e-20 CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 401 98.5 1.9e-20 >>CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 (503 aa) initn: 3323 init1: 3323 opt: 3323 Z-score: 3985.9 bits: 747.1 E(32554): 1.1e-215 Smith-Waterman score: 3323; 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CCDS56 DRECNEKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECYSVFTNQMPLGPMGFLKSALSF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYS ::::::::::.::::.::: :.:::::::.: ::.:::.::.:::..: ..:: ::::. CCDS56 AEDEEWKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLVRSLRQEAENSKSINLKDFFGAYT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFPFLTPILEALNITV :::::.: :::..::::::::::..: ::::... ::::.: :..::::::..::::: . CCDS56 MDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLDPFLLLISLFPFLTPVFEALNIGL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FPRKVISFLTKSVKQIKEGRLKETQKHRVDFLQLMIDSQNSKDSETHKALSDLELMAQSI ::. : :: .:....::.:::. :::::::.: ::::::::....:::::::::.:::: CCDS56 FPKDVTHFLKNSIERMKESRLKDKQKHRVDFFQQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 IFIFAGYETTSSVLSFIIYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQLEYLDMVV :.:::.:.:::..: ::.::::::::::::.:.:::.::::::: :::...:.::::::: CCDS56 IIIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 NETLRLFPVAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFS :::::::::. :. ::::::.::::.:::::..::.: :.:::::::::::::: ::: CCDS56 NETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERSH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 KKNKDNIDPYIYTPFGSGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFG >>CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (393 aa) initn: 1659 init1: 1394 opt: 1394 Z-score: 1673.6 bits: 318.9 E(32554): 6.7e-87 Smith-Waterman score: 1485; 52.0% identity (67.9% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-392) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSFRKGYWTF ::::::.:.:::.:.:.::.:::.:::..: :::::::::::::::::. : CCDS64 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTIL--------- 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGFMKNAISI : :: .. . : CCDS64 -----------------------------------------FYLRRSLNKIP------SW 60 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYS : : :.: ..: . :::.: .. : CCDS64 A----W-----WLTP---------VIPALW------------EAEAGGSPKVRS-----S 70 80 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFPFLTPILEALNITV .. . ::. ... ..::.: .::::::..::::: . 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CCDS55 SQACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKR 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 LLRFNPLDPFVLSIKVFP-FLTPILEALNITVFPRK----VISFLTKSVKQIKEGRLKET ...: :... . :: ...:. . ..: : . .:..: .... : ... CCDS55 FFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVPLAR-----ILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQA 150 160 170 180 190 200 270 280 290 pF1KE5 -QKHRVDFLQLMIDSQNS------------KD-----------SETH------KALSDLE ...: ::::...:...: .: :. : . :. : CCDS55 AEERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDE 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LMAQSIIFIFAGYETTSSVLSFIIYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQ-L ...:..::..:::: ...::: : :::.:: :.:. .:.:. .. : . .. . : CCDS55 IVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYLLATNPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGL 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 EYLDMVVNETLRLFPVAMRLERVCKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEK :::::. ::::..: :.:. : .: :. :. :: :.:. . .:::::..: :: CCDS55 PYLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPET 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 FLPERFSKKNKDNIDPYIYTPFGSGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQI : ::::. . ... :. : :::.:::.:.:.:..:...::.:..::..: :. : :::. CCDS55 FNPERFTAEARQQHRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQV 390 400 410 420 430 440 480 490 500 pF1KE5 PLKLRFGGLLLTEKPIVLKAESRDETVSGA ::.:. . : .. . .: :: CCDS55 PLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR 450 460 503 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:47:38 2016 done: Tue Nov 8 05:47:38 2016 Total Scan time: 3.060 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]