Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2284
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2284, 777 aa
  1>>>pF1KE2284 777 - 777 aa - 777 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0996+/-0.000783; mu= 9.1573+/- 0.048
 mean_var=165.4215+/-33.318, 0's: 0 Z-trim(115.1): 44  B-trim: 243 in 1/52
 Lambda= 0.099719
 statistics sampled from 15630 (15674) to 15630 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.481), width:  16
 Scan time:  4.320

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6            ( 777) 5176 756.7 3.3e-218
CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9         ( 859) 1001 156.1 2.3e-37
CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9         ( 885) 1001 156.1 2.3e-37
CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9         ( 902) 1001 156.1 2.4e-37
CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9         ( 913) 1001 156.1 2.4e-37
CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9          ( 914) 1001 156.1 2.4e-37
CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19         ( 716)  737 118.0 5.4e-26
CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19         ( 710)  724 116.2 1.9e-25
CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1          ( 768)  570 94.0 9.7e-19
CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1           ( 803)  570 94.0   1e-18


>>CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6                 (777 aa)
 initn: 5176 init1: 5176 opt: 5176  Z-score: 4031.0  bits: 756.7 E(32554): 3.3e-218
Smith-Waterman score: 5176; 100.0% identity (100.0% similar) in 777 aa overlap (1-777:1-777)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MLPRPLRLLLDTSPPGGVVLSSFRSRDPEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLPRPLRLLLDTSPPGGVVLSSFRSRDPEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 EEDGAVFTVTSRQYRPLDPLVPMPPPRSSRRLRAGTLEALVRHLLDTRTSGTDVSFMSAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EEDGAVFTVTSRQYRPLDPLVPMPPPRSSRRLRAGTLEALVRHLLDTRTSGTDVSFMSAF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LATHRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDELERTTEVAISVLSTWLASHPEDFGSEAKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LATHRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDELERTTEVAISVLSTWLASHPEDFGSEAKG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QLDRLESFLLQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLDRLESFLLQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 VFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 SPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQSPLEPHSKKAPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQSPLEPHSKKAPR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 SGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 NLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 GVPTPLVSCDRPSTGGDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GVPTPLVSCDRPSTGGDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LSPPASSPRPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGGEGSGPGASDCRIIRVQMELGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSPPASSPRPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGGEGSGPGASDCRIIRVQMELGE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 DGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       
pF1KE2 MDGASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDGASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF
              730       740       750       760       770       

>>CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9              (859 aa)
 initn: 1347 init1: 353 opt: 1001  Z-score: 784.3  bits: 156.1 E(32554): 2.3e-37
Smith-Waterman score: 1267; 39.0% identity (67.1% similar) in 589 aa overlap (220-777:308-859)

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE2 LQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVLVFLADHLAE
                                     :. :.:..  .    .   .:::  : .::
CCDS43 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE
       280       290       300       310       320       330       

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE2 QLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGAT
       :.::.::::: ...: .:::..:..::. :. :: :..::::::::.::. :... ::  
CCDS43 QFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNR
       340       350       360       370       380       390       

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE2 STGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAA
       ::            . :.:::..:.::.::.:::.:.::::.::..:::::. ::::. .
CCDS43 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT
                   400       410       420       430       440     

     370       380       390       400        410       420        
pF1KE2 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG--
       : ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..:   . . :: . :.: .  .. :  
CCDS43 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII
         450       460       470       480       490       500     

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE2 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD
        :.:::::::: ::::::.: :: : .  :::.:::::: :..... ::. : .:.. ::
CCDS43 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD
         510       520       530       540       550       560     

         490       500       510       520       530            540
pF1KE2 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV
       ...  :..... :.:..:. .:::.:::. :   . :. . : ....:..  .     :.
CCDS43 EQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELST
         570       580       590       600       610       620     

              550            560       570       580               
pF1KE2 GVPTPLVSCDRPSTG-----GDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSL------------D
       .  .   :::.   :     :: : .  .      .. ..  ..: .            .
CCDS43 SGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE
         630       640       650       660       670       680     

           590          600        610       620       630         
pF1KE2 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG
       :: .:::   .. : .. .  :  ...:   .: :.::.:       :  ..:..    .
CCDS43 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS-------GLCNSSSALPLYN
         690       700       710       720              730        

     640       650       660       670       680       690         
pF1KE2 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL
       .  :    :: ::::.... ..:..:::::::::::::.:: ... :.: .     .:::
CCDS43 QQVG----DCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL
      740           750        760       770       780       790   

     700       710       720        730       740       750        
pF1KE2 VQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGG
       .:.:  .:.: :: .:::::::.. :..::.:..:    : : ::    .::.:      
CCDS43 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------
           800       810       820           830       840         

      760       770       
pF1KE2 GGSFPRIKATGRKIARALF
          .::.:  : :::...:
CCDS43 ---LPRMKQKGLKIAKGIF
              850         

>>CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9              (885 aa)
 initn: 1226 init1: 353 opt: 1001  Z-score: 784.1  bits: 156.1 E(32554): 2.3e-37
Smith-Waterman score: 1267; 39.0% identity (67.1% similar) in 589 aa overlap (220-777:334-885)

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE2 LQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVLVFLADHLAE
                                     :. :.:..  .    .   .:::  : .::
CCDS65 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE
           310       320       330       340       350       360   

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE2 QLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGAT
       :.::.::::: ...: .:::..:..::. :. :: :..::::::::.::. :... ::  
CCDS65 QFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNR
           370       380       390       400       410       420   

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE2 STGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAA
       ::            . :.:::..:.::.::.:::.:.::::.::..:::::. ::::. .
CCDS65 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT
                       430       440       450       460       470 

     370       380       390       400        410       420        
pF1KE2 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG--
       : ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..:   . . :: . :.: .  .. :  
CCDS65 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII
             480       490       500       510       520       530 

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       ...  :..... :.:..:. .:::.:::. :   . :. . : ....:..  .     :.
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       :: .:::   .. : .. .  :  ...:   .: :.::.:       :  ..:..    .
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       .:.:  .:.: :: .:::::::.. :..::.:..:    : : ::    .::.:      
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pF1KE2 GGSFPRIKATGRKIARALF
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CCDS65 ---LPRMKQKGLKIAKGIF
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CCDS65 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII
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pF1KE2 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD
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CCDS65 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD
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pF1KE2 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV
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pF1KE2 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG
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CCDS65 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS-------GLCNSSSALPLYN
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pF1KE2 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL
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CCDS65 QQVG----DCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL
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CCDS65 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------
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      760       770       
pF1KE2 GGSFPRIKATGRKIARALF
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CCDS65 ---LPRMKQKGLKIAKGIF
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pF1KE2 LQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVLVFLADHLAE
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CCDS69 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE
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CCDS69 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT
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     370       380       390       400        410       420        
pF1KE2 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG--
       : ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..:   . . :: . :.: .  .. :  
CCDS69 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII
              510       520       530       540       550       560

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE2 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD
        :.:::::::: ::::::.: :: : .  :::.:::::: :..... ::. : .:.. ::
CCDS69 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD
              570       580       590       600       610       620

         490       500       510       520       530            540
pF1KE2 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV
       ...  :..... :.:..:. .:::.:::. :   . :. . : ....:..  .     :.
CCDS69 EQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELST
              630       640       650       660       670       680

              550            560       570       580               
pF1KE2 GVPTPLVSCDRPSTG-----GDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSL------------D
       .  .   :::.   :     :: : .  .      .. ..  ..: .            .
CCDS69 SGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE
              690       700       710       720       730       740

           590          600        610       620       630         
pF1KE2 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG
       :: .:::   .. : .. .  :  ...:   .: :.::.:       :  ..:..    .
CCDS69 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS-------GLCNSSSALPLYN
              750       760       770       780              790   

     640       650       660       670       680       690         
pF1KE2 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL
       .  :    :: ::::.... ..:..:::::::::::::.:: ... :.: .     .:::
CCDS69 QQVG----DCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL
               800        810       820       830       840        

     700       710       720        730       740       750        
pF1KE2 VQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGG
       .:.:  .:.: :: .:::::::.. :..::.:..:    : : ::    .::.:      
CCDS69 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------
      850       860       870       880           890              

      760       770       
pF1KE2 GGSFPRIKATGRKIARALF
          .::.:  : :::...:
CCDS69 ---LPRMKQKGLKIAKGIF
         900       910    

>>CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19              (716 aa)
 initn: 1283 init1: 647 opt: 737  Z-score: 580.2  bits: 118.0 E(32554): 5.4e-26
Smith-Waterman score: 1344; 38.5% identity (61.5% similar) in 749 aa overlap (53-741:12-715)

             30        40        50        60         70           
pF1KE2 FRSRDPEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDEE-EDGAVFTVTSRQYR------
                                     ::.. : :: :::::..:. :. :      
CCDS54                    MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSP
                                  10        20        30        40 

             80                90       100        110       120   
pF1KE2 ---PLDPLVPMPPP------RSS--RRLRAGTLEALVRHLL-DTRTSGTDVSFMSAFLAT
          :    .: :        :.:  : :::. :: :: .:.   : .  : ::: :::::
CCDS54 AEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQ--DPSFMPAFLAT
              50        60        70        80          90         

           130       140       150                 160       170   
pF1KE2 HRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDELERTT----------EVAISVLSTWLASHPED
       .:.:. :  :::..   .      :  :...:.          ....:::..:: .::.:
CCDS54 YRTFVPTACLLGFLLPPMPP-PPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQD
     100       110        120       130       140       150        

            180       190        200       210              220    
pF1KE2 FGSE-AKGQLDRLESFLLQTGYAA-GKGVGGGSADLIRNLRSRVD-------PQAPDLPK
       : .. :...:  ...::   :.:: :.. .  .  :....  ...       ::.   : 
CCDS54 FRDHPAHSDLGSVRTFL---GWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPP
      160       170          180       190       200       210     

          230                     240       250       260       270
pF1KE2 PLALPGDP--------------PADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGG
        .:  .::              :  : ..: : .:..::::::.: ::: ..   .:::.
CCDS54 RVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQGP-QLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGS
         220       230       240        250       260       270    

              280       290       300       310       320       330
pF1KE2 LWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRAR
       .:..::::: .   :.:::::.::: :.: :..:::::      ::      :  ::::.
CCDS54 VWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVLGA------PG------LAAPQRAQ
          280       290       300       310                   320  

              340       350       360       370       380       390
pF1KE2 LLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSE
        ::::::.:..:: ::::::. :..:::::.::.::. .:: ..:. : .: .: ::::.
CCDS54 RLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPLSTFRKLSQIFSD
            330       340       350       360       370       380  

              400       410       420       430       440       450
pF1KE2 EDNYSQSRELLVQEVKLQSPLEPHSKKAPRSGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDEL
       :.:. .:::.: ::   ..  :  .  .   ..   : :::::::: ::::::.:  : :
CCDS54 ENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDML
            390       400       410       420       430       440  

              460       470       480       490       500       510
pF1KE2 ENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEV
       :.  :::.:::::. .:.....:: .:..:.:.:   :   :..   ::: ::.:.:  .
CCDS54 EGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVI
            450       460       470       480       490       500  

              520       530       540       550       560       570
pF1KE2 EPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSVGVPTPLVSCDRPSTGGDEAPTTPAPLLTRL
       :::..: : .::. :   . .. .  :.     .:       .. ::  :..:.  :   
CCDS54 EPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSP------SGSPGD--PSSPTSSLCIS
            510       520       530             540         550    

              580       590       600       610       620       630
pF1KE2 AQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSHLSPPASSPRPSRGHRRSASCGSPLSGGAEE
             ::::       .::    :..:   . ::.::  : : . . :   :::     
CCDS54 ------PSVSP------GSP----PSSPRSRDAPAGSPPASPGPQ-GPSTKLPLSLDLPS
                      560           570       580        590       

              640           650       660       670       680      
pF1KE2 ASGGTGYGGEGSGP----GASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKK
           .   :    :     .:. :.:::... .. :..:.:::.:::::::::. :.:.:
CCDS54 PRPFALPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSID-NDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQK
       600       610       620        630       640       650      

        690       700       710       720        730          740  
pF1KE2 NNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQR---RRSSTATPG
       .:  .  : .:.: :.:::.: : :: .:::::::.  : .::.::..   : . ...: 
CCDS54 HNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS
        660       670       680       690       700       710      

            750       760       770       
pF1KE2 VTSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF

>>CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19              (710 aa)
 initn: 1285 init1: 649 opt: 724  Z-score: 570.1  bits: 116.2 E(32554): 1.9e-25
Smith-Waterman score: 1336; 38.1% identity (61.1% similar) in 748 aa overlap (53-741:12-709)

             30        40        50        60         70           
pF1KE2 FRSRDPEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDEE-EDGAVFTVTSRQYR------
                                     ::.. : :: :::::..:. :. :      
CCDS32                    MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSP
                                  10        20        30        40 

             80                90       100        110       120   
pF1KE2 ---PLDPLVPMPPP------RSS--RRLRAGTLEALVRHLL-DTRTSGTDVSFMSAFLAT
          :    .: :        :.:  : :::. :: :: .:.   : .  : ::: :::::
CCDS32 AEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQ--DPSFMPAFLAT
              50        60        70        80          90         

           130       140       150                 160       170   
pF1KE2 HRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDELERTT----------EVAISVLSTWLASHPED
       .:.:. :  :::..   .      :  :...:.          ....:::..:: .::.:
CCDS32 YRTFVPTACLLGFLLPPMPP-PPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQD
     100       110        120       130       140       150        

            180       190        200       210              220    
pF1KE2 FGSE-AKGQLDRLESFLLQTGYAA-GKGVGGGSADLIRNLRSRVD-------PQAPDLPK
       : .. :...:  ...::   :.:: :.. .  .  :....  ...       ::.   : 
CCDS32 FRDHPAHSDLGSVRTFL---GWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPP
      160       170          180       190       200       210     

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pF1KE2 PLALPGDP--------------PADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGG
        .:  .::              :  : ..: : .:..::::::.: ::: ..   .:::.
CCDS32 RVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQGP-QLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGS
         220       230       240        250       260       270    

              280       290       300       310       320       330
pF1KE2 LWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRAR
       .:..::::: .   :.:::::.::: :.: :..:::::      ::      :  ::::.
CCDS32 VWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVLGA------PG------LAAPQRAQ
          280       290       300       310                   320  

              340       350       360       370       380       390
pF1KE2 LLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSE
        ::::::.:..:: ::::::. :..:::::.::.::. .:: ..:. : .: .: ::::.
CCDS32 RLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPLSTFRKLSQIFSD
            330       340       350       360       370       380  

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pF1KE2 EDNYSQSRELLVQEVKLQSPLEPHSKKAPRSGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDEL
       :.:. .:::.: ::   ..  :  .  .   ..   : :::::::: ::::::.:  : :
CCDS32 ENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDML
            390       400       410       420       430       440  

              460       470       480       490       500       510
pF1KE2 ENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEV
       :.  :::.:::::. .:.....:: .:..:.:.:   :   :..   ::: ::.:.:  .
CCDS32 EGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVI
            450       460       470       480       490       500  

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pF1KE2 EPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSVGVPTPLVSCDRPSTGGDEAPTTPAPLLTRL
       :::..: : .::. :   . .. .  :.     .:       .. ::  :..:.   . .
CCDS32 EPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSP------SGSPGD--PSSPT---SSV
            510       520       530             540            550 

              580       590       600          610       620       
pF1KE2 AQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSH---LSPPASSPRPSRGHRRSASCGSPLSGG
       .      :  : :.   : :.  .:  ::    ::    ::::      .   :::    
CCDS32 SPGSPPSSPRSRDAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSPRPF-----ALPLGSPRIPL
             560       570       580       590            600      

       630       640       650       660       670       680       
pF1KE2 AEEASGGTGYGGEGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKN
         . :              :. :.:::... .. :..:.:::.:::::::::. :.:.:.
CCDS32 PAQQS--------------SEARVIRVSID-NDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKH
        610                     620        630       640       650 

       690       700       710       720        730          740   
pF1KE2 NRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQR---RRSSTATPGV
       :  .  : .:.: :.:::.: : :: .:::::::.  : .::.::..   : . ...:  
CCDS32 NVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS 
             660       670       680       690       700       710 

           750       760       770       
pF1KE2 TSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF

>>CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1               (768 aa)
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        30        40        50        60         70        80      
pF1KE2 PEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDEE-EDGAVFTVTSRQYRPLDPLVP----
                                     : :: :.:::. :: .. .  .        
CCDS72                 MKLLWQAKMSSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQIQQAANKGARW
                               10        20        30        40    

                            90       100       110       120       
pF1KE2 -------MPPPRSS--------RRLRAGTLEALVRHLLDTRTSGTDVSFMSAFLATHRAF
              .:: ..         : ..::::: ::..:: :  . .: ...: ::.:.:.:
CCDS72 LGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLL-TAFGDNDFTYISIFLSTYRGF
           50        60        70        80         90       100   

       130       140       150         160              170        
pF1KE2 TSTPALLGLMADRLEALESHPTDE--LERTTEVAI-------SVLSTWLASHPEDFGSEA
       .::  .: :. ::   : :   .:   . ..:  .       :.: .:: .  :::    
CCDS72 ASTKEVLELLLDRYGNLTSPNCEEDGSQSSSESKMVIRNAIASILRAWLDQCAEDFREPP
           110       120       130       140       150       160   

      180        190       200       210       220       230       
pF1KE2 KGQ-LDRLESFLLQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPP----
       .   :..: ..:  : .  :.     . .:.......       ::. ...  .      
CCDS72 HFPCLQKLLDYL--TRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQEVETDNGLPNTISFSLEEEEELE
           170         180       190       200       210       220 

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE2 -ADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVT
        .. ..   :  : .::::: .::.:: ...: .::: .:..::.  ..:: :..:::..
CCDS72 GGESAEFTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATIS
             230       240       250       260       270       280 

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE2 QFNKVAGAVVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVY
       ::: ..  :::..::.            . :.  :::...:::: .:.:::::.::::. 
CCDS72 QFNTLTKCVVSTILGG------------KELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLR
             290                   300       310       320         

            360       370       380       390       400            
pF1KE2 AVVSALQSSPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQE-----VKL
       :.::::::. :.::. .:. . :: . .:  : .:::...:.  :::::..:     ..:
CCDS72 AIVSALQSNSIYRLKKTWAAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANL
     330       340       350       360       370       380         

       410       420             430       440       450       460 
pF1KE2 QSPLEPHSKKAPR----SGSRG--GGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRR
       .: .. ..:.. :    . . :   :.:::::::: ::.:::.: .: .:.: :::.:::
CCDS72 DSSVKENQKRTQRRLQLQKDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRR
     390       400       410       420       430       440         

             470       480       490       500       510       520 
pF1KE2 KEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAP
       .:: :..... ::. : .: . ::. . .:.:  . ::: .:. .:::.:  ....  .:
CCDS72 REFEVIAQIKLLQSACNSYCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSP
     450       460       470       480       490       500         

             530         540                            550        
pF1KE2 RVLRPTLVISQWTEVLGS--VGVPTP---------------------LVSCDRPSTGGDE
       .  : ..:       :::  .  :::                     . ::.   . ..:
CCDS72 KP-RKSMVKRLSLLFLGSDMITSPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEE
     510        520       530       540       550       560        

      560         570       580       590       600       610      
pF1KE2 APTTP--APLLTRLAQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSHLSPPASSPRPSRGHRR
       .  ::  .:   .     .  : ::. :   .: .. :  .:   :::. .  : . :.:
CCDS72 GSITPMDTPDEPQKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLS-SPPSCNNNP-KIHKR
      570       580       590       600       610        620       

        620       630       640       650       660       670      
pF1KE2 SASCGSPLSGGAEEASGGTGYGGEGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKA
       :.:  :  :     .     :. ..      :  :::...:  ..:..::::..:::::.
CCDS72 SVSVTSITSTVLPPV-----YNQQNE-----DTCIIRISVE-DNNGNMYKSIMLTSQDKT
        630       640                 650        660       670     

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pF1KE2 PSVISRVLKKNNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRR
       :.::.:.. :.: ::  : ::::::..  ..::.:: ::::::::.. .. ::.::..  
CCDS72 PAVIQRAMLKHNLDSDPAEEYELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNS
         680       690       700       710       720       730     

         740       750       760       770       
pF1KE2 SSTATPGVTSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF
                                                 
CCDS72 MEEQVKLRSRTSLTLPRTAKRGCWSNRHSKITL         
         740       750       760                 

>>CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1                (803 aa)
 initn: 1159 init1: 320 opt: 570  Z-score: 449.6  bits: 94.0 E(32554): 1e-18
Smith-Waterman score: 1229; 34.2% identity (60.9% similar) in 755 aa overlap (51-733:43-768)

               30        40        50        60         70         
pF1KE2 SSFRSRDPEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDEE-EDGAVFTVTSRQYRPLDP
                                     ::. .. : :: :.:::. :: .. .  . 
CCDS13 VSKFKLSTKVESTGHWLVEDHVRIWEVLKTEESSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQIQQA
             20        30        40        50        60        70  

      80                           90       100       110       120
pF1KE2 LVP-----------MPPPRSS--------RRLRAGTLEALVRHLLDTRTSGTDVSFMSAF
                     .:: ..         : ..::::: ::..:: :  . .: ...: :
CCDS13 ANKGARWLGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLL-TAFGDNDFTYISIF
             80        90       100       110        120       130 

              130       140       150         160              170 
pF1KE2 LATHRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDE--LERTTEVAI-------SVLSTWLASHP
       :.:.:.:.::  .: :. ::   : :   .:   . ..:  .       :.: .:: .  
CCDS13 LSTYRGFASTKEVLELLLDRYGNLTSPNCEEDGSQSSSESKMVIRNAIASILRAWLDQCA
             140       150       160       170       180       190 

             180        190       200       210       220       230
pF1KE2 EDFGSEAKGQ-LDRLESFLLQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPG
       :::    .   :..: ..:  : .  :.     . .:.......       ::. ...  
CCDS13 EDFREPPHFPCLQKLLDYL--TRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQEVETDNGLPNTISFSL
             200       210         220       230       240         

                   240       250       260       270       280     
pF1KE2 DPP-----ADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCP
       .       .. ..   :  : .::::: .::.:: ...: .::: .:..::.  ..:: :
CCDS13 EEEEELEGGESAEFTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAP
     250       260       270       280       290       300         

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE2 SVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLL
       ..:::..::: ..  :::..::.            . :.  :::...:::: .:.:::::
CCDS13 TIRATISQFNTLTKCVVSTILGG------------KELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLL
     310       320       330                   340       350       

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE2 RNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQE-
       .::::. :.::::::. :.::. .:. . :: . .:  : .:::...:.  :::::..: 
CCDS13 KNFSSLRAIVSALQSNSIYRLKKTWAAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEG
       360       370       380       390       400       410       

              410       420             430       440       450    
pF1KE2 ----VKLQSPLEPHSKKAPR----SGSRG--GGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGY
           ..:.: .. ..:.. :    . . :   :.:::::::: ::.:::.: .: .:.: 
CCDS13 TSKFANLDSSVKENQKRTQRRLQLQKDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGL
       420       430       440       450       460       470       

          460       470       480       490       500       510    
pF1KE2 INFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPG
       :::.:::.:: :..... ::. : .: . ::. . .:.:  . ::: .:. .:::.:  .
CCDS13 INFEKRRREFEVIAQIKLLQSACNSYCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAA
       480       490       500       510       520       530       

          520       530         540                            550 
pF1KE2 SSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGS--VGVPTP---------------------LVSCDR
       ...  .:.  : ..:       :::  .  :::                     . ::. 
CCDS13 DASTTSPKP-RKSMVKRLSLLFLGSDMITSPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCES
       540        550       560       570       580       590      

             560         570       580       590       600         
pF1KE2 PSTGGDEAPTTP--APLLTRLAQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSHLSPPASSPR
         . ..:.  ::  .:   .     .  : ::. :   .: .. :  .:   :::. .  
CCDS13 NHSEAEEGSITPMDTPDEPQKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLS-SPPSCNNN
        600       610       620       630       640        650     

     610       620       630       640       650       660         
pF1KE2 PSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGGEGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSIL
       : . :.::.:  :  :     .     :. ..      :  :::...:  ..:..::::.
CCDS13 P-KIHKRSVSVTSITSTVLPPV-----YNQQNE-----DTCIIRISVE-DNNGNMYKSIM
          660       670            680            690        700   

     670       680       690       700       710       720         
pF1KE2 VTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDF
       .:::::.:.::.:.. :.: ::  : ::::::..  ..::.:: ::::::::.. .. ::
CCDS13 LTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSDPAEEYELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDF
           710       720       730       740       750       760   

      730       740       750       760       770       
pF1KE2 LLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF
       .::..                                            
CCDS13 ILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLPRTAKRGCWSNRHSKITL         
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