Result of FASTA (ccds) for pFN21AB7063
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7063, 673 aa
  1>>>pF1KB7063 673 - 673 aa - 673 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9241+/-0.000836; mu= 5.4825+/- 0.051
 mean_var=214.8614+/-43.206, 0's: 0 Z-trim(115.1): 67  B-trim: 9 in 1/52
 Lambda= 0.087497
 statistics sampled from 15618 (15685) to 15618 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.482), width:  16
 Scan time:  3.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5068.1 FOXO3 gene_id:2309|Hs108|chr6           ( 673) 4479 578.0 1.4e-164
CCDS9371.1 FOXO1 gene_id:2308|Hs108|chr13          ( 655) 1106 152.3 2.1e-36
CCDS43969.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX          ( 505)  926 129.4 1.2e-29
CCDS55440.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX          ( 450)  777 110.6   5e-24


>>CCDS5068.1 FOXO3 gene_id:2309|Hs108|chr6                (673 aa)
 initn: 4479 init1: 4479 opt: 4479  Z-score: 3067.9  bits: 578.0 E(32554): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 4479; 100.0% identity (100.0% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-673)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAEAPASPAPLSPLEVELDPEFEPQSRPRSCTWPLQRPELQASPAKPSGETAADSMIPEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 MAEAPASPAPLSPLEVELDPEFEPQSRPRSCTWPLQRPELQASPAKPSGETAADSMIPEE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EDDEDDEDGGGRAGSAMAIGGGGGSGTLGSGLLLEDSARVLAPGGQDPGSGPATAAGGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EDDEDDEDGGGRAGSAMAIGGGGGSGTLGSGLLLEDSARVLAPGGQDPGSGPATAAGGLS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GGTQALLQPQQPLPPPQPGAAGGSGQPRKCSSRRNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRLTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 GGTQALLQPQQPLPPPQPGAAGGSGQPRKCSSRRNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRLTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 SQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINPDG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 GKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAALQTAPESADDSPSQLSKWPGSPTSRSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 GKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAALQTAPESADDSPSQLSKWPGSPTSRSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 DELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTELDEVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPSVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 DELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTELDEVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPSVSK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 PCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLTENLMDDLLDNITLPPSQPSPTGGLMQRSSSFPYTTKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 PCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLTENLMDDLLDNITLPPSQPSPTGGLMQRSSSFPYTTKG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 SGLGSPTSSFNSTVFGPSSLNSLRQSPMQTIQENKPATFSSMSHYGNQTLQDLLTSDSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SGLGSPTSSFNSTVFGPSSLNSLRQSPMQTIQENKPATFSSMSHYGNQTLQDLLTSDSLS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 HSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNSRRNVMLRNDPMMSFAAQPNQGSLVNQNLLHHQHQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 HSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNSRRNVMLRNDPMMSFAAQPNQGSLVNQNLLHHQHQT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 QGALGGSRALSNSVSNMGLSESSSLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 QGALGGSRALSNSVSNMGLSESSSLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 VMGHEKFPSDLDLDMFNGSLECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 VMGHEKFPSDLDLDMFNGSLECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFT
              610       620       630       640       650       660

              670   
pF1KB7 GAKQASSQSWVPG
       :::::::::::::
CCDS50 GAKQASSQSWVPG
              670   

>>CCDS9371.1 FOXO1 gene_id:2308|Hs108|chr13               (655 aa)
 initn: 1474 init1: 790 opt: 1106  Z-score: 767.0  bits: 152.3 E(32554): 2.1e-36
Smith-Waterman score: 1767; 46.9% identity (69.3% similar) in 703 aa overlap (12-673:4-655)

               10        20        30        40              50    
pF1KB7 MAEAPASPAPLSPLEVELDPEFEPQSRPRSCTWPLQRPELQ------ASPAKPSGETAAD
                  .:  ::.::.:::  ::::::::: :::..      .::: ::: .::.
CCDS93         MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPA-PSGSAAAN
                       10        20        30        40         50 

           60        70        80        90        100        110  
pF1KB7 SMIPEEEDDEDDEDGGGRAGSAMAIGGGGGSGTLGSGL-LLEDSARV-LAPGGQDPGSGP
          :       :  .:  ..:: :.     :. . :.: :::.:     :::.   . . 
CCDS93 ---P-------DAAAGLPSASAAAV-----SADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAA
                        60             70        80        90      

               120           130                140         150    
pF1KB7 ATAA---GGLSGGTQA----LLQPQQPLPPPQ---------PGAAGG--SGQPRKCSS-R
       :.::   ::: :  :.     :.:  : :::          : ::.:  .::::: :: :
CCDS93 AAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHPAPPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSR
        100       110       120       130       140       150      

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB7 RNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRLTLSQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHN
       ::::::::::::::.::::: .:::::::::::::. :::::::::::::::::::::::
CCDS93 RNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHN
        160       170       180       190       200       210      

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB7 LSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINPDGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAA
       :::::.:.:::::::::::::..::.::::::.:::::.::::..:..:::.:::::::.
CCDS93 LSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKAS
        220       230       240       250       260       270      

           280        290       300       310       320       330  
pF1KB7 LQTAPESADDSP-SQLSKWPGSPTSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTE
       ::.. :.: ::: ::.::::.:: :.:.:..: :. :: ::.:::::.::::::::  ::
CCDS93 LQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIM--TE
        280       290       300       310       320       330      

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB7 LDEVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPSVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLTENLMDDLLD
        :.. . :  .  :.:       ::..:  .. :: :.....  :.     :::.:.: .
CCDS93 QDDLGEGD--VHSMVYP------PSAAKMAST-LPSLSEISNPENM-----ENLLDNL-N
          340               350        360       370               

                 400       410       420       430       440       
pF1KB7 NITLPPS-----QPSPTGGLMQRSSSFPYTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPSSLNSLRQSP
        .. : :     : :: : .::..  . ..  ...:.::. .... ..: ::.. : : :
CCDS93 LLSSPTSLTVSTQSSP-GTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMP
     380       390        400       410       420       430        

       450       460         470       480       490       500     
pF1KB7 MQTIQENKPATFSSMSHYGNQT--LQDLLTSDSLSHSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNS
       .::.:.:: .....::.:.     :..::::::  :.:.: :  :: ..: .. : .:  
CCDS93 IQTLQDNK-SSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIM-TPVDPGVAQPNSRVLGQ--
      440        450       460       470        480       490      

         510        520       530        540       550        560  
pF1KB7 RRNVMLRNDPMMS-FAAQPNQGSLVN-QNLLHHQHQTQGALGGSRALSNSVSNMG-LSES
         :::.  . .:: ...: ......: ..  :  :  : .  ..: : ..::.:   :  
CCDS93 --NVMMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGM
            500       510       520       530       540       550  

            570       580       590       600          610         
pF1KB7 SSLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLPVMG---HEKFPSDLDLDMFNGS
       . : ..:   : :. . ::   ..:.: :  :.  .   ::   .::.:::::  ::   
CCDS93 NRLTQVKTPVQVPLPHPMQM--SALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLD-GMFIER
            560       570         580       590       600          

     620       630       640       650       660       670   
pF1KB7 LECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFTGAKQASSQSWVPG
       :.::::::::..:::.: ::::::... .:.        :  . .....::: :
CCDS93 LDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQS--------FPHSVKTTTHSWVSG
     610       620       630       640               650     

>>CCDS43969.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX               (505 aa)
 initn: 1263 init1: 740 opt: 926  Z-score: 645.8  bits: 129.4 E(32554): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 1191; 39.2% identity (60.3% similar) in 635 aa overlap (16-643:16-502)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAEAPASPAPLSPLEVELDPEFEPQSRPRSCTWPLQRPELQASPAKPSGETAADSMIPEE
                      ..:::.:::::::::::::: :::.  .:..:          :: 
CCDS43 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPEIANQPSEP----------PEV
               10        20        30        40                  50

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EDDEDDEDGGGRAGSAMAIGGGGGSGTLGSGLLLEDSARVLAPGGQDPGSGPATAAGGLS
       : :                        ::         .: . : ..:            
CCDS43 EPD------------------------LGE--------KVHTEGRSEP------------
                                               60                  

              130         140       150       160       170        
pF1KB7 GGTQALLQPQQPLPP--PQPGAAGGSGQPRKCSSRRNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRL
            ::  . : :   ::::  :.   ::: .:::::::: :::.::..::::.:.:::
CCDS43 ----ILLPSRLPEPAGGPQPGILGAVTGPRKGGSRRNAWGNQSYAELISQAIESAPEKRL
             70        80        90       100       110       120  

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 TLSQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINP
       ::.:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::.:..:.::.:::::::..::
CCDS43 TLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIKVHNEATGKSSWWMLNP
            130       140       150       160       170       180  

      240       250       260       270        280         290     
pF1KB7 DGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKK-AALQTAPESADD-SP-SQLSKWPGSP
       .::::::::::::.:::.:.:  ..:..: ::: ..: . ::.:   :: ....:: :::
CCDS43 EGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKPSVLPAPPEGATPTSPVGHFAKWSGSP
            190       200       210       220       230       240  

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB7 TSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTELDEVQDDDAPLSPMLYSSSASLS
        ::. .: : :: :: :..::::.:: ::::.   .:   :  .. : :    :: :.  
CCDS43 CSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRPESE---VLAEEIPAS---VSSYAGGV
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       .. .  :. .:  ...:..:.:.      ..:... .    . :::     .:.:. :::
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       ::.    .::.::: ::..::: :                 .. ... :....:..   :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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