Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2447
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2447, 852 aa
1>>>pF1KE2447 852 - 852 aa - 852 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2419+/-0.000469; mu= 21.7013+/- 0.029
mean_var=71.5131+/-14.219, 0's: 0 Z-trim(109.9): 21 B-trim: 89 in 1/54
Lambda= 0.151664
statistics sampled from 18113 (18131) to 18113 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 11.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_877439 (OMIM: 612646) metastasis-associated in ( 852) 5616 1238.9 0
XP_011509195 (OMIM: 605611) PREDICTED: SH3 domain- ( 963) 2144 479.2 3.9e-134
XP_011509194 (OMIM: 605611) PREDICTED: SH3 domain- ( 963) 2144 479.2 3.9e-134
XP_011509193 (OMIM: 605611) PREDICTED: SH3 domain- ( 963) 2144 479.2 3.9e-134
NP_055336 (OMIM: 605611) SH3 domain-binding protei ( 963) 2144 479.2 3.9e-134
XP_011509196 (OMIM: 605611) PREDICTED: SH3 domain- ( 963) 2144 479.2 3.9e-134
>>NP_877439 (OMIM: 612646) metastasis-associated in colo (852 aa)
initn: 5616 init1: 5616 opt: 5616 Z-score: 6635.6 bits: 1238.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5616; 99.9% identity (99.9% similar) in 852 aa overlap (1-852:1-852)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLITERKHFRSGRIAQSMSEANLIDMEAGKLSKSCNITECQDPDLLHNWPDAFTLRGNNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 MLITERKHFRSGRIAQSMSEANLIDMEAGKLSKSCNITECQDPDLLHNWPDAFTLRGNNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SKVANPFWNQLSASNPFLDDITQLRNNRKRNNISILKEDPFLFCREIENGNSFDSSGDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 SKVANPFWNQLSASNPFLDDITQLRNNRKRNNISILKEDPFLFCREIENGNSFDSSGDEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVHQLLRQTSSRNSGRSKSVSELLDILDDTAHAHQSIHNSDQILLHDLEWLKNDREAYKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 DVHQLLRQTSSRNSGRSKSVSELLDILDDTAHAHQSIHNSDQILLHDLEWLKNDREAYKM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AWLSQRQLARSCLDLNTISQSPGWAQTQLAEVTIACKVNHQGGSVQLPESDITVHVPQGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 AWLSQRQLARSCLDLNTISQSPGWAQTQLAEVTIACKVNHQGGSVQLPESDITVHVPQGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VAVGEFQEVSLRAFLDPPHMLNHDLSCTVSPLLEIMLGNLNTMEALLLEMKIGAEVRKDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 VAVGEFQEVSLRAFLDPPHMLNHDLSCTVSPLLEIMLGNLNTMEALLLEMKIGAEVRKDP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FSQVMTEMVCLHSLGKEGPFKVLSNCYIYKDTIQVKLIDLSQVMYLVVAAQAKALPSPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 FSQVMTEMVCLHSLGKEGPFKVLSNCYIYKDTIQVKLIDLSQVMYLVVAAQAKALPSPAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TIWDYIHKTTSIGIYGPKYIHPSFTVVLTVCGHNYMPGQLTISDIKKGGKNISPVVFQLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 TIWDYIHKTTSIGIYGPKYIHPSFTVVLTVCGHNYMPGQLTISDIKKGGKNISPVVFQLW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GKQSFLLDKPQDLSISIFSCDPDFEVKTEGERKEIKQKQLEAGEVVHQQFLFSLVEHREM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 GKQSFLLDKPQDLSISIFSCDPDFEVKTEGERKEIKQKQLEAGEVVHQQFLFSLVEHREM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HLFDFCVQVEPPNGEPVAQFSITTPDPTPNLKRLSNLPGYLQKKEEIKSAPLSPKILVKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 HLFDFCVQVEPPNGEPVAQFSITTPDPTPNLKRLSNLPGYLQKKEEIKSAPLSPKILVKY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 PTFQDKTLNFSNYGVTLKAVLRQSKIDYFLEYFKGDTIALLGEGKVKAIGQSKVKEWYVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 PTFQDKTLNFSNYGVTLKAVLRQSKIDYFLEYFKGDTIALLGEGKVKAIGQSKVKEWYVG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VLRGKIGLVHCKNVKVISKEQVMFMSDSVFTTRNLLEQIVLPLKKLTYIYSVVLTLVSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 VLRGKIGLVHCKNVKVISKEQVMFMSDSVFTTRNLLEQIVLPLKKLTYIYSVVLTLVSEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VYDWKVLADVLGYSHLSLEDFDQIQADKESEKVSYVIKKLKEDCHTERNTRKFLYELIVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 VYDWKVLADVLGYSHLSLEDFDQIQADKESEKVSYVIKKLKEDCHTERNTRKFLYELIVA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LLKMDCQELVARLIQEAAVLTSAVKLGKGWRELAEKLVRLTKQQMEAYEIPHRGNTGDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 LLKMDCQELVARLIQEAAVLTSAVKLGKGWRELAEKLVRLTKQQMEAYEIPHRGNTGDVA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VEMMWKPAYDFLYTWSAHYGNNYTDVLQDLQSALDRMKNPVTKHWRELTGVLILVNSLEV
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_877 VEMMWKPAYDFLYTWSAHYGNNYRDVLQDLQSALDRMKNPVTKHWRELTGVLILVNSLEV
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE2 LRVTAFSTSEEV
::::::::::::
NP_877 LRVTAFSTSEEV
850
>>XP_011509195 (OMIM: 605611) PREDICTED: SH3 domain-bind (963 aa)
initn: 1979 init1: 961 opt: 2144 Z-score: 2529.1 bits: 479.2 E(85289): 3.9e-134
Smith-Waterman score: 2191; 42.7% identity (70.4% similar) in 868 aa overlap (12-851:102-958)
10 20 30 40
pF1KE2 MLITERKHFRSGRIAQSMSEANLIDMEAGKLSKSCNITECQ
: : .:. . .... . :: : : .
XP_011 TTLKFSKGDHLYVLDTSGGEWWYAHNTTEMGYIPSSYVQP--LNYRNSTLSDSGMIDNLP
80 90 100 110 120
50 60 70 80
pF1KE2 D-PD-------LLHNWPDAFTLRGNNASKVANPFWNQLSASNPFLDD----ITQLRNNRK
: :: :: .: : . : :. ::::: .. .::::. . .: .
XP_011 DSPDEVAKELELLGGWTDDKKVPGRMYSN--NPFWNGVQ-TNPFLNGNVPVMPSLDELNP
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130
pF1KE2 RNNISILKEDPFLFCREIENGNSFDSSG---DELDVHQLL-------RQTSSRNSGRSKS
......: : .. . .:.: ::: : . : :.. : :: :
XP_011 KSTVDLLLFDAGTSSFTESSSATTNSTGNIFDELPVTNGLHAEPPVRRDNPFFRSKRSYS
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 VSELLDILDDTAHAHQSIHNSDQILLHDLEWLKNDREAYKMAWLSQRQLARSCLDLNTIS
.::: ..:. . : : . : ... :: .. :::..:.::::: ::. ..
XP_011 LSEL-SVLQAKSDAPTSSSFFTGLKSPAPEQFQS-REDFRTAWLNHRKLARSCHDLDLLG
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 QSPGWAQTQLAEVTIACKVNHQGGSVQLPESDITVHVPQGHVAVGEFQEVSLRAFLDPPH
:::::.::: .:..:.::.. .::.::::...:..:::.:::: :: :..:..:.::::
XP_011 QSPGWGQTQAVETNIVCKLDSSGGAVQLPDTSISIHVPEGHVAPGETQQISMKALLDPPL
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 MLNHDLSCTVSPLLEIMLGNLNTMEALLLEMKIGAEVRKDPFSQVMTEMVCLHSLGKEGP
:: : ::..::.::. :.::.. ...::::..::...: ::. . . ::.: .::::
XP_011 ELNSDRSCSISPVLEVKLSNLEVKTSIILEMKVSAEIKNDLFSKSTVGLQCLRSDSKEGP
370 380 390 400 410 420
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 F-KVLSNCYIYKDTIQVKLIDLSQVMYLVVAAQAKALPSPAATIWDYIHKTTSIGIYGPK
. .: :: ::.:..: .: ::..:.:.. .. :. :.::.:.: ...:.::::
XP_011 YVSVPLNCSC-GDTVQAQLHNLEPCMYVAVVAHGPSILYPS-TVWDFINKKVTVGLYGPK
430 440 450 460 470 480
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 YIHPSFTVVLTVCGHNYMPGQLTISDIKKGGKNISPVVFQLWGKQSFLLDKPQDLSISIF
.::::: .:.:. ::. : : .:.. . . : .::..:::::..:.:..::::.. .:
XP_011 HIHPSFKTVVTIFGHDCAPKTLLVSEVTRQAPNPAPVALQLWGKHQFVLSRPQDLKVCMF
490 500 510 520 530 540
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SCDPDFEVKTEGERKEIKQKQLEAGEVVHQQFLFSLVEHREMHLFDFC--VQVEPPNGEP
: ..:::. . : .. ::. :.: ....: .. . .: :: :::. .
XP_011 SNMTNYEVKASEQAKVVRGFQLKLGKV--SRLIFPITSQNPNELSDFTLRVQVKDDQEAI
550 560 570 580 590 600
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 VAQFSITTPDPTPNLKRLSNLPGYLQKKEEIKSAPLSP-KILVKYPTFQDKTLNFSNYGV
..:: . ::.: :. . . ::.:. . ::: .:::::::. .. ..:
XP_011 LTQFCVQTPQPPPKSAIKPSGQRRFLKKNEVGKIILSPFATTTKYPTFQDRPVSSLKFGK
610 620 630 640 650 660
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 TLKAVLRQSKIDYFLEYFKGDTIALLGEGKVKAIGQSKVKEWYVGVLRGKIGLVHCKNVK
::.:.::.: :.::: ::: ::::.: .:. :: .::::.: .:..:::: :::
XP_011 LLKTVVRQNKNHYLLEYKKGDGIALLSEERVRLRGQLWTKEWYIGYYQGRVGLVHTKNVL
670 680 690 700 710 720
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 VISKEQVMFMSDSVFTTRNLLEQIVLPLKKLTYIYSVVLTLVSEKVYDWKVLADVLGYSH
:... . . : ..: :::::. : : :::::. : ::. :.. .:. .::.::: .
XP_011 VVGRARPSLCSGPELSTSVLLEQILRPCKFLTYIYASVRTLLMENISSWRSFADALGYVN
730 740 750 760 770 780
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 LSLEDFDQIQADKESEKVSYVIKKLKEDCH-TERNTRK-FLYELIVALLKMDCQELVARL
: : : . . :.: :.:. :..::::::. :: . :: : ::..:::::::: ::.::
XP_011 LPLTFFCRAELDSEPERVASVLEKLKEDCNNTENKERKSFQKELVMALLKMDCQGLVVRL
790 800 810 820 830 840
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 IQEAAVLTSAVKLGKGWRELAEKLVRLTKQQMEAYEIPHRGNTGDVAVEMMWKPAYDFLY
::. ..::.::.... ::::::::....::::.::: ::: .: : : :::::::::
XP_011 IQDFVLLTTAVEVAQRWRELAEKLAKVSKQQMDAYESPHRDRNGVVDSEAMWKPAYDFLL
850 860 870 880 890 900
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 TWSAHYGNNYTDVLQDLQSALDRMKNPVTKHWRELTGVLILVNSLEVLRVTAFSTSEEV
::: . :..: ::.:.:. .::.::::.::.:..:::.:::::::.:::..::: ...
XP_011 TWSHQIGDSYRDVIQELHLGLDKMKNPITKRWKHLTGTLILVNSLDVLRAAAFSPADQDD
910 920 930 940 950 960
XP_011 FVI
>>XP_011509194 (OMIM: 605611) PREDICTED: SH3 domain-bind (963 aa)
initn: 1979 init1: 961 opt: 2144 Z-score: 2529.1 bits: 479.2 E(85289): 3.9e-134
Smith-Waterman score: 2191; 42.7% identity (70.4% similar) in 868 aa overlap (12-851:102-958)
10 20 30 40
pF1KE2 MLITERKHFRSGRIAQSMSEANLIDMEAGKLSKSCNITECQ
: : .:. . .... . :: : : .
XP_011 TTLKFSKGDHLYVLDTSGGEWWYAHNTTEMGYIPSSYVQP--LNYRNSTLSDSGMIDNLP
80 90 100 110 120
50 60 70 80
pF1KE2 D-PD-------LLHNWPDAFTLRGNNASKVANPFWNQLSASNPFLDD----ITQLRNNRK
: :: :: .: : . : :. ::::: .. .::::. . .: .
XP_011 DSPDEVAKELELLGGWTDDKKVPGRMYSN--NPFWNGVQ-TNPFLNGNVPVMPSLDELNP
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130
pF1KE2 RNNISILKEDPFLFCREIENGNSFDSSG---DELDVHQLL-------RQTSSRNSGRSKS
......: : .. . .:.: ::: : . : :.. : :: :
XP_011 KSTVDLLLFDAGTSSFTESSSATTNSTGNIFDELPVTNGLHAEPPVRRDNPFFRSKRSYS
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 VSELLDILDDTAHAHQSIHNSDQILLHDLEWLKNDREAYKMAWLSQRQLARSCLDLNTIS
.::: ..:. . : : . : ... :: .. :::..:.::::: ::. ..
XP_011 LSEL-SVLQAKSDAPTSSSFFTGLKSPAPEQFQS-REDFRTAWLNHRKLARSCHDLDLLG
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 QSPGWAQTQLAEVTIACKVNHQGGSVQLPESDITVHVPQGHVAVGEFQEVSLRAFLDPPH
:::::.::: .:..:.::.. .::.::::...:..:::.:::: :: :..:..:.::::
XP_011 QSPGWGQTQAVETNIVCKLDSSGGAVQLPDTSISIHVPEGHVAPGETQQISMKALLDPPL
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 MLNHDLSCTVSPLLEIMLGNLNTMEALLLEMKIGAEVRKDPFSQVMTEMVCLHSLGKEGP
:: : ::..::.::. :.::.. ...::::..::...: ::. . . ::.: .::::
XP_011 ELNSDRSCSISPVLEVKLSNLEVKTSIILEMKVSAEIKNDLFSKSTVGLQCLRSDSKEGP
370 380 390 400 410 420
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 F-KVLSNCYIYKDTIQVKLIDLSQVMYLVVAAQAKALPSPAATIWDYIHKTTSIGIYGPK
. .: :: ::.:..: .: ::..:.:.. .. :. :.::.:.: ...:.::::
XP_011 YVSVPLNCSC-GDTVQAQLHNLEPCMYVAVVAHGPSILYPS-TVWDFINKKVTVGLYGPK
430 440 450 460 470 480
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 YIHPSFTVVLTVCGHNYMPGQLTISDIKKGGKNISPVVFQLWGKQSFLLDKPQDLSISIF
.::::: .:.:. ::. : : .:.. . . : .::..:::::..:.:..::::.. .:
XP_011 HIHPSFKTVVTIFGHDCAPKTLLVSEVTRQAPNPAPVALQLWGKHQFVLSRPQDLKVCMF
490 500 510 520 530 540
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SCDPDFEVKTEGERKEIKQKQLEAGEVVHQQFLFSLVEHREMHLFDFC--VQVEPPNGEP
: ..:::. . : .. ::. :.: ....: .. . .: :: :::. .
XP_011 SNMTNYEVKASEQAKVVRGFQLKLGKV--SRLIFPITSQNPNELSDFTLRVQVKDDQEAI
550 560 570 580 590 600
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 VAQFSITTPDPTPNLKRLSNLPGYLQKKEEIKSAPLSP-KILVKYPTFQDKTLNFSNYGV
..:: . ::.: :. . . ::.:. . ::: .:::::::. .. ..:
XP_011 LTQFCVQTPQPPPKSAIKPSGQRRFLKKNEVGKIILSPFATTTKYPTFQDRPVSSLKFGK
610 620 630 640 650 660
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 TLKAVLRQSKIDYFLEYFKGDTIALLGEGKVKAIGQSKVKEWYVGVLRGKIGLVHCKNVK
::.:.::.: :.::: ::: ::::.: .:. :: .::::.: .:..:::: :::
XP_011 LLKTVVRQNKNHYLLEYKKGDGIALLSEERVRLRGQLWTKEWYIGYYQGRVGLVHTKNVL
670 680 690 700 710 720
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 VISKEQVMFMSDSVFTTRNLLEQIVLPLKKLTYIYSVVLTLVSEKVYDWKVLADVLGYSH
:... . . : ..: :::::. : : :::::. : ::. :.. .:. .::.::: .
XP_011 VVGRARPSLCSGPELSTSVLLEQILRPCKFLTYIYASVRTLLMENISSWRSFADALGYVN
730 740 750 760 770 780
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 LSLEDFDQIQADKESEKVSYVIKKLKEDCH-TERNTRK-FLYELIVALLKMDCQELVARL
: : : . . :.: :.:. :..::::::. :: . :: : ::..:::::::: ::.::
XP_011 LPLTFFCRAELDSEPERVASVLEKLKEDCNNTENKERKSFQKELVMALLKMDCQGLVVRL
790 800 810 820 830 840
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 IQEAAVLTSAVKLGKGWRELAEKLVRLTKQQMEAYEIPHRGNTGDVAVEMMWKPAYDFLY
::. ..::.::.... ::::::::....::::.::: ::: .: : : :::::::::
XP_011 IQDFVLLTTAVEVAQRWRELAEKLAKVSKQQMDAYESPHRDRNGVVDSEAMWKPAYDFLL
850 860 870 880 890 900
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 TWSAHYGNNYTDVLQDLQSALDRMKNPVTKHWRELTGVLILVNSLEVLRVTAFSTSEEV
::: . :..: ::.:.:. .::.::::.::.:..:::.:::::::.:::..::: ...
XP_011 TWSHQIGDSYRDVIQELHLGLDKMKNPITKRWKHLTGTLILVNSLDVLRAAAFSPADQDD
910 920 930 940 950 960
XP_011 FVI
>>XP_011509193 (OMIM: 605611) PREDICTED: SH3 domain-bind (963 aa)
initn: 1979 init1: 961 opt: 2144 Z-score: 2529.1 bits: 479.2 E(85289): 3.9e-134
Smith-Waterman score: 2191; 42.7% identity (70.4% similar) in 868 aa overlap (12-851:102-958)
10 20 30 40
pF1KE2 MLITERKHFRSGRIAQSMSEANLIDMEAGKLSKSCNITECQ
: : .:. . .... . :: : : .
XP_011 TTLKFSKGDHLYVLDTSGGEWWYAHNTTEMGYIPSSYVQP--LNYRNSTLSDSGMIDNLP
80 90 100 110 120
50 60 70 80
pF1KE2 D-PD-------LLHNWPDAFTLRGNNASKVANPFWNQLSASNPFLDD----ITQLRNNRK
: :: :: .: : . : :. ::::: .. .::::. . .: .
XP_011 DSPDEVAKELELLGGWTDDKKVPGRMYSN--NPFWNGVQ-TNPFLNGNVPVMPSLDELNP
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130
pF1KE2 RNNISILKEDPFLFCREIENGNSFDSSG---DELDVHQLL-------RQTSSRNSGRSKS
......: : .. . .:.: ::: : . : :.. : :: :
XP_011 KSTVDLLLFDAGTSSFTESSSATTNSTGNIFDELPVTNGLHAEPPVRRDNPFFRSKRSYS
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
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NP_055 FVI
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XP_011 FVI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]