Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4511
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4511, 539 aa
1>>>pF1KE4511 539 - 539 aa - 539 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0334+/-0.000395; mu= 14.9580+/- 0.025
mean_var=97.1482+/-19.631, 0's: 0 Z-trim(113.4): 125 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.130124
statistics sampled from 22669 (22795) to 22669 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 10.070
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016866328 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 539) 3569 681.0 2.5e-195
NP_002260 (OMIM: 604545) importin subunit alpha-6 ( 539) 3569 681.0 2.5e-195
XP_011534107 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 559) 3562 679.7 6.5e-195
XP_016866327 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 559) 3562 679.7 6.5e-195
XP_016866329 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 536) 3549 677.2 3.4e-194
NP_036448 (OMIM: 610563) importin subunit alpha-7 ( 536) 3012 576.4 7.6e-164
XP_005270768 (OMIM: 610563) PREDICTED: importin su ( 566) 3005 575.1 2e-163
XP_005247494 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 538) 2883 552.2 1.5e-156
NP_002255 (OMIM: 600686) importin subunit alpha-5 ( 538) 2883 552.2 1.5e-156
XP_011511097 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 477) 2602 499.4 1e-140
XP_016866330 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 332) 2132 411.0 2.8e-114
XP_016866332 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 327) 2122 409.2 1e-113
XP_016866331 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 327) 2122 409.2 1e-113
XP_005247496 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1988 384.0 3.9e-106
XP_016861853 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1988 384.0 3.9e-106
XP_016861852 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1988 384.0 3.9e-106
XP_011511099 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1988 384.0 3.9e-106
XP_016861854 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 1988 384.0 3.9e-106
NP_001307540 (OMIM: 600685) importin subunit alpha ( 529) 1546 301.2 5.3e-81
NP_002257 (OMIM: 600685) importin subunit alpha-1 ( 529) 1546 301.2 5.3e-81
NP_002259 (OMIM: 602970) importin subunit alpha-3 ( 521) 1480 288.8 2.8e-77
NP_002258 (OMIM: 601892) importin subunit alpha-4 ( 521) 1446 282.4 2.3e-75
XP_016876050 (OMIM: 601892) PREDICTED: importin su ( 497) 1445 282.2 2.6e-75
NP_001139187 (OMIM: 614107) importin subunit alpha ( 516) 1232 242.2 2.9e-63
XP_011514517 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 543) 1232 242.2 3e-63
XP_016867703 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1199 236.0 2.1e-61
XP_016867701 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1199 236.0 2.1e-61
XP_016867702 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1199 236.0 2.1e-61
XP_016867699 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 537) 1199 236.0 2.2e-61
XP_016867697 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 548) 1199 236.0 2.2e-61
XP_016867700 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 522) 1198 235.8 2.4e-61
XP_016867698 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 544) 1156 228.0 5.9e-59
XP_016867705 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 425) 1129 222.8 1.6e-57
XP_016867704 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 487) 924 184.4 7e-46
NP_001240783 (OMIM: 605730) sperm-associated antig ( 484) 291 65.5 4.1e-10
NP_758442 (OMIM: 605730) sperm-associated antigen ( 458) 289 65.2 5.1e-10
NP_001240784 (OMIM: 605730) sperm-associated antig ( 484) 289 65.2 5.3e-10
XP_005252702 (OMIM: 605730) PREDICTED: sperm-assoc ( 506) 289 65.2 5.5e-10
NP_036575 (OMIM: 605730) sperm-associated antigen ( 509) 289 65.2 5.6e-10
NP_001093899 (OMIM: 179502) rap1 GTPase-GDP dissoc ( 558) 196 47.8 0.00011
NP_001093898 (OMIM: 179502) rap1 GTPase-GDP dissoc ( 559) 196 47.8 0.00011
NP_001299618 (OMIM: 615408,615451) armadillo repea ( 736) 180 44.8 0.0011
NP_001276949 (OMIM: 615408,615451) armadillo repea (1044) 180 44.9 0.0014
NP_060546 (OMIM: 615408,615451) armadillo repeat-c (1044) 180 44.9 0.0014
XP_016871321 (OMIM: 611226) PREDICTED: armadillo r ( 681) 167 42.4 0.0055
XP_011517652 (OMIM: 611226) PREDICTED: armadillo r ( 682) 167 42.4 0.0055
NP_001269675 (OMIM: 611226) armadillo repeat-conta ( 688) 167 42.4 0.0055
NP_001269674 (OMIM: 611226) armadillo repeat-conta ( 865) 167 42.5 0.0066
NP_775104 (OMIM: 611226) armadillo repeat-containi ( 872) 167 42.5 0.0067
>>XP_016866328 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin subuni (539 aa)
initn: 3569 init1: 3569 opt: 3569 Z-score: 3627.6 bits: 681.0 E(85289): 2.5e-195
Smith-Waterman score: 3569; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE4 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
490 500 510 520 530
>>NP_002260 (OMIM: 604545) importin subunit alpha-6 [Hom (539 aa)
initn: 3569 init1: 3569 opt: 3569 Z-score: 3627.6 bits: 681.0 E(85289): 2.5e-195
Smith-Waterman score: 3569; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE4 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
490 500 510 520 530
>>XP_011534107 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin subuni (559 aa)
initn: 3562 init1: 3562 opt: 3562 Z-score: 3620.3 bits: 679.7 E(85289): 6.5e-195
Smith-Waterman score: 3562; 100.0% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (2-539:22-559)
10 20 30 40
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGRQRSRGRGSRTFPLRTRRRDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 QKREEQLFKRRNVYLPRNDESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QKREEQLFKRRNVYLPRNDESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 LTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLEL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSA
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LPCLLHLLSSPKESIRKEACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPCLLHLLSSPKESIRKEACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKE
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 AAWAITNATSGGTPEQIRYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAWAITNATSGGTPEQIRYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESK
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 QNGIGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QNGIGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDE
490 500 510 520 530 540
530
pF1KE4 NQQQFIFQQQEAPMDGFQL
:::::::::::::::::::
XP_011 NQQQFIFQQQEAPMDGFQL
550
>>XP_016866327 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin subuni (559 aa)
initn: 3562 init1: 3562 opt: 3562 Z-score: 3620.3 bits: 679.7 E(85289): 6.5e-195
Smith-Waterman score: 3562; 100.0% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (2-539:22-559)
10 20 30 40
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGRQRSRGRGSRTFPLRTRRRDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 QKREEQLFKRRNVYLPRNDESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QKREEQLFKRRNVYLPRNDESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 LTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLEL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSA
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LPCLLHLLSSPKESIRKEACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPCLLHLLSSPKESIRKEACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKE
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 AAWAITNATSGGTPEQIRYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAWAITNATSGGTPEQIRYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESK
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 QNGIGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNGIGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDE
490 500 510 520 530 540
530
pF1KE4 NQQQFIFQQQEAPMDGFQL
:::::::::::::::::::
XP_016 NQQQFIFQQQEAPMDGFQL
550
>>XP_016866329 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin subuni (536 aa)
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Smith-Waterman score: 3549; 100.0% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (4-539:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
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pF1KE4 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
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430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
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pF1KE4 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
480 490 500 510 520 530
>>NP_036448 (OMIM: 610563) importin subunit alpha-7 [Hom (536 aa)
initn: 3016 init1: 2668 opt: 3012 Z-score: 3062.5 bits: 576.4 E(85289): 7.6e-164
Smith-Waterman score: 3012; 84.0% identity (94.6% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
:..::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::.:::::::: : ..
NP_036 METMASPGKDNYRMKSYKNNALNPEEMRRRREEEGIQLRKQKREQQLFKRRNVELINEEA
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 SMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPID
.:..: ..: .:::. : :.: .::.:.::...: ::..::::::::::::.::::
NP_036 AMFDSLLMDSYVSSTTG---ESVITREMVEMLFSDDSDLQLATTQKFRKLLSKEPSPPID
70 80 90 100 110
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pF1KE4 QVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLN
.::. : ::.:::.::.:::::::::::::::::::::: .::.:::.:::::::.:::
NP_036 EVINTPRVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWALTNIASGTSQQTKIVIEAGAVPIFIELLN
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190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNL
:. :::::::::::::::::.. :::.:::: :: ::: :::.:.::: :::::::::::
NP_036 SDFEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNCSILNPLLTLLTKSTRLTMTRNAVWALSNL
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pF1KE4 CRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCR
::::::::.:.:::::: :::::::::: :.:::.::::::::::::.::::::::::::
NP_036 CRGKNPPPEFAKVSPCLPVLSRLLFSSDSDLLADACWALSYLSDGPNEKIQAVIDSGVCR
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 RLVELLMHNDYKVASPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
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370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 WTISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLD
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..: :.::::.:::::::::
NP_036 VSLGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEGKRSGSGVNPYCGLIEEAYGLD
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490 500 510 520 530
pF1KE4 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
::::::::::::::::::::::::::::.:: :..:::::.:::::::: ::::.::::
NP_036 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEDDDSSLAPQVDETQQQFIFQQPEAPMEGFQL
480 490 500 510 520 530
>>XP_005270768 (OMIM: 610563) PREDICTED: importin subuni (566 aa)
initn: 3009 init1: 2668 opt: 3005 Z-score: 3055.1 bits: 575.1 E(85289): 2e-163
Smith-Waterman score: 3005; 84.0% identity (94.6% similar) in 538 aa overlap (2-539:32-566)
10 20 30
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRR
..::::::::::::::::.::::.::::::
XP_005 ALLPASLSAVLEGEASVQDSPGSVMKSYVSETMASPGKDNYRMKSYKNNALNPEEMRRRR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 EEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQM
:::::::::::::.:::::::: : .. .:..: ..: .:::. : :.: .::.:
XP_005 EEEGIQLRKQKREQQLFKRRNVELINEEAAMFDSLLMDSYVSSTTG---ESVITREMVEM
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 IFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWA
.::...: ::..::::::::::::.::::.::. : ::.:::.::.::::::::::::::
XP_005 LFSDDSDLQLATTQKFRKLLSKEPSPPIDEVINTPRVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 LTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNC
:::::::: .::.:::.:::::::.::::. :::::::::::::::::.. :::.::::
XP_005 LTNIASGTSQQTKIVIEAGAVPIFIELLNSDFEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNC
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 EILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDV
:: ::: :::.:.::: :::::::::::::::::::.:.:::::: :::::::::: :.
XP_005 SILNPLLTLLTKSTRLTMTRNAVWALSNLCRGKNPPPEFAKVSPCLPVLSRLLFSSDSDL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 LADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQ
:::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_005 LADACWALSYLSDGPNEKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVASPALRAVGNIVTGDDIQ
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340 350 360 370 380 390
pF1KE4 TQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQ
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEACWTISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQ
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 KAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENI
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYLVSLGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENI
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460 470 480 490 500 510
pF1KE4 LRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDD
:::::::.:..: :.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
XP_005 LRLGEQEGKRSGSGVNPYCGLIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEDDD
480 490 500 510 520 530
520 530
pF1KE4 PSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
:..:::::.:::::::: ::::.::::
XP_005 SSLAPQVDETQQQFIFQQPEAPMEGFQL
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>>XP_005247494 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin subuni (538 aa)
initn: 2882 init1: 2601 opt: 2883 Z-score: 2931.6 bits: 552.2 E(85289): 1.5e-156
Smith-Waterman score: 2883; 80.1% identity (93.1% similar) in 539 aa overlap (4-539:1-538)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRND-
:..:::.:.:.::::::.:::.::::::::::.::::::::::::::::: ...
XP_005 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEET
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 --ESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNP
: : .. ... .::. : :.:.::..::::.. .:::.:::::::::::::::
XP_005 EEEVMSDGGFHEAQISNMEMAPGG-VITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIK
:::.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.:::::::. :.:..::..:::::::.
XP_005 PIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWAL
::.:: :::::::::::::::::.. :::.::.:.::::::.:....:::: ::::::::
XP_005 LLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSG
:::::::.:::.:.:::::::::: ::: :: :::::.::::::::::::::::::::.:
XP_005 SNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.:
XP_005 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 EACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQI
:::::.::::::::::::.::::::::.:: ::: ::::::::::::::::::::. :::
XP_005 EACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 RYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAY
.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::::::
XP_005 KYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAY
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGF
:::::::::::::::::::::::::::::.:..: ::.:::: ::::.:::: ::::.::
XP_005 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGF
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 QL
::
XP_005 QL
>>NP_002255 (OMIM: 600686) importin subunit alpha-5 [Hom (538 aa)
initn: 2882 init1: 2601 opt: 2883 Z-score: 2931.6 bits: 552.2 E(85289): 1.5e-156
Smith-Waterman score: 2883; 80.1% identity (93.1% similar) in 539 aa overlap (4-539:1-538)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRND-
:..:::.:.:.::::::.:::.::::::::::.::::::::::::::::: ...
NP_002 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEET
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 --ESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNP
: : .. ... .::. : :.:.::..::::.. .:::.:::::::::::::::
NP_002 EEEVMSDGGFHEAQISNMEMAPGG-VITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIK
:::.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.:::::::. :.:..::..:::::::.
NP_002 PIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWAL
::.:: :::::::::::::::::.. :::.::.:.::::::.:....:::: ::::::::
NP_002 LLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSG
:::::::.:::.:.:::::::::: ::: :: :::::.::::::::::::::::::::.:
NP_002 SNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.:
NP_002 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 EACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQI
:::::.::::::::::::.::::::::.:: ::: ::::::::::::::::::::. :::
NP_002 EACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 RYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAY
.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::::::
NP_002 KYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGF
:::::::::::::::::::::::::::::.:..: ::.:::: ::::.:::: ::::.::
NP_002 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGF
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 QL
::
NP_002 QL
>>XP_011511097 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin subuni (477 aa)
initn: 2601 init1: 2601 opt: 2602 Z-score: 2647.3 bits: 499.4 E(85289): 1e-140
Smith-Waterman score: 2602; 81.4% identity (93.7% similar) in 478 aa overlap (62-539:1-477)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 EEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQM
: .. ... .::. : :.:.::..:
XP_011 MSDGGFHEAQISNMEMAPGG-VITSDMIEM
10 20
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 IFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWA
:::.. .:::.::::::::::::::::::.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.
XP_011 IFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWV
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 LTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNC
:::::::. :.:..::..:::::::.::.:: :::::::::::::::::.. :::.::.:
XP_011 LTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDC
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 EILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDV
.::::::.:....:::: :::::::::::::::.:::.:.:::::::::: ::: :: ::
XP_011 NILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDV
150 160 170 180 190 200
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