FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6269, 694 aa 1>>>pF1KB6269 694 - 694 aa - 694 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7402+/-0.000939; mu= 9.6228+/- 0.057 mean_var=155.7536+/-31.606, 0's: 0 Z-trim(111.4): 20 B-trim: 542 in 1/50 Lambda= 0.102767 statistics sampled from 12330 (12345) to 12330 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16 Scan time: 3.700 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 ( 694) 4671 704.7 1.1e-202 CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 772) 846 137.6 6.4e-32 CCDS82150.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 742) 844 137.3 7.7e-32 CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 761) 844 137.3 7.8e-32 CCDS46458.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 582) 604 101.7 3.3e-21 CCDS46457.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 589) 604 101.7 3.3e-21 CCDS42782.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 605) 604 101.7 3.4e-21 CCDS8876.1 NFE2 gene_id:4778|Hs108|chr12 ( 373) 532 90.9 3.7e-18 >>CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 (694 aa) initn: 4671 init1: 4671 opt: 4671 Z-score: 3752.0 bits: 704.7 E(32554): 1.1e-202 Smith-Waterman score: 4671; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 PFSASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 PFSASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 ADEAHGLLGAAAASSTGGAGASVDGGSQAVQGGGGDPRAARSGPLDAGEEEKAPAEPTAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ADEAHGLLGAAAASSTGGAGASVDGGSQAVQGGGGDPRAARSGPLDAGEEEKAPAEPTAQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 VPDAGGCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEERVSAQKENSLQQNDDDENKIAEKPDWE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 VPDAGGCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEERVSAQKENSLQQNDDDENKIAEKPDWE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 AEKTTESRNERHLNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 AEKTTESRNERHLNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 YHVNFSQAISQDVNLHEAILLCPNNTFRRDPTARTSQSQEPFLQLNSHTTNPEQTLPGTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 YHVNFSQAISQDVNLHEAILLCPNNTFRRDPTARTSQSQEPFLQLNSHTTNPEQTLPGTN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 LTGFLSPVDNHMRNLTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LTGFLSPVDNHMRNLTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 LSLDSSHNNTSVIKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LSLDSSHNNTSVIKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQ 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 SDSDFHGDLTFQHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 SDSDFHGDLTFQHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQ 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 RAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 RAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKL 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 DIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 DIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPN 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KB6 HYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 HYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK 670 680 690 >>CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (772 aa) initn: 1077 init1: 626 opt: 846 Z-score: 686.5 bits: 137.6 E(32554): 6.4e-32 Smith-Waterman score: 1107; 34.7% identity (60.2% similar) in 734 aa overlap (51-694:45-770) 30 40 50 60 70 pF1KB6 LSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALSPF----SASGGWGRAGHLHP :: ::::. . : .. :.: .:: CCDS11 FTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGP-SSAYTQTQFHNLRNTLDGYG----IHP 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KB6 KGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGSADEAHGLLGAAAASST :. .:: . .:: .:::: :: : :.::::: ::.. .. : : ::. CCDS11 KSIDLDNYFTAR-RLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNSGLALESSS 70 80 90 100 110 120 140 150 160 pF1KB6 GGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGP----------------------LDAG : .. :.: :.. :: : : . .: . : : :: CCDS11 GLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAG 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KB6 EE------EKAPAEPTAQVPDAG--------GCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEER .: .. . .. :.: : . ..: . . . . .: .:.. CCDS11 REVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQ 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 pF1KB6 VSAQKENSLQ---------QNDD---DENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGTDTSF .. . :. :. .: . : ..:.: :.: . . : :.::.. : CCDS11 TALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPF 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 SLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAIL .::. .: : : : . .. . . : : :..: . . :.:.:.::.: : CCDS11 DLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASL 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 pF1KB6 L-CPNNTFRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNHMRNL : .. . .: ... :. .: : :..:. ..:. .::::: :. : : : CCDS11 GGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTAND 370 380 390 400 410 420 380 390 400 410 420 430 pF1KB6 TSQDLLYD-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNT :. : : :: ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. . CCDS11 TAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPS 430 440 450 460 470 480 440 450 460 470 pF1KB6 SV-------------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPE :. .:..: : .:::.:: .: :. . .. ::::: : :: CCDS11 SLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-YQPE 490 500 510 520 530 540 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 PSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLED ::.:... .: . : . .:: :::::.. :.: .:.. : : :. . . . . CCDS11 YSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADF 550 560 570 580 590 600 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 TDRNLSRDEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKV :...::::.::.:..:::. :.:...::. :: .::.: :.. :.:::::::::::::. 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CCDS82 DLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDF 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KB6 FRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNHMRNLTSQDLLY . .: ... :. .: : :..:. ..:. .::::: :. : : : :. : CCDS82 LLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELP 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 pF1KB6 D-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNTSV----- : :: ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. .:. CCDS82 DPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEG 410 420 430 440 450 460 440 450 460 470 pF1KB6 --------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHL .:..: : .:::.:: .: :. . .. ::::: : :: ::.:.. CCDS82 SSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-YQPEYSKFCRM 470 480 490 500 510 520 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 DQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSR . .: . : . .:: :::::.. :.: .:.. : : :. . . . . :...:: CCDS82 SYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADFLDKQMSR 530 540 550 560 570 580 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 DEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRK ::.::.:..:::. :.:...::. :: .::.: :.. :.:::::::::::::.::::::: CCDS82 DEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRK 590 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 650 pF1KB6 RKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPV :::: ::::: :: .:: : : ::... ... ::::...::...:.::::..::: CCDS82 RKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPY 650 660 670 680 690 700 660 670 680 690 pF1KB6 NPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK .:..:::: . :::.:..:. .. . ... .: : . CCDS82 SPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK 710 720 730 740 >>CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (761 aa) initn: 1073 init1: 626 opt: 844 Z-score: 685.0 bits: 137.3 E(32554): 7.8e-32 Smith-Waterman score: 1133; 35.2% identity (61.0% similar) in 738 aa overlap (36-694:36-759) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 RWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALSPF--- ::: :.. .: :: ::::. . : CCDS82 KYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPP---LREIIL---GP-SSAYTQTQFHNL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 -SASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGSA .. :.: .:::. .:: . .:: .:::: :: : :.::::: ::. CCDS82 RNTLDGYG----IHPKSIDLDNYFTAR-RLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 pF1KB6 DEAHGLLGAAAASSTGGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGP----------- . .. : : ::.: .. :.: :.. :: : : . .: . : CCDS82 SGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDID 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KB6 LDAGEE------EKAPAEPTAQVPDAG--------GCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEE : ::.: .. . .. :.: : . ..: . . . . .: CCDS82 LGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPS 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 pF1KB6 NEERVSAQKENSLQ---------QNDD---DENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGT .:.... . :. :. .: . : ..:.: :.: . . : :.:: CCDS82 GEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGT 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KB6 DTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLH .. :.::. .: : : : . .. . . : : :..: . . :.:.:.:: CCDS82 ESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLH 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KB6 EAILL-CPNNTFRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNH .: : : .. . .: ... :. .: : :..:. ..:. .::::: :. : : CCDS82 QASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNG 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 pF1KB6 MRNLTSQDLLYD-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSS : :. : : :: ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::: CCDS82 TANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSS 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 pF1KB6 HNNTSV-------------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGG :. .:. .:..: : .:::.:: .: :. . .. ::::: CCDS82 HSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG- 480 490 500 510 520 530 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 YYPEPSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSR : :: ::.:... .: . : . .:: :::::.. :.: .:.. : : :. . . . 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CCDS88 TNERERLLRARGEADRTLEVMRQQLTELYRDIFQHLRDESGNSYSPEEYALQQAADGTIF 310 320 330 340 350 360 680 690 pF1KB6 IVPKELVASGHKKETQKGKRK .::. CCDS88 LVPRGTKMEATD 370 694 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 05:24:40 2016 done: Sun Nov 6 05:24:40 2016 Total Scan time: 3.700 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]