FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4110, 481 aa 1>>>pF1KE4110 481 - 481 aa - 481 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6855+/-0.00113; mu= 7.6685+/- 0.067 mean_var=183.0241+/-39.131, 0's: 0 Z-trim(109.3): 150 B-trim: 410 in 1/51 Lambda= 0.094803 statistics sampled from 10598 (10762) to 10598 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16 Scan time: 3.370 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 3287 462.3 5.2e-130 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 2536 359.5 3.8e-99 CCDS4677.1 TRIM15 gene_id:89870|Hs108|chr6 ( 465) 1190 175.5 1.1e-43 CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 905 136.5 6.7e-32 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 808 123.2 6.1e-28 CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 511) 754 115.9 1.1e-25 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 748 115.0 1.8e-25 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 746 114.8 2.3e-25 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 704 109.0 1.2e-23 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 704 109.0 1.2e-23 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 692 107.4 3.7e-23 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 692 107.4 3.8e-23 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 630 98.9 1.3e-20 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 618 97.3 4.3e-20 CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 619 97.5 4.5e-20 CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 518) 613 96.6 6.9e-20 CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 600 94.7 2e-19 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 579 91.9 1.7e-18 CCDS43414.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 329) 572 90.8 2.4e-18 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 572 90.9 3.2e-18 CCDS4463.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 303) 561 89.3 6.4e-18 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 541 86.7 6.1e-17 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 540 86.6 6.4e-17 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 534 85.6 8.8e-17 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 534 85.6 9.2e-17 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 536 86.0 9.4e-17 CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 536 86.0 9.5e-17 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 534 85.7 1.2e-16 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 536 86.2 1.4e-16 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 529 85.1 1.8e-16 CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 460 75.6 1.3e-13 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 446 73.6 3.8e-13 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 448 74.0 4.1e-13 CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 444 73.3 4.6e-13 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 446 73.7 4.8e-13 CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 431 71.6 1.9e-12 CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 424 70.5 2.8e-12 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 411 68.9 1.3e-11 CCDS5679.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 500) 404 68.0 2.7e-11 CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 401 67.5 3.3e-11 >>CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 (481 aa) initn: 3287 init1: 3287 opt: 3287 Z-score: 2447.5 bits: 462.3 E(32554): 5.2e-130 Smith-Waterman score: 3287; 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43.1% identity (69.4% similar) in 480 aa overlap (1-479:1-463) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC : .. :. . . : .: : :.. ::: :::.::: :: .. . . . :::: CCDS46 MPATPSLKVVHELPACTLCAGPLEDAVTIPCGHTFCRLCLPALSQMGAQSSGKILLCPLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLG-LGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCV .: :. : . :: ::: :.:::::::::::.: ::: CCDS46 QEE----------------EQAETPMAPVPLGPLGET-YCEEHGEKIYFFCENDAEFLCV 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 VCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVS :::. : .::. ::..: :::..... :. : ::.::.... .:....::::::. CCDS46 FCREGPTHQAHTVGFLDEAIQPYRDRLRSRLEALSTERDEIEDVKCQEDQKLQVLLTQIE 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEEL .:..:: . : .:.. ::.:. .:::.:. . .: ..:::. :. :. :..: ..:: CCDS46 SKKHQVETAFERLQQELEQQRCLLLARLRELEQQIWKERDEYITKVSEEVTRLGAQVKEL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 EEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLE ::: ..:: ::: :.: . ::: . .: :.::.: ..:::: .. : : . :.:: : CCDS46 EEKCQQPASELLQDVRVNQSRCEMKTFVSPEAISPDLVKKIRDFHRKILTLPEMMRMFSE 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 KLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRATCVLAHTG .: .:. . . :.:::::. .:.::::.. .... . .. ::.: ::: ::. : CCDS46 NLAHHLEIDSGVITLDPQTASRSLVLSEDRKSVRYTRQKKSLPDSPLRFDGLPAVLGFPG 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 ITGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALGSFP ...::: : :...:. ::.:::::..: :.::::. : :.::::: .. : : CCDS46 FSSGRHRWQVDLQLGDGGGCTVGVAGEGVRRKGEMGLSAEDGVWAVIISHQQCWASTSPG 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 TRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRKVIPFFGLWGRGSSFSL : : :.: :: :::.::::.: ::. :: :.:::.::::::. ::.:::..: .:: ..: CCDS46 TDLPLSEIPRGVRVALDYEAGQVTLHNAQTQEPIFTFTASFSGKVFPFFAVWKKGSCLTL 410 420 430 440 450 460 480 pF1KE4 SS CCDS46 KG >>CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 (539 aa) initn: 1225 init1: 549 opt: 905 Z-score: 686.2 bits: 136.5 E(32554): 6.7e-32 Smith-Waterman score: 1044; 37.0% identity (60.5% similar) in 522 aa overlap (1-458:1-516) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC ::..: . :: .::.: :: ::.:::::::: :::.: : : : :.:::: CCDS46 MATSAPLRSLEEEVTCSICLDYLRDPVTIDCGHVFCRSCTTDVRPISGS----RPVCPLC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGE-----ED--VCQEHGEKIYFFCEDD :.::. ..:: ::::..:::::::.. . :: .: .:..: ::....:::: CCDS46 KKPFKKENIRPVWQLASLVENIERLKVDKGRQPGEVTREQQDAKLCERHREKLHYYCEDD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 EMQLCVVCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQV :::.:::. :: :: ..: :: :.::.: . :. ::..:..:: .:.. . . . CCDS46 GKLLCVMCRESREHRPHTAVLMEKAAQPHREKILNHLSTLRRDRDKIQGFQAKGEADILA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 LLTQVSTKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFS : ... .:: ...:: . ..::.:.. :: :: . . .. . :..: .::. :.. CCDS46 ALKKLQDQRQYIVAEFEQGHQFLREREEHLLEQLAKLEQELTEGREKFKSRGVGELARLA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRK--CRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQ .: ::: : ..:: ::. : :. : : .: ::.: . .. .: .. : :: CCDS46 LVISELEGKAQQPAAELMQDTRDFLNRYPRKKFWVGKPIARV--VKKKTGEFSDKLLSLQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 REMKMFLEKLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRA : .. : :: .:.:. . ..::::.. : :::: . . .. .... .::.:: CCDS46 RGLREFQGKLLRDLEYKTVSVTLDPQSASGYLQLSEDWKCVTYTSLYKSAYLHPQQFDCE 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 TCVLAHTGITGGRHTWVVSI-------DLAHGG--------------------------- ::. :.: :. : : . : .: CCDS46 PGVLGSKGFTWGKVYWEVEVEREGWSEDEEEGDEEEEGEEEEEEEEAGYGDGYDDWETDE 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 pF1KE4 ---------------------SCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALG :: :::. ..:.:::.: ::::.::::.::. . . : CCDS46 DEESLGDEEEEEEEEEEEVLESCMVGVARDSVKRKGDLSLRPEDGVWALRLSSSGIWANT 420 430 440 450 460 470 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 SFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRKVIPFFGLWGRGSS : ..: .::.: ..:::: : :::::: ..: :::::: CCDS46 SPEAELFPALRPRRVGIALDYEGGTVTFTNAESQELIYTFTATFTRRLVPFLWLKWPGTR 480 490 500 510 520 530 480 pF1KE4 FSLSS CCDS46 LLLRP >>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 (485 aa) initn: 918 init1: 358 opt: 808 Z-score: 615.1 bits: 123.2 E(32554): 6.1e-28 Smith-Waterman score: 978; 34.6% identity (65.0% similar) in 486 aa overlap (1-468:1-462) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC : .: : ....:: ::::. ::::..:::::.::..::. :::: . . . ::::: CCDS31 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVV . : .: ..:::::::::::... :.: .:: . :.:..::::. .::..: . .: . CCDS31 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGL-KGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEA 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 CREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVST : .. :: .:.. .::.: :. ..:. :. :.::.:: ... : :: . :: : CCDS31 CSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVET 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 pF1KE4 KRQQVISEFAHLRKFLEEQQ----------SILLAQLESQDGDILRQRDEFD---LLVAG ..:... :: . ...::..: . ::.:. . .. . :. :.. :. . CCDS31 RKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETM-QKLELNHSELIQQS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EICRFSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQA .. . .: ::.:...::.: .: ::. .: : .. . ..: .: :: : . CCDS31 QV--LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCR-----V 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LPLQREMKMFLEKLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQR : :.. .: . : . :::.:.. .:..:::..:.... :. ::::.: CCDS31 LGLREILKTY-----------AADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPER 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 FDRATCVLAHTGITGGRHTWVVSI-DLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVR : : . ::. :..::: : : . : .. : .:: ...:.:: . : :. : :..: CCDS31 FYRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWG---LGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIR 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 LAWG--FVSALGSFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVT-REPIYTFTA-SFTR : : . .. .: :.: ::.: . .:::. ..: :.. :.:: : CCDS31 LRKGNEYRAGTDEYPI-LSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPG 400 410 420 430 440 450 470 480 pF1KE4 KVIPFFGLWGRGSSFSLSS ...:.: CCDS31 RLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED 460 470 480 >>CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 (511 aa) initn: 995 init1: 387 opt: 754 Z-score: 574.9 bits: 115.9 E(32554): 1.1e-25 Smith-Waterman score: 972; 35.4% identity (64.8% similar) in 492 aa overlap (5-475:18-505) 10 20 30 40 pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIP : .. : :..: :: .::::...:::.:::::. : : : CCDS44 MAAVGPRTGPGTGAEALALAAELQGEATCSICLELFREPVSVECGHSFCRACIGRCWERP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KE4 GPD----LEESPT----CPLCKEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDV- : ..: :: :.:: ::...::: ::: :. ..:..: .. . ::. CCDS44 GAGSVGAATRAPPFPLPCPQCREPARPSQLRPNRQLAAVATLLRRFSLPAA-APGEHGSQ 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 pF1KE4 ----------CQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVVCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHK : .::: . ..:.:: .:::: .: :: :.. :..:. .: ... CCDS44 AAAARAAAARCGQHGEPFKLYCQDDGRAICVVCDRAREHREHAVLPLDEAVQEAKELLES 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 CLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVSTKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLE :. :.:: :. . ..: :.:. . :: :.......: .:: :: :: ::.. ::..:: CCDS44 RLRVLKKELEDCEVFRSTEKKESKELLKQMAAEQEKVGAEFQALRAFLVEQEGRLLGRLE 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 SQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRK . .. ....: .. :: ..: : ...: ..: ..: ...::: :: . : CCDS44 ELSREVAQKQNENLAQLGVEITQLSKLSSQIQETAQKPDLDFLQEFKSTLSRCSNVPGPK 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 PVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLEKLCFELDYEP-AHISLDPQTSHPKLLLSE :..:: :. ... . ... :. .: : : : ::. : ....:::.:..:.:.:: CCDS44 PTTVSSEMKNKVWNVSLKTFVLKGMLKKFKEDLRGELEKEEKVELTLDPDTANPRLILSL 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 DHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDRATCVLAHTGITGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSED : . .... . :. :..: ::: : ::: :...::: : : . : . ::. :. CCDS44 DLKGVRLGERAQDLPNHPCRFDTNTRVLASCGFSSGRHHWEVEVGSKDGWA--FGVARES 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 VQRKGELRLRPEEGVWAVRLAWGFVSALGSFPTRLTLKE-QPRQVRVSLDYEVGWVTFTN :.::: . :::::::..: : :. : : : :. . .:::.:: ::: :.: CCDS44 VRRKGLTPFTPEEGVWALQLNGGQYWAVTS-PERSPLSCGHLSRVRVALDLEVGAVSFYA 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 pF1KE4 AVTREPIYTFTASFTRKVIPFFGLWGRGSSFSLSS . . .::: ..: ..:.:.:.. . :. CCDS44 VEDMRHLYTFRVNFQERVFPLFSVCSTGTYLRIWP 480 490 500 510 >>CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 (474 aa) initn: 626 init1: 330 opt: 748 Z-score: 570.9 bits: 115.0 E(32554): 1.8e-25 Smith-Waterman score: 765; 31.5% identity (60.0% similar) in 483 aa overlap (10-470:6-459) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTR-YCEIPGPDLEESPTCPL . .:..:::: ...::.:.:::::::.:: : . :: : :: CCDS56 MEAEDIQEELTCPICLDYFQDPVSIECGHNFCRGCLHRNWAPGGGP----FP-CPE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 CKEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCV :..: :...:::: :: ..:. .: .: : .: .: : . .:::::. .:. CCDS56 CRHPSAPAALRPNWALARLTEKTQRRRL----GPVPPGLCGRHWEPLRLFCEDDQRPVCL 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 VCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVS ::::. :: ::.: ...: :::.. : . : . ......:. : : ... CCDS56 VCRESQEHQTHAMAPIDEAFESYREKLLKSQRNLVAKMKKVMHLQDVEVKNATQWKDKIK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEEL ..:... .::..:..:: :.....: .:.... . .. .: : . : .. :: :. CCDS56 SQRMRISTEFSKLHNFLVEEEDLFLQRLNKEEEETKKKLNENTLKLNQTIASLKKLILEV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 EEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLE ::.. :. ::: . . .: : : . : : : . ... : .::..:: :. CCDS56 GEKSQAPTLELLQNPKEVLTRSEI----QDVNYSLE-AVKVKTVCQ--IPLMKEM---LK 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE4 KLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQ----------FSYKWQNSPD--NPQ- . :.. ..: .:.::::..:.. . .. :: :. ::: CCDS56 R--FQVA-----VNLAEDTAHPKLVFSQEGRYVKNTASASSWPVFSSAWNYFAGWRNPQK 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 -----RFDRATCVLAHTGITGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQR-KGELRLRPEE ::.. :::... .:.:.: : .. . .::: :::. . .. :. CCDS56 TAFVERFQHLPCVLGKNVFTSGKHYW--EVESRDSLEVAVGVCREDVMGITDRSKMSPDV 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 pF1KE4 GVWAVRL-AWGFVSALGSFPTRLTLKEQP-RQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTA :.::. : :. .: :: : .: ..: : :: .: :.: .:: ..::. CCDS56 GIWAIYWSAAGYWPLIG-FPGTPTQQEPALHRVGVYLDRGTGNVSFYSAVDGVHLHTFSC 390 400 410 420 430 440 460 470 480 pF1KE4 SFTRKVIPFFGLWGRGSSFSLSS : . .. ::: : CCDS56 SSVSRLRPFFWLSPLASLVIPPVTDRK 450 460 470 >>CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 (513 aa) initn: 896 init1: 416 opt: 746 Z-score: 568.9 bits: 114.8 E(32554): 2.3e-25 Smith-Waterman score: 963; 34.4% identity (64.4% similar) in 486 aa overlap (1-470:1-476) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC :::.. . : .:..::.: . ::. .:::::.: :::.: : : : . .:: : CCDS46 MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLAR-CW--GTA-ETNVSCPQC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLG-EEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCV .: : .::: .::::.. ...:. : : : ::..: : . ..::.:.: .:: CCDS46 RETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 VCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVS :: .. :: :.. ::.:. ..:::.. : :.. .. .. ... .. ::. .. CCDS46 VCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEEL .:.... :: .: . :.:.. :::.:: : : . . . .: ..:.:: .: CCDS46 MEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSSLIAQL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 EEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLE :::...:.:::: :: .:: : : . .: . :.: ..:. : :. : : . .:.: : CCDS46 EEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 KLCFELD---------YEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDR :. ... . ..:::.:..:.:.::.. .....:: :. ::::.::. CCDS46 KMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 ATCVLAHTGITGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRL--- :::. . .::: : .... .. :.:: ..: ::: . :..: ::: : CCDS46 FPCVLGSPCFIAGRHYW--EVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRKGGVTSAPQNGFWAVSLWYG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 --AWGFVSALGSFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFT-ASFTRKV :...: . ..: : :. .: . :::..: :.: :.. : .::. :.: : CCDS46 KEYWALTSPMTALPLRTPLQ----RVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHTFTFSHATFCGPV 420 430 440 450 460 470 470 480 pF1KE4 IPFFGLWGRGSSFSLSS :.:.: CCDS46 RPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP 480 490 500 510 >>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 (488 aa) initn: 1047 init1: 390 opt: 704 Z-score: 538.2 bits: 109.0 E(32554): 1.2e-23 Smith-Waterman score: 1081; 38.9% identity (67.3% similar) in 471 aa overlap (2-468:15-465) 10 20 30 40 pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIP ..::.. .: :..: .: :.::: :.::::::.::.::. : CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE-- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 GPDLEESPTCPLCKEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIY :::.. ::.:.. : :.::: ::...:: ..:: :. . .:..: .: : . CCDS34 --DLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKR-KIRDESLCPQHHEALS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 FFCEDDEMQLCVVCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRE .:: .:. .:..: . : .::. :.::. :.:...:::. :... .:: . .: : CCDS34 LFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 NKRMQVLLTQVSTKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAG .:. : : ..:::.. :: .:.. :.:.:..::..:: .. ::: :: . . : CCDS34 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDIL-QRLRENAAHLG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EICR-FSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQ . : .. : :.: : . . :.: :..::: .:: : . ..:: :: . . .::.: CCDS34 DKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 ALPLQREMKMFLEKLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQF-SYKWQNSPDNP . :.. .:... : ..:::.:.::.:.::::.. ..: . .. ::.: CCDS34 YFALRKILKQLI-----------ADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 QRFDRATCVLAHTGITGGRHTWVVSI-DLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWA .:: :::: :.:.::: : : . : .: . ::: ..:.::::: :: : : CCDS34 RRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWA---VGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWR 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 VRLAWGFVSALGSFP-TRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFTASFTRK ::: : : . : : : .: .:..: . ::::.: ..: :.. : ::::: .::.: CCDS34 VRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEK 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 VIPFFGLWGRGSSFSLSS . :.: CCDS34 LWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE 470 480 >>CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 (503 aa) initn: 903 init1: 390 opt: 704 Z-score: 538.0 bits: 109.0 E(32554): 1.2e-23 Smith-Waterman score: 861; 36.3% identity (67.0% similar) in 397 aa overlap (2-396:15-386) 10 20 30 40 pF1KE4 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIP ..::.. .: :..: .: :.::: :.::::::.::.::. : CCDS78 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE-- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 GPDLEESPTCPLCKEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIY :::.. ::.:.. : :.::: ::...:: ..:: :. . .:..: .: : . CCDS78 --DLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKR-KIRDESLCPQHHEALS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 FFCEDDEMQLCVVCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRE .:: .:. .:..: . : .::. :.::. :.:...:::. :... .:: . .: : CCDS78 LFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 NKRMQVLLTQVSTKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAG .:. : : ..:::.. :: .:.. :.:.:..::..:: .. ::: :: . . : CCDS78 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDIL-QRLRENAAHLG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EICR-FSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQ . : .. : :.: : . . :.: :..::: .:: : . ..:: :: . . .::.: CCDS78 DKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 ALPLQREMKMFLEKLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQF-SYKWQNSPDNP . :.. .:... : ..:::.:.::.:.::::.. ..: . .. ::.: CCDS78 YFALRKILKQLI-----------ADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 QRFDRATCVLAHTGITGGRHTWVVSIDLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAV .:: :::: :.:.::: : .. :: : :...: . .. :. 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