Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2447
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2447, 852 aa
1>>>pF1KE2447 852 - 852 aa - 852 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7936+/-0.00112; mu= 18.2000+/- 0.067
mean_var=62.8242+/-12.574, 0's: 0 Z-trim(102.5): 29 B-trim: 299 in 1/48
Lambda= 0.161812
statistics sampled from 6993 (6999) to 6993 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5369.1 MACC1 gene_id:346389|Hs108|chr7 ( 852) 5616 1320.2 0
CCDS2513.1 SH3BP4 gene_id:23677|Hs108|chr2 ( 963) 2144 509.7 1e-143
>>CCDS5369.1 MACC1 gene_id:346389|Hs108|chr7 (852 aa)
initn: 5616 init1: 5616 opt: 5616 Z-score: 7075.1 bits: 1320.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5616; 99.9% identity (99.9% similar) in 852 aa overlap (1-852:1-852)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLITERKHFRSGRIAQSMSEANLIDMEAGKLSKSCNITECQDPDLLHNWPDAFTLRGNNA
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CCDS53 MLITERKHFRSGRIAQSMSEANLIDMEAGKLSKSCNITECQDPDLLHNWPDAFTLRGNNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SKVANPFWNQLSASNPFLDDITQLRNNRKRNNISILKEDPFLFCREIENGNSFDSSGDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SKVANPFWNQLSASNPFLDDITQLRNNRKRNNISILKEDPFLFCREIENGNSFDSSGDEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVHQLLRQTSSRNSGRSKSVSELLDILDDTAHAHQSIHNSDQILLHDLEWLKNDREAYKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DVHQLLRQTSSRNSGRSKSVSELLDILDDTAHAHQSIHNSDQILLHDLEWLKNDREAYKM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AWLSQRQLARSCLDLNTISQSPGWAQTQLAEVTIACKVNHQGGSVQLPESDITVHVPQGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AWLSQRQLARSCLDLNTISQSPGWAQTQLAEVTIACKVNHQGGSVQLPESDITVHVPQGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VAVGEFQEVSLRAFLDPPHMLNHDLSCTVSPLLEIMLGNLNTMEALLLEMKIGAEVRKDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAVGEFQEVSLRAFLDPPHMLNHDLSCTVSPLLEIMLGNLNTMEALLLEMKIGAEVRKDP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FSQVMTEMVCLHSLGKEGPFKVLSNCYIYKDTIQVKLIDLSQVMYLVVAAQAKALPSPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FSQVMTEMVCLHSLGKEGPFKVLSNCYIYKDTIQVKLIDLSQVMYLVVAAQAKALPSPAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TIWDYIHKTTSIGIYGPKYIHPSFTVVLTVCGHNYMPGQLTISDIKKGGKNISPVVFQLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TIWDYIHKTTSIGIYGPKYIHPSFTVVLTVCGHNYMPGQLTISDIKKGGKNISPVVFQLW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GKQSFLLDKPQDLSISIFSCDPDFEVKTEGERKEIKQKQLEAGEVVHQQFLFSLVEHREM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GKQSFLLDKPQDLSISIFSCDPDFEVKTEGERKEIKQKQLEAGEVVHQQFLFSLVEHREM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HLFDFCVQVEPPNGEPVAQFSITTPDPTPNLKRLSNLPGYLQKKEEIKSAPLSPKILVKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HLFDFCVQVEPPNGEPVAQFSITTPDPTPNLKRLSNLPGYLQKKEEIKSAPLSPKILVKY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 PTFQDKTLNFSNYGVTLKAVLRQSKIDYFLEYFKGDTIALLGEGKVKAIGQSKVKEWYVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PTFQDKTLNFSNYGVTLKAVLRQSKIDYFLEYFKGDTIALLGEGKVKAIGQSKVKEWYVG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VLRGKIGLVHCKNVKVISKEQVMFMSDSVFTTRNLLEQIVLPLKKLTYIYSVVLTLVSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLRGKIGLVHCKNVKVISKEQVMFMSDSVFTTRNLLEQIVLPLKKLTYIYSVVLTLVSEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VYDWKVLADVLGYSHLSLEDFDQIQADKESEKVSYVIKKLKEDCHTERNTRKFLYELIVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VYDWKVLADVLGYSHLSLEDFDQIQADKESEKVSYVIKKLKEDCHTERNTRKFLYELIVA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LLKMDCQELVARLIQEAAVLTSAVKLGKGWRELAEKLVRLTKQQMEAYEIPHRGNTGDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LLKMDCQELVARLIQEAAVLTSAVKLGKGWRELAEKLVRLTKQQMEAYEIPHRGNTGDVA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VEMMWKPAYDFLYTWSAHYGNNYTDVLQDLQSALDRMKNPVTKHWRELTGVLILVNSLEV
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VEMMWKPAYDFLYTWSAHYGNNYRDVLQDLQSALDRMKNPVTKHWRELTGVLILVNSLEV
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE2 LRVTAFSTSEEV
::::::::::::
CCDS53 LRVTAFSTSEEV
850
>>CCDS2513.1 SH3BP4 gene_id:23677|Hs108|chr2 (963 aa)
initn: 1979 init1: 961 opt: 2144 Z-score: 2693.8 bits: 509.7 E(32554): 1e-143
Smith-Waterman score: 2191; 42.7% identity (70.4% similar) in 868 aa overlap (12-851:102-958)
10 20 30 40
pF1KE2 MLITERKHFRSGRIAQSMSEANLIDMEAGKLSKSCNITECQ
: : .:. . .... . :: : : .
CCDS25 TTLKFSKGDHLYVLDTSGGEWWYAHNTTEMGYIPSSYVQP--LNYRNSTLSDSGMIDNLP
80 90 100 110 120
50 60 70 80
pF1KE2 D-PD-------LLHNWPDAFTLRGNNASKVANPFWNQLSASNPFLDD----ITQLRNNRK
: :: :: .: : . : :. ::::: .. .::::. . .: .
CCDS25 DSPDEVAKELELLGGWTDDKKVPGRMYSN--NPFWNGVQ-TNPFLNGNVPVMPSLDELNP
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130
pF1KE2 RNNISILKEDPFLFCREIENGNSFDSSG---DELDVHQLL-------RQTSSRNSGRSKS
......: : .. . .:.: ::: : . : :.. : :: :
CCDS25 KSTVDLLLFDAGTSSFTESSSATTNSTGNIFDELPVTNGLHAEPPVRRDNPFFRSKRSYS
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 VSELLDILDDTAHAHQSIHNSDQILLHDLEWLKNDREAYKMAWLSQRQLARSCLDLNTIS
.::: ..:. . : : . : ... :: .. :::..:.::::: ::. ..
CCDS25 LSEL-SVLQAKSDAPTSSSFFTGLKSPAPEQFQS-REDFRTAWLNHRKLARSCHDLDLLG
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 QSPGWAQTQLAEVTIACKVNHQGGSVQLPESDITVHVPQGHVAVGEFQEVSLRAFLDPPH
:::::.::: .:..:.::.. .::.::::...:..:::.:::: :: :..:..:.::::
CCDS25 QSPGWGQTQAVETNIVCKLDSSGGAVQLPDTSISIHVPEGHVAPGETQQISMKALLDPPL
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 MLNHDLSCTVSPLLEIMLGNLNTMEALLLEMKIGAEVRKDPFSQVMTEMVCLHSLGKEGP
:: : ::..::.::. :.::.. ...::::..::...: ::. . . ::.: .::::
CCDS25 ELNSDRSCSISPVLEVKLSNLEVKTSIILEMKVSAEIKNDLFSKSTVGLQCLRSDSKEGP
370 380 390 400 410 420
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 F-KVLSNCYIYKDTIQVKLIDLSQVMYLVVAAQAKALPSPAATIWDYIHKTTSIGIYGPK
. .: :: ::.:..: .: ::..:.:.. .. :. :.::.:.: ...:.::::
CCDS25 YVSVPLNCSC-GDTVQAQLHNLEPCMYVAVVAHGPSILYPS-TVWDFINKKVTVGLYGPK
430 440 450 460 470 480
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 YIHPSFTVVLTVCGHNYMPGQLTISDIKKGGKNISPVVFQLWGKQSFLLDKPQDLSISIF
.::::: .:.:. ::. : : .:.. . . : .::..:::::..:.:..::::.. .:
CCDS25 HIHPSFKTVVTIFGHDCAPKTLLVSEVTRQAPNPAPVALQLWGKHQFVLSRPQDLKVCMF
490 500 510 520 530 540
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SCDPDFEVKTEGERKEIKQKQLEAGEVVHQQFLFSLVEHREMHLFDFC--VQVEPPNGEP
: ..:::. . : .. ::. :.: ....: .. . .: :: :::. .
CCDS25 SNMTNYEVKASEQAKVVRGFQLKLGKV--SRLIFPITSQNPNELSDFTLRVQVKDDQEAI
550 560 570 580 590 600
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 VAQFSITTPDPTPNLKRLSNLPGYLQKKEEIKSAPLSP-KILVKYPTFQDKTLNFSNYGV
..:: . ::.: :. . . ::.:. . ::: .:::::::. .. ..:
CCDS25 LTQFCVQTPQPPPKSAIKPSGQRRFLKKNEVGKIILSPFATTTKYPTFQDRPVSSLKFGK
610 620 630 640 650 660
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 TLKAVLRQSKIDYFLEYFKGDTIALLGEGKVKAIGQSKVKEWYVGVLRGKIGLVHCKNVK
::.:.::.: :.::: ::: ::::.: .:. :: .::::.: .:..:::: :::
CCDS25 LLKTVVRQNKNHYLLEYKKGDGIALLSEERVRLRGQLWTKEWYIGYYQGRVGLVHTKNVL
670 680 690 700 710 720
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 VISKEQVMFMSDSVFTTRNLLEQIVLPLKKLTYIYSVVLTLVSEKVYDWKVLADVLGYSH
:... . . : ..: :::::. : : :::::. : ::. :.. .:. .::.::: .
CCDS25 VVGRARPSLCSGPELSTSVLLEQILRPCKFLTYIYASVRTLLMENISSWRSFADALGYVN
730 740 750 760 770 780
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 LSLEDFDQIQADKESEKVSYVIKKLKEDCH-TERNTRK-FLYELIVALLKMDCQELVARL
: : : . . :.: :.:. :..::::::. :: . :: : ::..:::::::: ::.::
CCDS25 LPLTFFCRAELDSEPERVASVLEKLKEDCNNTENKERKSFQKELVMALLKMDCQGLVVRL
790 800 810 820 830 840
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 IQEAAVLTSAVKLGKGWRELAEKLVRLTKQQMEAYEIPHRGNTGDVAVEMMWKPAYDFLY
::. ..::.::.... ::::::::....::::.::: ::: .: : : :::::::::
CCDS25 IQDFVLLTTAVEVAQRWRELAEKLAKVSKQQMDAYESPHRDRNGVVDSEAMWKPAYDFLL
850 860 870 880 890 900
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 TWSAHYGNNYTDVLQDLQSALDRMKNPVTKHWRELTGVLILVNSLEVLRVTAFSTSEEV
::: . :..: ::.:.:. .::.::::.::.:..:::.:::::::.:::..::: ...
CCDS25 TWSHQIGDSYRDVIQELHLGLDKMKNPITKRWKHLTGTLILVNSLDVLRAAAFSPADQDD
910 920 930 940 950 960
CCDS25 FVI
852 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 20:04:30 2016 done: Mon Nov 7 20:04:31 2016
Total Scan time: 3.450 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]