FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6756, 812 aa 1>>>pF1KE6756 812 - 812 aa - 812 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3645+/-0.00063; mu= 20.6990+/- 0.039 mean_var=82.8615+/-16.687, 0's: 0 Z-trim(105.9): 302 B-trim: 48 in 1/52 Lambda= 0.140896 statistics sampled from 13758 (14064) to 13758 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.48), E-opt: 0.2 (0.165), width: 16 Scan time: 6.840 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011513669 (OMIM: 611785) PREDICTED: ATP-binding ( 812) 5161 1060.3 0 NP_848654 (OMIM: 611785) ATP-binding cassette sub- ( 812) 5161 1060.3 0 NP_001157413 (OMIM: 611785) ATP-binding cassette s (1257) 5161 1060.5 0 NP_000434 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1279) 2425 504.3 1.3e-141 XP_011514611 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1287) 2422 503.7 2e-141 NP_061337 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1286) 2401 499.5 3.9e-140 XP_011514617 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1074) 2398 498.8 5.3e-140 XP_016867812 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1294) 2398 498.9 6.1e-140 XP_011514610 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1294) 2398 498.9 6.1e-140 NP_000918 (OMIM: 120080,171050,612244) multidrug r (1280) 2372 493.6 2.3e-138 XP_011514612 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1259) 2088 435.8 5.5e-121 XP_011510383 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE ( 763) 1904 398.3 6.9e-110 XP_016860656 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE ( 916) 1904 398.3 7.9e-110 XP_016860655 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1098) 1904 398.4 9e-110 NP_003733 (OMIM: 601847,603201,605479) bile salt e (1321) 1904 398.4 1e-109 XP_006712880 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1335) 1904 398.5 1e-109 XP_011510380 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1355) 1904 398.5 1.1e-109 XP_011510379 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1355) 1904 398.5 1.1e-109 XP_016860654 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1314) 1669 350.7 2.5e-95 XP_011514615 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1232) 1342 284.2 2.4e-75 NP_061338 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1232) 1342 284.2 2.4e-75 XP_011514614 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1247) 953 205.1 1.5e-51 XP_011514613 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1251) 949 204.3 2.7e-51 NP_001278951 (OMIM: 170260,604571) antigen peptide ( 547) 847 183.3 2.5e-45 NP_000584 (OMIM: 170260,604571) antigen peptide tr ( 808) 847 183.4 3.4e-45 NP_001157465 (OMIM: 611785) ATP-binding cassette s ( 126) 784 170.0 6e-42 NP_001157414 (OMIM: 611785) ATP-binding cassette s ( 131) 784 170.0 6.2e-42 XP_011510382 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE ( 936) 721 157.9 2e-37 XP_005253343 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) P (1549) 722 158.2 2.5e-37 XP_005253345 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) P (1549) 722 158.2 2.5e-37 XP_011518847 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) P (1549) 722 158.2 2.5e-37 NP_064693 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) ATP- (1549) 722 158.2 2.5e-37 XP_005253341 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) P (1549) 722 158.2 2.5e-37 XP_005253346 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) P (1536) 721 158.0 2.8e-37 NP_005682 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) ATP- (1549) 711 156.0 1.2e-36 XP_005253344 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) P (1549) 711 156.0 1.2e-36 XP_006719088 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) P (1536) 710 155.8 1.3e-36 XP_005253347 (OMIM: 239850,601439,608569,614050) P (1502) 683 150.3 5.9e-35 NP_001269222 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette s ( 630) 658 144.9 1e-33 NP_009119 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette sub- ( 718) 658 145.0 1.1e-33 NP_001269220 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette s ( 735) 658 145.0 1.2e-33 XP_011542438 (OMIM: 605454) PREDICTED: ATP-binding ( 442) 622 137.5 1.3e-31 XP_011542437 (OMIM: 605454) PREDICTED: ATP-binding ( 559) 622 137.6 1.5e-31 NP_036221 (OMIM: 605454) ATP-binding cassette sub- ( 738) 622 137.7 1.9e-31 NP_005680 (OMIM: 111600,605452,609153,614497,61540 ( 842) 568 126.7 4.2e-28 XP_016874593 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 485) 558 124.5 1.1e-27 XP_011536400 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 548) 558 124.5 1.2e-27 XP_005253615 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 548) 558 124.5 1.2e-27 NP_001229942 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette s ( 703) 558 124.6 1.5e-27 NP_062570 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette sub- ( 723) 558 124.6 1.5e-27 >>XP_011513669 (OMIM: 611785) PREDICTED: ATP-binding cas (812 aa) initn: 5161 init1: 5161 opt: 5161 Z-score: 5671.5 bits: 1060.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5161; 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100.0% identity (100.0% similar) in 812 aa overlap (1-812:446-1257) 10 20 30 pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFG :::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TVALVGLNGSGKSTVVQLLQRLYDPDDGFIMVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFG 420 430 440 450 460 470 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TTISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TTISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAI 480 490 500 510 520 530 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 ARALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 ARALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTL 540 550 560 570 580 590 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 KDGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQDIKKADEQMESMTYSTERKTNSLPLHSVKSIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KDGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQDIKKADEQMESMTYSTERKTNSLPLHSVKSIK 600 610 620 630 640 650 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 SDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SDFIDKAEESTQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAK 660 670 680 690 700 710 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 IITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IITMFGNNDKTTLKHDAEIYSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKA 720 730 740 750 760 770 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 MLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MLYQDIAWFDEKENSTGGLTTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGW 780 790 800 810 820 830 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 EMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EMTFLILSIAPVLAVTGMIETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKA 840 850 860 870 880 890 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 FEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 FEQMYEEMLQTQHRNTSKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMF 900 910 920 930 940 950 520 530 540 550 560 570 pF1KE6 IVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IVFTAIAYGAMAIGETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNL 960 970 980 990 1000 1010 580 590 600 610 620 630 pF1KE6 EFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EFREVSFFYPCRPDVFILRGLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 640 650 660 670 680 690 pF1KE6 FDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 FDGVDAKELNVQWLRSQIAIVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIH 1080 1090 1100 1110 1120 1130 700 710 720 730 740 750 pF1KE6 SFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIARALLQKPKILLLDEATSALDNDSEKVVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SFIEGLPEKYNTQVGLKGAQLSGGQKQRLAIARALLQKPKILLLDEATSALDNDSEKVVQ 1140 1150 1160 1170 1180 1190 760 770 780 790 800 810 pF1KE6 HALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVVLHNGKIKEQGTHQELLRNRDIYFKLVNAQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HALDKARTGRTCLVVTHRLSAIQNADLIVVLHNGKIKEQGTHQELLRNRDIYFKLVNAQS 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE6 VQ :: NP_001 VQ >-- initn: 653 init1: 368 opt: 683 Z-score: 749.6 bits: 150.2 E(85289): 5.2e-35 Smith-Waterman score: 683; 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NP_001 MENSERAEEMQENYQRNGTAEEQPKLRKEAVGSIEIFRFA--DGLDITL 10 20 30 40 250 260 270 280 290 pF1KE6 VVLGTLASVLNGTVHPVFSIIFAKI-------------ITMFGNNDKTT--LKHDAEIYS ..:: :::..::. :.. ...... : . : .. :..: . . NP_001 MILGILASLVNGACLPLMPLVLGEMSDNLISGCLVQTNTTNYQNCTQSQEKLNEDMTLLT 50 60 70 80 90 100 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 MIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGLTT . .: .:: .. ..: .. .. : :.:. :...: :::.::: . : :.: NP_001 LYYVGIGVAALIFGYIQISLWIITAARQTKRIRKQFFHSVLAQDIGWFDSCD--IGELNT 110 120 130 140 150 160 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 ILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMIET .. :: .:. . :..:..: :: ....... .... ::..:.. :: .:.. ... . NP_001 RMTDDIDKISDGIGDKIALLFQNMSTFSIGLAVGLVKGWKLTLVTLSTSPLIMASAAACS 170 180 190 200 210 220 420 430 440 450 460 pF1KE6 AAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQH-----RNT . ....:. . ..:: .: :.: .:::.... .. : : . :. . :. NP_001 RMVISLTSKELSAYSKAGAVAEEVLSSIRTVIAFRAQEKELQRYTQNLKDAKDFGIKRTI 230 240 250 260 270 280 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 SKKAQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGR--MTPEGMFIVFTAIAYGAMAIG ..:... :. : : .. .:. .: .:. :: :. .: .. :: .. .... :: NP_001 ASKVSL-GAVYFFMNG----TYGLAFWYGTSLILNGEPGYTIGTVLAVFFSVIHSSYCIG 290 300 310 320 330 340 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 ETLVLAPEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPD .. .. :...: :.: ...:::.::. : : ::.. ::..::..::: :: ::. 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NP_000 RALVRNPKILLLDEATSALDTESEAEVQAALDKAREGRTTIVIAHRLSTVRNADVIAGFE 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 pF1KE6 DGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQ----DIKKADEQMESMTYSTERKTNS----LPL ::...:.:.:.::: :.:.:..:: : .:.. . .... .:. :. : NP_000 DGVIVEQGSHSELMKKEGVYFKLVNMQTSGSQIQSEEFELNDEKAATRMAPNGWKSRLFR 610 620 630 640 650 660 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 HSV-KSIK-SDFIDKAEE-STQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTV ::. :..: :.. .:. . :.. : ..: ::.::.::::: :::. :.::. .. :: . 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XP_011 FMSLGTIMAIAHGSGLPLMMIVFGEMTDKFVDTAGNFSFPVNFSLSLLNPGKILEEEMTR 60 70 80 90 100 110 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 YSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGL :.. . ::. .:. ..: :. :. ..:. :.:.: :.:.::: :.: : XP_011 YAYYYSGLGAGVLVAAYIQVSFWTLAAGRQIRKIRQKFFHAILRQEIGWFD--INDTTEL 120 130 140 150 160 170 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 TTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMI .: :. ::..:. . :...:.. : .... . :..:: ::..:..:..:.:.:.... . XP_011 NTRLTDDISKISEGIGDKVGMFFQAVATFFAGFIVGFIRGWKLTLVIMAISPILGLSAAV 180 190 200 210 220 230 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 ETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKK . ...:..:. .:: .: ::: :::.... .. . :.. :.. .. :: XP_011 WAKILSAFSDKELAAYAKAGAVAEEALGAIRTVIAFGGQNKELERYQKHLENAKEIGIKK 240 250 260 270 280 290 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 AQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVL : . .... .:: .:: .: .:. :. . ..: . . :: .: ::...:.. XP_011 AISANISMGIAFLLIYASYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMTVFFSILIGAFSVGQAAPC 300 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 APEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILR ...:...: .: .....:.::: :..:.:::. .::::: .: : :: : .: ::. XP_011 IDAFANARGAAYVIFDIIDNNPKIDSFSERGHKPDSIKGNLEFNDVHFSYPSRANVKILK 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 GLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIA ::.:... :.:::.::::::::::.:::.:::::: .: . 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NP_061 GLNLKVQSGQTVALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIG 420 430 440 450 460 470 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 IVPQEPVLFNCSIAENIAYGDNSRVVPLDEIKEAANAANIHSFIEGLPEKYNTQVGLKGA NP_061 VVSQEPVLFSTTIAENICYGRGNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQL 480 490 500 510 520 530 >>XP_011514617 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) PREDI (1074 aa) initn: 3158 init1: 1552 opt: 2398 Z-score: 2634.5 bits: 498.8 E(85289): 5.3e-140 Smith-Waterman score: 3138; 58.3% identity (85.2% similar) in 824 aa overlap (2-807:235-1058) 10 20 30 pF1KE6 MVDENDIRALNVRHYRDHIGVVSQEPVLFGT .: .::: .:: . :. :::::::::::.: XP_011 VALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIGVVSQEPVLFST 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 TISNNIKYGRDDVTDEEMERAAREANAYDFIMEFPNKFNTLVGEKGAQMSGGQKQRIAIA ::..:: ::: .:: .:...:..:::::.:::..:.::.:::::.:::.::::::::::: XP_011 TIAENICYGRGNVTMDEIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIA 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RALVRNPKILILDEATSALDSESKSAVQAALEKASKGRTTIVVAHRLSTIRSADLIVTLK ::::::::::.:::::::::.::.. :::::.:: .::::::.::::::.:.::.:. .. 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XP_016 RALVRNPKILLLDEATSALDTESEAEVQAALDKAREGRTTIVIAHRLSTVRNADVIAGFE 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 pF1KE6 DGMLAEKGAHAELMAKRGLYYSLVMSQ----DIKKADEQMESMTYSTERKTNS----LPL ::...:.:.:.::: :.:.:..:: : .:.. . .... .:. :. : XP_016 DGVIVEQGSHSELMKKEGVYFKLVNMQTSGSQIQSEEFELNDEKAATRMAPNGWKSRLFR 610 620 630 640 650 660 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 HSV-KSIK-SDFIDKAEE-STQSKEISLPEVSLLKILKLNKPEWPFVVLGTLASVLNGTV ::. :..: :.. .:. . :.. : ..: ::.::.::::: :::. :.::. .. :: . 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XP_016 AISANISMGIAFLLIYASYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMTVFFSILIGAFSVGQAAPC 300 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 APEYSKAKSGAAHLFALLEKKPNIDSRSQEGKKPDTCEGNLEFREVSFFYPCRPDVFILR ...:...: .: .....:.::: :..:.:::. .::::: .: : :: : .: ::. XP_016 IDAFANARGAAYVIFDIIDNNPKIDSFSERGHKPDSIKGNLEFNDVHFSYPSRANVKILK 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 GLSLSIERGKTVAFVGSSGCGKSTSVQLLQRLYDPVQGQVLFDGVDAKELNVQWLRSQIA ::.:... :.:::.::::::::::.:::.:::::: .: . 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XP_011 FMSLGTIMAIAHGSGLPLMMIVFGEMTDKFVDTAGNFSFPVNFSLSLLNPGKILEEEMTR 60 70 80 90 100 110 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 YSMIFVILGVICFVSYFMQGLFYGRAGEILTMRLRHLAFKAMLYQDIAWFDEKENSTGGL :.. . ::. .:. ..: :. :. ..:. :.:.: :.:.::: :.: : XP_011 YAYYYSGLGAGVLVAAYIQVSFWTLAAGRQIRKIRQKFFHAILRQEIGWFD--INDTTEL 120 130 140 150 160 170 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 TTILAIDIAQIQGATGSRIGVLTQNATNMGLSVIISFIYGWEMTFLILSIAPVLAVTGMI .: :. ::..:. . :...:.. : .... . :..:: ::..:..:..:.:.:.... . XP_011 NTRLTDDISKISEGIGDKVGMFFQAVATFFAGFIVGFIRGWKLTLVIMAISPILGLSAAV 180 190 200 210 220 230 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 ETAAMTGFANKDKQELKHAGKIATEALENIRTIVSLTREKAFEQMYEEMLQTQHRNTSKK . ...:..:. .:: .: ::: :::.... .. . :.. :.. .. :: XP_011 WAKILSAFSDKELAAYAKAGAVAEEALGAIRTVIAFGGQNKELERYQKHLENAKEIGIKK 240 250 260 270 280 290 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 AQIIGSCYAFSHAFIYFAYAAGFRFGAYLIQAGRMTPEGMFIVFTAIAYGAMAIGETLVL : . .... .:: .:: .: .:. :. . ..: . . :: .: ::...:.. 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