FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2284, 777 aa 1>>>pF1KE2284 777 - 777 aa - 777 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0996+/-0.000783; mu= 9.1573+/- 0.048 mean_var=165.4215+/-33.318, 0's: 0 Z-trim(115.1): 44 B-trim: 243 in 1/52 Lambda= 0.099719 statistics sampled from 15630 (15674) to 15630 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.481), width: 16 Scan time: 4.320 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 ( 777) 5176 756.7 3.3e-218 CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 859) 1001 156.1 2.3e-37 CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 885) 1001 156.1 2.3e-37 CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 902) 1001 156.1 2.4e-37 CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 913) 1001 156.1 2.4e-37 CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 914) 1001 156.1 2.4e-37 CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 716) 737 118.0 5.4e-26 CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 710) 724 116.2 1.9e-25 CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 768) 570 94.0 9.7e-19 CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 803) 570 94.0 1e-18 >>CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 (777 aa) initn: 5176 init1: 5176 opt: 5176 Z-score: 4031.0 bits: 756.7 E(32554): 3.3e-218 Smith-Waterman score: 5176; 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CCDS65 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT 450 460 470 480 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG-- : ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..: . . :: . :.: . .. : CCDS65 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII 490 500 510 520 530 540 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD :.:::::::: ::::::.: :: : . :::.:::::: :..... ::. : .:.. :: CCDS65 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD 550 560 570 580 590 600 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV ... :..... :.:..:. .:::.:::. : . :. . : ....:.. . :. CCDS65 EQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELST 610 620 630 640 650 660 550 560 570 580 pF1KE2 GVPTPLVSCDRPSTG-----GDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSL------------D . . :::. : :: : . . .. .. ..: . . CCDS65 SGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE 670 680 690 700 710 720 590 600 610 620 630 pF1KE2 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG :: .::: .. : .. . : ...: .: :.::.: : ..:.. . CCDS65 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS-------GLCNSSSALPLYN 730 740 750 760 770 780 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL . : :: ::::.... ..:..:::::::::::::.:: ... :.: . .::: CCDS65 QQVG----DCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL 790 800 810 820 830 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 VQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGG .:.: .:.: :: .:::::::.. :..::.:..: : : :: .::.: CCDS65 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------ 840 850 860 870 880 760 770 pF1KE2 GGSFPRIKATGRKIARALF .::.: : :::...: CCDS65 ---LPRMKQKGLKIAKGIF 890 900 >>CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (913 aa) initn: 1347 init1: 353 opt: 1001 Z-score: 783.9 bits: 156.1 E(32554): 2.4e-37 Smith-Waterman score: 1267; 39.0% identity (67.1% similar) in 589 aa overlap (220-777:362-913) 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 LQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVLVFLADHLAE :. :.:.. . . .::: : .:: CCDS65 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE 340 350 360 370 380 390 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 QLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGAT :.::.::::: ...: .:::..:..::. :. :: :..::::::::.::. :... :: CCDS65 QFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNR 400 410 420 430 440 450 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 STGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAA :: . :.:::..:.::.::.:::.:.::::.::..:::::. ::::. . CCDS65 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT 460 470 480 490 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG-- : ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..: . . :: . :.: . .. : CCDS65 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII 500 510 520 530 540 550 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD :.:::::::: ::::::.: :: : . :::.:::::: :..... ::. : .:.. :: CCDS65 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD 560 570 580 590 600 610 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV ... :..... :.:..:. .:::.:::. : . :. . : ....:.. . :. CCDS65 EQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELST 620 630 640 650 660 670 550 560 570 580 pF1KE2 GVPTPLVSCDRPSTG-----GDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSL------------D . . :::. : :: : . . .. .. ..: . . CCDS65 SGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE 680 690 700 710 720 730 590 600 610 620 630 pF1KE2 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG :: .::: .. : .. . : ...: .: :.::.: : ..:.. . CCDS65 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS-------GLCNSSSALPLYN 740 750 760 770 780 790 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL . : :: ::::.... ..:..:::::::::::::.:: ... :.: . .::: CCDS65 QQVG----DCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL 800 810 820 830 840 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 VQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGG .:.: .:.: :: .:::::::.. :..::.:..: : : :: .::.: CCDS65 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------ 850 860 870 880 890 760 770 pF1KE2 GGSFPRIKATGRKIARALF .::.: : :::...: CCDS65 ---LPRMKQKGLKIAKGIF 900 910 >>CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (914 aa) initn: 1296 init1: 353 opt: 1001 Z-score: 783.9 bits: 156.1 E(32554): 2.4e-37 Smith-Waterman score: 1267; 39.0% identity (67.1% similar) in 589 aa overlap (220-777:363-914) 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 LQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVLVFLADHLAE :. :.:.. . . .::: : .:: CCDS69 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE 340 350 360 370 380 390 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 QLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGAT :.::.::::: ...: .:::..:..::. :. :: :..::::::::.::. :... :: CCDS69 QFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNR 400 410 420 430 440 450 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 STGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAA :: . :.:::..:.::.::.:::.:.::::.::..:::::. ::::. . CCDS69 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT 460 470 480 490 500 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG-- : ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..: . . :: . :.: . .. : CCDS69 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII 510 520 530 540 550 560 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD :.:::::::: ::::::.: :: : . :::.:::::: :..... ::. : .:.. :: CCDS69 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD 570 580 590 600 610 620 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV ... :..... :.:..:. .:::.:::. : . :. . : ....:.. . :. CCDS69 EQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELST 630 640 650 660 670 680 550 560 570 580 pF1KE2 GVPTPLVSCDRPSTG-----GDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSL------------D . . :::. : :: : . . .. .. ..: . . CCDS69 SGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE 690 700 710 720 730 740 590 600 610 620 630 pF1KE2 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG :: .::: .. : .. . : ...: .: :.::.: : ..:.. . CCDS69 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS-------GLCNSSSALPLYN 750 760 770 780 790 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL . : :: ::::.... ..:..:::::::::::::.:: ... :.: . .::: CCDS69 QQVG----DCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL 800 810 820 830 840 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 VQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGG .:.: .:.: :: .:::::::.. :..::.:..: : : :: .::.: CCDS69 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------ 850 860 870 880 890 760 770 pF1KE2 GGSFPRIKATGRKIARALF .::.: : :::...: CCDS69 ---LPRMKQKGLKIAKGIF 900 910 >>CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (716 aa) initn: 1283 init1: 647 opt: 737 Z-score: 580.2 bits: 118.0 E(32554): 5.4e-26 Smith-Waterman score: 1344; 38.5% identity (61.5% similar) in 749 aa overlap (53-741:12-715) 30 40 50 60 70 pF1KE2 FRSRDPEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDEE-EDGAVFTVTSRQYR------ ::.. : :: :::::..:. :. : CCDS54 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSP 10 20 30 40 80 90 100 110 120 pF1KE2 ---PLDPLVPMPPP------RSS--RRLRAGTLEALVRHLL-DTRTSGTDVSFMSAFLAT : .: : :.: : :::. :: :: .:. : . : ::: ::::: CCDS54 AEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQ--DPSFMPAFLAT 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 pF1KE2 HRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDELERTT----------EVAISVLSTWLASHPED .:.:. : :::.. . : :...:. ....:::..:: .::.: CCDS54 YRTFVPTACLLGFLLPPMPP-PPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQD 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 pF1KE2 FGSE-AKGQLDRLESFLLQTGYAA-GKGVGGGSADLIRNLRSRVD-------PQAPDLPK : .. :...: ...:: :.:: :.. . . :.... ... ::. : CCDS54 FRDHPAHSDLGSVRTFL---GWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPP 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 pF1KE2 PLALPGDP--------------PADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGG .: .:: : : ..: : .:..::::::.: ::: .. .:::. CCDS54 RVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQGP-QLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGS 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 LWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRAR .:..::::: . :.:::::.::: :.: :..::::: :: : ::::. CCDS54 VWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVLGA------PG------LAAPQRAQ 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 LLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSE ::::::.:..:: ::::::. :..:::::.::.::. .:: ..:. : .: .: ::::. CCDS54 RLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPLSTFRKLSQIFSD 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 EDNYSQSRELLVQEVKLQSPLEPHSKKAPRSGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDEL :.:. .:::.: :: .. : . . .. : :::::::: ::::::.: : : CCDS54 ENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDML 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 ENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEV :. :::.:::::. .:.....:: .:..:.:.: : :.. ::: ::.:.: . CCDS54 EGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVI 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 EPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSVGVPTPLVSCDRPSTGGDEAPTTPAPLLTRL :::..: : .::. : . .. . :. .: .. :: :..:. : CCDS54 EPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSP------SGSPGD--PSSPTSSLCIS 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 AQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSHLSPPASSPRPSRGHRRSASCGSPLSGGAEE :::: .:: :..: . ::.:: : : . . : ::: CCDS54 ------PSVSP------GSP----PSSPRSRDAPAGSPPASPGPQ-GPSTKLPLSLDLPS 560 570 580 590 640 650 660 670 680 pF1KE2 ASGGTGYGGEGSGP----GASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKK . : : .:. :.:::... .. :..:.:::.:::::::::. :.:.: CCDS54 PRPFALPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSID-NDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQK 600 610 620 630 640 650 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 NNRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQR---RRSSTATPG .: . : .:.: :.:::.: : :: .:::::::. : .::.::.. : . ...: CCDS54 HNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS 660 670 680 690 700 710 750 760 770 pF1KE2 VTSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF >>CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (710 aa) initn: 1285 init1: 649 opt: 724 Z-score: 570.1 bits: 116.2 E(32554): 1.9e-25 Smith-Waterman score: 1336; 38.1% identity (61.1% similar) in 748 aa overlap (53-741:12-709) 30 40 50 60 70 pF1KE2 FRSRDPEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDEE-EDGAVFTVTSRQYR------ ::.. : :: :::::..:. :. : CCDS32 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRRQRSQRRSP 10 20 30 40 80 90 100 110 120 pF1KE2 ---PLDPLVPMPPP------RSS--RRLRAGTLEALVRHLL-DTRTSGTDVSFMSAFLAT : .: : :.: : :::. :: :: .:. : . : ::: ::::: CCDS32 AEGPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQ--DPSFMPAFLAT 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 pF1KE2 HRAFTSTPALLGLMADRLEALESHPTDELERTT----------EVAISVLSTWLASHPED .:.:. : :::.. . : :...:. ....:::..:: .::.: CCDS32 YRTFVPTACLLGFLLPPMPP-PPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLRAVVSVLGSWLQDHPQD 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 pF1KE2 FGSE-AKGQLDRLESFLLQTGYAA-GKGVGGGSADLIRNLRSRVD-------PQAPDLPK : .. :...: ...:: :.:: :.. . . :.... ... ::. : CCDS32 FRDHPAHSDLGSVRTFL---GWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLEEAEREQEEEPPQVWTGPP 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 pF1KE2 PLALPGDP--------------PADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGG .: .:: : : ..: : .:..::::::.: ::: .. .:::. CCDS32 RVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQGP-QLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGS 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 LWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRAR .:..::::: . :.:::::.::: :.: :..::::: :: : ::::. CCDS32 VWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVLGA------PG------LAAPQRAQ 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 LLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAAWGEATRDSLRVFSSLCQIFSE ::::::.:..:: ::::::. :..:::::.::.::. .:: ..:. : .: .: ::::. CCDS32 RLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPLSTFRKLSQIFSD 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 EDNYSQSRELLVQEVKLQSPLEPHSKKAPRSGSRGGGVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDEL :.:. .:::.: :: .. : . . .. : :::::::: ::::::.: : : CCDS32 ENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDML 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 ENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPDHDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEV :. :::.:::::. .:.....:: .:..:.:.: : :.. ::: ::.:.: . CCDS32 EGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVI 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 EPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLGSVGVPTPLVSCDRPSTGGDEAPTTPAPLLTRL :::..: : .::. : . .. . :. .: .. :: :..:. . . CCDS32 EPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSP------SGSPGD--PSSPT---SSV 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 pF1KE2 AQHMKWPSVSSLDSALESSPSLHSPADPSH---LSPPASSPRPSRGHRRSASCGSPLSGG . : : :. : :. .: :: :: :::: . ::: CCDS32 SPGSPPSSPRSRDAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSPRPF-----ALPLGSPRIPL 560 570 580 590 600 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 AEEASGGTGYGGEGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKN . : :. :.:::... .. :..:.:::.:::::::::. :.:.:. CCDS32 PAQQS--------------SEARVIRVSID-NDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKH 610 620 630 640 650 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 NRDSAVASEYELVQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQR---RRSSTATPGV : . : .:.: :.:::.: : :: .:::::::. : .::.::.. : . ...: CCDS32 NVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFYAMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS 660 670 680 690 700 710 750 760 770 pF1KE2 TSGPSASGTPPSEGGGGSFPRIKATGRKIARALF >>CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 (768 aa) initn: 1202 init1: 320 opt: 570 Z-score: 449.9 bits: 94.0 E(32554): 9.7e-19 Smith-Waterman score: 1217; 34.2% identity (60.8% similar) in 748 aa overlap (58-733:15-733) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 PEEGGGPGGLVVGGGQEEEEEEEEEAPVSVWDEE-EDGAVFTVTSRQYRPLDPLVP---- : :: :.:::. :: .. . . CCDS72 MKLLWQAKMSSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQIQQAANKGARW 10 20 30 40 90 100 110 120 pF1KE2 -------MPPPRSS--------RRLRAGTLEALVRHLLDTRTSGTDVSFMSAFLATHRAF .:: .. : ..::::: ::..:: : . .: ...: ::.:.:.: CCDS72 LGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLL-TAFGDNDFTYISIFLSTYRGF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE2 TSTPALLGLMADRLEALESHPTDE--LERTTEVAI-------SVLSTWLASHPEDFGSEA .:: .: :. :: : : .: . ..: . :.: .:: . ::: CCDS72 ASTKEVLELLLDRYGNLTSPNCEEDGSQSSSESKMVIRNAIASILRAWLDQCAEDFREPP 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 KGQ-LDRLESFLLQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPP---- . :..: ..: : . :. . .:....... ::. ... . CCDS72 HFPCLQKLLDYL--TRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQEVETDNGLPNTISFSLEEEEELE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 -ADPTDVLVFLADHLAEQLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVT .. .. : : .::::: .::.:: ...: .::: .:..::. ..:: :..:::.. CCDS72 GGESAEFTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATIS 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QFNKVAGAVVSSVLGATSTGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVY ::: .. :::..::. . :. :::...:::: .:.:::::.::::. 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