FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5593, 420 aa 1>>>pF1KE5593 420 - 420 aa - 420 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6944+/-0.000813; mu= 10.5415+/- 0.049 mean_var=110.0552+/-22.504, 0's: 0 Z-trim(110.7): 124 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.122256 statistics sampled from 11626 (11773) to 11626 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.362), width: 16 Scan time: 2.700 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4995.1 TPBG gene_id:7162|Hs108|chr6 ( 420) 2790 502.8 2.5e-142 CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 ( 420) 405 82.2 1.1e-15 CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 ( 473) 367 75.5 1.2e-13 CCDS60895.1 TPBGL gene_id:100507050|Hs108|chr11 ( 382) 334 69.6 5.7e-12 CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 ( 811) 322 67.7 4.6e-11 >>CCDS4995.1 TPBG gene_id:7162|Hs108|chr6 (420 aa) initn: 2790 init1: 2790 opt: 2790 Z-score: 2668.8 bits: 502.8 E(32554): 2.5e-142 Smith-Waterman score: 2790; 100.0% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (1-420:1-420) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 MPGGCSRGPAAGDGRLRLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 QCPALCECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAEL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 AALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELIL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 NHIVPPEDERQNRSFEGMVVAALLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLD 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 LSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDC 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 HMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILPPSLQTSYVFLG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 IVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADPRLTNLSSNSDV 370 380 390 400 410 420 >>CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 (420 aa) initn: 285 init1: 138 opt: 405 Z-score: 395.4 bits: 82.2 E(32554): 1.1e-15 Smith-Waterman score: 407; 31.9% identity (54.7% similar) in 320 aa overlap (54-349:23-315) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 VLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAARTVKCVNRNLT : : .:: :: : . ::.: :.. CCDS79 MLPGLRRLLQAPASACLLLMLLALPLAAPSCPMLCTCYSSPPTVSCQANNFS 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 EVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNLSGSRLDEVRAGAFEHLPS :: .:: .. ::: .: . .: :.:. ..: .: : .. :. . :.:.:: . CCDS79 SVPLSLPPSTQRLFLQNNLIRTLRPGTFG-----SNLLTLWLFSNNLSTIYPGTFRHLQA 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 LRQLDLSHN-PLADLSPFAFSGSNASVSAPSPLVELILNHIVPPEDERQNRSFEGMVVAA :..:::. : : .: : .:.: : .: :. . : :. : . CCDS79 LEELDLGDNRHLRSLEPDTFQG----------LERLQSLHLY----RCQLSSLPGNIF-- 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 LLAGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQLPSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLES :.: .:. : : : .:.: :..:.: .: :: : .: : :: ::.: :. 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CCDS13 TFRDLGNLTHLFLHGNRISSVPERAFRGLHSLDRLLLHQNRVAHVHPHAFRDLGRLMTLY 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 LEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDNNPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLTCA : : :..: . .:: :..: ..: :..:::::::. . .::.. . ..... :. CCDS13 LFANNLSALPTEALAPLRALQYLR--LNDNPWVCDCRARPLWAWLQKFR--GSSSEVPCS 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 YPEKMRNRVLLELNSADLD-CDPILPPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKK :... .: : .: . ::. : : CCDS13 LPQRLAGRDLKRLAANDLQGCAVATGPYHPIWTGRATDEEPLGLPKCCQPDAADKASVLE 290 300 310 320 330 340 >>CCDS60895.1 TPBGL gene_id:100507050|Hs108|chr11 (382 aa) initn: 785 init1: 334 opt: 334 Z-score: 328.3 bits: 69.6 E(32554): 5.7e-12 Smith-Waterman score: 702; 40.1% identity (58.4% similar) in 392 aa overlap (47-410:14-362) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 RLARLALVLLGWVSSSSPTSSASSFSSSAPFLASAVSAQPPLPDQCPALCECSEAARTV- .:..:. .:: : :: : : . . . 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CCDS60 -----------------ALVRGGPAL--LAALDAA-----------LAPLAELRLLGLAG 160 170 180 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 NSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQ---GLPHIRVFLDNNPWVCDC :.: : ...: :..::.: .. ::: : : :. ::: :..: .:: : : CCDS60 NALSRLPPAALR-LARLEQLDVRLNALAGLDPDELRALERDGGLPGPRLLLADNPLRCGC 190 200 210 220 230 240 310 320 330 340 pF1KE5 HMADMVTWLKE-TEVVQGKDRLTCAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDP-----------IL ...::.. :: : . :: :: :. . .: ::.:..: : : CCDS60 AARPLLAWLRNATERVPDSRRLRCAAPRALLDRPLLDLDGARLRCADSGADARGEEAEAA 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 PPSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINAD : :..::::.:.:::::: :::.::::::.::..::.:.:.::::.::::::::: .:: CCDS60 GPELEASYVFFGLVLALIGLIFLMVLYLNRRGIQRWMRNLREACRDQMEGYHYRYEQDAD 310 320 330 340 350 360 410 420 pF1KE5 PRLTNLSSNSDV :: CCDS60 PRRAPAPAAPAGSRATSPGSGL 370 380 >>CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 (811 aa) initn: 336 init1: 136 opt: 322 Z-score: 312.1 bits: 67.7 E(32554): 4.6e-11 Smith-Waterman score: 328; 33.7% identity (59.8% similar) in 276 aa overlap (96-355:160-422) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 CECSEAARTVKCVNRNLTEVPTDLPAYVRNLFLTGNQLAVLPAGAFARRPPLAELAALNL : : :: :..:: ..:: ::..: :.: CCDS75 LRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFA---PLGNLLYLHL 130 140 150 160 170 180 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 SGSRLDEVRAGAFEHLPSLRQLDLSHNPLADLSPFAFSGSNASVSAP-SPLVELILN--- ..:. . .:: .: .:: :.:: : .:.: : .:.. :: : :::. CCDS75 ESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSAN---ELQP---SLRHAATFAPLRSLSSLILSANN 190 200 210 220 230 240 190 200 210 220 230 pF1KE5 --HIVPPEDERQNR----SFEGMVVAALL--AGRALQGLRRLELASNHFLYLPRDVLAQL :. : .. : :..: .. : : .:..::.:.: .:.. :: .: : CCDS75 LQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPL 250 260 270 280 290 300 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 PSLRHLDLSNNSLVSLTYVSFRNLTHLESLHLEDNALKVLHNGTLAELQGLPHIRVFLDN ::. ::::.: : .: ..: .: .:. : :..:::..: . .: .: :. ::. CCDS75 HSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPAL--YRLDLDG 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 pF1KE5 NPWVCDCHMADMVTWLKETEVVQGKDRLT----CAYPEKMRNRVLLELNSADLDCDPILP : :.:::.. . :. . . ::. :: : .: .:.. : :.. .:. CCDS75 NGWTCDCRLRGLKRWMGDWHS-QGR-LLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCAD 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 PSLQTSYVFLGIVLALIGAIFLLVLYLNRKGIKKWMHNIRDACRDHMEGYHYRYEINADP :: ..: CCDS75 PSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELV 420 430 440 450 460 470 420 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 02:07:52 2016 done: Tue Nov 8 02:07:53 2016 Total Scan time: 2.700 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]