FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5744, 746 aa 1>>>pF1KB5744 746 - 746 aa - 746 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1443+/-0.000481; mu= 16.2342+/- 0.030 mean_var=112.9952+/-21.900, 0's: 0 Z-trim(110.6): 131 B-trim: 420 in 1/56 Lambda= 0.120655 statistics sampled from 18852 (19008) to 18852 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 10.110 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005579 (OMIM: 600388) meprin A subunit alpha pr ( 746) 5111 901.8 0 XP_011512930 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 774) 4972 877.7 0 XP_011512931 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 705) 4773 843.0 0 NP_001295100 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta ( 700) 1786 323.0 2.5e-87 NP_005916 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta iso ( 701) 1786 323.0 2.5e-87 XP_011524315 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A su ( 628) 918 171.9 7.1e-42 XP_011524316 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A su ( 577) 607 117.7 1.3e-25 NP_001002036 (OMIM: 608860) astacin-like metalloen ( 431) 423 85.6 4.6e-16 XP_011509508 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 432) 423 85.6 4.7e-16 XP_011509507 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 436) 423 85.6 4.7e-16 XP_011542919 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 622) 375 77.4 2e-13 XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 717) 375 77.4 2.2e-13 NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 730) 375 77.5 2.2e-13 XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 813) 375 77.5 2.4e-13 NP_006120 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 986) 375 77.6 2.8e-13 NP_036597 (OMIM: 606743) tolloid-like protein 2 pr (1015) 369 76.5 5.9e-13 NP_001191689 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like pr ( 392) 362 75.0 6.8e-13 XP_016864059 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 964) 362 75.3 1.3e-12 NP_036596 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like prote (1013) 362 75.3 1.4e-12 XP_011509510 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 252) 345 71.8 3.8e-12 XP_011509509 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 418) 346 72.2 4.9e-12 XP_011530516 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 837) 334 70.4 3.5e-11 NP_705691 (OMIM: 609626) MAM domain-containing gly ( 955) 239 53.9 3.7e-06 XP_016866223 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 961) 239 53.9 3.7e-06 XP_006715119 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 973) 239 53.9 3.7e-06 NP_694999 (OMIM: 612879) MAM domain-containing pro ( 686) 208 48.4 0.00012 >>NP_005579 (OMIM: 600388) meprin A subunit alpha precur (746 aa) initn: 5111 init1: 5111 opt: 5111 Z-score: 4816.3 bits: 901.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5111; 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NP_001 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: : NP_001 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP :.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. NP_001 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLY : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : NP_001 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 PNSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. NP_001 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 pF1KB5 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. : NP_001 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS .. :::.::..:.. .:.: :: NP_001 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC : : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: :::: NP_001 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC 610 620 630 640 710 720 730 740 pF1KB5 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGV--IFLTFSIIAILSQRPRK . ... .....:..: ..: ...... : . NP_001 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNHAF 650 660 670 680 690 700 >>NP_005916 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta isoform (701 aa) initn: 1630 init1: 599 opt: 1786 Z-score: 1688.7 bits: 323.0 E(85289): 2.5e-87 Smith-Waterman score: 1847; 40.4% identity (66.0% similar) in 755 aa overlap (3-745:4-681) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI : : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.::: NP_005 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES :... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::. 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NP_005 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: : NP_005 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP :.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. NP_005 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLY : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : NP_005 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 PNSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. NP_005 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 pF1KB5 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. : NP_005 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS .. :::.::..:.. .:.: :: NP_005 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC : : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: :::: NP_005 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC 610 620 630 640 710 720 730 740 pF1KB5 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGV--IFLTFSIIAILSQRPRK . ... .....:..: ..: ...... : . NP_005 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF 650 660 670 680 690 700 >>XP_011524315 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A subuni (628 aa) initn: 1213 init1: 325 opt: 918 Z-score: 872.8 bits: 171.9 E(85289): 7.1e-42 Smith-Waterman score: 1410; 35.5% identity (57.6% similar) in 755 aa overlap (3-745:4-608) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI : : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.::: XP_011 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES :... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::. XP_011 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV .:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.:::::: XP_011 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN : ::.:::. . .: XP_011 RIMWDRILSASSLSF--------------------------------------------- 180 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ .: :.:: :.:::::.. :..:: . ... XP_011 -----------------------------MDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP 190 200 210 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: : XP_011 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP :.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. XP_011 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG 280 290 300 310 320 330 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLY : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : XP_011 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN 340 350 360 370 380 390 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 PNSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. XP_011 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF 400 410 420 430 440 450 540 550 560 570 580 pF1KB5 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. : XP_011 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI 460 470 480 490 500 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS .. :::.::..:.. .:.: :: XP_011 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS 510 520 530 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC : : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: :::: XP_011 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC 540 550 560 570 710 720 730 740 pF1KB5 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGV--IFLTFSIIAILSQRPRK . ... .....:..: ..: ...... : . XP_011 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF 580 590 600 610 620 >>XP_011524316 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A subuni (577 aa) initn: 1192 init1: 288 opt: 607 Z-score: 580.7 bits: 117.7 E(85289): 1.3e-25 Smith-Waterman score: 1149; 32.8% identity (52.8% similar) in 754 aa overlap (3-745:4-557) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI : : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.::: XP_011 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES :... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::. XP_011 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV .:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.:::::: XP_011 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN : ::.:::: XP_011 RIMWDRILSG-------------------------------------------------- 180 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ XP_011 ------------------------------------------------------------ 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 AGEVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSD .:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: :: XP_011 --------------SGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESD 190 200 210 220 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 RLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQ .: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. XP_011 QLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGA 230 240 250 260 270 280 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 NSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLYP : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : XP_011 -SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNL 290 300 310 320 330 340 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 NSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSH ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. XP_011 AHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFM 350 360 370 380 390 400 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 TSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIF :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. :. XP_011 TTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYIL 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 VDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSR . :::.::..:.. .:.: :: XP_011 LTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PSV 460 470 480 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 QKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQ : : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: ::::. XP_011 Q--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERCE 490 500 510 520 720 730 740 pF1KB5 AVQVHGSVLGMVIGGTAGV--IFLTFSIIAILSQRPRK ... .....:..: ..: ...... : . XP_011 KRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF 530 540 550 560 570 >>NP_001002036 (OMIM: 608860) astacin-like metalloendope (431 aa) initn: 351 init1: 174 opt: 423 Z-score: 409.3 bits: 85.6 E(85289): 4.6e-16 Smith-Waterman score: 427; 32.4% identity (62.2% similar) in 238 aa overlap (41-262:53-284) 20 30 40 50 60 pF1KB5 FFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLD-------LFQGDILLQK ::: :: . :. :..:::. . NP_001 GAPLASSCAGACGTSFPDGLTPEGTQASGDKDIPAINQGLILEETPESSFLIEGDIIRPS 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 pF1KB5 SRNGLRDPNTRWTF------PIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES : ...: . .:..:... .. .:: :. :. ..:. : :. . 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