FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5744, 746 aa 1>>>pF1KB5744 746 - 746 aa - 746 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5988+/-0.00117; mu= 13.4532+/- 0.069 mean_var=101.4704+/-19.896, 0's: 0 Z-trim(103.3): 81 B-trim: 85 in 1/51 Lambda= 0.127322 statistics sampled from 7291 (7356) to 7291 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 3.120 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4918.1 MEP1A gene_id:4224|Hs108|chr6 ( 746) 5111 950.4 0 CCDS77173.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 700) 1786 339.6 9.8e-93 CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 701) 1786 339.6 9.8e-93 CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 ( 431) 423 89.1 1.5e-17 CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 375 80.5 1.1e-14 CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 375 80.5 1.4e-14 CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 369 79.4 3e-14 CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 ( 392) 362 77.9 3.3e-14 CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 362 78.1 7.4e-14 >>CCDS4918.1 MEP1A gene_id:4224|Hs108|chr6 (746 aa) initn: 5111 init1: 5111 opt: 5111 Z-score: 5078.7 bits: 950.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5111; 99.7% identity (99.9% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-746) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDIL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 LQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 LQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 IFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 IFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 DQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 DQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 QRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 QRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 DHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 DHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 WVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 WVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIY 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 LDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLYPNSGESSG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: :::: CCDS49 LDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGVTLYPNSRESSG 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 YLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAIND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 YLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAIND 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 TVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 TVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLS 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 QTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 QTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGP 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 LEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS49 LEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLG 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KB5 MVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK :::::::::::::::::::::::::: CCDS49 MVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK 730 740 >>CCDS77173.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 (700 aa) initn: 1630 init1: 599 opt: 1786 Z-score: 1778.3 bits: 339.6 E(32554): 9.8e-93 Smith-Waterman score: 1847; 40.4% identity (66.0% similar) in 755 aa overlap (3-745:4-681) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI : : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.::: CCDS77 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES :... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::. CCDS77 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV .:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.:::::: CCDS77 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN : ::.:::: .:::.::.:.. .::.:::: :.:::. .: .:.. :::...: .:. CCDS77 RIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAF-QNGTEPTIVTRISDFE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ ..::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.:::::.. :..:: . ... CCDS77 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: : CCDS77 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP :.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. CCDS77 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLY : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : CCDS77 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 PNSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. CCDS77 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 pF1KB5 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. : CCDS77 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS .. :::.::..:.. .:.: :: CCDS77 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC : : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: :::: CCDS77 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC 610 620 630 640 710 720 730 740 pF1KB5 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGV--IFLTFSIIAILSQRPRK . ... .....:..: ..: ...... : . CCDS77 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNHAF 650 660 670 680 690 700 >>CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 (701 aa) initn: 1630 init1: 599 opt: 1786 Z-score: 1778.3 bits: 339.6 E(32554): 9.8e-93 Smith-Waterman score: 1847; 40.4% identity (66.0% similar) in 755 aa overlap (3-745:4-681) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI : : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.::: CCDS45 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES :... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::. CCDS45 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV .:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.:::::: CCDS45 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN : ::.:::: .:::.::.:.. .::.:::: :.:::. .: .:.. :::...: .:. CCDS45 RIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAF-QNGTEPTIVTRISDFE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ ..::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.:::::.. :..:: . ... CCDS45 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: : CCDS45 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP :.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. CCDS45 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLY : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : CCDS45 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 PNSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. CCDS45 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 pF1KB5 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. : CCDS45 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS .. :::.::..:.. .:.: :: CCDS45 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC : : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: :::: CCDS45 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC 610 620 630 640 710 720 730 740 pF1KB5 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGV--IFLTFSIIAILSQRPRK . ... .....:..: ..: ...... : . CCDS45 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF 650 660 670 680 690 700 >>CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 (431 aa) initn: 351 init1: 174 opt: 423 Z-score: 428.4 bits: 89.1 E(32554): 1.5e-17 Smith-Waterman score: 427; 32.4% identity (62.2% similar) in 238 aa overlap (41-262:53-284) 20 30 40 50 60 pF1KB5 FFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLD-------LFQGDILLQK ::: :: . :. :..:::. . CCDS33 GAPLASSCAGACGTSFPDGLTPEGTQASGDKDIPAINQGLILEETPESSFLIEGDIIRPS 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 pF1KB5 SRNGLRDPNTRWTF------PIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES : ...: . .:..:... .. .:: :. :. ..:. : :. . CCDS33 PFRLLSATSNKWPMGGSGVVEVPFLLSSKYDEPSRQVILEALAEFERSTCIRFVTYQDQR 90 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKA--IIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDY ..: . . ::.: :: . : .:.. : :. :. ::..:.:::.::..:.::: : CCDS33 DFISIIPMYGCFSSVGRSGGMQVVSLAPTCLQKGRGIVLHELMHVLGFWHEHTRADRDRY 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 VNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAK-IPE . . :..:: :.. :: ..: .. ::::: :.::: ..:.. . .:::: : CCDS33 IRVNWNEILPGFEINFIKSQSS---NMLTPYDYSSVMHYGRLAFSRRG-LPTITPLWAPS 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 FNSIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDS . :::: ..:: :. :. ..:.:. . 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