FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6457, 476 aa 1>>>pF1KE6457 476 - 476 aa - 476 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2708+/-0.000934; mu= 18.7224+/- 0.056 mean_var=85.0850+/-16.304, 0's: 0 Z-trim(107.4): 50 B-trim: 4 in 1/49 Lambda= 0.139043 statistics sampled from 9504 (9548) to 9504 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16 Scan time: 2.220 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4955.1 TINAG gene_id:27283|Hs108|chr6 ( 476) 3395 691.1 6.5e-199 CCDS343.1 TINAGL1 gene_id:64129|Hs108|chr1 ( 467) 1533 317.6 1.8e-86 CCDS72745.1 TINAGL1 gene_id:64129|Hs108|chr1 ( 362) 1324 275.6 6.1e-74 CCDS55586.1 TINAGL1 gene_id:64129|Hs108|chr1 ( 436) 1165 243.8 2.8e-64 CCDS8282.1 CTSC gene_id:1075|Hs108|chr11 ( 463) 300 70.3 5e-12 >>CCDS4955.1 TINAG gene_id:27283|Hs108|chr6 (476 aa) initn: 3395 init1: 3395 opt: 3395 Z-score: 3684.6 bits: 691.1 E(32554): 6.5e-199 Smith-Waterman score: 3395; 99.4% identity (99.8% similar) in 476 aa overlap (1-476:1-476) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MWTGYKILIFSYLTTEIWMEKRYLSQREVDLEAYFTRNHTVLQGTRFKRAIFQGQYCRNF :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 MWTGYKILIFSYLTTEIWMEKQYLSQREVDLEAYFTRNHTVLQGTRFKRAIFQGQYCRNF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 GCCEDRDDGCVTEFYAANALCYCDKFCDRENSDCCPDYKSFCREEKEWPPHTQPWYPEGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 GCCEDRDDGCVTEFYAANALCYCDKFCDRENSDCCPDYKSFCREEKEWPPHTQPWYPEGC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 FKDGQHYEEGSVIKENCNSCTCSGQQWKCSQHVCLVRSELIEQVNKGDYGWTAQNYSQFW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 FKDGQHYEEGSVIKENCNSCTCSGQQWKCSQHVCLVRSELIEQVNKGDYGWTAQNYSQFW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 GMTLEDGFKFRLGTLPPSLMLLSMNEMTASLPATTDLPEFFVASYKWPGWTHGPLDQKNC :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 GMTLEDGFKFRLGTLPPSPMLLSMNEMTASLPATTDLPEFFVASYKWPGWTHGPLDQKNC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 AASWAFSTASVAADRIAIQSKGRYTANLSPQNLISCCAKNRHGCNSGSIDRAWWYLRKRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 AASWAFSTASVAADRIAIQSKGRYTANLSPQNLISCCAKNRHGCNSGSIDRAWWYLRKRG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 LVSHACYPLFKDQNATNNGCAMASRSDGRGKRHATKPCPNNVEKSNRIYQCSPPYRVSSN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 LVSHACYPLFKDQNATNNGCAMASRSDGRGKRHATKPCPNNVEKSNRIYQCSPPYRVSSN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 ETEIMKEIMQNGPVQAIMQVHEDFFHYKTGIYRHVTSTNKESEKYRKLQTHAVKLTGWGT ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 ETEIMKEIMQNGPVQAIMQVREDFFHYKTGIYRHVTSTNKESEKYRKLQTHAVKLTGWGT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 LRGAQGQKEKFWIAANSWGKSWGENGYFRILRGVNESDIEKLIIAAWGQLTSSDEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 LRGAQGQKEKFWIAANSWGKSWGENGYFRILRGVNESDIEKLIIAAWGQLTSSDEP 430 440 450 460 470 >>CCDS343.1 TINAGL1 gene_id:64129|Hs108|chr1 (467 aa) initn: 1459 init1: 662 opt: 1533 Z-score: 1666.1 bits: 317.6 E(32554): 1.8e-86 Smith-Waterman score: 1533; 49.6% identity (73.5% similar) in 427 aa overlap (54-474:45-463) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 LSQREVDLEAYFTRNHTVLQGTRFKRAIFQGQYCRNFG-CCEDRDDGCVTEFYAANALCY :.::.. ::. : : :. . .: .:: CCDS34 AGHLALGAQQGRGRRELAPGLHLRGIRDAGGRYCQEQDLCCRGRADDCALPYLGA--ICY 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 CDKFCDRENSDCCPDYKSFCREEKEWPPHTQPWYP-EGCFKDGQHYEEGSVIKENCNSCT :: ::.: ::::::. .:: :: :. : .::.. :. : .. .::: :: CCDS34 CDLFCNRTVSDCCPDFWDFCLGV---PP---PFPPIQGCMHGGRIYPVLGTYWDNCNRCT 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 CS-GQQWKCSQHVCLVRSELIEQVNKGDYGWTAQNYSQFWGMTLEDGFKFRLGTLPPSLM :. ..::.:.:. ::: ..:. .:.:.::: : :.: ::::::..:...::::. :: CCDS34 CQENRQWQCDQEPCLVDPDMIKAINQGNYGWQAGNHSAFWGMTLDEGIRYRLGTIRPSSS 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 LLSMNEMTASLPATTDLPEFFVASYKWPGWTHGPLDQKNCAASWAFSTASVAADRIAIQS ...:.:. . : :: : :: :::. : :::: :::.:::::::.::.::..:.: CCDS34 VMNMHEIYTVLNPGEVLPTAFEASEKWPNLIHEPLDQGNCAGSWAFSTAAVASDRVSIHS 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 pF1KE6 KGRYTANLSPQNLISCCAKNRHGCNSGSIDRAWWYLRKRGLVSHACYPLF---KDQNATN :..: ::::::.:: .....:: .: .: :::.::.::.:: :::. .:. . 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CCDS34 PPCMMHSRAMGRGKRQATAHCPNSYVNNNDIYQVTPVYRLGSNDKEIMKELMENGPVQAL 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 MQVHEDFFHYKTGIYRHVTSTNKESEKYRKLQTHAVKLTGWGTLRGAQGQKEKFWIAANS :.:::::: :: ::: :. . . :.::. ::.::.:::: .:. :.: :::: CCDS34 MEVHEDFFLYKGGIYSHTPVSLGRPERYRRHGTHSVKITGWGEETLPDGRTLKYWTAANS 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 pF1KE6 WGKSWGENGYFRILRGVNESDIEKLIIAAWGQLTSSDEP :: .::: :.:::.::::: :::......::.. : CCDS34 WGPAWGERGHFRIVRGVNECDIESFVLGVWGRVGMEDMGHH 430 440 450 460 >>CCDS72745.1 TINAGL1 gene_id:64129|Hs108|chr1 (362 aa) initn: 1299 init1: 662 opt: 1324 Z-score: 1441.0 bits: 275.6 E(32554): 6.1e-74 Smith-Waterman score: 1324; 51.3% identity (75.8% similar) in 355 aa overlap (124-474:4-358) 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 CCPDYKSFCREEKEWPPHTQPWYPEGCFKDGQHYEEGSVIKENCNSCTCS-GQQWKCSQH :. : .. .::: :::. ..::.:.:. 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CCDS55 -----------------------------WQAGNHSAFWGMTLDEGIRYRLGTIRPSSSV 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 LSMNEMTASLPATTDLPEFFVASYKWPGWTHGPLDQKNCAASWAFSTASVAADRIAIQSK ..:.:. . : :: : :: :::. : :::: :::.:::::::.::.::..:.: CCDS55 MNMHEIYTVLNPGEVLPTAFEASEKWPNLIHEPLDQGNCAGSWAFSTAAVASDRVSIHSL 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 pF1KE6 GRYTANLSPQNLISCCAKNRHGCNSGSIDRAWWYLRKRGLVSHACYPLF---KDQNATNN :..: ::::::.:: .....:: .: .: :::.::.::.:: :::. .:. . CCDS55 GHMTPVLSPQNLLSCDTHQQQGCRGGRLDGAWWFLRRRGVVSDHCYPFSGRERDEAGPAP 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 GCAMASRSDGRGKRHATKPCPNNVEKSNRIYQCSPPYRVSSNETEIMKEIMQNGPVQAIM : : ::. :::::.:: :::. ..: ::: .: ::..::. :::::.:.::::::.: CCDS55 PCMMHSRAMGRGKRQATAHCPNSYVNNNDIYQVTPVYRLGSNDKEIMKELMENGPVQALM 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 QVHEDFFHYKTGIYRHVTSTNKESEKYRKLQTHAVKLTGWGTLRGAQGQKEKFWIAANSW .:::::: :: ::: :. . . :.::. ::.::.:::: .:. :.: ::::: CCDS55 EVHEDFFLYKGGIYSHTPVSLGRPERYRRHGTHSVKITGWGEETLPDGRTLKYWTAANSW 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 pF1KE6 GKSWGENGYFRILRGVNESDIEKLIIAAWGQLTSSDEP : .::: :.:::.::::: :::......::.. : CCDS55 GPAWGERGHFRIVRGVNECDIESFVLGVWGRVGMEDMGHH 400 410 420 430 >>CCDS8282.1 CTSC gene_id:1075|Hs108|chr11 (463 aa) initn: 451 init1: 172 opt: 300 Z-score: 329.4 bits: 70.3 E(32554): 5e-12 Smith-Waterman score: 437; 28.9% identity (56.0% similar) in 377 aa overlap (100-466:116-457) 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 CVTEFYAANALCYCDKFCDRENSDCCPDYKSFCREEKEWPPHTQPWYPEGCFKDGQHYEE ..: : : .:: :.. CCDS82 IIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKEEGSKVTTYCNETMTGWVHDVLGRNWACFT-GKKVGT 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 GSVIKENC--NSCTCSGQQWKCSQHVCLVRSELIEQVNKGDYGWTAQNYSQFWGMTLEDG .: :: : ...: : :... .... .: . .::: .: .. .:: : CCDS82 AS---ENVYVNIAHLKNSQEKYSNRLYKYDHNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLTLGDM 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 FKFRLGTLPPSLMLLSMNEMTASLPATT-DLPEFFVASYKWPGWTHG-----PL-DQKNC .. : : .. . .:: . :: .:. : . .:: :. .: .: CCDS82 IR-RSGGHSRKIPRPKPAPLTAEIQQKILHLP----TSWDWRN-VHGINFVSPVRNQASC 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 pF1KE6 AASWAFSTASVAADRIAIQSKGRYTANLSPQNLISCCAKNRHGCNSG-SIDRAWWYLRKR .. ..:.. .. :: : ... : ::::...:: .. .::..: : : . CCDS82 GSCYSFASMGMLEARIRILTNNSQTPILSPQEVVSC-SQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDF 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 GLVSHACYPLFKDQNATNNGCAMASRSDGRGKRHATKPCPNNVEKSNRIYQCSPPYRVSS ::: .::.: ..:.. : : . : : . . :. . . CCDS82 GLVEEACFPY----TGTDSPCKM--KED----------C---FRYYSSEYHYVGGFYGGC 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 NETEIMKEIMQNGPVQAIMQVHEDFFHYKTGIYRHVTSTNKESEKYRKLQTHAVKLTGWG ::. . :....::. . ..:..::.::: :::.: . .. . .: .::: :.:.: CCDS82 NEALMKLELVHHGPMAVAFEVYDDFLHYKKGIYHH--TGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 TLRGAQGQKEKFWIAANSWGKSWGENGYFRILRGVNESDIEKLIIAAWGQLTSSDEP : .:.:. .::. :::: .::::::::: ::..: ::.. .:: CCDS82 T-DSASGMD--YWIVKNSWGTGWGENGYFRIRRGTDECAIESIAVAATPIPKL 420 430 440 450 460 476 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 13:28:51 2016 done: Tue Nov 8 13:28:51 2016 Total Scan time: 2.220 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]