Result of FASTA (omim) for pFN21AB6269
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6269, 694 aa
  1>>>pF1KB6269 694 - 694 aa - 694 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6256+/-0.000372; mu= 10.2061+/- 0.023
 mean_var=161.9849+/-32.139, 0's: 0 Z-trim(118.8): 46  B-trim: 1609 in 1/54
 Lambda= 0.100771
 statistics sampled from 31992 (32038) to 31992 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.376), width:  16
 Scan time: 12.180

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004280 (OMIM: 604135) nuclear factor erythroid  ( 694) 4671 691.5 2.9e-198
NP_003195 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid  ( 772)  846 135.4 7.9e-31
XP_005257467 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 772)  846 135.4 7.9e-31
XP_005257472 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 731)  844 135.1 9.2e-31
XP_005257469 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 742)  844 135.1 9.3e-31
NP_001317191 (OMIM: 163260) nuclear factor erythro ( 742)  844 135.1 9.3e-31
NP_001317190 (OMIM: 163260) nuclear factor erythro ( 761)  844 135.1 9.5e-31
XP_005257468 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear fac ( 761)  844 135.1 9.5e-31
NP_001300833 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 505)  604 100.1 2.2e-20
NP_001300832 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 532)  604 100.1 2.3e-20
NP_001300831 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 575)  604 100.1 2.4e-20
NP_001138885 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 582)  604 100.1 2.5e-20
NP_001300829 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 589)  604 100.1 2.5e-20
NP_001300830 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 589)  604 100.1 2.5e-20
NP_001138884 (OMIM: 600492) nuclear factor erythro ( 589)  604 100.1 2.5e-20
NP_006155 (OMIM: 600492) nuclear factor erythroid  ( 605)  604 100.2 2.5e-20
NP_001129495 (OMIM: 601490) transcription factor N ( 373)  532 89.5 2.5e-17
NP_006154 (OMIM: 601490) transcription factor NF-E ( 373)  532 89.5 2.5e-17
NP_001248390 (OMIM: 601490) transcription factor N ( 373)  532 89.5 2.5e-17
XP_005268963 (OMIM: 601490) PREDICTED: transcripti ( 373)  532 89.5 2.5e-17
NP_996749 (OMIM: 602751) transcription regulator p ( 736)  278 52.8 5.5e-06
NP_001177 (OMIM: 602751) transcription regulator p ( 736)  278 52.8 5.5e-06
XP_005248816 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841)  261 50.4 3.4e-05
XP_011534342 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841)  261 50.4 3.4e-05
XP_016866655 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841)  261 50.4 3.4e-05
NP_001164265 (OMIM: 605394) transcription regulato ( 841)  261 50.4 3.4e-05
XP_016866654 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841)  261 50.4 3.4e-05
NP_068585 (OMIM: 605394) transcription regulator p ( 841)  261 50.4 3.4e-05
XP_011534341 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 841)  261 50.4 3.4e-05
XP_005248815 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 877)  261 50.4 3.5e-05
XP_016866652 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05
XP_016866645 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05
XP_016866653 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05
XP_016866647 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05
XP_016866651 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05
XP_016866648 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05
XP_016866650 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05
XP_016866646 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05
XP_016866649 (OMIM: 605394) PREDICTED: transcripti ( 927)  261 50.4 3.6e-05


>>NP_004280 (OMIM: 604135) nuclear factor erythroid 2-re  (694 aa)
 initn: 4671 init1: 4671 opt: 4671  Z-score: 3680.5  bits: 691.5 E(85289): 2.9e-198
Smith-Waterman score: 4671; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 PFSASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PFSASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ADEAHGLLGAAAASSTGGAGASVDGGSQAVQGGGGDPRAARSGPLDAGEEEKAPAEPTAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ADEAHGLLGAAAASSTGGAGASVDGGSQAVQGGGGDPRAARSGPLDAGEEEKAPAEPTAQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 VPDAGGCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEERVSAQKENSLQQNDDDENKIAEKPDWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VPDAGGCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEERVSAQKENSLQQNDDDENKIAEKPDWE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 AEKTTESRNERHLNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AEKTTESRNERHLNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 YHVNFSQAISQDVNLHEAILLCPNNTFRRDPTARTSQSQEPFLQLNSHTTNPEQTLPGTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YHVNFSQAISQDVNLHEAILLCPNNTFRRDPTARTSQSQEPFLQLNSHTTNPEQTLPGTN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 LTGFLSPVDNHMRNLTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LTGFLSPVDNHMRNLTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 LSLDSSHNNTSVIKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LSLDSSHNNTSVIKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 SDSDFHGDLTFQHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SDSDFHGDLTFQHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 RAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 DIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690    
pF1KB6 HYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK
              670       680       690    

>>NP_003195 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid 2-re  (772 aa)
 initn: 1077 init1: 626 opt: 846  Z-score: 674.5  bits: 135.4 E(85289): 7.9e-31
Smith-Waterman score: 1107; 34.7% identity (60.2% similar) in 734 aa overlap (51-694:45-770)

               30        40        50        60            70      
pF1KB6 LSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALSPF----SASGGWGRAGHLHP
                                     :: ::::. . :    ..  :.:    .::
NP_003 FTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGP-SSAYTQTQFHNLRNTLDGYG----IHP
           20        30        40         50        60             

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB6 KGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGSADEAHGLLGAAAASST
       :. .::     . .:: .::::    :: : :.:::::    ::.. ..   : :  ::.
NP_003 KSIDLDNYFTAR-RLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNSGLALESSS
      70        80         90       100       110       120        

        140           150         160                              
pF1KB6 GGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGP----------------------LDAG
       :   ..  :.:   :.. :: : : .  .: . :                      : ::
NP_003 GLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAG
      130       140       150       160       170       180        

      170             180               190       200       210    
pF1KB6 EE------EKAPAEPTAQVPDAG--------GCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEER
       .:      ..   .   .. :.:        :  .   ..: . . . .  .:   .:..
NP_003 REVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQ
      190       200       210       220       230       240        

          220                   230       240       250         260
pF1KB6 VSAQKENSLQ---------QNDD---DENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGTDTSF
       .. . :. :.         .: .   : ..:.:    :.:  . . :     :.::.. :
NP_003 TALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPF
      250       260       270       280       290       300        

              270       280       290       300       310       320
pF1KB6 SLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAIL
       .::. .: : :  : .   .. .   .  :   :   :..: .  .  :.:.:.::.: :
NP_003 DLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASL
      310       320       330       340       350       360        

               330         340        350       360        370     
pF1KB6 L-CPNNTFRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNHMRNL
         : .. .  .: ...    :.  .: :  :..:. ..:. .::::: :. :  :   : 
NP_003 GGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTAND
      370       380       390       400       410       420        

         380            390       400       410       420       430
pF1KB6 TSQDLLYD-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNT
       :.   : :     ::  ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. .
NP_003 TAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPS
      430       440       450       460       470       480        

                                 440       450       460       470 
pF1KB6 SV-------------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPE
       :.                    .:..: :  .:::.:: .: :. . .. ::::: : ::
NP_003 SLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-YQPE
      490       500       510       520       530       540        

             480       490        500       510       520       530
pF1KB6 PSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLED
        ::.:... .:    . : . .:: :::::.. :.: .:.. : :   :. . . .  . 
NP_003 YSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADF
       550       560       570       580       590        600      

              540       550       560       570       580       590
pF1KB6 TDRNLSRDEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKV
        :...::::.::.:..:::. :.:...::. :: .::.: :.. :.:::::::::::::.
NP_003 LDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKM
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pF1KB6 AAQNCRKRKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLR
       ::::::::::: ::::: :: .::  :  : ::...  ...  ::::...::...:.:::
NP_003 AAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLR
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pF1KB6 DDQGRPVNPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK  
       :..::: .:..:::: . :::.:..:. .. .  ... .: : .  
NP_003 DENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
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       :. .::     . .:: .::::    :: : :.:::::    ::.. ..   : :  ::.
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       :   ..  :.:   :.. :: : : .  .: . :                      : ::
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       .:      ..   .   .. :.:        :  .   ..: . . . .  .:   .:..
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pF1KB6 VSAQKENSLQ---------QNDD---DENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGTDTSF
       .. . :. :.         .: .   : ..:.:    :.:  . . :     :.::.. :
XP_005 TALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPF
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pF1KB6 SLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAIL
       .::. .: : :  : .   .. .   .  :   :   :..: .  .  :.:.:.::.: :
XP_005 DLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASL
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pF1KB6 L-CPNNTFRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNHMRNL
         : .. .  .: ...    :.  .: :  :..:. ..:. .::::: :. :  :   : 
XP_005 GGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTAND
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pF1KB6 TSQDLLYD-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNT
       :.   : :     ::  ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. .
XP_005 TAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPS
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pF1KB6 SV-------------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPE
       :.                    .:..: :  .:::.:: .: :. . .. ::::: : ::
XP_005 SLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-YQPE
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pF1KB6 PSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLED
        ::.:... .:    . : . .:: :::::.. :.: .:.. : :   :. . . .  . 
XP_005 YSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADF
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pF1KB6 TDRNLSRDEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKV
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XP_005 LDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKM
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pF1KB6 AAQNCRKRKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLR
       ::::::::::: ::::: :: .::  :  : ::...  ...  ::::...::...:.:::
XP_005 AAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLR
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pF1KB6 DDQGRPVNPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK  
       :..::: .:..:::: . :::.:..:. .. .  ... .: : .  
XP_005 DENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
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Smith-Waterman score: 1252; 37.2% identity (63.6% similar) in 744 aa overlap (4-694:4-729)

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pF1KB6 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLL--LPPPTLLQDELLFLGGPASSAYA
          ::.. . :  ::..:.:::: :.:::.: ::   :::   :.. .:   :: ::::.
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           ::.. ..   : :  ::.:   ..  :.:   :.. :: : : .  .: . :. .:
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pF1KB6 EEEKAPAEPTA--QVPDAGGCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEER------VSAQKE
       .  :   .  :  .: : .   .:.. : .: ... ....   :. :       :...  
XP_005 DLTKEDIDLGAGREVFDYSHRQKEQD-VEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETG
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pF1KB6 NSLQ-QNDDDENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPENSL
       .:.  :   : ..:.:    :.:  . . :     :.::.. :.::. .: : :  : . 
XP_005 ESFPAQFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQA
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pF1KB6 EGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAILL-CPNNTFRRDPTART-
         .. .   .  :   :   :..: .  .  :.:.:.::.: :  : .. .  .: ... 
XP_005 MEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESL
          290       300       310       320       330       340    

          340        350       360        370       380            
pF1KB6 -SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNHMRNLTSQDLLYD-----LDIN
          :.  .: :  :..:. ..:. .::::: :. :  :   : :.   : :     ::  
XP_005 PVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEA
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pF1KB6 IFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNTSV---------------
       ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. .:.               
XP_005 MLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSS
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pF1KB6 ----IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQSDSDFHGD
            .:..: :  .:::.:: .: :. . .. ::::: : :: ::.:... .:    . 
XP_005 SSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-YQPEYSKFCRMSYQDPAQLSC
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pF1KB6 LTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQRAKALHI
       : . .:: :::::.. :.: .:.. : :   :. . . .  .  :...::::.::.:..:
XP_005 LPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKI
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pF1KB6 PFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLDIILNLE
       ::. :.:...::. :: .::.: :.. :.:::::::::::::.::::::::::: :::::
XP_005 PFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLE
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pF1KB6 DDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPNHYALQCT
        :: .::  :  : ::...  ...  ::::...::...:.::::..::: .:..:::: .
XP_005 RDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYA
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pF1KB6 HDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK  
        :::.:..:. .. .  ... .: : .  
XP_005 GDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
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>>XP_005257469 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear factor   (742 aa)
 initn: 1077 init1: 626 opt: 844  Z-score: 673.2  bits: 135.1 E(85289): 9.3e-31
Smith-Waterman score: 1215; 36.8% identity (61.7% similar) in 741 aa overlap (17-694:15-740)

               10        20        30          40        50        
pF1KB6 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLL--LPPPTLLQDELLFLGGPASSAYA
                       .:.:::: :.:::.: ::   :::   :.. .:   :: ::::.
XP_005   MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPP---LREIIL---GP-SSAYT
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pF1KB6 LSPF----SASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVH
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XP_005 QTQFHNLRNTLDGYG----IHPKSIDLDNYFTAR-RLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVH
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pF1KB6 SVAAGSADEAHGLLGAAAASSTGGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGPLDAG
           ::.. ..   : :  ::.:   ..  :.:   :.. :: : : .  .: . :. .:
XP_005 RDPEGSVSGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPV-SG
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pF1KB6 EEEKAPAEPTA----QVPDAGGCASEENGVLREKHEAV-----DHSSQHEENEERVSAQK
       .  :   .       :  : :.     .   :.:.. :     : . :     : . :  
XP_005 DLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALA
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pF1KB6 ENSLQQNDDDEN----------KIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGTDTSFSLEDLFQ
       .: : ...  :.          .:.:    :.:  . . :     :.::.. :.::. .:
XP_005 RNLLVDGETGESFPAQFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQ
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pF1KB6 LLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAILL-CPNNT
        : :  : .   .. .   .  :   :   :..: .  .  :.:.:.::.: :  : .. 
XP_005 DLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDF
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       .  .: ...    :.  .: :  :..:. ..:. .::::: :. :  :   : :.   : 
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pF1KB6 D-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNTSV-----
       :     ::  ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. .:.     
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pF1KB6 --------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHL
                      .:..: :  .:::.:: .: :. . .. ::::: : :: ::.:..
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pF1KB6 DQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSR
       . .:    . : . .:: :::::.. :.: .:.. : :   :. . . .  .  :...::
XP_005 SYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADFLDKQMSR
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pF1KB6 DEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRK
       ::.::.:..:::. :.:...::. :: .::.: :.. :.:::::::::::::.:::::::
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pF1KB6 RKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPV
       :::: ::::: :: .::  :  : ::...  ...  ::::...::...:.::::..::: 
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pF1KB6 NPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK  
       .:..:::: . :::.:..:. .. .  ... .: : .  
XP_005 SPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
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>>NP_001317191 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid 2  (742 aa)
 initn: 1077 init1: 626 opt: 844  Z-score: 673.2  bits: 135.1 E(85289): 9.3e-31
Smith-Waterman score: 1215; 36.8% identity (61.7% similar) in 741 aa overlap (17-694:15-740)

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                       .:.:::: :.:::.: ::   :::   :.. .:   :: ::::.
NP_001   MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPP---LREIIL---GP-SSAYT
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        . :    ..  :.:    .:::. .::     . .:: .::::    :: : :.:::::
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pF1KB6 SVAAGSADEAHGLLGAAAASSTGGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGPLDAG
           ::.. ..   : :  ::.:   ..  :.:   :.. :: : : .  .: . :. .:
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pF1KB6 EEEKAPAEPTA----QVPDAGGCASEENGVLREKHEAV-----DHSSQHEENEERVSAQK
       .  :   .       :  : :.     .   :.:.. :     : . :     : . :  
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pF1KB6 ENSLQQNDDDEN----------KIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGTDTSFSLEDLFQ
       .: : ...  :.          .:.:    :.:  . . :     :.::.. :.::. .:
NP_001 RNLLVDGETGESFPAQFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQ
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pF1KB6 LLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAILL-CPNNT
        : :  : .   .. .   .  :   :   :..: .  .  :.:.:.::.: :  : .. 
NP_001 DLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDF
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       .  .: ...    :.  .: :  :..:. ..:. .::::: :. :  :   : :.   : 
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pF1KB6 D-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNTSV-----
       :     ::  ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. .:.     
NP_001 DPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEG
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pF1KB6 --------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHL
                      .:..: :  .:::.:: .: :. . .. ::::: : :: ::.:..
NP_001 SSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-YQPEYSKFCRM
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pF1KB6 DQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSR
       . .:    . : . .:: :::::.. :.: .:.. : :   :. . . .  .  :...::
NP_001 SYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADFLDKQMSR
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pF1KB6 DEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRK
       ::.::.:..:::. :.:...::. :: .::.: :.. :.:::::::::::::.:::::::
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pF1KB6 RKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPV
       :::: ::::: :: .::  :  : ::...  ...  ::::...::...:.::::..::: 
NP_001 RKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPY
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pF1KB6 NPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK  
       .:..:::: . :::.:..:. .. .  ... .: : .  
NP_001 SPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
           710       720       730       740  

>>NP_001317190 (OMIM: 163260) nuclear factor erythroid 2  (761 aa)
 initn: 1073 init1: 626 opt: 844  Z-score: 673.0  bits: 135.1 E(85289): 9.5e-31
Smith-Waterman score: 1133; 35.2% identity (61.0% similar) in 738 aa overlap (36-694:36-759)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB6 RWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALSPF---
                                     :::   :.. .:   :: ::::. . :   
NP_001 KYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPP---LREIIL---GP-SSAYTQTQFHNL
          10        20        30           40            50        

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pF1KB6 -SASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGSA
        ..  :.:    .:::. .::     . .:: .::::    :: : :.:::::    ::.
NP_001 RNTLDGYG----IHPKSIDLDNYFTAR-RLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSV
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pF1KB6 DEAHGLLGAAAASSTGGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGP-----------
       . ..   : :  ::.:   ..  :.:   :.. :: : : .  .: . :           
NP_001 SGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDID
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pF1KB6 LDAGEE------EKAPAEPTAQVPDAG--------GCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEE
       : ::.:      ..   .   .. :.:        :  .   ..: . . . .  .:   
NP_001 LGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPS
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pF1KB6 NEERVSAQKENSLQ---------QNDD---DENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGT
       .:.... . :. :.         .: .   : ..:.:    :.:  . . :     :.::
NP_001 GEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGT
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pF1KB6 DTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLH
       .. :.::. .: : :  : .   .. .   .  :   :   :..: .  .  :.:.:.::
NP_001 ESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLH
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pF1KB6 EAILL-CPNNTFRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNH
       .: :  : .. .  .: ...    :.  .: :  :..:. ..:. .::::: :. :  : 
NP_001 QASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNG
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pF1KB6 MRNLTSQDLLYD-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSS
         : :.   : :     ::  ..:::.::.:: :..:.:...::: .: :::::::::::
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       :. .:.                    .:..: :  .:::.:: .: :. . .. ::::: 
NP_001 HSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-
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pF1KB6 YYPEPSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSR
       : :: ::.:... .:    . : . .:: :::::.. :.: .:.. : :   :. . . .
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         .  :...::::.::.:..:::. :.:...::. :: .::.: :.. :.::::::::::
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       :::.::::::::::: ::::: :: .::  :  : ::...  ...  ::::...::...:
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       .::::..::: .:..:::: . :::.:..:. .. .  ... .: : .  
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>>XP_005257468 (OMIM: 163260) PREDICTED: nuclear factor   (761 aa)
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pF1KB6 -SASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGSA
        ..  :.:    .:::. .::     . .:: .::::    :: : :.:::::    ::.
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       . ..   : :  ::.:   ..  :.:   :.. :: : : .  .: . :           
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pF1KB6 NEERVSAQKENSLQ---------QNDD---DENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGT
       .:.... . :. :.         .: .   : ..:.:    :.:  . . :     :.::
XP_005 GEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGT
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pF1KB6 EAILL-CPNNTFRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNH
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pF1KB6 MRNLTSQDLLYD-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSS
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pF1KB6 HNNTSV-------------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGG
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XP_005 HSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-
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pF1KB6 YYPEPSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSR
       : :: ::.:... .:    . : . .:: :::::.. :.: .:.. : :   :. . . .
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pF1KB6 YLEDTDRNLSRDEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRG
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pF1KB6 KNKVAAQNCRKRKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIF
       :::.::::::::::: ::::: :: .::  :  : ::...  ...  ::::...::...:
XP_005 KNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVF
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       .::::..::: .:..:::: . :::.:..:. .. .  ... .: : .  
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>>NP_001300833 (OMIM: 600492) nuclear factor erythroid 2  (505 aa)
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NP_001 PSPEAKLTEVDNYH--FYSSIP---SMEKEVGNCSPHFLNAFE-DSFSSILSTEDPN-QL
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       . .. : . :.    : .. ..:.. : ..: :   .   : ..:.  .   :.. .:. 
NP_001 TVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSMP--SPATLSHSLSELLNGPIDVSDLSL
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NP_001 ELDSAPGSVKQNGPKTPVH---SSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDAQCENTPEKELPVSPGH
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NP_001 RKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVDFNEMMSKEQFNEAQLA
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       :::::::::::::::::::::::. :..::.:. .:. .:: : .:... .:.....:..
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pF1KB6 LHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK
       :  :: ..:: :::..:.: .:..:.:: :.::....:::                 
NP_001 LSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN        
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>>NP_001300832 (OMIM: 600492) nuclear factor erythroid 2  (532 aa)
 initn: 591 init1: 549 opt: 604  Z-score: 486.6  bits: 100.1 E(85289): 2.3e-20
Smith-Waterman score: 604; 32.1% identity (63.7% similar) in 430 aa overlap (262-677:111-523)

             240       250       260       270          280        
pF1KB6 KIAEKPDWEAEKTTESRNERHLNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPEN---SLEGISLGDIPLP
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NP_001 PVFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMV
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pF1KB6 GSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAILLC-PN--NTFRRDPTARTSQSQEPFLQL
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NP_001 PSPEAKLTEVDNYH--FYSSIP---SMEKEVGNCSPHFLNAFE-DSFSSILSTEDPN-QL
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pF1KB6 NSHTTNPEQTLP---GTNL-TGFLS-P-VDNHMRNLTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLAT
       . .. : . :.    : .. ..:.. : ..: :   .   : ..:.  .   :.. .:. 
NP_001 TVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSMP--SPATLSHSLSELLNGPIDVSDLSL
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pF1KB6 EDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNTSVIKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHH
          :.     .  .  :::::.::..: . .:  .:  : :  :   .:  .: :    .
NP_001 CKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSVASPEHSVESSSYGDT-LLGL-SDSEV---E
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